More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2965 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_2965  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
392 aa  751    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3183  major facilitator superfamily MFS_1  65.7 
 
 
380 aa  416  9.999999999999999e-116  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.15273  normal  0.971908 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1845  major facilitator superfamily MFS_1  32.89 
 
 
404 aa  153  4e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4707  MFS family transporter  32.8 
 
 
415 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.759386  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0619  hypothetical protein  33.06 
 
 
408 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53780  MFS family transporter  32.8 
 
 
415 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.033353  normal  0.109422 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2054  major facilitator  27.71 
 
 
408 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3510  major facilitator family transporter  25.5 
 
 
402 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.983677  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4176  major facilitator transporter  30.06 
 
 
425 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3521  major facilitator family transporter  25.06 
 
 
406 aa  115  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0626  hypothetical protein  30.69 
 
 
411 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3210  major facilitator family transporter  24.18 
 
 
404 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3513  major facilitator family transporter  24.37 
 
 
414 aa  113  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3212  major facilitator transporter  27.48 
 
 
408 aa  113  7.000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.244211  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3296  major facilitator family transporter  24.18 
 
 
404 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2812  major facilitator superfamily MFS_1  26.18 
 
 
427 aa  112  1.0000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3556  major facilitator family transporter  24.18 
 
 
404 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3266  major facilitator family transporter  24.12 
 
 
404 aa  108  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3500  permease  25.46 
 
 
409 aa  106  8e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1748  major facilitator family transporter  25.65 
 
 
399 aa  104  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.365711  normal  0.514177 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6840  major facilitator superfamily MFS_1  34.96 
 
 
384 aa  105  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.806913  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13009  integral membrane protein  29.6 
 
 
445 aa  104  2e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  7.64265e-25  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5417  major facilitator transporter  26.19 
 
 
407 aa  102  9e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.886931  normal  0.408108 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2806  major facilitator superfamily MFS_1  24.62 
 
 
434 aa  97.1  4e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0892  major facilitator superfamily MFS_1  27.33 
 
 
408 aa  96.3  8e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6302  major facilitator transporter  29.02 
 
 
424 aa  89.4  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2858  major facilitator transporter  28.54 
 
 
423 aa  86.7  7e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.518401 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0852  major facilitator superfamily MFS_1  21.99 
 
 
438 aa  86.7  7e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.207548 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2202  major facilitator transporter  25.44 
 
 
410 aa  86.3  8e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0642059  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1896  major facilitator transporter  28.81 
 
 
412 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.482817 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1916  major facilitator transporter  28.81 
 
 
412 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.181905  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1962  major facilitator superfamily transporter  28.81 
 
 
412 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2995  major facilitator transporter  28.01 
 
 
425 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5945  major facilitator superfamily MFS_1  30.38 
 
 
363 aa  83.6  0.000000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.309927  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4191  major facilitator transporter  28.3 
 
 
381 aa  82.8  0.00000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0528095  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1460  major facilitator superfamily MFS_1  25.43 
 
 
423 aa  80.5  0.00000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2131  major facilitator superfamily transporter  27.96 
 
 
423 aa  80.1  0.00000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.600199  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3367  major facilitator superfamily MFS_1  29.2 
 
 
396 aa  79  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0109833  normal  0.0295865 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2625  major facilitator superfamily MFS_1  26.09 
 
 
398 aa  76.6  0.0000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2943  major facilitator transporter  26.63 
 
 
417 aa  76.3  0.0000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2971  major facilitator transporter  28.64 
 
 
427 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.633747 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2336  major facilitator transporter  29.5 
 
 
427 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.155458  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2950  major facilitator transporter  29.5 
 
 
427 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.256248  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0865  major facilitator transporter  26.8 
 
 
430 aa  74.3  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2742  major facilitator transporter  31.36 
 
 
418 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0666  d-galactonate transporter  25.62 
 
 
447 aa  70.5  0.00000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0432694 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4231  major facilitator transporter  27.49 
 
 
403 aa  70.1  0.00000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.578267  normal  0.128432 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4400  major facilitator transporter  30.41 
 
 
397 aa  69.7  0.00000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.848546  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4090  major facilitator transporter  32.55 
 
 
417 aa  69.7  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.116905  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4739  major facilitator transporter  32.55 
 
 
426 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.178474  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3427  major facilitator transporter  32.55 
 
 
462 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6076  major facilitator transporter  32.55 
 
 
416 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2515  major facilitator superfamily MFS_1  27.68 
 
 
428 aa  67.8  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.577453 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3221  major facilitator superfamily MFS_1  25.41 
 
 
405 aa  67.4  0.0000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5706  major facilitator transporter  29.5 
 
 
421 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.899176  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6459  major facilitator transporter  29.5 
 
 
421 aa  67  0.0000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.338256  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1254  nitrate/nitrite transporter  29.3 
 
 
424 aa  67  0.0000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2048  sugar transporter  34.16 
 
 
478 aa  66.2  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5210  major facilitator transporter  30.59 
 
 
416 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.925158  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7074  major facilitator transporter  29.69 
 
 
436 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.884668 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4401  major facilitator transporter  30.17 
 
 
461 aa  65.1  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1866  major facilitator transporter  28.52 
 
 
425 aa  65.5  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.591814  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3372  major facilitator transporter  31.13 
 
 
416 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2484  major facilitator superfamily MFS_1  25.42 
 
 
437 aa  64.3  0.000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.371428  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5388  major facilitator transporter  29.45 
 
 
422 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0135338 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1189  major facilitator superfamily MFS_1  26.75 
 
 
400 aa  64.7  0.000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.051319  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4592  major facilitator transporter  31.69 
 
 
440 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.947939 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6607  major facilitator transporter  32.03 
 
 
439 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.806643  normal  0.758649 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5132  major facilitator transporter  25.93 
 
 
412 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5727  major facilitator transporter  25.93 
 
 
434 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3401  major facilitator transporter  24.87 
 
 
394 aa  63.2  0.000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2040  major facilitator family transporter  25.44 
 
 
431 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7622  major facilitator transporter  32.03 
 
 
439 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.388014  normal  0.362364 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3147  major facilitator transporter  25.93 
 
 
434 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0966  major facilitator transporter  26.42 
 
 
412 aa  62.4  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.582345  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5760  major facilitator transporter  32.03 
 
 
439 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0193  major facilitator transporter  25.99 
 
 
425 aa  62.4  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.81343  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6125  major facilitator transporter  32.03 
 
 
439 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.444392 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1368  major facilitator superfamily MFS_1  24.94 
 
 
415 aa  61.6  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.16217  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4496  major facilitator transporter  25.78 
 
 
434 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10910  major facilitator transporter  27.5 
 
 
419 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0129173  normal  0.971248 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0030  major facilitator transporter  26.32 
 
 
402 aa  62.4  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.63894  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02171  transport transmembrane protein  23.11 
 
 
448 aa  61.2  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.115532  normal  0.0335477 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3052  major facilitator family transporter  25 
 
 
413 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0742962  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5712  general substrate transporter  27.87 
 
 
406 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.195276 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0267  hypothetical protein  32.05 
 
 
434 aa  61.2  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1001  MFS family transporter  26.88 
 
 
419 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4218  d-galactonate transporter  25.28 
 
 
432 aa  60.8  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0834  major facilitator transporter  23.88 
 
 
433 aa  60.8  0.00000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.789702 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4628  d-galactonate transporter  25.25 
 
 
447 aa  60.8  0.00000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.563971  hitchhiker  0.000103132 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4111  d-galactonate transporter  25.28 
 
 
432 aa  60.8  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.748063  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4160  d-galactonate transporter  25.28 
 
 
432 aa  60.8  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1107  major facilitator transporter  26.52 
 
 
440 aa  60.5  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2536  major facilitator transporter  22.37 
 
 
414 aa  60.5  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1255  major facilitator transporter  31.64 
 
 
413 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0230086  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3886  major facilitator superfamily MFS_1  29.51 
 
 
437 aa  60.1  0.00000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.214665  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0117  nitrate/nitrite transporter  29.3 
 
 
424 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5618  major facilitator transporter  29.59 
 
 
428 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.287687 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1625  major facilitator family transporter  29.3 
 
 
424 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.339331  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0436  regulatory protein UhpC  23.72 
 
 
434 aa  60.1  0.00000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>