266 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A0966 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A0966  major facilitator transporter  100 
 
 
412 aa  809    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.582345  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19400  arabinose efflux permease family protein  32.51 
 
 
407 aa  116  6.9999999999999995e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3480  Arabinose efflux permease-like protein  36.74 
 
 
738 aa  103  6e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0787182  hitchhiker  0.00623555 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5945  major facilitator superfamily MFS_1  27.89 
 
 
363 aa  90.5  5e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.309927  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3400  major facilitator transporter  28.14 
 
 
430 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5234  major facilitator transporter  30.16 
 
 
430 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0360  major facilitator superfamily MFS_1  26.7 
 
 
413 aa  61.2  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3788  major facilitator superfamily MFS_1  29.37 
 
 
438 aa  60.8  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.64327  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2718  major facilitator transporter  30.12 
 
 
430 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5166  major facilitator transporter  31.1 
 
 
429 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.733081 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4070  major facilitator transporter  30.72 
 
 
430 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3052  major facilitator family transporter  29.89 
 
 
413 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0742962  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3451  major facilitator transporter  30.72 
 
 
430 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.225334  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5675  major facilitator transporter  27.75 
 
 
429 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7197  major facilitator superfamily permease  27.3 
 
 
397 aa  57.4  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3238  TcaB protein  27.34 
 
 
394 aa  57.4  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.297435  normal  0.145107 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5039  major facilitator transporter  27.3 
 
 
410 aa  57.4  0.0000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.582294  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2957  major facilitator transporter  27.6 
 
 
406 aa  56.6  0.0000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.902774 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1023  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 
431 aa  56.6  0.0000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0652623  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3412  major facilitator transporter  23.4 
 
 
431 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.06823  hitchhiker  0.00118762 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1328  major facilitator superfamily MFS_1  27.16 
 
 
451 aa  55.8  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.567921 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1700  major facilitator superfamily MFS_1  25.49 
 
 
421 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.194128  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2812  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 
427 aa  55.5  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4105  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  26.34 
 
 
437 aa  54.7  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5654  major facilitator transporter  25 
 
 
426 aa  54.3  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.557325 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3974  major facilitator superfamily MFS_1  30.41 
 
 
219 aa  54.3  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0321  nitrate transporter  31.41 
 
 
403 aa  54.3  0.000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10910  major facilitator transporter  26.6 
 
 
419 aa  54.3  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0129173  normal  0.971248 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2916  major facilitator transporter  25.83 
 
 
416 aa  54.3  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0195936  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1929  major facilitator transporter  24.66 
 
 
399 aa  53.9  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0368409  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1938  major facilitator transporter  26.25 
 
 
443 aa  53.9  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.829808  normal  0.641646 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2622  major facilitator superfamily MFS_1  23.85 
 
 
421 aa  53.5  0.000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6220  major facilitator superfamily MFS_1  25.95 
 
 
437 aa  53.5  0.000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000198759  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1705  major facilitator transporter  28.35 
 
 
414 aa  53.1  0.000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.460049  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3718  major facilitator transporter  25 
 
 
426 aa  53.1  0.000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.298146  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4650  major facilitator transporter  25 
 
 
426 aa  53.1  0.000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.964668 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2806  major facilitator superfamily MFS_1  23.12 
 
 
434 aa  53.1  0.000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0382  major facilitator superfamily MFS_1  26.09 
 
 
419 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.577765  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1916  major facilitator transporter  26.71 
 
 
412 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.181905  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0273  major facilitator transporter  24.57 
 
 
405 aa  52.4  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.473201  normal  0.019317 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0236  major facilitator transporter  23.55 
 
 
446 aa  52.4  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1962  major facilitator superfamily transporter  26.71 
 
 
412 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5058  major facilitator superfamily MFS_1  21.89 
 
 
425 aa  52.4  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.796866 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1896  major facilitator transporter  26.71 
 
 
412 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.482817 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3183  major facilitator superfamily MFS_1  24.51 
 
 
380 aa  52.4  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.15273  normal  0.971908 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1655  membrane transport protein  23.53 
 
 
428 aa  52.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.809863  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3837  major facilitator superfamily MFS_1  26.33 
 
 
400 aa  51.6  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.791856  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2414  major facilitator transporter  28.64 
 
 
394 aa  52  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.173973  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5148  major facilitator transporter  32.62 
 
 
514 aa  52  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3930  major facilitator superfamily MFS_1  30.94 
 
 
391 aa  51.6  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.369822  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0306  major facilitator transporter  27.02 
 
 
439 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.456873 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05590  arabinose efflux permease family protein  29.75 
 
 
502 aa  51.6  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6485  major facilitator superfamily D-glucarate permease  23.91 
 
 
445 aa  52.4  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.848435  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1627  membrane transport protein  22.99 
 
 
428 aa  51.2  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2965  major facilitator superfamily MFS_1  25.28 
 
 
392 aa  51.2  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4307  major facilitator transporter  28.14 
 
 
430 aa  51.2  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.622363  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51310  D-galactonate transporter  26.71 
 
 
434 aa  51.2  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1793  membrane transport protein  22.99 
 
 
428 aa  51.2  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.626262  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1432  major facilitator superfamily MFS_1  27.56 
 
 
390 aa  51.2  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1714  membrane transport protein  22.99 
 
 
428 aa  51.2  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5154  major facilitator transporter  22.66 
 
 
428 aa  50.8  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.379393  normal  0.385289 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5220  major facilitator transporter  35.29 
 
 
558 aa  50.8  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.337283  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0350  major facilitator superfamily MFS_1  26.61 
 
 
419 aa  50.8  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.222192  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4825  major facilitator transporter  25.68 
 
 
418 aa  51.2  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.327434  normal  0.0172769 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2580  major facilitator transporter  22.66 
 
 
398 aa  50.8  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0171602  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4479  major facilitator transporter  27.55 
 
 
419 aa  50.4  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4122  D-galactonate transporter  23.29 
 
 
436 aa  50.4  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0101407  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1264  major facilitator transporter  29.95 
 
 
411 aa  50.4  0.00006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0045  major facilitator transporter  24.21 
 
 
444 aa  50.4  0.00006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0327786  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1647  membrane transport protein  22.99 
 
 
428 aa  50.1  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4176  major facilitator transporter  25.47 
 
 
425 aa  50.1  0.00007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2807  major facilitator superfamily MFS_1  28.48 
 
 
414 aa  50.1  0.00007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0892  major facilitator superfamily MFS_1  31.37 
 
 
408 aa  49.7  0.00009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4823  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 
432 aa  49.7  0.00009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00322501  normal  0.0186272 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4271  major facilitator transporter  26.72 
 
 
468 aa  49.7  0.00009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0659968  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0769  putative sugar transporter  24.55 
 
 
441 aa  49.3  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51130  MFS (major facilitator superfamily) transporter  25.38 
 
 
439 aa  49.7  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.845287  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2129  major facilitator transporter  26.14 
 
 
442 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.526702  normal  0.377982 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0506  membrane transport protein  24.55 
 
 
446 aa  49.3  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.870522  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4111  d-galactonate transporter  28.95 
 
 
432 aa  49.7  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.748063  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3147  major facilitator transporter  34.46 
 
 
434 aa  49.7  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2122  major facilitator transporter  24.45 
 
 
409 aa  49.3  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4496  major facilitator transporter  34.46 
 
 
434 aa  49.3  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1729  major facilitator transporter  26.72 
 
 
453 aa  48.9  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5002  major facilitator transporter  34.46 
 
 
433 aa  49.3  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5940  major facilitator transporter  24.37 
 
 
433 aa  49.3  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.054012 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3221  major facilitator superfamily MFS_1  26.7 
 
 
405 aa  49.3  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32250  Major facilitator family transporter protein  22.87 
 
 
415 aa  48.9  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03865  hexuranate transporter  28.78 
 
 
433 aa  49.3  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0030  major facilitator transporter  28.1 
 
 
402 aa  49.3  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.63894  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2152  major facilitator transporter  24.45 
 
 
409 aa  49.3  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.291  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1819  putative transporter  24.42 
 
 
417 aa  49.3  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.143968  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0691  major facilitator family transporter  24.55 
 
 
458 aa  49.3  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.358679  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4160  d-galactonate transporter  28.95 
 
 
432 aa  49.7  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1997  major facilitator superfamily permease  24.55 
 
 
458 aa  49.3  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4218  d-galactonate transporter  28.95 
 
 
432 aa  49.7  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02171  transport transmembrane protein  21.91 
 
 
448 aa  48.9  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.115532  normal  0.0335477 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3116  major facilitator superfamily MFS_1  25.16 
 
 
430 aa  48.5  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000115925  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0508  major facilitator transporter  29.55 
 
 
438 aa  48.9  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0836573  normal  0.693468 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5132  major facilitator transporter  34.46 
 
 
412 aa  48.9  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>