More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2048 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_2048  sugar transporter  100 
 
 		 478 aa  932    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13363  sugar-transport integral membrane protein sugI  54.68 
 
 		 502 aa  433  1e-120  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0365125  normal  0.911319 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1160  sugar transporter  33.55 
 
 		 468 aa  234  2.0000000000000002e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0565582  hitchhiker  0.000112742 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0526  sugar transporter  34.1 
 
 		 457 aa  231  3e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.637088  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3265  galactose-proton symporter  33.84 
 
 		 464 aa  226  5.0000000000000005e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0111445  normal  0.101317 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3330  galactose-proton symporter  33.84 
 
 		 464 aa  226  5.0000000000000005e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00323998  normal  0.618679 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3338  galactose-proton symporter  33.84 
 
 		 464 aa  226  5.0000000000000005e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.0071419  normal  0.395807 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3254  galactose-proton symporter  33.84 
 
 		 464 aa  226  5.0000000000000005e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000516746  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3434  galactose-proton symporter  33.84 
 
 		 464 aa  226  5.0000000000000005e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.444066  normal  0.014218 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4246  galactose-proton symporter  34.62 
 
 		 464 aa  222  9e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.487781  normal  0.587718 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2900  sugar transporter  31.84 
 
 		 475 aa  222  9.999999999999999e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.407104  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3108  sugar transporter  33.63 
 
 		 480 aa  222  9.999999999999999e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.934005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3661  sugar transporter  32.54 
 
 		 480 aa  220  3.9999999999999997e-56  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0388  sugar transporter  34.98 
 
 		 472 aa  220  3.9999999999999997e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.535327 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3286  galactose-proton symporter  33.19 
 
 		 464 aa  220  5e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.583808  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0771  sugar transporter  33.19 
 
 		 464 aa  220  5e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00259481  hitchhiker  0.000457793 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3347  sugar transporter  32.68 
 
 		 465 aa  220  5e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0767559  decreased coverage  0.00268397 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3375  galactose-proton symporter  33.19 
 
 		 464 aa  220  5e-56  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3085  galactose-proton symporter  33.19 
 
 		 464 aa  220  5e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0156709  hitchhiker  0.000187462 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02773  D-galactose transporter  33.19 
 
 		 464 aa  220  5e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.255079  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02736  hypothetical protein  33.19 
 
 		 464 aa  220  5e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.39424  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3101  galactose-proton symporter  33.19 
 
 		 464 aa  220  5e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4102  sugar transporter  32.73 
 
 		 477 aa  219  7e-56  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0752  sugar transporter  34.4 
 
 		 464 aa  218  2e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.718529  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4863  sugar transporter  31.9 
 
 		 464 aa  216  7e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.83447 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0710  sugar transporter  30.87 
 
 		 476 aa  216  9e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.148606 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0757  sugar transporter  30.91 
 
 		 448 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0214435  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41890  MFS family sugar transporter  32.66 
 
 		 449 aa  213  4.9999999999999996e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2989  arabinose-proton symporter  31.11 
 
 		 472 aa  212  1e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0609314 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02689  arabinose transporter  30.89 
 
 		 472 aa  212  1e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02650  hypothetical protein  30.89 
 
 		 472 aa  212  1e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4110  arabinose-proton symporter  30.89 
 
 		 472 aa  211  3e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000412167 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3162  arabinose-proton symporter  30.89 
 
 		 472 aa  210  4e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.839771  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3021  arabinose-proton symporter  30.89 
 
 		 472 aa  210  4e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0849  sugar transporter  30.89 
 
 		 472 aa  210  4e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2988  arabinose-proton symporter  30.89 
 
 		 472 aa  210  4e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.993393  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0874  sugar transporter  30.89 
 
 		 472 aa  210  5e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0456  D-xylose-proton symporter  30.65 
 
 		 463 aa  208  2e-52  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3166  L-arabinose/proton symport protein  31.19 
 
 		 472 aa  207  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3348  L-arabinose/proton symport protein  31.19 
 
 		 472 aa  207  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.110273 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3184  L-arabinose/proton symport protein  31.19 
 
 		 472 aa  207  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7518  sugar transporter  32.49 
 
 		 507 aa  208  2e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3247  L-arabinose/proton symport protein  31.19 
 
 		 472 aa  207  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000138124 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3184  sugar transporter  30.73 
 
 		 441 aa  207  3e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.137091  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3232  L-arabinose/proton symport protein  31.19 
 
 		 472 aa  207  4e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.852071  hitchhiker  0.0000142975 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1731  D-xylose-proton symporter  30.65 
 
 		 463 aa  206  6e-52  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3294  sugar transporter  30.43 
 
 		 471 aa  206  7e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.534261 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0183  sugar transporter  32.62 
 
 		 474 aa  204  2e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.447711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1599  sugar transporter  31.88 
 
 		 444 aa  204  3e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.846588  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7188  sugar transporter  28.89 
 
 		 438 aa  202  7e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3220  sugar transporter  33.56 
 
 		 468 aa  201  1.9999999999999998e-50  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.681904 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1394  sugar transporter  31.59 
 
 		 452 aa  200  5e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4403  sugar transporter  32.46 
 
 		 492 aa  197  3e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.92249  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1756  arabinose efflux permease  31.6 
 
 		 516 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2754  sugar transporter  30.04 
 
 		 497 aa  194  3e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2820  sugar transporter  31.58 
 
 		 544 aa  192  8e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0133634 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1619  hypothetical protein  29.27 
 
 		 471 aa  192  1e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1053  sugar transporter  34.32 
 
 		 430 aa  192  1e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.55252 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50070  myo-inositol transporter  29.24 
 
 		 485 aa  191  2e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2334  major facilitator superfamily protein  31.41 
 
 		 446 aa  191  2.9999999999999997e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1682  D-xylose proton-symporter  29.55 
 
 		 458 aa  189  9e-47  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000961132  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1624  hypothetical protein  29.27 
 
 		 471 aa  188  2e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1174  sugar transporter  29.44 
 
 		 473 aa  188  2e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.63081 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0105  sugar transporter  32.29 
 
 		 482 aa  187  3e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4271  D-xylose transporter XylE  27.95 
 
 		 491 aa  187  3e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0128  D-xylose proton-symporter  29.87 
 
 		 484 aa  187  4e-46  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0489745  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3868  sugar transporter  29.52 
 
 		 450 aa  186  6e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3592  sugar transporter  29.2 
 
 		 442 aa  186  6e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0369851  hitchhiker  0.00000823269 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4582  D-xylose transporter XylE  28.16 
 
 		 491 aa  186  7e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3998  D-xylose transporter XylE  28.16 
 
 		 491 aa  186  9e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.688802  normal  0.586255 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03863  hypothetical protein  28.16 
 
 		 491 aa  186  9e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03903  D-xylose transporter  28.16 
 
 		 491 aa  186  9e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3965  sugar transporter  28.16 
 
 		 491 aa  186  9e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5512  D-xylose transporter XylE  28.16 
 
 		 491 aa  186  9e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0479  sugar transporter  29.63 
 
 		 471 aa  184  2.0000000000000003e-45  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000749242  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8679  sugar transporter  30.61 
 
 		 533 aa  185  2.0000000000000003e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.546222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2102  sugar transporter  28.86 
 
 		 457 aa  184  3e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1363  sugar transporter family protein  28.84 
 
 		 473 aa  184  3e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.498359  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0959  sugar transporter  29.18 
 
 		 472 aa  184  4.0000000000000006e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0368  sugar transporter  29.57 
 
 		 448 aa  183  5.0000000000000004e-45  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.968703  hitchhiker  0.00000305958 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1773  sugar transporter  31.75 
 
 		 491 aa  183  5.0000000000000004e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0500  sugar transporter  31.12 
 
 		 445 aa  182  1e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.615232  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1578  sugar transporter  27.37 
 
 		 466 aa  181  2e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19521  hypothetical protein  29.5 
 
 		 480 aa  181  2.9999999999999997e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0853  D-xylose proton-symporter  31.72 
 
 		 459 aa  180  4.999999999999999e-44  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2214  D-xylose transporter XylE  27.46 
 
 		 468 aa  180  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4664  sugar transporter  27.83 
 
 		 475 aa  179  7e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2136  sugar transporter  33.41 
 
 		 447 aa  179  1e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.104462 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0468  sugar transporter  30 
 
 		 447 aa  178  2e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0464  hypothetical protein  30.41 
 
 		 473 aa  178  2e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33610  MFS transporter, sugar porter family  30.23 
 
 		 497 aa  178  2e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.300012  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4418  D-xylose transporter XylE  28.06 
 
 		 491 aa  177  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00317086 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00600  MFS transporter, sugar porter family  28.66 
 
 		 499 aa  176  7e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0654  major facilitator superfamily sugar transporter  31.27 
 
 		 443 aa  176  8e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.866655  normal  0.707022 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3869  sugar transporter  31.12 
 
 		 485 aa  176  9.999999999999999e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.131713  normal  0.43014 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0827  sugar transporter  28.29 
 
 		 450 aa  175  9.999999999999999e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36280  MFS transporter, sugar porter family  29.87 
 
 		 468 aa  176  9.999999999999999e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15770  MFS transporter, sugar porter family  31.96 
 
 		 493 aa  176  9.999999999999999e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0944  sugar transporter  29.68 
 
 		 480 aa  175  9.999999999999999e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0488  hypothetical protein  29.8 
 
 		 473 aa  175  1.9999999999999998e-42  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>