More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2136 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_2136  sugar transporter  100 
 
 		 447 aa  872    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.104462 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1053  sugar transporter  58.22 
 
 		 430 aa  458  9.999999999999999e-129  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.55252 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0654  major facilitator superfamily sugar transporter  55.68 
 
 		 443 aa  429  1e-119  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.866655  normal  0.707022 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0526  sugar transporter  47.33 
 
 		 457 aa  365  1e-100  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.637088  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0368  sugar transporter  46.91 
 
 		 448 aa  363  4e-99  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.968703  hitchhiker  0.00000305958 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3184  sugar transporter  47.8 
 
 		 441 aa  361  2e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.137091  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4863  sugar transporter  46.59 
 
 		 464 aa  357  1.9999999999999998e-97  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.83447 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7188  sugar transporter  47.55 
 
 		 438 aa  355  5.999999999999999e-97  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1599  sugar transporter  45.58 
 
 		 444 aa  338  1.9999999999999998e-91  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.846588  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3822  sugar transporter  42.17 
 
 		 443 aa  315  8e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.103912  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0500  sugar transporter  43.78 
 
 		 445 aa  295  1e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.615232  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0757  sugar transporter  36.49 
 
 		 448 aa  250  3e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0214435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19521  hypothetical protein  37.58 
 
 		 480 aa  243  7e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4271  D-xylose transporter XylE  34.2 
 
 		 491 aa  240  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03863  hypothetical protein  34.2 
 
 		 491 aa  239  1e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4582  D-xylose transporter XylE  34.2 
 
 		 491 aa  238  1e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03903  D-xylose transporter  34.2 
 
 		 491 aa  239  1e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3965  sugar transporter  34.2 
 
 		 491 aa  239  1e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5512  D-xylose transporter XylE  34.2 
 
 		 491 aa  239  1e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3998  D-xylose transporter XylE  34.2 
 
 		 491 aa  239  1e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.688802  normal  0.586255 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1578  sugar transporter  36.6 
 
 		 466 aa  237  3e-61  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2102  sugar transporter  34.27 
 
 		 457 aa  237  4e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36280  MFS transporter, sugar porter family  35.74 
 
 		 468 aa  235  1.0000000000000001e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4418  D-xylose transporter XylE  33.47 
 
 		 491 aa  232  9e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00317086 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3868  sugar transporter  35.81 
 
 		 450 aa  229  7e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1682  D-xylose proton-symporter  34.8 
 
 		 458 aa  228  2e-58  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000961132  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0183  sugar transporter  35.41 
 
 		 474 aa  226  5.0000000000000005e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.447711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0827  sugar transporter  34.1 
 
 		 450 aa  226  7e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1756  arabinose efflux permease  35.31 
 
 		 516 aa  225  2e-57  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3592  sugar transporter  34.91 
 
 		 442 aa  224  2e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0369851  hitchhiker  0.00000823269 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0456  D-xylose-proton symporter  35.59 
 
 		 463 aa  223  7e-57  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2820  sugar transporter  35.44 
 
 		 544 aa  222  9.999999999999999e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0133634 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4212  sugar transporter  33.85 
 
 		 477 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4699  sugar transporter  29.77 
 
 		 477 aa  221  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1731  D-xylose-proton symporter  35.37 
 
 		 463 aa  221  3e-56  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0710  sugar transporter  34.33 
 
 		 476 aa  219  6e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.148606 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0944  sugar transporter  33.03 
 
 		 480 aa  218  1e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2214  D-xylose transporter XylE  33.19 
 
 		 468 aa  218  2e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0128  D-xylose proton-symporter  33.41 
 
 		 484 aa  217  2.9999999999999998e-55  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0489745  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15770  MFS transporter, sugar porter family  36.11 
 
 		 493 aa  217  2.9999999999999998e-55  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4230  sugar transporter  34.81 
 
 		 467 aa  217  4e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3869  sugar transporter  33.96 
 
 		 485 aa  216  7e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.131713  normal  0.43014 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0468  sugar transporter  36.12 
 
 		 447 aa  215  9.999999999999999e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2094  sugar transporter  34.71 
 
 		 487 aa  215  9.999999999999999e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0241306  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4403  sugar transporter  33.93 
 
 		 492 aa  215  9.999999999999999e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.92249  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50070  myo-inositol transporter  31.75 
 
 		 485 aa  215  1.9999999999999998e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4664  sugar transporter  30 
 
 		 475 aa  213  4.9999999999999996e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2900  sugar transporter  36.26 
 
 		 475 aa  213  5.999999999999999e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.407104  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4102  sugar transporter  35.03 
 
 		 477 aa  213  7e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17570  MFS transporter, sugar porter family  33.05 
 
 		 486 aa  212  9e-54  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.262232  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3220  sugar transporter  36.71 
 
 		 468 aa  211  1e-53  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.681904 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1160  sugar transporter  35.17 
 
 		 468 aa  212  1e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0565582  hitchhiker  0.000112742 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0245  sugar transporter family protein  31.84 
 
 		 478 aa  211  2e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.669235  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0388  sugar transporter  35.31 
 
 		 472 aa  210  3e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.535327 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7518  sugar transporter  34.02 
 
 		 507 aa  209  9e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4020  sugar transporter  31.71 
 
 		 480 aa  209  1e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.997993 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2109  sugar transporter  34.62 
 
 		 475 aa  209  1e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.197372  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1514  sugar transporter  34.41 
 
 		 474 aa  209  1e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00665244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3999  sugar transporter  34.33 
 
 		 479 aa  208  1e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2334  major facilitator superfamily protein  34.26 
 
 		 446 aa  207  2e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3108  sugar transporter  34.79 
 
 		 480 aa  207  3e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.934005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1953  sugar transporter  35.17 
 
 		 452 aa  206  7e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.288052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2312  sugar transporter family protein  35.17 
 
 		 452 aa  206  7e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.588743  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00600  MFS transporter, sugar porter family  33.47 
 
 		 499 aa  205  1e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1668  sugar transporter  35.06 
 
 		 472 aa  205  1e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3727  sugar transporter  31.99 
 
 		 466 aa  205  1e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6750  major facilitator superfamily permease/glucose transporter  34.45 
 
 		 469 aa  205  1e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.184804 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3347  sugar transporter  35.02 
 
 		 465 aa  204  2e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0767559  decreased coverage  0.00268397 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3661  sugar transporter  32.51 
 
 		 480 aa  204  3e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4483  sugar transporter  34.48 
 
 		 474 aa  203  4e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.125142  normal  0.0950882 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0295  metabolite transport protein  31.91 
 
 		 482 aa  202  8e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1394  sugar transporter  32.1 
 
 		 452 aa  202  8e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0752  sugar transporter  35.48 
 
 		 464 aa  202  9e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.718529  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8679  sugar transporter  32.28 
 
 		 533 aa  202  9.999999999999999e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.546222  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2175  sugar transporter  34.83 
 
 		 482 aa  202  9.999999999999999e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.349166  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3330  galactose-proton symporter  35.25 
 
 		 464 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00323998  normal  0.618679 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3434  galactose-proton symporter  35.25 
 
 		 464 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.444066  normal  0.014218 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02736  hypothetical protein  35.48 
 
 		 464 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.39424  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0771  sugar transporter  35.48 
 
 		 464 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00259481  hitchhiker  0.000457793 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3254  galactose-proton symporter  35.25 
 
 		 464 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000516746  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3375  galactose-proton symporter  35.48 
 
 		 464 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3286  galactose-proton symporter  35.48 
 
 		 464 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.583808  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02773  D-galactose transporter  35.48 
 
 		 464 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.255079  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3085  galactose-proton symporter  35.48 
 
 		 464 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0156709  hitchhiker  0.000187462 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3101  galactose-proton symporter  35.48 
 
 		 464 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3265  galactose-proton symporter  35.25 
 
 		 464 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0111445  normal  0.101317 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3338  galactose-proton symporter  35.25 
 
 		 464 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.0071419  normal  0.395807 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3055  sugar transporter  34.74 
 
 		 494 aa  200  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.177873 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0802  sugar transporter  33.41 
 
 		 496 aa  200  3.9999999999999996e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4061  sugar transporter  32.14 
 
 		 490 aa  200  5e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.631668 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3778  sugar transporter  34.33 
 
 		 479 aa  199  6e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4246  galactose-proton symporter  35.25 
 
 		 464 aa  199  6e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.487781  normal  0.587718 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0478  D-xylose proton-symporter  29.59 
 
 		 480 aa  199  7.999999999999999e-50  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0479  sugar transporter  31.21 
 
 		 471 aa  198  2.0000000000000003e-49  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000749242  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1728  sugar transporter  31.62 
 
 		 468 aa  197  4.0000000000000005e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0944862  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0488  hypothetical protein  33.77 
 
 		 473 aa  197  4.0000000000000005e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33610  MFS transporter, sugar porter family  31.72 
 
 		 497 aa  197  4.0000000000000005e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.300012  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0464  hypothetical protein  33.77 
 
 		 473 aa  196  6e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1773  sugar transporter  32.25 
 
 		 491 aa  196  7e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3493  sugar transporter  34.89 
 
 		 486 aa  196  8.000000000000001e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>