237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_2950 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A6302  major facilitator transporter  87.85 
 
 		 424 aa  718    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2336  major facilitator transporter  100 
 
 		 427 aa  822    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.155458  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2995  major facilitator transporter  92.47 
 
 		 425 aa  734    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2950  major facilitator transporter  100 
 
 		 427 aa  822    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.256248  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2971  major facilitator transporter  98.59 
 
 		 427 aa  810    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.633747 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2858  major facilitator transporter  91.29 
 
 		 423 aa  728    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.518401 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2943  major facilitator transporter  79.63 
 
 		 417 aa  597  1e-169  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1460  major facilitator superfamily MFS_1  51.09 
 
 		 423 aa  390  1e-107  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3886  major facilitator superfamily MFS_1  58.84 
 
 		 437 aa  374  1e-102  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.214665  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3748  major facilitator superfamily MFS_1  56.22 
 
 		 419 aa  338  8e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0798464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4825  major facilitator superfamily MFS_1  56.22 
 
 		 419 aa  338  8e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.700339  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0628  major facilitator superfamily MFS_1  56.73 
 
 		 439 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.545486  normal  0.453894 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4072  major facilitator transporter  56.87 
 
 		 433 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4401  major facilitator transporter  55.26 
 
 		 461 aa  303  4.0000000000000003e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4589  major facilitator superfamily transporter  52.81 
 
 		 431 aa  278  1e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0353  major facilitator transporter  52.77 
 
 		 417 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6840  major facilitator superfamily MFS_1  32.43 
 
 		 384 aa  111  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.806913  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4231  major facilitator transporter  32.49 
 
 		 403 aa  102  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.578267  normal  0.128432 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2214  putative transporter  33.68 
 
 		 413 aa  99  1e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2854  major facilitator superfamily MFS_1  32.52 
 
 		 409 aa  98.6  2e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1168  major facilitator superfamily MFS_1  31.97 
 
 		 417 aa  98.6  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.262607 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1347  major facilitator superfamily MFS_1  34.75 
 
 		 410 aa  97.4  4e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00703114  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1331  major facilitator superfamily MFS_1  33.79 
 
 		 411 aa  95.5  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.255079  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1916  major facilitator transporter  32 
 
 		 412 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.181905  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1962  major facilitator superfamily transporter  32 
 
 		 412 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1896  major facilitator transporter  32 
 
 		 412 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.482817 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3367  major facilitator superfamily MFS_1  33.06 
 
 		 396 aa  93.2  7e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0109833  normal  0.0295865 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2131  major facilitator superfamily transporter  29.87 
 
 		 423 aa  90.9  4e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.600199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13009  integral membrane protein  27.03 
 
 		 445 aa  84  0.000000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  7.64265e-25  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2965  major facilitator superfamily MFS_1  27.98 
 
 		 392 aa  81.6  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2054  major facilitator  24.78 
 
 		 408 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3183  major facilitator superfamily MFS_1  29.09 
 
 		 380 aa  76.6  0.0000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.15273  normal  0.971908 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4707  MFS family transporter  28.99 
 
 		 415 aa  76.3  0.0000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.759386  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3221  major facilitator superfamily MFS_1  27.32 
 
 		 405 aa  75.9  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53780  MFS family transporter  28.75 
 
 		 415 aa  76.3  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.033353  normal  0.109422 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1845  major facilitator superfamily MFS_1  26.74 
 
 		 404 aa  74.7  0.000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4400  major facilitator transporter  32.3 
 
 		 397 aa  70.9  0.00000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.848546  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0619  hypothetical protein  26.49 
 
 		 408 aa  70.5  0.00000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3513  major facilitator family transporter  21.64 
 
 		 414 aa  69.7  0.00000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3510  major facilitator family transporter  20.91 
 
 		 402 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.983677  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3296  major facilitator family transporter  21.39 
 
 		 404 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3556  major facilitator family transporter  21.39 
 
 		 404 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3521  major facilitator family transporter  21.36 
 
 		 406 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3500  permease  20.79 
 
 		 409 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3210  major facilitator family transporter  21.36 
 
 		 404 aa  66.6  0.0000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0626  hypothetical protein  30.77 
 
 		 411 aa  63.9  0.000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0184  major facilitator superfamily MFS_1  32.89 
 
 		 397 aa  62  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.197618 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1748  major facilitator family transporter  21.57 
 
 		 399 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.365711  normal  0.514177 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2054  major facilitator superfamily MFS_1  27.54 
 
 		 445 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00125626 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3266  major facilitator family transporter  20.88 
 
 		 404 aa  60.1  0.00000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4176  major facilitator transporter  26.01 
 
 		 425 aa  59.3  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2202  major facilitator transporter  22.57 
 
 		 410 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0642059  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4428  major facilitator transporter  24.83 
 
 		 428 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00672186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5417  major facilitator transporter  27.9 
 
 		 407 aa  57.8  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.886931  normal  0.408108 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3212  major facilitator transporter  22 
 
 		 408 aa  57.8  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.244211  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2495  major facilitator superfamily MFS_1  27.27 
 
 		 442 aa  57  0.0000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00806465  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4945  major facilitator transporter  24.68 
 
 		 440 aa  57  0.0000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3268  sn-glycerol-3-phosphate transporter  26.93 
 
 		 446 aa  56.6  0.0000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3215  major facilitator transporter  24.68 
 
 		 440 aa  57  0.0000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.846569 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0305  sn-glycerol-3-phosphate transporter  25.51 
 
 		 449 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.886958 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5238  glycerol-3-phosphate transporter  25.22 
 
 		 449 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2511  sn-glycerol-3-phosphate transporter  23.73 
 
 		 452 aa  54.7  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3077  major facilitator transporter  19.66 
 
 		 456 aa  54.7  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.374174  normal  0.0107759 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0661  major facilitator transporter  27.95 
 
 		 418 aa  54.7  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.655156 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2627  sn-glycerol-3-phosphate transporter  23.73 
 
 		 452 aa  54.7  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.588856 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2419  sn-glycerol-3-phosphate transporter  23.73 
 
 		 452 aa  54.7  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2468  sn-glycerol-3-phosphate transporter  23.73 
 
 		 452 aa  54.7  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0862405 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2523  sn-glycerol-3-phosphate transporter  23.73 
 
 		 452 aa  54.7  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.791252 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3974  major facilitator superfamily MFS_1  26.71 
 
 		 219 aa  53.9  0.000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0247  sn-glycerol-3-phosphate transporter  23.73 
 
 		 450 aa  53.1  0.000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0274937  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69130  sn-glycerol-3-phosphate transporter  25.14 
 
 		 448 aa  53.1  0.000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03311  sn-glycerol-3-phosphate transporter  22.79 
 
 		 455 aa  52.8  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5451  sn-glycerol-3-phosphate transporter  23.48 
 
 		 449 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00923139 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3958  sn-glycerol-3-phosphate transporter  23.55 
 
 		 449 aa  53.1  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00220837  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02166  sn-glycerol-3-phosphate transporter  23.94 
 
 		 452 aa  52  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2622  sn-glycerol-3-phosphate transporter  23.94 
 
 		 452 aa  52  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1419  glycerol-3-phosphate transporter  23.94 
 
 		 452 aa  52  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.833771  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2380  sn-glycerol-3-phosphate transporter  23.94 
 
 		 452 aa  52  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0807  d-galactonate transporter  22.3 
 
 		 450 aa  52  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3474  major facilitator superfamily MFS_1  25.9 
 
 		 415 aa  52  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00256717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2537  sn-glycerol-3-phosphate transporter  23.94 
 
 		 452 aa  52  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02125  hypothetical protein  23.94 
 
 		 452 aa  52  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2392  sn-glycerol-3-phosphate transporter  23.94 
 
 		 452 aa  52  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1411  sn-glycerol-3-phosphate transporter  23.94 
 
 		 452 aa  52  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.476503 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3377  sn-glycerol-3-phosphate transporter  23.94 
 
 		 452 aa  52  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2804  sn-glycerol-3-phosphate transporter  23.06 
 
 		 450 aa  52  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.42488  normal  0.676266 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3033  major facilitator transporter  26.39 
 
 		 444 aa  52.4  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.822126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0892  major facilitator superfamily MFS_1  26.98 
 
 		 408 aa  51.6  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002677  glycerol-3-phosphate transporter  22.22 
 
 		 454 aa  50.8  0.00004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0001  sn-glycerol-3-phosphate transporter  22.41 
 
 		 452 aa  51.2  0.00004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000530916  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1701  major facilitator transporter  34.42 
 
 		 416 aa  51.2  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.3535  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02171  transport transmembrane protein  24.66 
 
 		 448 aa  50.4  0.00006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.115532  normal  0.0335477 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4153  major facilitator transporter  28.9 
 
 		 436 aa  50.4  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.25615  normal  0.56292 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1713  sn-glycerol-3-phosphate transporter  22.51 
 
 		 483 aa  50.4  0.00006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0993  2-ketogluconate/H(+) major facilitator transporter  24.38 
 
 		 440 aa  50.4  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.051326  normal  0.375991 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0666  d-galactonate transporter  25 
 
 		 447 aa  49.7  0.00009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0432694 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2236  general substrate transporter  24.77 
 
 		 449 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3153  major facilitator transporter  24.8 
 
 		 436 aa  49.3  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4105  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  27.57 
 
 		 437 aa  49.7  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0992  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  28.48 
 
 		 429 aa  49.7  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0509881  normal  0.749387 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>