294 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_2131 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_2131  major facilitator superfamily transporter  100 
 
 
423 aa  824    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.600199  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4231  major facilitator transporter  84.37 
 
 
403 aa  613  9.999999999999999e-175  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.578267  normal  0.128432 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1916  major facilitator transporter  71.28 
 
 
412 aa  480  1e-134  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.181905  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1896  major facilitator transporter  71.28 
 
 
412 aa  480  1e-134  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.482817 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1962  major facilitator superfamily transporter  71.28 
 
 
412 aa  480  1e-134  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13009  integral membrane protein  56.78 
 
 
445 aa  393  1e-108  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  7.64265e-25  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3221  major facilitator superfamily MFS_1  50.63 
 
 
405 aa  353  4e-96  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3367  major facilitator superfamily MFS_1  51.62 
 
 
396 aa  336  3.9999999999999995e-91  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0109833  normal  0.0295865 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4400  major facilitator transporter  51.74 
 
 
397 aa  293  3e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.848546  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2854  major facilitator superfamily MFS_1  45.27 
 
 
409 aa  271  2e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1331  major facilitator superfamily MFS_1  47.04 
 
 
411 aa  255  1.0000000000000001e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.255079  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0184  major facilitator superfamily MFS_1  48.79 
 
 
397 aa  228  1e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.197618 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1347  major facilitator superfamily MFS_1  45.72 
 
 
410 aa  210  3e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00703114  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2214  putative transporter  40.37 
 
 
413 aa  189  1e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1168  major facilitator superfamily MFS_1  38.42 
 
 
417 aa  168  2e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.262607 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6840  major facilitator superfamily MFS_1  37.82 
 
 
384 aa  139  1e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.806913  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1460  major facilitator superfamily MFS_1  31.04 
 
 
423 aa  133  6e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3886  major facilitator superfamily MFS_1  34.96 
 
 
437 aa  123  7e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.214665  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6302  major facilitator transporter  33.41 
 
 
424 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2858  major facilitator transporter  30.86 
 
 
423 aa  107  6e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.518401 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2995  major facilitator transporter  31.19 
 
 
425 aa  104  3e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3748  major facilitator superfamily MFS_1  32.13 
 
 
419 aa  101  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0798464  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4825  major facilitator superfamily MFS_1  32.13 
 
 
419 aa  101  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.700339  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1845  major facilitator superfamily MFS_1  29.48 
 
 
404 aa  97.8  3e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2971  major facilitator transporter  31.36 
 
 
427 aa  96.3  8e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.633747 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2336  major facilitator transporter  31.46 
 
 
427 aa  96.3  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.155458  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2054  major facilitator  23.88 
 
 
408 aa  95.9  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2950  major facilitator transporter  31.46 
 
 
427 aa  96.3  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.256248  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4401  major facilitator transporter  32.29 
 
 
461 aa  93.6  6e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2943  major facilitator transporter  30.27 
 
 
417 aa  93.2  7e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0619  hypothetical protein  30.79 
 
 
408 aa  90.5  5e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4707  MFS family transporter  29.89 
 
 
415 aa  90.1  7e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.759386  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53780  MFS family transporter  29.45 
 
 
415 aa  90.1  7e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.033353  normal  0.109422 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0628  major facilitator superfamily MFS_1  30.4 
 
 
439 aa  88.6  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.545486  normal  0.453894 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3210  major facilitator family transporter  23.46 
 
 
404 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3521  major facilitator family transporter  23.4 
 
 
406 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2965  major facilitator superfamily MFS_1  28.76 
 
 
392 aa  81.3  0.00000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3296  major facilitator family transporter  23.15 
 
 
404 aa  80.5  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3513  major facilitator family transporter  23.15 
 
 
414 aa  80.5  0.00000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3556  major facilitator family transporter  23.15 
 
 
404 aa  80.5  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1748  major facilitator family transporter  22.17 
 
 
399 aa  80.1  0.00000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.365711  normal  0.514177 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3510  major facilitator family transporter  22.96 
 
 
402 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.983677  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3500  permease  22.22 
 
 
409 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5417  major facilitator transporter  24.66 
 
 
407 aa  76.3  0.0000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.886931  normal  0.408108 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3266  major facilitator family transporter  23.15 
 
 
404 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3212  major facilitator transporter  24.29 
 
 
408 aa  73.6  0.000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.244211  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4072  major facilitator transporter  30.59 
 
 
433 aa  73.6  0.000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4589  major facilitator superfamily transporter  33.45 
 
 
431 aa  65.5  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2623  hypothetical protein  19.73 
 
 
455 aa  62  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2474  hypothetical protein  19.39 
 
 
455 aa  61.6  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6829  major facilitator superfamily MFS_1  25.12 
 
 
454 aa  62  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4307  major facilitator transporter  25.35 
 
 
430 aa  60.1  0.00000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.622363  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2718  major facilitator transporter  25.72 
 
 
430 aa  60.1  0.00000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6216  major facilitator transporter  25.13 
 
 
460 aa  59.7  0.00000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178508  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0353  major facilitator transporter  32.7 
 
 
417 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1866  major facilitator transporter  26.09 
 
 
425 aa  58.5  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.591814  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0456  major facilitator superfamily MFS_1  23.84 
 
 
415 aa  57.4  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.317164  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4384  major facilitator superfamily MFS_1  25.31 
 
 
460 aa  57  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.897653 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03865  hexuranate transporter  24.68 
 
 
433 aa  57  0.0000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4825  major facilitator transporter  27.17 
 
 
418 aa  56.6  0.0000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.327434  normal  0.0172769 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3099  putative oxalate/formate antiporter  25.61 
 
 
429 aa  55.8  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4010  major facilitator transporter  32.69 
 
 
446 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.835742  normal  0.379616 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1710  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  32.69 
 
 
446 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0437115 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2580  major facilitator transporter  22.01 
 
 
398 aa  55.8  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0171602  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5166  major facilitator transporter  25.36 
 
 
429 aa  55.1  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.733081 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69130  sn-glycerol-3-phosphate transporter  26.55 
 
 
448 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0703  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  25.56 
 
 
460 aa  54.7  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.119379  normal  0.0930092 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6033  major facilitator transporter  26.25 
 
 
467 aa  54.3  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.296948 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3400  major facilitator transporter  25.42 
 
 
430 aa  54.3  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5039  major facilitator transporter  25.99 
 
 
410 aa  53.9  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.582294  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1244  major facilitator superfamily MFS_1  21.55 
 
 
439 aa  53.5  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.477377  normal  0.0341715 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1711  nitrate/proton symporter  27.64 
 
 
436 aa  53.5  0.000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.20518  normal  0.395808 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4070  major facilitator transporter  25.96 
 
 
430 aa  53.1  0.000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3451  major facilitator transporter  25.96 
 
 
430 aa  53.1  0.000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.225334  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1773  major facilitator superfamily MFS_1  21.56 
 
 
441 aa  52.8  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2236  general substrate transporter  22.93 
 
 
449 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0577  glycerol-3-phosphate transporter  25.62 
 
 
448 aa  52.4  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3298  sn-glycerol-3-phosphate transporter  23.83 
 
 
457 aa  52.8  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5234  major facilitator transporter  25.5 
 
 
430 aa  52.4  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5749  major facilitator superfamily MFS_1  22.89 
 
 
436 aa  52.4  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5388  major facilitator transporter  27.78 
 
 
422 aa  52.4  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0135338 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0626  hypothetical protein  28.99 
 
 
411 aa  52  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0831  GlpT/PgpT/UhpT family protein  22.02 
 
 
456 aa  52  0.00002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.571145  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5472  major facilitator transporter  25.55 
 
 
437 aa  52.4  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5675  major facilitator transporter  26.78 
 
 
429 aa  51.6  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0604  hypothetical protein  28.48 
 
 
422 aa  52  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0585  hypothetical protein  28.48 
 
 
427 aa  52  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0436  regulatory protein UhpC  24.33 
 
 
434 aa  52.4  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2202  major facilitator transporter  20.17 
 
 
410 aa  52  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0642059  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3142  major facilitator transporter  24.15 
 
 
401 aa  52.4  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00277995 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1700  major facilitator superfamily MFS_1  26.03 
 
 
421 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.194128  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5978  sn-glycerol-3-phosphate transporter  25.33 
 
 
448 aa  52  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.207284  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3215  major facilitator transporter  23.53 
 
 
430 aa  52  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.274791  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1367  major facilitator superfamily MFS_1  21.19 
 
 
446 aa  51.6  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5075  major facilitator transporter  22.84 
 
 
430 aa  51.2  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2843  major facilitator superfamily MFS_1  20.69 
 
 
426 aa  50.8  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.088157  normal  0.111913 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6214  major facilitator superfamily MFS_1  22.39 
 
 
433 aa  50.8  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2475  d-galactonate transporter  24.74 
 
 
438 aa  51.2  0.00004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.812559  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0552  major facilitator transporter  29.17 
 
 
407 aa  51.2  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.929363 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1647  membrane transport protein  20.78 
 
 
428 aa  50.8  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>