163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_4589 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_4589  major facilitator superfamily transporter  100 
 
 		 431 aa  821    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3886  major facilitator superfamily MFS_1  70.17 
 
 		 437 aa  460  9.999999999999999e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.214665  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4401  major facilitator transporter  71.24 
 
 		 461 aa  416  9.999999999999999e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1460  major facilitator superfamily MFS_1  51.34 
 
 		 423 aa  397  1e-109  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2858  major facilitator transporter  54.7 
 
 		 423 aa  373  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.518401 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2995  major facilitator transporter  54.2 
 
 		 425 aa  370  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6302  major facilitator transporter  53.16 
 
 		 424 aa  353  2e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2943  major facilitator transporter  54.15 
 
 		 417 aa  351  1e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2971  major facilitator transporter  52.97 
 
 		 427 aa  350  3e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.633747 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2336  major facilitator transporter  52.63 
 
 		 427 aa  349  4e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.155458  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2950  major facilitator transporter  52.63 
 
 		 427 aa  349  4e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.256248  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3748  major facilitator superfamily MFS_1  57.88 
 
 		 419 aa  338  9.999999999999999e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0798464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4825  major facilitator superfamily MFS_1  57.88 
 
 		 419 aa  338  9.999999999999999e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.700339  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0628  major facilitator superfamily MFS_1  57.68 
 
 		 439 aa  309  5e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.545486  normal  0.453894 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4072  major facilitator transporter  57.83 
 
 		 433 aa  297  3e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0353  major facilitator transporter  50.36 
 
 		 417 aa  236  8e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6840  major facilitator superfamily MFS_1  34.7 
 
 		 384 aa  124  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.806913  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3367  major facilitator superfamily MFS_1  33.87 
 
 		 396 aa  102  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0109833  normal  0.0295865 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2214  putative transporter  34.04 
 
 		 413 aa  101  3e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2131  major facilitator superfamily transporter  31.02 
 
 		 423 aa  99  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.600199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1331  major facilitator superfamily MFS_1  34.47 
 
 		 411 aa  95.5  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.255079  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2854  major facilitator superfamily MFS_1  33.65 
 
 		 409 aa  95.5  2e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4231  major facilitator transporter  30.24 
 
 		 403 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.578267  normal  0.128432 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1916  major facilitator transporter  33.61 
 
 		 412 aa  94.7  3e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.181905  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1962  major facilitator superfamily transporter  33.61 
 
 		 412 aa  94.7  3e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1896  major facilitator transporter  33.61 
 
 		 412 aa  94.4  4e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.482817 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1347  major facilitator superfamily MFS_1  31.92 
 
 		 410 aa  90.9  5e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00703114  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1168  major facilitator superfamily MFS_1  30.65 
 
 		 417 aa  89.7  9e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.262607 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53780  MFS family transporter  28.71 
 
 		 415 aa  84.3  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.033353  normal  0.109422 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4707  MFS family transporter  28.71 
 
 		 415 aa  84  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.759386  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3221  major facilitator superfamily MFS_1  29.55 
 
 		 405 aa  77.4  0.0000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2965  major facilitator superfamily MFS_1  30.36 
 
 		 392 aa  76.3  0.000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2054  major facilitator  23 
 
 		 408 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13009  integral membrane protein  27.76 
 
 		 445 aa  75.5  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  7.64265e-25  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0626  hypothetical protein  31.39 
 
 		 411 aa  74.7  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1845  major facilitator superfamily MFS_1  25.49 
 
 		 404 aa  73.6  0.000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3212  major facilitator transporter  20.83 
 
 		 408 aa  70.5  0.00000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.244211  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0619  hypothetical protein  29.17 
 
 		 408 aa  64.7  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3210  major facilitator family transporter  18.99 
 
 		 404 aa  64.3  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3296  major facilitator family transporter  19.11 
 
 		 404 aa  63.9  0.000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3556  major facilitator family transporter  19.11 
 
 		 404 aa  63.9  0.000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3521  major facilitator family transporter  19.49 
 
 		 406 aa  63.9  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3513  major facilitator family transporter  19.11 
 
 		 414 aa  63.9  0.000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3266  major facilitator family transporter  19.35 
 
 		 404 aa  63.2  0.000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3183  major facilitator superfamily MFS_1  26.44 
 
 		 380 aa  62.4  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.15273  normal  0.971908 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3500  permease  22.01 
 
 		 409 aa  60.8  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1748  major facilitator family transporter  19.9 
 
 		 399 aa  60.1  0.00000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.365711  normal  0.514177 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4400  major facilitator transporter  29.14 
 
 		 397 aa  59.7  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.848546  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4176  major facilitator transporter  25.45 
 
 		 425 aa  58.5  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3974  major facilitator superfamily MFS_1  27.92 
 
 		 219 aa  58.5  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5417  major facilitator transporter  28.42 
 
 		 407 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.886931  normal  0.408108 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3510  major facilitator family transporter  18.94 
 
 		 402 aa  57.8  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.983677  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3877  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 464 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06530  major facilitator family transporter  30.6 
 
 		 462 aa  55.5  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0804742  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2392  major facilitator transporter  30.54 
 
 		 450 aa  53.1  0.000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0710  major facilitator superfamily MFS_1  28.1 
 
 		 404 aa  52.4  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0659  major facilitator superfamily transporter  28.76 
 
 		 428 aa  52.8  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.726769 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4501  phthalate permease family protein  27.88 
 
 		 427 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.131797  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1700  major facilitator superfamily MFS_1  26.52 
 
 		 421 aa  52.4  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.194128  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1766  major facilitator transporter  24 
 
 		 424 aa  52  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.601014  normal  0.308968 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3268  sn-glycerol-3-phosphate transporter  26.85 
 
 		 446 aa  51.6  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2392  major facilitator superfamily MFS_1  28.72 
 
 		 416 aa  50.8  0.00005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0243  major facilitator transporter  26.19 
 
 		 410 aa  50.8  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2484  major facilitator superfamily MFS_1  29.88 
 
 		 437 aa  50.1  0.00007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.371428  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3077  major facilitator transporter  24.84 
 
 		 456 aa  50.1  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.374174  normal  0.0107759 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1107  major facilitator transporter  28.25 
 
 		 440 aa  50.1  0.00007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4280  major facilitator superfamily MFS_1  27.43 
 
 		 439 aa  50.1  0.00008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4215  major facilitator superfamily MFS_1  26.47 
 
 		 438 aa  49.7  0.00009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.528706 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0534  major facilitator transporter  27.96 
 
 		 455 aa  49.7  0.00009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000100009  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0484  major facilitator family transporter  29.26 
 
 		 464 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291295 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1401  nitrate/proton symporter  26.11 
 
 		 422 aa  49.3  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3273  major facilitator transporter  25.1 
 
 		 403 aa  49.3  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.180374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0517  major facilitator transporter  29.26 
 
 		 464 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0921044 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0422  hypothetical protein  27.37 
 
 		 455 aa  47.8  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3292  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  28.19 
 
 		 430 aa  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.330767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1883  major facilitator superfamily MFS_1  24.84 
 
 		 421 aa  47.8  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0333  major facilitator transporter  25 
 
 		 439 aa  47.8  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000730576 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0995  DNA polymerase III, alpha subunit  30.73 
 
 		 471 aa  47.8  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000812271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0184  major facilitator superfamily MFS_1  32.04 
 
 		 397 aa  47.8  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.197618 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2637  major facilitator superfamily MFS_1  26.22 
 
 		 420 aa  47.8  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4719  major facilitator transporter  28.72 
 
 		 464 aa  47.8  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.210959 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6607  major facilitator transporter  26.51 
 
 		 439 aa  47.8  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.806643  normal  0.758649 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4153  major facilitator transporter  26.87 
 
 		 436 aa  47.4  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.25615  normal  0.56292 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0513  major facilitator transporter  28.72 
 
 		 464 aa  47.4  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2676  major facilitator transporter  26.51 
 
 		 418 aa  47.4  0.0006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0818  major facilitator transporter  32.07 
 
 		 429 aa  47.4  0.0006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3930  major facilitator superfamily MFS_1  35.63 
 
 		 391 aa  47  0.0007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.369822  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2315  nitrate transporter  27.96 
 
 		 418 aa  47  0.0007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3526  major facilitator superfamily MFS_1  25.9 
 
 		 421 aa  47  0.0007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0398  hypothetical protein  26.84 
 
 		 455 aa  46.6  0.0008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4020  major facilitator superfamily MFS_1  28.83 
 
 		 435 aa  46.6  0.0008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4133  major facilitator superfamily MFS_1  28.83 
 
 		 435 aa  46.6  0.0008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0326  major facilitator transporter  34.67 
 
 		 462 aa  45.8  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000804058  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0477  inner membrane transport protein YajR  27.84 
 
 		 454 aa  46.2  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6376  major facilitator transporter  26.11 
 
 		 428 aa  46.2  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.213646  normal  0.258712 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44190  putative sugar MFS transporter  30.36 
 
 		 462 aa  46.6  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0069077  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0496  inner membrane transport protein YajR  28.35 
 
 		 454 aa  46.2  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6125  major facilitator transporter  26.1 
 
 		 439 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.444392 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4026  major facilitator transporter  24.85 
 
 		 455 aa  46.2  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000155639  hitchhiker  0.000000003027 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0475  inner membrane transport protein YajR  28.35 
 
 		 454 aa  46.6  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>