236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6840 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6840  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 384 aa  700    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.806913  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1331  major facilitator superfamily MFS_1  43.67 
 
 		 411 aa  159  5e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.255079  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1460  major facilitator superfamily MFS_1  31.2 
 
 		 423 aa  154  2e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3367  major facilitator superfamily MFS_1  39.71 
 
 		 396 aa  151  2e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0109833  normal  0.0295865 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13009  integral membrane protein  37.32 
 
 		 445 aa  149  7e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  7.64265e-25  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1916  major facilitator transporter  37.54 
 
 		 412 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.181905  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1962  major facilitator superfamily transporter  37.54 
 
 		 412 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1896  major facilitator transporter  37.54 
 
 		 412 aa  144  3e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.482817 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2131  major facilitator superfamily transporter  38.44 
 
 		 423 aa  142  8e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.600199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2858  major facilitator transporter  36.46 
 
 		 423 aa  138  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.518401 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2995  major facilitator transporter  36.27 
 
 		 425 aa  138  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4231  major facilitator transporter  37.26 
 
 		 403 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.578267  normal  0.128432 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1347  major facilitator superfamily MFS_1  44.67 
 
 		 410 aa  134  3e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00703114  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6302  major facilitator transporter  36.04 
 
 		 424 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3221  major facilitator superfamily MFS_1  34.03 
 
 		 405 aa  131  2.0000000000000002e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3886  major facilitator superfamily MFS_1  36.97 
 
 		 437 aa  129  7.000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.214665  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2943  major facilitator transporter  36.6 
 
 		 417 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2971  major facilitator transporter  36.73 
 
 		 427 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.633747 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2214  putative transporter  38.29 
 
 		 413 aa  126  6e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4400  major facilitator transporter  39.06 
 
 		 397 aa  124  2e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.848546  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2336  major facilitator transporter  35.66 
 
 		 427 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.155458  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2950  major facilitator transporter  35.66 
 
 		 427 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.256248  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0184  major facilitator superfamily MFS_1  40.84 
 
 		 397 aa  119  7e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.197618 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2854  major facilitator superfamily MFS_1  34.46 
 
 		 409 aa  116  5e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3748  major facilitator superfamily MFS_1  34.83 
 
 		 419 aa  116  6e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0798464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4825  major facilitator superfamily MFS_1  34.83 
 
 		 419 aa  116  6e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.700339  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2965  major facilitator superfamily MFS_1  33.88 
 
 		 392 aa  115  1.0000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1845  major facilitator superfamily MFS_1  30.68 
 
 		 404 aa  113  6e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4401  major facilitator transporter  35.12 
 
 		 461 aa  105  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5417  major facilitator transporter  30.73 
 
 		 407 aa  104  3e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.886931  normal  0.408108 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1168  major facilitator superfamily MFS_1  36.32 
 
 		 417 aa  102  8e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.262607 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0628  major facilitator superfamily MFS_1  33 
 
 		 439 aa  102  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.545486  normal  0.453894 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53780  MFS family transporter  32.22 
 
 		 415 aa  101  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.033353  normal  0.109422 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3296  major facilitator family transporter  23.94 
 
 		 404 aa  99.4  8e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3210  major facilitator family transporter  23.88 
 
 		 404 aa  99.8  8e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3556  major facilitator family transporter  23.94 
 
 		 404 aa  99.4  8e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3513  major facilitator family transporter  23.94 
 
 		 414 aa  99.4  9e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4707  MFS family transporter  32.22 
 
 		 415 aa  99  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.759386  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1748  major facilitator family transporter  22.74 
 
 		 399 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.365711  normal  0.514177 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3183  major facilitator superfamily MFS_1  32.6 
 
 		 380 aa  96.7  5e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.15273  normal  0.971908 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3521  major facilitator family transporter  23.44 
 
 		 406 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4072  major facilitator transporter  34.57 
 
 		 433 aa  95.1  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0619  hypothetical protein  32.14 
 
 		 408 aa  94.4  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2054  major facilitator  24.3 
 
 		 408 aa  93.2  7e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3266  major facilitator family transporter  23.44 
 
 		 404 aa  93.2  8e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0626  hypothetical protein  32.55 
 
 		 411 aa  92.8  8e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3500  permease  22.28 
 
 		 409 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3510  major facilitator family transporter  21.91 
 
 		 402 aa  91.3  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.983677  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2202  major facilitator transporter  24.93 
 
 		 410 aa  86.3  7e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0642059  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4589  major facilitator superfamily transporter  35.73 
 
 		 431 aa  81.6  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3212  major facilitator transporter  24.2 
 
 		 408 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.244211  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0353  major facilitator transporter  32.74 
 
 		 417 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0892  major facilitator superfamily MFS_1  35.86 
 
 		 408 aa  73.6  0.000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2625  major facilitator superfamily MFS_1  31.98 
 
 		 398 aa  65.9  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2392  major facilitator transporter  27.24 
 
 		 450 aa  62  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1711  nitrate/proton symporter  28.99 
 
 		 436 aa  60.8  0.00000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.20518  normal  0.395808 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1401  nitrate/proton symporter  30.24 
 
 		 422 aa  58.5  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1189  major facilitator superfamily MFS_1  32.66 
 
 		 400 aa  58.2  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.051319  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6220  major facilitator superfamily MFS_1  26.86 
 
 		 437 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000198759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4428  major facilitator transporter  25.83 
 
 		 428 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00672186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3974  major facilitator superfamily MFS_1  31.71 
 
 		 219 aa  57.8  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4105  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  28.38 
 
 		 437 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4592  major facilitator transporter  26.9 
 
 		 440 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.947939 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2392  major facilitator superfamily MFS_1  34.15 
 
 		 416 aa  57.8  0.0000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3412  major facilitator transporter  30.5 
 
 		 431 aa  57.4  0.0000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.06823  hitchhiker  0.00118762 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0434  major facilitator superfamily transporter  28.68 
 
 		 435 aa  56.2  0.0000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3763  major facilitator superfamily transporter  27.7 
 
 		 417 aa  55.8  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1407  major facilitator transporter  22.51 
 
 		 452 aa  55.8  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4307  major facilitator transporter  28.66 
 
 		 430 aa  55.5  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.622363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5869  transporter, major facilitator family  23.76 
 
 		 453 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3699  major facilitator transporter  23.76 
 
 		 453 aa  54.3  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0619657 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4901  major facilitator transporter  23.76 
 
 		 453 aa  54.3  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.449685  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0425  major facilitator superfamily MFS_1  28.68 
 
 		 435 aa  54.3  0.000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4948  major facilitator transporter  23.76 
 
 		 453 aa  54.3  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.470711  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5472  major facilitator transporter  32.08 
 
 		 437 aa  54.7  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03865  hexuranate transporter  32.85 
 
 		 433 aa  54.3  0.000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2236  general substrate transporter  25.67 
 
 		 449 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5194  Permeases of the major facilitator superfamily  34.75 
 
 		 436 aa  53.9  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0067  major facilitator superfamily MFS_1  22.41 
 
 		 449 aa  54.3  0.000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0659  major facilitator superfamily transporter  29.14 
 
 		 428 aa  53.9  0.000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.726769 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04233  predicted transporter  23.76 
 
 		 453 aa  53.9  0.000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3641  major facilitator superfamily MFS_1  23.76 
 
 		 453 aa  53.9  0.000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4587  major facilitator transporter  23.76 
 
 		 453 aa  53.9  0.000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5368  major facilitator transporter  30.5 
 
 		 432 aa  53.9  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.823594 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04199  hypothetical protein  23.76 
 
 		 453 aa  53.9  0.000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1107  major facilitator transporter  28.42 
 
 		 440 aa  53.5  0.000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2515  major facilitator superfamily MFS_1  31.87 
 
 		 428 aa  53.1  0.000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.577453 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1512  nitrite transporter  30.55 
 
 		 917 aa  53.1  0.000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2718  major facilitator transporter  32.89 
 
 		 430 aa  53.1  0.000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4597  major facilitator transporter  26.62 
 
 		 420 aa  52.4  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1710  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  26.42 
 
 		 446 aa  52  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0437115 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3526  major facilitator superfamily MFS_1  27.78 
 
 		 421 aa  52  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4160  d-galactonate transporter  24.4 
 
 		 432 aa  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4218  d-galactonate transporter  24.4 
 
 		 432 aa  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4111  d-galactonate transporter  24.4 
 
 		 432 aa  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.748063  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4945  major facilitator transporter  30.06 
 
 		 440 aa  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0061  major facilitator superfamily MFS_1  22.19 
 
 		 449 aa  51.6  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4171  major facilitator superfamily MFS_1  29.25 
 
 		 415 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3215  major facilitator transporter  30.06 
 
 		 440 aa  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.846569 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0552  major facilitator transporter  32.3 
 
 		 407 aa  52  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.929363 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>