235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_2943 on replicon NC_010084
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010084  Bmul_2943  major facilitator transporter  100 
 
 
417 aa  804    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2995  major facilitator transporter  80.47 
 
 
425 aa  620  1e-177  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2858  major facilitator transporter  81.75 
 
 
423 aa  622  1e-177  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.518401 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6302  major facilitator transporter  79.48 
 
 
424 aa  615  1e-175  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2971  major facilitator transporter  80.33 
 
 
427 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.633747 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2336  major facilitator transporter  80.33 
 
 
427 aa  610  1e-173  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.155458  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2950  major facilitator transporter  80.33 
 
 
427 aa  610  1e-173  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.256248  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1460  major facilitator superfamily MFS_1  51.98 
 
 
423 aa  391  1e-107  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3886  major facilitator superfamily MFS_1  58.33 
 
 
437 aa  380  1e-104  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.214665  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3748  major facilitator superfamily MFS_1  56.86 
 
 
419 aa  328  1.0000000000000001e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0798464  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4825  major facilitator superfamily MFS_1  56.86 
 
 
419 aa  328  1.0000000000000001e-88  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.700339  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0628  major facilitator superfamily MFS_1  56.31 
 
 
439 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.545486  normal  0.453894 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4401  major facilitator transporter  56.66 
 
 
461 aa  312  7.999999999999999e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4072  major facilitator transporter  55.53 
 
 
433 aa  310  2e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4589  major facilitator superfamily transporter  55.5 
 
 
431 aa  277  3e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0353  major facilitator transporter  50.47 
 
 
417 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6840  major facilitator superfamily MFS_1  33.7 
 
 
384 aa  121  3e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.806913  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1331  major facilitator superfamily MFS_1  34.07 
 
 
411 aa  105  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.255079  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1168  major facilitator superfamily MFS_1  32.06 
 
 
417 aa  104  3e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.262607 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2214  putative transporter  35.73 
 
 
413 aa  104  3e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1347  major facilitator superfamily MFS_1  33.51 
 
 
410 aa  98.6  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00703114  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2854  major facilitator superfamily MFS_1  31.46 
 
 
409 aa  97.8  3e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4231  major facilitator transporter  30.86 
 
 
403 aa  94.4  3e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.578267  normal  0.128432 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2131  major facilitator superfamily transporter  31.36 
 
 
423 aa  85.9  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.600199  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1916  major facilitator transporter  31.75 
 
 
412 aa  85.5  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.181905  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1962  major facilitator superfamily transporter  31.75 
 
 
412 aa  85.5  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1896  major facilitator transporter  31.75 
 
 
412 aa  85.5  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.482817 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3367  major facilitator superfamily MFS_1  31.06 
 
 
396 aa  82  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0109833  normal  0.0295865 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4707  MFS family transporter  26.23 
 
 
415 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.759386  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3510  major facilitator family transporter  20.49 
 
 
402 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.983677  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3221  major facilitator superfamily MFS_1  28.33 
 
 
405 aa  77.8  0.0000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53780  MFS family transporter  26.23 
 
 
415 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.033353  normal  0.109422 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3296  major facilitator family transporter  21.76 
 
 
404 aa  77.8  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3210  major facilitator family transporter  21.83 
 
 
404 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13009  integral membrane protein  28.73 
 
 
445 aa  77.4  0.0000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  7.64265e-25  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3556  major facilitator family transporter  21.76 
 
 
404 aa  77.8  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3513  major facilitator family transporter  21.76 
 
 
414 aa  77.4  0.0000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3521  major facilitator family transporter  21.57 
 
 
406 aa  76.6  0.0000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1845  major facilitator superfamily MFS_1  25.45 
 
 
404 aa  73.6  0.000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2965  major facilitator superfamily MFS_1  26.84 
 
 
392 aa  73.6  0.000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2054  major facilitator  24.02 
 
 
408 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3500  permease  20.4 
 
 
409 aa  70.1  0.00000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3266  major facilitator family transporter  21.97 
 
 
404 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3183  major facilitator superfamily MFS_1  27.05 
 
 
380 aa  69.3  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.15273  normal  0.971908 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1748  major facilitator family transporter  19.65 
 
 
399 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.365711  normal  0.514177 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4176  major facilitator transporter  26.85 
 
 
425 aa  65.1  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5207  d-galactonate transporter  27.48 
 
 
485 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.045527 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3398  d-galactonate transporter  28.38 
 
 
458 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0331831  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0619  hypothetical protein  25.69 
 
 
408 aa  63.9  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4680  d-galactonate transporter  27.48 
 
 
485 aa  63.5  0.000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3212  major facilitator transporter  19.06 
 
 
408 aa  61.6  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.244211  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0327  D-galactonate transporter  29.28 
 
 
459 aa  62  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0626  hypothetical protein  29.8 
 
 
411 aa  62  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3044  D-galactonate transporter  29.91 
 
 
464 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5322  d-galactonate transporter  29.91 
 
 
464 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4400  major facilitator transporter  33.24 
 
 
397 aa  61.6  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.848546  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2236  general substrate transporter  25.06 
 
 
449 aa  60.5  0.00000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3974  major facilitator superfamily MFS_1  25.89 
 
 
219 aa  59.7  0.00000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3268  sn-glycerol-3-phosphate transporter  25.41 
 
 
446 aa  59.7  0.00000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5417  major facilitator transporter  25.33 
 
 
407 aa  57.4  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.886931  normal  0.408108 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3410  major facilitator superfamily MFS_1  30.67 
 
 
393 aa  57.4  0.0000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.357174  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2202  major facilitator transporter  21.64 
 
 
410 aa  57.4  0.0000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0642059  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4501  phthalate permease family protein  22.93 
 
 
427 aa  57  0.0000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.131797  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5052  major facilitator transporter  28.5 
 
 
423 aa  56.6  0.0000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.344485  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5808  major facilitator transporter  28.5 
 
 
423 aa  56.6  0.0000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.499125  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02634  predicted D-glucarate transporter  25.21 
 
 
450 aa  56.2  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02171  transport transmembrane protein  24.68 
 
 
448 aa  55.8  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.115532  normal  0.0335477 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0923  d-galactonate transporter  25.21 
 
 
450 aa  56.2  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3093  glucarate permease  25.21 
 
 
450 aa  56.2  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.110237  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02596  hypothetical protein  25.21 
 
 
450 aa  56.2  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2927  glucarate permease  25.21 
 
 
450 aa  56.2  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1161  major facilitator transporter  23.78 
 
 
435 aa  56.2  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.531017  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2933  glucarate permease  25.21 
 
 
450 aa  56.2  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1710  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  23.54 
 
 
446 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0437115 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4010  major facilitator transporter  23.54 
 
 
446 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.835742  normal  0.379616 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0899  d-galactonate transporter  24.79 
 
 
450 aa  54.7  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4428  major facilitator transporter  23.25 
 
 
428 aa  54.7  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00672186  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0305  sn-glycerol-3-phosphate transporter  23.84 
 
 
449 aa  54.3  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.886958 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4050  glucarate permease  25.1 
 
 
450 aa  54.3  0.000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0894  major facilitator superfamily MFS_1  25.6 
 
 
403 aa  53.9  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1713  sn-glycerol-3-phosphate transporter  23.08 
 
 
483 aa  53.9  0.000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2054  major facilitator superfamily MFS_1  27.03 
 
 
445 aa  53.9  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00125626 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3077  major facilitator transporter  19.91 
 
 
456 aa  53.5  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.374174  normal  0.0107759 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0818  major facilitator transporter  33.91 
 
 
429 aa  53.5  0.000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4945  major facilitator transporter  22.61 
 
 
440 aa  53.5  0.000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69130  sn-glycerol-3-phosphate transporter  23.56 
 
 
448 aa  53.5  0.000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3215  major facilitator transporter  22.61 
 
 
440 aa  53.5  0.000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.846569 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3298  sn-glycerol-3-phosphate transporter  20.25 
 
 
457 aa  53.1  0.000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1803  major facilitator superfamily D-galactonate transporter  26.48 
 
 
450 aa  53.1  0.000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0303385  hitchhiker  0.00231881 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0184  major facilitator superfamily MFS_1  32.3 
 
 
397 aa  52.8  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.197618 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5238  glycerol-3-phosphate transporter  23.55 
 
 
449 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4863  d-galactonate transporter  26.89 
 
 
450 aa  52.4  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0267254 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5368  major facilitator transporter  25.16 
 
 
432 aa  51.6  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.823594 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3242  d-galactonate transporter  23.01 
 
 
451 aa  52  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.141261 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2516  major facilitator transporter  26.17 
 
 
354 aa  52.4  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.128628  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2419  sn-glycerol-3-phosphate transporter  22.03 
 
 
452 aa  51.2  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3084  glucarate permease  24.45 
 
 
440 aa  51.2  0.00003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.567935  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4946  d-galactonate transporter  30.21 
 
 
435 aa  51.2  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.899086  normal  0.0491095 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2468  sn-glycerol-3-phosphate transporter  22.03 
 
 
452 aa  51.2  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0862405 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2627  sn-glycerol-3-phosphate transporter  22.03 
 
 
452 aa  51.2  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.588856 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>