More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_3212 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010184  BcerKBAB4_3212  major facilitator transporter  100 
 
 
408 aa  810    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.244211  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1748  major facilitator family transporter  71.03 
 
 
399 aa  563  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.365711  normal  0.514177 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3500  permease  71.03 
 
 
409 aa  557  1e-157  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3510  major facilitator family transporter  68.56 
 
 
402 aa  551  1e-156  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.983677  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3296  major facilitator family transporter  69.25 
 
 
404 aa  552  1e-156  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3556  major facilitator family transporter  69.25 
 
 
404 aa  552  1e-156  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3513  major facilitator family transporter  69.25 
 
 
414 aa  552  1e-156  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3266  major facilitator family transporter  68.75 
 
 
404 aa  545  1e-154  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3210  major facilitator family transporter  69 
 
 
404 aa  547  1e-154  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3521  major facilitator family transporter  68.75 
 
 
406 aa  539  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2202  major facilitator transporter  58.31 
 
 
410 aa  430  1e-119  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0642059  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2054  major facilitator  46.29 
 
 
408 aa  340  4e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0619  hypothetical protein  32.27 
 
 
408 aa  209  8e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5417  major facilitator transporter  33.68 
 
 
407 aa  205  9e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.886931  normal  0.408108 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0626  hypothetical protein  32.91 
 
 
411 aa  203  5e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1845  major facilitator superfamily MFS_1  31.2 
 
 
404 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53780  MFS family transporter  29.97 
 
 
415 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.033353  normal  0.109422 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4707  MFS family transporter  29.4 
 
 
415 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.759386  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2236  general substrate transporter  24.82 
 
 
449 aa  105  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2965  major facilitator superfamily MFS_1  26.87 
 
 
392 aa  101  2e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1710  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  23.75 
 
 
446 aa  100  6e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0437115 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4010  major facilitator transporter  23.75 
 
 
446 aa  100  6e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.835742  normal  0.379616 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3183  major facilitator superfamily MFS_1  25.94 
 
 
380 aa  98.6  2e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.15273  normal  0.971908 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0892  major facilitator superfamily MFS_1  24.11 
 
 
408 aa  90.1  7e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1306  major facilitator transporter  23.77 
 
 
454 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.599836 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3829  D-galactonate transporter  23.26 
 
 
454 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4539  d-galactonate transporter  23.26 
 
 
454 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.327531  normal  0.0349681 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5765  d-galactonate transporter  23.26 
 
 
454 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4215  major facilitator superfamily MFS_1  23.51 
 
 
438 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.528706 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3988  major facilitator superfamily MFS_1  21.69 
 
 
442 aa  83.2  0.000000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.74321  normal  0.0290381 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51310  D-galactonate transporter  24.06 
 
 
434 aa  82.4  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4121  major facilitator transporter  23.45 
 
 
455 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.801811 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3221  major facilitator superfamily MFS_1  23.4 
 
 
405 aa  81.6  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1094  d-galactonate transporter  23.18 
 
 
430 aa  81.3  0.00000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0012  d-galactonate transporter  23.32 
 
 
430 aa  80.9  0.00000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03574  D-galactonate transporter  23.51 
 
 
430 aa  80.9  0.00000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0012  d-galactonate transporter  23.51 
 
 
430 aa  80.9  0.00000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4199  d-galactonate transporter  23.51 
 
 
445 aa  80.9  0.00000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3367  major facilitator superfamily MFS_1  26.99 
 
 
396 aa  80.9  0.00000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0109833  normal  0.0295865 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03518  hypothetical protein  23.51 
 
 
430 aa  80.9  0.00000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3903  d-galactonate transporter  23.51 
 
 
445 aa  80.9  0.00000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4055  d-galactonate transporter  23.51 
 
 
430 aa  80.9  0.00000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1460  major facilitator superfamily MFS_1  22.31 
 
 
423 aa  79  0.0000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3397  D-galactonate transporter  24.59 
 
 
446 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2475  d-galactonate transporter  22.25 
 
 
438 aa  77.8  0.0000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.812559  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4949  major facilitator transporter  22.67 
 
 
428 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6079  major facilitator transporter  22.67 
 
 
413 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6376  major facilitator transporter  22.55 
 
 
428 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.213646  normal  0.258712 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3211  major facilitator transporter  22.67 
 
 
428 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4160  d-galactonate transporter  22.86 
 
 
432 aa  77.4  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4111  d-galactonate transporter  22.86 
 
 
432 aa  77.4  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.748063  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4218  d-galactonate transporter  22.86 
 
 
432 aa  77.4  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2180  MFS transporter, phthalate permease family  23.4 
 
 
478 aa  77  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.256774  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4122  D-galactonate transporter  23.34 
 
 
436 aa  77  0.0000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0101407  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0027  d-galactonate transporter  22.92 
 
 
429 aa  77  0.0000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.104375  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1990  D-galactonate transporter  23.3 
 
 
436 aa  76.6  0.0000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0023647  normal  0.0470104 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2812  major facilitator superfamily MFS_1  23.06 
 
 
427 aa  76.6  0.0000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0852  major facilitator superfamily MFS_1  21.28 
 
 
438 aa  76.6  0.0000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.207548 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4121  major facilitator transporter  23.08 
 
 
463 aa  76.3  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.503182 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3099  d-galactonate transporter  24.12 
 
 
454 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3600  d-galactonate transporter  24.12 
 
 
454 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.442053  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5174  major facilitator transporter  23.56 
 
 
469 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4772  major facilitator transporter  22.81 
 
 
463 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3395  major facilitator transporter  22.81 
 
 
463 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5194  major facilitator transporter  23.08 
 
 
479 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3336  major facilitator transporter  23.08 
 
 
464 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2316  d-galactonate transporter  23.1 
 
 
454 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.601207  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4176  major facilitator transporter  25.2 
 
 
425 aa  73.9  0.000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3242  d-galactonate transporter  23.2 
 
 
451 aa  72.8  0.00000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.141261 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2815  d-galactonate transporter  22.86 
 
 
453 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.362765  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0899  d-galactonate transporter  21.71 
 
 
450 aa  72  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0829  D-galactonate transporter  21.07 
 
 
468 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.017326  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3121  glucarate permease  22.63 
 
 
452 aa  71.6  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.830611 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0045  d-galactonate transporter  22.07 
 
 
430 aa  72  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.249209 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6958  major facilitator superfamily MFS_1  22.86 
 
 
427 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.300756  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3168  glucarate permease  22.63 
 
 
452 aa  71.6  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.101605 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3103  glucarate permease  22.63 
 
 
452 aa  71.6  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3184  glucarate permease  22.63 
 
 
452 aa  71.6  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.513823 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3283  glucarate permease  22.63 
 
 
452 aa  71.6  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.129198  normal  0.747059 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02634  predicted D-glucarate transporter  21.71 
 
 
450 aa  71.2  0.00000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3093  glucarate permease  21.71 
 
 
450 aa  71.2  0.00000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.110237  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2927  glucarate permease  21.71 
 
 
450 aa  71.2  0.00000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2776  major facilitator transporter  23.3 
 
 
461 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3398  d-galactonate transporter  22.77 
 
 
458 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0331831  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02596  hypothetical protein  21.71 
 
 
450 aa  71.2  0.00000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0923  d-galactonate transporter  21.71 
 
 
450 aa  71.2  0.00000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2933  glucarate permease  21.71 
 
 
450 aa  71.2  0.00000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4084  probable glucarate transporter  23.87 
 
 
436 aa  70.9  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.463281  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0217  d-galactonate transporter  23.98 
 
 
446 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2625  major facilitator superfamily MFS_1  24.93 
 
 
398 aa  70.9  0.00000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05240  D-galactonate transporter  22.19 
 
 
463 aa  70.5  0.00000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3978  putative glucarate transporter  23.87 
 
 
436 aa  70.5  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.776069 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4023  glucarate transporter  23.87 
 
 
436 aa  70.5  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.957782  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3916  probable glucarate transporter  23.87 
 
 
436 aa  70.5  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0225  d-galactonate transporter  23.71 
 
 
446 aa  70.5  0.00000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000305819 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3084  glucarate permease  21.91 
 
 
440 aa  70.1  0.00000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.567935  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2806  major facilitator superfamily MFS_1  21.25 
 
 
434 aa  70.1  0.00000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4050  glucarate permease  21.71 
 
 
450 aa  70.1  0.00000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4592  major facilitator transporter  23.02 
 
 
440 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.947939 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6302  major facilitator transporter  21.39 
 
 
424 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>