257 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3221 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3221  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 405 aa  780    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2131  major facilitator superfamily transporter  50.88 
 
 		 423 aa  340  2.9999999999999998e-92  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.600199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4231  major facilitator transporter  48.22 
 
 		 403 aa  325  7e-88  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.578267  normal  0.128432 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2854  major facilitator superfamily MFS_1  52.05 
 
 		 409 aa  315  9.999999999999999e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3367  major facilitator superfamily MFS_1  49.49 
 
 		 396 aa  306  3e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0109833  normal  0.0295865 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1916  major facilitator transporter  47.75 
 
 		 412 aa  297  2e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.181905  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1962  major facilitator superfamily transporter  47.75 
 
 		 412 aa  297  2e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1896  major facilitator transporter  47.75 
 
 		 412 aa  297  2e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.482817 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13009  integral membrane protein  45.69 
 
 		 445 aa  293  4e-78  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  7.64265e-25  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4400  major facilitator transporter  48.36 
 
 		 397 aa  279  5e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.848546  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1331  major facilitator superfamily MFS_1  42.68 
 
 		 411 aa  225  9e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.255079  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0184  major facilitator superfamily MFS_1  46.05 
 
 		 397 aa  223  7e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.197618 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1347  major facilitator superfamily MFS_1  40.21 
 
 		 410 aa  171  3e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00703114  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2214  putative transporter  39.14 
 
 		 413 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1168  major facilitator superfamily MFS_1  33.91 
 
 		 417 aa  146  7.0000000000000006e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.262607 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6840  major facilitator superfamily MFS_1  34.03 
 
 		 384 aa  118  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.806913  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1460  major facilitator superfamily MFS_1  26.7 
 
 		 423 aa  110  5e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1845  major facilitator superfamily MFS_1  31.13 
 
 		 404 aa  92  2e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3886  major facilitator superfamily MFS_1  29.76 
 
 		 437 aa  89  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.214665  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3210  major facilitator family transporter  23.21 
 
 		 404 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2054  major facilitator  25.38 
 
 		 408 aa  83.2  0.000000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3510  major facilitator family transporter  23.57 
 
 		 402 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.983677  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3513  major facilitator family transporter  23.21 
 
 		 414 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3296  major facilitator family transporter  23.21 
 
 		 404 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4401  major facilitator transporter  27.78 
 
 		 461 aa  81.6  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3556  major facilitator family transporter  23.21 
 
 		 404 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3212  major facilitator transporter  23.77 
 
 		 408 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.244211  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3521  major facilitator family transporter  23.46 
 
 		 406 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4825  major facilitator superfamily MFS_1  28.82 
 
 		 419 aa  79  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.700339  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3748  major facilitator superfamily MFS_1  28.82 
 
 		 419 aa  79  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0798464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53780  MFS family transporter  29.74 
 
 		 415 aa  78.2  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.033353  normal  0.109422 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2943  major facilitator transporter  28.06 
 
 		 417 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4707  MFS family transporter  30.77 
 
 		 415 aa  77  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.759386  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0628  major facilitator superfamily MFS_1  30.25 
 
 		 439 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.545486  normal  0.453894 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6302  major facilitator transporter  25.66 
 
 		 424 aa  76.3  0.0000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3266  major facilitator family transporter  22.72 
 
 		 404 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5417  major facilitator transporter  27.24 
 
 		 407 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.886931  normal  0.408108 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1748  major facilitator family transporter  24.83 
 
 		 399 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.365711  normal  0.514177 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2858  major facilitator transporter  26.33 
 
 		 423 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.518401 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2971  major facilitator transporter  27.03 
 
 		 427 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.633747 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2336  major facilitator transporter  27.03 
 
 		 427 aa  73.6  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.155458  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2995  major facilitator transporter  25.86 
 
 		 425 aa  73.2  0.000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2950  major facilitator transporter  27.03 
 
 		 427 aa  73.6  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.256248  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3500  permease  22.86 
 
 		 409 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0619  hypothetical protein  28.21 
 
 		 408 aa  72.4  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2965  major facilitator superfamily MFS_1  26.02 
 
 		 392 aa  71.6  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4072  major facilitator transporter  30.58 
 
 		 433 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0626  hypothetical protein  28.38 
 
 		 411 aa  57.8  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0577  glycerol-3-phosphate transporter  24.52 
 
 		 448 aa  54.7  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6607  major facilitator transporter  27.62 
 
 		 439 aa  54.3  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.806643  normal  0.758649 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1982  major facilitator superfamily MFS_1  27.95 
 
 		 434 aa  53.5  0.000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.130406  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1432  major facilitator superfamily MFS_1  26.93 
 
 		 390 aa  53.5  0.000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5388  major facilitator transporter  31.87 
 
 		 422 aa  53.5  0.000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0135338 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5760  major facilitator transporter  27.35 
 
 		 439 aa  52.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6125  major facilitator transporter  27.35 
 
 		 439 aa  52.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.444392 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4589  major facilitator superfamily transporter  32.24 
 
 		 431 aa  52.8  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3862  major facilitator transporter  27.57 
 
 		 453 aa  52.8  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7622  major facilitator transporter  27.42 
 
 		 439 aa  51.6  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.388014  normal  0.362364 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1539  probable glucarate transporter  23.4 
 
 		 453 aa  51.6  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.21091  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0353  major facilitator transporter  42.06 
 
 		 417 aa  52  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0966  major facilitator transporter  27.54 
 
 		 412 aa  51.2  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.582345  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1069  nitrite transporter  31.07 
 
 		 502 aa  51.2  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1512  nitrite transporter  26.4 
 
 		 917 aa  51.2  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0387  major facilitator transporter  27.86 
 
 		 467 aa  50.8  0.00004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.285838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1511  nitrite transporter  29.95 
 
 		 488 aa  50.8  0.00004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1562  major facilitator transporter  27.52 
 
 		 450 aa  51.2  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.384388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1711  nitrate/proton symporter  29.13 
 
 		 436 aa  51.2  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.20518  normal  0.395808 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1766  major facilitator transporter  27.54 
 
 		 424 aa  50.8  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.601014  normal  0.308968 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3183  major facilitator superfamily MFS_1  32.62 
 
 		 380 aa  50.8  0.00005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.15273  normal  0.971908 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2236  general substrate transporter  23.31 
 
 		 449 aa  50.4  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6596  d-galactonate transporter  26.82 
 
 		 457 aa  50.4  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.143418  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1633  major facilitator superfamily MFS_1  32.41 
 
 		 503 aa  50.1  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0865478  normal  0.084905 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1989  major facilitator superfamily MFS_1  27.87 
 
 		 437 aa  50.4  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.180864  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6242  major facilitator superfamily MFS_1  25.66 
 
 		 439 aa  50.4  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4450  d-galactonate transporter  30.38 
 
 		 450 aa  50.1  0.00007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.821723 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4584  d-galactonate transporter  30.38 
 
 		 450 aa  50.1  0.00007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.960578  normal  0.440179 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03877  Nitrate transporter  29.07 
 
 		 488 aa  50.1  0.00007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4592  major facilitator transporter  25.08 
 
 		 440 aa  49.7  0.00008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.947939 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2202  major facilitator transporter  22.41 
 
 		 410 aa  50.1  0.00008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0642059  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3077  major facilitator transporter  22.09 
 
 		 456 aa  50.1  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.374174  normal  0.0107759 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3714  nitrate transporter  26.13 
 
 		 491 aa  49.7  0.00008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4009  major facilitator transporter  26.19 
 
 		 436 aa  49.7  0.00009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.636189  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1710  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  25.68 
 
 		 446 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0437115 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0300  nitrite extrusion protein  26.62 
 
 		 895 aa  49.7  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.129473  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3398  d-galactonate transporter  27.34 
 
 		 458 aa  49.3  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0331831  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4311  major facilitator transporter  27.62 
 
 		 437 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.516977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3565  major facilitator transporter  23.18 
 
 		 429 aa  48.9  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2623  hypothetical protein  20 
 
 		 455 aa  48.9  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2474  hypothetical protein  20 
 
 		 455 aa  48.9  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2231  major facilitator superfamily MFS_1  26.72 
 
 		 443 aa  48.9  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.495487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4597  major facilitator transporter  26.96 
 
 		 420 aa  48.5  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4010  major facilitator transporter  29.19 
 
 		 446 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.835742  normal  0.379616 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1344  major facilitator transporter  27.44 
 
 		 439 aa  48.5  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1022  nitrite transporter  25.36 
 
 		 489 aa  48.5  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2890  nitrite transporter  26.62 
 
 		 912 aa  48.5  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0107  major facilitator superfamily MFS_1  26.69 
 
 		 390 aa  48.9  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.781532  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3642  nitrite transporter  32.32 
 
 		 534 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.289797  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6376  major facilitator transporter  27.4 
 
 		 428 aa  47.8  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.213646  normal  0.258712 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61560  putative MFS transporter  26.58 
 
 		 457 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.167083 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5303  MFS family transporter  26.58 
 
 		 457 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>