More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_4009 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009668  Oant_4009  major facilitator transporter  100 
 
 		 436 aa  863    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.636189  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0668  major facilitator superfamily MFS_1  46.38 
 
 		 423 aa  349  6e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.202105  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4010  major facilitator transporter  25.75 
 
 		 446 aa  87  5e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.835742  normal  0.379616 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1710  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  25.25 
 
 		 446 aa  86.7  7e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0437115 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2236  general substrate transporter  24.69 
 
 		 449 aa  80.9  0.00000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1938  major facilitator transporter  22.95 
 
 		 443 aa  77  0.0000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.829808  normal  0.641646 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4945  major facilitator transporter  22.43 
 
 		 440 aa  77.4  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3215  major facilitator transporter  22.43 
 
 		 440 aa  77.4  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.846569 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2315  nitrate transporter  27.03 
 
 		 418 aa  76.3  0.0000000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5472  major facilitator transporter  26.69 
 
 		 437 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4428  major facilitator transporter  23.95 
 
 		 428 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00672186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4725  major facilitator superfamily MFS_1  23.6 
 
 		 430 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.456281  normal  0.916146 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3699  major facilitator transporter  22.74 
 
 		 453 aa  73.2  0.000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0619657 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5869  transporter, major facilitator family  22.74 
 
 		 453 aa  73.6  0.000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4948  major facilitator transporter  22.74 
 
 		 453 aa  73.2  0.000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.470711  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4901  major facilitator transporter  22.74 
 
 		 453 aa  73.2  0.000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.449685  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04233  predicted transporter  22.74 
 
 		 453 aa  72.8  0.00000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3641  major facilitator superfamily MFS_1  22.74 
 
 		 453 aa  72.8  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1290  major facilitator superfamily MFS_1  24.73 
 
 		 441 aa  72.8  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04199  hypothetical protein  22.74 
 
 		 453 aa  72.8  0.00000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4587  major facilitator transporter  22.74 
 
 		 453 aa  72.8  0.00000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4705  major facilitator superfamily MFS_1  24.03 
 
 		 434 aa  72.4  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0828035 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2103  major facilitator transporter  22.7 
 
 		 449 aa  72  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.552492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3988  major facilitator superfamily MFS_1  23.62 
 
 		 442 aa  72  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.74321  normal  0.0290381 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2246  major facilitator superfamily MFS_1  26.04 
 
 		 427 aa  71.6  0.00000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2215  major facilitator superfamily MFS_1  25.2 
 
 		 413 aa  71.6  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0909109  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2637  major facilitator superfamily MFS_1  20.88 
 
 		 420 aa  70.9  0.00000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3077  major facilitator transporter  21.34 
 
 		 456 aa  70.1  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.374174  normal  0.0107759 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2435  major facilitator transporter  25 
 
 		 431 aa  69.7  0.00000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1139  major facilitator superfamily MFS_1  26.68 
 
 		 395 aa  69.3  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.388877  normal  0.0189112 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3273  major facilitator transporter  26.72 
 
 		 403 aa  69.3  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.180374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6958  major facilitator superfamily MFS_1  25.06 
 
 		 427 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.300756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0067  major facilitator superfamily MFS_1  23.43 
 
 		 449 aa  68.6  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1107  major facilitator transporter  20.71 
 
 		 440 aa  68.9  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2012  major facilitator superfamily MFS_1  24.71 
 
 		 413 aa  67.8  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000197881 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2210  major facilitator transporter  27.14 
 
 		 455 aa  67.4  0.0000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.937907 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0061  major facilitator superfamily MFS_1  24.12 
 
 		 449 aa  67.4  0.0000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4716  major facilitator transporter  26.33 
 
 		 423 aa  67  0.0000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.296103  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1444  major facilitator transporter  24.16 
 
 		 416 aa  66.2  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2392  major facilitator transporter  26.18 
 
 		 450 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2240  putative permease  22.25 
 
 		 411 aa  65.9  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5368  major facilitator transporter  22.33 
 
 		 432 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.823594 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1672  major facilitator transporter  23.15 
 
 		 389 aa  65.5  0.000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000335684  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1905  major facilitator transporter  25.42 
 
 		 426 aa  65.9  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3412  major facilitator transporter  25.23 
 
 		 431 aa  65.5  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.06823  hitchhiker  0.00118762 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1407  major facilitator transporter  22.47 
 
 		 452 aa  65.1  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4575  putative transport transmembrane protein  27.45 
 
 		 414 aa  64.7  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0903  major facilitator transporter  24.85 
 
 		 440 aa  64.3  0.000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0333563  normal  0.084831 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2651  major facilitator family transporter  23.38 
 
 		 447 aa  64.3  0.000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1328  major facilitator superfamily MFS_1  26.96 
 
 		 451 aa  64.3  0.000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.567921 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1965  major facilitator transporter  24.66 
 
 		 459 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.683879  normal  0.501277 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2656  major facilitator superfamily MFS_1  21.52 
 
 		 417 aa  63.9  0.000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2916  major facilitator transporter  24.94 
 
 		 416 aa  63.9  0.000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0195936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3444  major facilitator transporter  23.21 
 
 		 417 aa  63.2  0.000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.303524  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0659  major facilitator superfamily transporter  21.79 
 
 		 428 aa  63.2  0.000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.726769 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0353  major facilitator family transporter  23.14 
 
 		 432 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1785  major facilitator transporter  23.08 
 
 		 422 aa  62.4  0.00000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00132489  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2054  major facilitator superfamily MFS_1  23.68 
 
 		 445 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00125626 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0383  major facilitator transporter  25.19 
 
 		 457 aa  62  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.754825 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0703  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  23.51 
 
 		 460 aa  62  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.119379  normal  0.0930092 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2817  major facilitator transporter  23.44 
 
 		 426 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.850013  normal  0.439964 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4949  major facilitator transporter  21.74 
 
 		 428 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2645  major facilitator transporter  23.47 
 
 		 466 aa  61.6  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3211  major facilitator transporter  21.74 
 
 		 428 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0666  d-galactonate transporter  23.37 
 
 		 447 aa  62  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0432694 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6216  major facilitator transporter  22.85 
 
 		 460 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5765  d-galactonate transporter  26.32 
 
 		 454 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4384  major facilitator superfamily MFS_1  21.69 
 
 		 460 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.897653 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2674  major facilitator transporter  23.5 
 
 		 426 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2676  major facilitator transporter  25.9 
 
 		 418 aa  61.6  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1726  major facilitator transporter  22.73 
 
 		 421 aa  61.2  0.00000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2580  major facilitator transporter  25.95 
 
 		 398 aa  61.2  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0171602  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3154  major facilitator transporter  23.45 
 
 		 447 aa  61.2  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2475  d-galactonate transporter  24.81 
 
 		 438 aa  60.8  0.00000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.812559  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0434  major facilitator superfamily transporter  21.68 
 
 		 435 aa  60.8  0.00000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0425  major facilitator superfamily MFS_1  21.39 
 
 		 435 aa  61.2  0.00000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2852  major facilitator transporter  22.99 
 
 		 438 aa  60.8  0.00000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.437146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4585  major facilitator transporter  22.65 
 
 		 429 aa  60.5  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.282305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2945  major facilitator transporter  22.73 
 
 		 436 aa  60.5  0.00000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.11349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3763  major facilitator superfamily transporter  20.65 
 
 		 417 aa  60.5  0.00000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1926  major facilitator transporter  25.48 
 
 		 441 aa  60.5  0.00000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.145333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6376  major facilitator transporter  21.84 
 
 		 428 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.213646  normal  0.258712 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4105  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  25 
 
 		 437 aa  60.1  0.00000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0203  major facilitator transporter  23.15 
 
 		 432 aa  60.1  0.00000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1700  major facilitator superfamily MFS_1  24.37 
 
 		 421 aa  60.1  0.00000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.194128  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5303  major facilitator transporter  25.68 
 
 		 436 aa  59.7  0.00000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0992  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  21.86 
 
 		 429 aa  60.1  0.00000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0509881  normal  0.749387 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13750  nitrite extrusion protein 1  21.67 
 
 		 431 aa  60.1  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.418786 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5194  Permeases of the major facilitator superfamily  25.64 
 
 		 436 aa  59.3  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2463  multidrug resistance protein, putative  22.03 
 
 		 398 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.190584  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0456  major facilitator superfamily MFS_1  25.79 
 
 		 415 aa  59.7  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.317164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2158  major facilitator transporter  23.13 
 
 		 447 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6357  major facilitator transporter  23.36 
 
 		 441 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.673805  normal  0.425262 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4501  phthalate permease family protein  22.77 
 
 		 427 aa  59.7  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.131797  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1306  major facilitator transporter  26.04 
 
 		 454 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.599836 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2056  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  24.19 
 
 		 448 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1232  nitrite extrusion protein 1  21.67 
 
 		 431 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3292  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  26.71 
 
 		 430 aa  59.3  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.330767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3829  D-galactonate transporter  25.66 
 
 		 454 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2097  major facilitator transporter  24.24 
 
 		 459 aa  59.3  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.201063 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>