More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1168 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_1168  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 417 aa  781    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.262607 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2214  putative transporter  52.86 
 
 		 413 aa  263  4e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1331  major facilitator superfamily MFS_1  42.46 
 
 		 411 aa  204  2e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.255079  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2131  major facilitator superfamily transporter  38.21 
 
 		 423 aa  201  3e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.600199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4231  major facilitator transporter  37.38 
 
 		 403 aa  199  6e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.578267  normal  0.128432 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1896  major facilitator transporter  37.43 
 
 		 412 aa  199  7.999999999999999e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.482817 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1916  major facilitator transporter  37.43 
 
 		 412 aa  199  9e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.181905  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1962  major facilitator superfamily transporter  37.43 
 
 		 412 aa  199  9e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3367  major facilitator superfamily MFS_1  37.81 
 
 		 396 aa  192  1e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0109833  normal  0.0295865 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13009  integral membrane protein  37.44 
 
 		 445 aa  191  2e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  7.64265e-25  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3221  major facilitator superfamily MFS_1  34.54 
 
 		 405 aa  185  1.0000000000000001e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4400  major facilitator transporter  38.65 
 
 		 397 aa  176  9e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.848546  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2854  major facilitator superfamily MFS_1  35.14 
 
 		 409 aa  156  5.0000000000000005e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1460  major facilitator superfamily MFS_1  29.29 
 
 		 423 aa  140  3.9999999999999997e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1347  major facilitator superfamily MFS_1  37.78 
 
 		 410 aa  139  1e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00703114  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0184  major facilitator superfamily MFS_1  37.56 
 
 		 397 aa  134  1.9999999999999998e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.197618 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6840  major facilitator superfamily MFS_1  35.53 
 
 		 384 aa  117  3e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.806913  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6302  major facilitator transporter  30.12 
 
 		 424 aa  117  5e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2995  major facilitator transporter  31.44 
 
 		 425 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2858  major facilitator transporter  31.62 
 
 		 423 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.518401 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2336  major facilitator transporter  31.97 
 
 		 427 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.155458  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2950  major facilitator transporter  31.97 
 
 		 427 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.256248  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2971  major facilitator transporter  31.71 
 
 		 427 aa  107  5e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.633747 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3886  major facilitator superfamily MFS_1  32.5 
 
 		 437 aa  105  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.214665  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0628  major facilitator superfamily MFS_1  31.9 
 
 		 439 aa  103  8e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.545486  normal  0.453894 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4072  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 433 aa  87.8  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3212  major facilitator transporter  23.67 
 
 		 408 aa  87.4  5e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.244211  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4401  major facilitator transporter  32.52 
 
 		 461 aa  84.3  0.000000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53780  MFS family transporter  29.75 
 
 		 415 aa  83.2  0.000000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.033353  normal  0.109422 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4707  MFS family transporter  29.74 
 
 		 415 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.759386  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2943  major facilitator transporter  29.9 
 
 		 417 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2054  major facilitator  22.74 
 
 		 408 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3510  major facilitator family transporter  23.68 
 
 		 402 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.983677  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4825  major facilitator superfamily MFS_1  29.1 
 
 		 419 aa  79.3  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.700339  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3748  major facilitator superfamily MFS_1  29.1 
 
 		 419 aa  79.3  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0798464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0619  hypothetical protein  26.3 
 
 		 408 aa  78.6  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1845  major facilitator superfamily MFS_1  26.71 
 
 		 404 aa  77.4  0.0000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3210  major facilitator family transporter  22.49 
 
 		 404 aa  77.4  0.0000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3521  major facilitator family transporter  24.14 
 
 		 406 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3513  major facilitator family transporter  22.86 
 
 		 414 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3296  major facilitator family transporter  22.49 
 
 		 404 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3556  major facilitator family transporter  22.49 
 
 		 404 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3500  permease  22.41 
 
 		 409 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3266  major facilitator family transporter  22.62 
 
 		 404 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1748  major facilitator family transporter  21.56 
 
 		 399 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.365711  normal  0.514177 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2474  hypothetical protein  22.89 
 
 		 455 aa  67.8  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1655  membrane transport protein  25 
 
 		 428 aa  66.2  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.809863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1647  membrane transport protein  23.08 
 
 		 428 aa  65.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2623  hypothetical protein  22.54 
 
 		 455 aa  65.5  0.000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1793  membrane transport protein  25 
 
 		 428 aa  65.1  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.626262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0993  2-ketogluconate/H(+) major facilitator transporter  34.45 
 
 		 440 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.051326  normal  0.375991 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1714  membrane transport protein  25 
 
 		 428 aa  65.1  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1627  membrane transport protein  25 
 
 		 428 aa  65.1  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3099  d-galactonate transporter  24.1 
 
 		 454 aa  63.9  0.000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3600  d-galactonate transporter  24.1 
 
 		 454 aa  63.9  0.000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.442053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0626  hypothetical protein  35.65 
 
 		 411 aa  62.4  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6596  d-galactonate transporter  28.34 
 
 		 457 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.143418  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5207  d-galactonate transporter  28.98 
 
 		 485 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.045527 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3829  D-galactonate transporter  28.08 
 
 		 454 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4539  d-galactonate transporter  28.08 
 
 		 454 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.327531  normal  0.0349681 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3569  d-galactonate transporter  26.52 
 
 		 444 aa  60.5  0.00000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.576776 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2316  d-galactonate transporter  23.76 
 
 		 454 aa  60.5  0.00000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.601207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0353  major facilitator transporter  41.38 
 
 		 417 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02992  predicted (D)-galactarate transporter  25.81 
 
 		 444 aa  59.7  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0578  d-galactonate transporter  25.81 
 
 		 444 aa  59.7  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5765  d-galactonate transporter  25.14 
 
 		 454 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3422  galactarate permease GarP  25.81 
 
 		 444 aa  59.7  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0573  d-galactonate transporter  25.81 
 
 		 444 aa  59.7  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4439  galactarate permease GarP  25.81 
 
 		 444 aa  59.7  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.333242 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3316  galactarate permease GarP  25.81 
 
 		 444 aa  59.7  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3605  galactarate permease GarP  25.81 
 
 		 444 aa  59.7  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02943  hypothetical protein  25.81 
 
 		 444 aa  59.7  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2815  d-galactonate transporter  24.11 
 
 		 453 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.362765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8222  major facilitator superfamily MFS_1  24.54 
 
 		 422 aa  58.2  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.41082  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5058  major facilitator superfamily MFS_1  28.02 
 
 		 425 aa  58.2  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.796866 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4863  d-galactonate transporter  25 
 
 		 450 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0267254 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4121  major facilitator transporter  23.39 
 
 		 455 aa  57  0.0000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.801811 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4680  d-galactonate transporter  28.34 
 
 		 485 aa  57  0.0000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0831  GlpT/PgpT/UhpT family protein  22.48 
 
 		 456 aa  56.6  0.0000008  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.571145  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05240  D-galactonate transporter  23.56 
 
 		 463 aa  55.8  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2580  major facilitator transporter  30.92 
 
 		 398 aa  55.8  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0171602  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0834  major facilitator transporter  24.47 
 
 		 433 aa  55.8  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.789702 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4589  major facilitator superfamily transporter  39.29 
 
 		 431 aa  56.2  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1306  major facilitator transporter  24.53 
 
 		 454 aa  55.5  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.599836 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3077  major facilitator transporter  24.77 
 
 		 456 aa  55.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.374174  normal  0.0107759 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4945  major facilitator transporter  31.22 
 
 		 440 aa  55.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3215  major facilitator transporter  31.22 
 
 		 440 aa  55.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.846569 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5417  major facilitator transporter  25.33 
 
 		 407 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.886931  normal  0.408108 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0575  glycerol-3-phosphate transporter  21.75 
 
 		 449 aa  54.7  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0424748  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2718  major facilitator transporter  29.95 
 
 		 430 aa  54.7  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2676  major facilitator superfamily MFS_1  24.05 
 
 		 432 aa  54.3  0.000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.164208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2246  major facilitator superfamily MFS_1  21.97 
 
 		 427 aa  54.3  0.000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6829  major facilitator superfamily MFS_1  27.46 
 
 		 454 aa  53.5  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1329  nitrate transporter  26.97 
 
 		 893 aa  53.9  0.000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1367  major facilitator superfamily MFS_1  22.3 
 
 		 446 aa  53.9  0.000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1711  nitrate/proton symporter  25.97 
 
 		 436 aa  53.5  0.000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.20518  normal  0.395808 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8624  major facilitator superfamily MFS_1  23.48 
 
 		 461 aa  53.1  0.000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.860223  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3689  D-galactonate transporter  24.62 
 
 		 458 aa  53.1  0.000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0556  glycerol-3-phosphate transporter  21.4 
 
 		 449 aa  53.1  0.000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000367094  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4226  D-galactonate transporter  23.21 
 
 		 461 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.912687 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>