280 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A6302 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_2971  major facilitator transporter  87.85 
 
 
427 aa  699    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.633747 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6302  major facilitator transporter  100 
 
 
424 aa  820    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2858  major facilitator transporter  88.39 
 
 
423 aa  702    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.518401 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2336  major facilitator transporter  87.85 
 
 
427 aa  699    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.155458  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2995  major facilitator transporter  88.44 
 
 
425 aa  699    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2950  major facilitator transporter  87.85 
 
 
427 aa  699    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.256248  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2943  major facilitator transporter  78.77 
 
 
417 aa  589  1e-167  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1460  major facilitator superfamily MFS_1  50.62 
 
 
423 aa  378  1e-103  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3886  major facilitator superfamily MFS_1  59.02 
 
 
437 aa  374  1e-102  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.214665  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4825  major facilitator superfamily MFS_1  55.66 
 
 
419 aa  331  1e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.700339  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3748  major facilitator superfamily MFS_1  55.66 
 
 
419 aa  331  1e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0798464  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0628  major facilitator superfamily MFS_1  56.37 
 
 
439 aa  330  3e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.545486  normal  0.453894 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4072  major facilitator transporter  56.23 
 
 
433 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4401  major facilitator transporter  55.91 
 
 
461 aa  302  9e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0353  major facilitator transporter  52.54 
 
 
417 aa  272  8.000000000000001e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4589  major facilitator superfamily transporter  53.52 
 
 
431 aa  270  2.9999999999999997e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6840  major facilitator superfamily MFS_1  34.33 
 
 
384 aa  112  9e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.806913  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4231  major facilitator transporter  32.61 
 
 
403 aa  103  4e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.578267  normal  0.128432 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1347  major facilitator superfamily MFS_1  33.51 
 
 
410 aa  99.4  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00703114  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1331  major facilitator superfamily MFS_1  32.68 
 
 
411 aa  98.6  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.255079  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2854  major facilitator superfamily MFS_1  32.81 
 
 
409 aa  98.2  3e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2131  major facilitator superfamily transporter  31.05 
 
 
423 aa  97.8  3e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.600199  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2214  putative transporter  32.65 
 
 
413 aa  96.3  9e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1916  major facilitator transporter  30.38 
 
 
412 aa  92.4  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.181905  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1896  major facilitator transporter  30.38 
 
 
412 aa  92.4  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.482817 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1962  major facilitator superfamily transporter  30.38 
 
 
412 aa  92.4  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3367  major facilitator superfamily MFS_1  32.8 
 
 
396 aa  91.3  3e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0109833  normal  0.0295865 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1168  major facilitator superfamily MFS_1  31.86 
 
 
417 aa  90.5  5e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.262607 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1845  major facilitator superfamily MFS_1  25.99 
 
 
404 aa  83.2  0.000000000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53780  MFS family transporter  25.59 
 
 
415 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.033353  normal  0.109422 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4707  MFS family transporter  26.7 
 
 
415 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.759386  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13009  integral membrane protein  27.6 
 
 
445 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  7.64265e-25  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2965  major facilitator superfamily MFS_1  27.79 
 
 
392 aa  80.9  0.00000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3183  major facilitator superfamily MFS_1  27.37 
 
 
380 aa  78.6  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.15273  normal  0.971908 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4400  major facilitator transporter  32.44 
 
 
397 aa  73.9  0.000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.848546  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2054  major facilitator  26.82 
 
 
408 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0619  hypothetical protein  26.45 
 
 
408 aa  72.8  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3221  major facilitator superfamily MFS_1  25.13 
 
 
405 aa  70.9  0.00000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0184  major facilitator superfamily MFS_1  31.63 
 
 
397 aa  67.4  0.0000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.197618 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3212  major facilitator transporter  20.67 
 
 
408 aa  66.6  0.0000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.244211  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3210  major facilitator family transporter  20.3 
 
 
404 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3500  permease  20.45 
 
 
409 aa  66.2  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3521  major facilitator family transporter  20.3 
 
 
406 aa  66.2  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3296  major facilitator family transporter  20 
 
 
404 aa  65.1  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3513  major facilitator family transporter  20 
 
 
414 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3556  major facilitator family transporter  20 
 
 
404 aa  65.1  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0626  hypothetical protein  29.94 
 
 
411 aa  65.5  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5417  major facilitator transporter  24.06 
 
 
407 aa  63.9  0.000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.886931  normal  0.408108 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3510  major facilitator family transporter  19.13 
 
 
402 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.983677  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4945  major facilitator transporter  22.25 
 
 
440 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3215  major facilitator transporter  22.25 
 
 
440 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.846569 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4010  major facilitator transporter  25.38 
 
 
446 aa  60.5  0.00000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.835742  normal  0.379616 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4428  major facilitator transporter  23.96 
 
 
428 aa  60.1  0.00000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00672186  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1710  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  25.38 
 
 
446 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0437115 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1748  major facilitator family transporter  19.95 
 
 
399 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.365711  normal  0.514177 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4176  major facilitator transporter  26.96 
 
 
425 aa  58.9  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3077  major facilitator transporter  20.98 
 
 
456 aa  58.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.374174  normal  0.0107759 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2236  general substrate transporter  25.78 
 
 
449 aa  57.4  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0666  d-galactonate transporter  25.94 
 
 
447 aa  57  0.0000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0432694 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3266  major facilitator family transporter  19.46 
 
 
404 aa  57  0.0000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3829  D-galactonate transporter  25.52 
 
 
454 aa  57  0.0000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4539  d-galactonate transporter  25.52 
 
 
454 aa  57  0.0000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.327531  normal  0.0349681 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2054  major facilitator superfamily MFS_1  26.33 
 
 
445 aa  56.6  0.0000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00125626 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0327  D-galactonate transporter  28.76 
 
 
459 aa  56.2  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2495  major facilitator superfamily MFS_1  25.91 
 
 
442 aa  56.2  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00806465  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5765  d-galactonate transporter  25.52 
 
 
454 aa  56.2  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3398  d-galactonate transporter  29.71 
 
 
458 aa  55.8  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0331831  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2425  major facilitator transporter  26.47 
 
 
458 aa  56.2  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0112572  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4628  d-galactonate transporter  25.96 
 
 
447 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.563971  hitchhiker  0.000103132 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2811  major facilitator superfamily MFS_1  23.38 
 
 
419 aa  55.1  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.501035  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5368  major facilitator transporter  24.61 
 
 
432 aa  55.5  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.823594 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0807  d-galactonate transporter  23.57 
 
 
450 aa  54.7  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5207  d-galactonate transporter  27.66 
 
 
485 aa  54.7  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.045527 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3044  D-galactonate transporter  28.77 
 
 
464 aa  54.7  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5322  d-galactonate transporter  28.77 
 
 
464 aa  54.7  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4680  d-galactonate transporter  27.66 
 
 
485 aa  54.3  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36120  putative MFS transporter  25.94 
 
 
441 aa  53.5  0.000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000263423 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4584  d-galactonate transporter  28.82 
 
 
450 aa  53.5  0.000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.960578  normal  0.440179 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4450  d-galactonate transporter  28.82 
 
 
450 aa  53.5  0.000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.821723 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0828  putative glucarate transporter (D-glucarate permease) transmembrane protein  28.1 
 
 
450 aa  53.1  0.000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.667348  normal  0.455207 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3410  major facilitator superfamily MFS_1  28.53 
 
 
393 aa  53.1  0.000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.357174  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3974  major facilitator superfamily MFS_1  27.33 
 
 
219 aa  52.8  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4105  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  28.97 
 
 
437 aa  52.8  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5164  major facilitator superfamily MFS_1  26.33 
 
 
452 aa  52  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5057  major facilitator transporter  24.94 
 
 
430 aa  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.195392  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0841  d-galactonate transporter  22.85 
 
 
450 aa  52  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5803  major facilitator transporter  24.94 
 
 
430 aa  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.10196  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2516  major facilitator transporter  25.71 
 
 
354 aa  51.6  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.128628  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2627  sn-glycerol-3-phosphate transporter  22.57 
 
 
452 aa  51.6  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.588856 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1647  membrane transport protein  22.35 
 
 
428 aa  51.2  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2419  sn-glycerol-3-phosphate transporter  22.57 
 
 
452 aa  51.6  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2468  sn-glycerol-3-phosphate transporter  22.57 
 
 
452 aa  51.6  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0862405 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2511  sn-glycerol-3-phosphate transporter  22.57 
 
 
452 aa  51.6  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3268  sn-glycerol-3-phosphate transporter  24.86 
 
 
446 aa  51.2  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2523  sn-glycerol-3-phosphate transporter  22.57 
 
 
452 aa  51.6  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.791252 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0199  sn-glycerol-3-phosphate transporter  22.19 
 
 
449 aa  51.6  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000543007  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2202  major facilitator transporter  22.22 
 
 
410 aa  50.8  0.00004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0642059  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4280  major facilitator superfamily MFS_1  22.67 
 
 
439 aa  51.2  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1419  glycerol-3-phosphate transporter  22.6 
 
 
452 aa  50.4  0.00005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.833771  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1411  sn-glycerol-3-phosphate transporter  22.6 
 
 
452 aa  50.4  0.00005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.476503 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>