275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_4231 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_4231  major facilitator transporter  100 
 
 		 403 aa  783    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.578267  normal  0.128432 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2131  major facilitator superfamily transporter  84.37 
 
 		 423 aa  600  1e-170  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.600199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1916  major facilitator transporter  70.34 
 
 		 412 aa  452  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.181905  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1962  major facilitator superfamily transporter  70.34 
 
 		 412 aa  452  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1896  major facilitator transporter  70.34 
 
 		 412 aa  452  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.482817 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13009  integral membrane protein  54.41 
 
 		 445 aa  389  1e-107  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  7.64265e-25  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3221  major facilitator superfamily MFS_1  47.97 
 
 		 405 aa  339  4e-92  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3367  major facilitator superfamily MFS_1  50 
 
 		 396 aa  328  8e-89  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0109833  normal  0.0295865 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4400  major facilitator transporter  51.02 
 
 		 397 aa  291  2e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.848546  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2854  major facilitator superfamily MFS_1  46.19 
 
 		 409 aa  277  3e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1331  major facilitator superfamily MFS_1  44.75 
 
 		 411 aa  250  3e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.255079  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0184  major facilitator superfamily MFS_1  47.58 
 
 		 397 aa  229  6e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.197618 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1347  major facilitator superfamily MFS_1  44.44 
 
 		 410 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00703114  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2214  putative transporter  39.58 
 
 		 413 aa  189  5e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1168  major facilitator superfamily MFS_1  37.06 
 
 		 417 aa  163  4.0000000000000004e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.262607 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6840  major facilitator superfamily MFS_1  37.53 
 
 		 384 aa  134  3e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.806913  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3886  major facilitator superfamily MFS_1  34.24 
 
 		 437 aa  122  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.214665  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6302  major facilitator transporter  33.81 
 
 		 424 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1460  major facilitator superfamily MFS_1  27.4 
 
 		 423 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3748  major facilitator superfamily MFS_1  34.96 
 
 		 419 aa  106  6e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0798464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4825  major facilitator superfamily MFS_1  34.96 
 
 		 419 aa  106  6e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.700339  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2858  major facilitator transporter  31.26 
 
 		 423 aa  107  6e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.518401 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2995  major facilitator transporter  31.35 
 
 		 425 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2336  major facilitator transporter  32.58 
 
 		 427 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.155458  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2950  major facilitator transporter  32.58 
 
 		 427 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.256248  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2971  major facilitator transporter  32.49 
 
 		 427 aa  103  7e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.633747 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1845  major facilitator superfamily MFS_1  29.92 
 
 		 404 aa  102  1e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2054  major facilitator  24.23 
 
 		 408 aa  98.6  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2943  major facilitator transporter  30.6 
 
 		 417 aa  94.7  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0628  major facilitator superfamily MFS_1  31.08 
 
 		 439 aa  92.4  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.545486  normal  0.453894 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0619  hypothetical protein  28.2 
 
 		 408 aa  89.4  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4707  MFS family transporter  29.24 
 
 		 415 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.759386  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53780  MFS family transporter  29.24 
 
 		 415 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.033353  normal  0.109422 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4072  major facilitator transporter  33.88 
 
 		 433 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4401  major facilitator transporter  31.25 
 
 		 461 aa  84  0.000000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3521  major facilitator family transporter  23.46 
 
 		 406 aa  84  0.000000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3210  major facilitator family transporter  22.39 
 
 		 404 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3513  major facilitator family transporter  22.72 
 
 		 414 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3296  major facilitator family transporter  22.83 
 
 		 404 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1748  major facilitator family transporter  21.25 
 
 		 399 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.365711  normal  0.514177 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3556  major facilitator family transporter  22.83 
 
 		 404 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3510  major facilitator family transporter  22.22 
 
 		 402 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.983677  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5417  major facilitator transporter  23.91 
 
 		 407 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.886931  normal  0.408108 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3500  permease  21.73 
 
 		 409 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3266  major facilitator family transporter  22.83 
 
 		 404 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0456  major facilitator superfamily MFS_1  25.07 
 
 		 415 aa  74.7  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.317164  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2965  major facilitator superfamily MFS_1  26.67 
 
 		 392 aa  74.7  0.000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3212  major facilitator transporter  23.88 
 
 		 408 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.244211  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3569  d-galactonate transporter  21.65 
 
 		 444 aa  62.8  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.576776 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4825  major facilitator transporter  27.36 
 
 		 418 aa  61.6  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.327434  normal  0.0172769 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4589  major facilitator superfamily transporter  31.47 
 
 		 431 aa  61.2  0.00000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0353  major facilitator transporter  27.8 
 
 		 417 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5039  major facilitator transporter  28.72 
 
 		 410 aa  59.3  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.582294  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2623  hypothetical protein  19.13 
 
 		 455 aa  58.9  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2615  major facilitator transporter  28.88 
 
 		 404 aa  58.5  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.164819 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3242  d-galactonate transporter  22.52 
 
 		 451 aa  58.5  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.141261 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02992  predicted (D)-galactarate transporter  21.04 
 
 		 444 aa  57.8  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0578  d-galactonate transporter  21.04 
 
 		 444 aa  57.8  0.0000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3316  galactarate permease GarP  21.04 
 
 		 444 aa  57.8  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2474  hypothetical protein  18.79 
 
 		 455 aa  57.8  0.0000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3422  galactarate permease GarP  21.04 
 
 		 444 aa  57.8  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02943  hypothetical protein  21.04 
 
 		 444 aa  57.8  0.0000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3605  galactarate permease GarP  21.04 
 
 		 444 aa  57.8  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0573  d-galactonate transporter  21.04 
 
 		 444 aa  57.8  0.0000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4439  galactarate permease GarP  21.04 
 
 		 444 aa  57.8  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.333242 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4307  major facilitator transporter  25.98 
 
 		 430 aa  57.4  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.622363  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02634  predicted D-glucarate transporter  22.61 
 
 		 450 aa  57  0.0000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0899  d-galactonate transporter  22.61 
 
 		 450 aa  57  0.0000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3084  glucarate permease  22.61 
 
 		 440 aa  57.4  0.0000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.567935  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2927  glucarate permease  22.61 
 
 		 450 aa  57  0.0000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2933  glucarate permease  22.61 
 
 		 450 aa  57  0.0000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0923  d-galactonate transporter  22.61 
 
 		 450 aa  57  0.0000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3093  glucarate permease  22.61 
 
 		 450 aa  57  0.0000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.110237  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02596  hypothetical protein  22.61 
 
 		 450 aa  57  0.0000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0382  major facilitator superfamily MFS_1  26.03 
 
 		 419 aa  56.6  0.0000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.577765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0306  major facilitator transporter  25.21 
 
 		 439 aa  56.6  0.0000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.456873 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2580  major facilitator transporter  20.68 
 
 		 398 aa  57  0.0000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0171602  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3600  d-galactonate transporter  23.03 
 
 		 454 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.442053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0350  major facilitator superfamily MFS_1  24.59 
 
 		 419 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.222192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3099  d-galactonate transporter  23.03 
 
 		 454 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0674  hypothetical protein  23.77 
 
 		 423 aa  55.8  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2316  d-galactonate transporter  24.67 
 
 		 454 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.601207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1866  major facilitator transporter  25.2 
 
 		 425 aa  56.2  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.591814  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6829  major facilitator superfamily MFS_1  24.14 
 
 		 454 aa  56.2  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1367  major facilitator superfamily MFS_1  22.96 
 
 		 446 aa  55.8  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2815  d-galactonate transporter  24.58 
 
 		 453 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.362765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1773  major facilitator superfamily MFS_1  22.96 
 
 		 441 aa  55.5  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4050  glucarate permease  22.26 
 
 		 450 aa  55.1  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4010  major facilitator transporter  24.14 
 
 		 446 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.835742  normal  0.379616 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1700  major facilitator superfamily MFS_1  25.21 
 
 		 421 aa  55.5  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.194128  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3526  major facilitator superfamily MFS_1  27.17 
 
 		 421 aa  55.5  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04490  sugar phosphate permease  32.62 
 
 		 469 aa  55.5  0.000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2916  major facilitator transporter  24.51 
 
 		 416 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0195936  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1710  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  24.14 
 
 		 446 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0437115 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3557  d-galactonate transporter  21.05 
 
 		 450 aa  54.7  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6216  major facilitator transporter  22.65 
 
 		 460 aa  54.7  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6607  major facilitator transporter  27.76 
 
 		 439 aa  54.3  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.806643  normal  0.758649 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3397  d-galactonate transporter  20.87 
 
 		 450 aa  54.3  0.000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3121  glucarate permease  21.91 
 
 		 452 aa  53.9  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.830611 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3168  glucarate permease  21.91 
 
 		 452 aa  53.9  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.101605 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>