More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_2580 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010184  BcerKBAB4_2580  major facilitator transporter  100 
 
 
398 aa  782    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0171602  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2482  major facilitator superfamily MFS_1  28.16 
 
 
417 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0706  major facilitator family transporter  27.6 
 
 
428 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.233996  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0557  major facilitator superfamily MFS_1  27.91 
 
 
415 aa  123  6e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0349703  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1737  major facilitator superfamily MFS_1  27.66 
 
 
413 aa  123  7e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0279  major facilitator transporter  26.17 
 
 
398 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2332  major facilitator transporter  25.7 
 
 
410 aa  104  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000158827  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3043  major facilitator transporter  23.96 
 
 
394 aa  89  1e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.890919 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6790  major facilitator superfamily MFS_1  23.44 
 
 
404 aa  83.6  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0169  major facilitator superfamily MFS_1  23.35 
 
 
397 aa  83.2  0.000000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0515  major facilitator superfamily MFS_1  25.34 
 
 
399 aa  82.8  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0489  major facilitator transporter  23.42 
 
 
394 aa  80.5  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1455  major facilitator transporter  23.98 
 
 
411 aa  80.1  0.00000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1789  major facilitator transporter  20.62 
 
 
400 aa  79  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.790734  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6311  major facilitator superfamily MFS_1  23.45 
 
 
413 aa  77.8  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0278735  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3859  major facilitator transporter  24.35 
 
 
402 aa  77.8  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.526422 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5881  major facilitator superfamily MFS_1  23.05 
 
 
404 aa  77.4  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1883  major facilitator superfamily MFS_1  25.44 
 
 
421 aa  76.3  0.0000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0358  hypothetical protein  25.71 
 
 
400 aa  75.9  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.23836  unclonable  0.0000000671481 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3596  major facilitator transporter  24.23 
 
 
398 aa  75.5  0.000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1590  major facilitator transporter  25.09 
 
 
431 aa  74.3  0.000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0171149  normal  0.72938 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1160  major facilitator transporter  23.71 
 
 
433 aa  74.3  0.000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0149798 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0225  protein of unknown function DUF1228  24.42 
 
 
395 aa  73.6  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2840  major facilitator family transporter  24.66 
 
 
398 aa  73.2  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.638107  normal  0.599456 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2817  major facilitator family transporter  24.66 
 
 
398 aa  72.8  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0448046  normal  0.764982 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0983  major facilitator superfamily permease  25.59 
 
 
410 aa  72.4  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.445341 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2952  major facilitator family transporter  24.66 
 
 
398 aa  72  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0674  hypothetical protein  24.18 
 
 
423 aa  71.6  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2736  major facilitator family transporter  24.66 
 
 
398 aa  72  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.601142  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3681  major facilitator superfamily MFS_1  23.71 
 
 
402 aa  71.6  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1585  major facilitator transporter  22.97 
 
 
403 aa  72  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2777  major facilitator family transporter  24.66 
 
 
398 aa  72  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3608  major facilitator transporter  23.28 
 
 
416 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2535  major facilitator transporter  25.12 
 
 
425 aa  70.5  0.00000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2587  major facilitator transporter  25.12 
 
 
425 aa  70.5  0.00000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1748  major facilitator family transporter  24.68 
 
 
399 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.365711  normal  0.514177 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0334  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 
395 aa  70.1  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04141  predicted transporter  23.42 
 
 
405 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3722  General substrate transporter  23.42 
 
 
405 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4896  hypothetical protein  26.1 
 
 
395 aa  69.7  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04104  hypothetical protein  23.42 
 
 
405 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1994  major facilitator transporter  21.41 
 
 
411 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.392153  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0905  major facilitator superfamily MFS_1  25.09 
 
 
368 aa  69.7  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2507  hypothetical protein  22.83 
 
 
443 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.690501  normal  0.711571 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0856  major facilitator transporter  23.04 
 
 
397 aa  68.6  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3912  major facilitator transporter  22.64 
 
 
416 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.812744 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0691  hypothetical protein  23.9 
 
 
423 aa  67.4  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0484  hypothetical protein  22.22 
 
 
400 aa  67.4  0.0000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1300  major facilitator transporter  22.69 
 
 
410 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.058248 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1189  major facilitator superfamily MFS_1  24.16 
 
 
400 aa  67  0.0000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.051319  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1047  major facilitator transporter  24.23 
 
 
405 aa  67.4  0.0000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2649  major facilitator transporter  23.86 
 
 
389 aa  67  0.0000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.189084 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2826  major facilitator superfamily MFS_1  24.48 
 
 
380 aa  67.4  0.0000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.160845 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7222  major facilitator superfamily MFS_1  22.99 
 
 
415 aa  67  0.0000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4451  MFS superfamily oxalate/formate antiporter  22.26 
 
 
438 aa  66.6  0.0000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000266277  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6538  major facilitator transporter  23.49 
 
 
404 aa  66.2  0.0000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.499845 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0655  major facilitator superfamily MFS_1  21.97 
 
 
408 aa  66.2  0.0000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.226203  normal  0.178333 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1288  hypothetical protein  23.48 
 
 
432 aa  66.2  0.0000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6744  major facilitator superfamily MFS_1  25.39 
 
 
405 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.713185 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0339  major facilitator superfamily permease  23.15 
 
 
399 aa  65.5  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.2038  normal  0.0205502 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5344  major facilitator transporter  23.93 
 
 
415 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0908766  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0856  hypothetical protein  23.22 
 
 
412 aa  65.1  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3500  permease  24.42 
 
 
409 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0040  major facilitator transporter  23.64 
 
 
394 aa  65.1  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6107  major facilitator transporter  21.41 
 
 
411 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1970  major facilitator transporter  21.41 
 
 
411 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3879  major facilitator superfamily MFS_1  25.09 
 
 
420 aa  64.3  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.239136  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2883  major facilitator transporter  22.86 
 
 
391 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000788215 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1289  hypothetical protein  22.99 
 
 
432 aa  64.3  0.000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1231  major facilitator superfamily tranporter  23.53 
 
 
428 aa  64.3  0.000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.475499 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3514  major facilitator transporter  23.08 
 
 
415 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.747582  normal  0.0415191 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3401  major facilitator transporter  25 
 
 
394 aa  64.3  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1982  major facilitator superfamily MFS_1  25.56 
 
 
434 aa  63.9  0.000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.130406  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04481  monocarboxylate transporter (Eurofung)  23.28 
 
 
510 aa  63.5  0.000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.129733  normal  0.497069 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3266  major facilitator family transporter  25.64 
 
 
404 aa  63.5  0.000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5285  major facilitator transporter  21.82 
 
 
408 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0853738 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0386  hypothetical protein  20.79 
 
 
359 aa  63.2  0.000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4613  major facilitator superfamily MFS_1  22.1 
 
 
417 aa  63.2  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.969548 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2851  protein of unknown function DUF1228  23.93 
 
 
394 aa  62.8  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0859226  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1139  major facilitator superfamily MFS_1  25.62 
 
 
395 aa  62.4  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.388877  normal  0.0189112 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5090  major facilitator transporter  22.32 
 
 
416 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.778625 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03970  transporter, putative  24.11 
 
 
539 aa  62.4  0.00000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0578  major facilitator superfamily MFS_1  26.57 
 
 
407 aa  62.4  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03658  MFS transporter (Mch2), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G12260)  25.12 
 
 
485 aa  62  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0976864  normal  0.916138 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2097  major facilitator superfamily MFS_1  23.9 
 
 
436 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.481915  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1354  multidrug-efflux transporter  23.37 
 
 
370 aa  61.6  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3046  major facilitator superfamily MFS_1  25.75 
 
 
421 aa  62  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.548752  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03997  MFS monocarboxylate transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G03240)  27.61 
 
 
437 aa  61.2  0.00000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00242974  normal  0.101334 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1467  major facilitator superfamily MFS_1  25.54 
 
 
443 aa  61.2  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1033  major facilitator transporter  23.05 
 
 
430 aa  61.2  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.512076  normal  0.078006 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0675  hypothetical protein  24.81 
 
 
427 aa  61.2  0.00000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1160  major facilitator superfamily MFS_1  23.05 
 
 
430 aa  61.2  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.13883  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3273  major facilitator transporter  27.63 
 
 
403 aa  61.2  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.180374  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4009  major facilitator transporter  25.95 
 
 
436 aa  61.2  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.636189  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1368  major facilitator superfamily MFS_1  31.79 
 
 
415 aa  61.2  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.16217  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2414  major facilitator superfamily MFS_1  23.9 
 
 
436 aa  60.8  0.00000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.136193 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0434  major facilitator transporter  22.41 
 
 
408 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0235  major facilitator transporter  26.7 
 
 
378 aa  60.8  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08789  MFS monocarboxylate transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G12710)  22.09 
 
 
506 aa  60.5  0.00000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.140975 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2137  major facilitator transporter  23.79 
 
 
436 aa  60.5  0.00000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.115705  normal  0.336562 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>