122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B0434 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B0434  major facilitator transporter  100 
 
 		 408 aa  780    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7222  major facilitator superfamily MFS_1  87.95 
 
 		 415 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2507  hypothetical protein  71.57 
 
 		 443 aa  503  1e-141  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.690501  normal  0.711571 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3608  major facilitator transporter  72.41 
 
 		 416 aa  504  1e-141  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2883  major facilitator transporter  73.25 
 
 		 391 aa  501  1e-141  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000788215 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3912  major facilitator transporter  72.94 
 
 		 416 aa  489  1e-137  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.812744 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5344  major facilitator transporter  70.31 
 
 		 415 aa  477  1e-133  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0908766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3514  major facilitator transporter  70.83 
 
 		 415 aa  461  1e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.747582  normal  0.0415191 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5090  major facilitator transporter  70.54 
 
 		 416 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.778625 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2826  major facilitator superfamily MFS_1  41.71 
 
 		 380 aa  220  3e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.160845 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0489  major facilitator transporter  36.65 
 
 		 394 aa  212  1e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3596  major facilitator transporter  38.7 
 
 		 398 aa  209  6e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0225  protein of unknown function DUF1228  39.02 
 
 		 395 aa  209  6e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1455  major facilitator transporter  39.69 
 
 		 411 aa  206  5e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0334  major facilitator superfamily MFS_1  38.2 
 
 		 395 aa  204  3e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8502  major facilitator transporter  38.38 
 
 		 388 aa  177  3e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.988555 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0241  major facilitator transporter  40.15 
 
 		 393 aa  172  6.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.616236  normal  0.0363881 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0339  major facilitator superfamily permease  38.12 
 
 		 399 aa  171  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.2038  normal  0.0205502 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1033  major facilitator transporter  39.58 
 
 		 389 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.611435 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2373  MFS family transporter  39.58 
 
 		 389 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.098036  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4509  hypothetical protein  33.16 
 
 		 392 aa  100  6e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.530694 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0484  hypothetical protein  28.49 
 
 		 400 aa  97.1  5e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0169  major facilitator superfamily MFS_1  30.59 
 
 		 397 aa  91.7  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0279  major facilitator transporter  28.2 
 
 		 398 aa  91.3  3e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0706  major facilitator family transporter  30.47 
 
 		 428 aa  89  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.233996  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3043  major facilitator transporter  28.21 
 
 		 394 aa  86.7  7e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.890919 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3310  MFS permease  31.75 
 
 		 401 aa  84.7  0.000000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.641652  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1585  major facilitator transporter  26.35 
 
 		 403 aa  84  0.000000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0856  major facilitator transporter  28.37 
 
 		 397 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3120  protein of unknown function DUF1228  30.99 
 
 		 394 aa  80.1  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.508963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2851  protein of unknown function DUF1228  29.63 
 
 		 394 aa  79  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0859226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2482  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 		 417 aa  79  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5539  hypothetical protein  30.08 
 
 		 402 aa  78.2  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.188295  normal  0.0555001 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0557  major facilitator superfamily MFS_1  28.73 
 
 		 415 aa  76.6  0.0000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0349703  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6839  protein of unknown function DUF1228  29.56 
 
 		 408 aa  76.3  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0480421  normal  0.134894 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0386  hypothetical protein  28.41 
 
 		 359 aa  74.7  0.000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0358  hypothetical protein  28.53 
 
 		 400 aa  72.8  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.23836  unclonable  0.0000000671481 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2332  major facilitator transporter  32.85 
 
 		 410 aa  71.6  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000158827  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0805  hypothetical protein  34.63 
 
 		 409 aa  70.5  0.00000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.703384  normal  0.650566 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1737  major facilitator superfamily MFS_1  28.06 
 
 		 413 aa  69.7  0.00000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2580  major facilitator transporter  22.41 
 
 		 398 aa  67.4  0.0000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0171602  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0806  hypothetical protein  29.17 
 
 		 423 aa  67  0.0000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.314007 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2649  major facilitator transporter  25.19 
 
 		 389 aa  65.9  0.000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.189084 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0733  hypothetical protein  26.56 
 
 		 388 aa  66.2  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.162418  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6538  major facilitator transporter  30.84 
 
 		 404 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.499845 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4896  hypothetical protein  24.09 
 
 		 395 aa  65.5  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4003  major facilitator superfamily transporter  30.56 
 
 		 400 aa  65.1  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.709384  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0634  protein of unknown function DUF1228  30.81 
 
 		 374 aa  65.5  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0485  hypothetical protein  27.27 
 
 		 406 aa  64.3  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.626037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0235  sugar transporter  24.5 
 
 		 395 aa  63.9  0.000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.105559  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1160  major facilitator transporter  24.14 
 
 		 433 aa  63.5  0.000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0149798 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1231  major facilitator superfamily tranporter  24.4 
 
 		 428 aa  63.2  0.000000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.475499 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1213  major facilitator transporter  28.74 
 
 		 398 aa  62.8  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.451147 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0072  hypothetical protein  29.05 
 
 		 400 aa  62.8  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0122  protein of unknown function DUF1228  30.57 
 
 		 402 aa  62.4  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0207  hypothetical protein  24.28 
 
 		 395 aa  62  0.00000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.49283  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3678  protein of unknown function DUF1228  29 
 
 		 405 aa  60.8  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.28396  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6744  major facilitator superfamily MFS_1  28.71 
 
 		 405 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.713185 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0821  protein of unknown function DUF1228  34.62 
 
 		 404 aa  58.2  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.303268  normal  0.29655 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3309  major facilitator transporter  29.66 
 
 		 395 aa  58.5  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0751  protein of unknown function DUF1228  40.4 
 
 		 404 aa  58.9  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.361372 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2647  major facilitator transporter  27.7 
 
 		 385 aa  58.2  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.652327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0209  protein of unknown function DUF1228  29.95 
 
 		 422 aa  55.8  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.805115  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0280  major facilitator transporter  32.82 
 
 		 395 aa  55.8  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0415  major facilitator transporter  29.29 
 
 		 392 aa  55.8  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.240789 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0856  hypothetical protein  28.02 
 
 		 412 aa  55.5  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1488  hypothetical protein  29.38 
 
 		 417 aa  55.1  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.861875 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0190  hypothetical protein  28.57 
 
 		 422 aa  55.1  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4528  major facilitator transporter  27.61 
 
 		 392 aa  55.5  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5034  major facilitator transporter  29.09 
 
 		 403 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0580159 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04201  predicted inner membrane protein  24.79 
 
 		 392 aa  53.9  0.000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000208654  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3664  protein of unknown function DUF1228  24.79 
 
 		 392 aa  53.9  0.000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000330121  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04164  hypothetical protein  24.79 
 
 		 392 aa  53.9  0.000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000012722  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0445  major facilitator transporter  26.57 
 
 		 408 aa  54.3  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1153  putative transmembrane efflux transmembrane protein  30.89 
 
 		 400 aa  53.1  0.000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.239859  normal  0.351745 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1047  major facilitator transporter  26.5 
 
 		 405 aa  53.1  0.000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1041  hypothetical protein  27.73 
 
 		 428 aa  52.4  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7234  major facilitator superfamily MFS_1  26.98 
 
 		 411 aa  52.8  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0633  major facilitator transporter  28.83 
 
 		 388 aa  51.6  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.510644 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4932  major facilitator transporter  24.94 
 
 		 392 aa  52  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2745  protein of unknown function DUF1228  34.9 
 
 		 399 aa  51.6  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3326  major facilitator superfamily MFS_1  28.47 
 
 		 388 aa  51.6  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.139767 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23780  arabinose efflux permease family protein  28.85 
 
 		 394 aa  51.2  0.00003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3732  hypothetical protein  25.79 
 
 		 392 aa  50.8  0.00004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000100771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4560  major facilitator transporter  25.79 
 
 		 392 aa  50.4  0.00005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4877  major facilitator transporter  26.11 
 
 		 392 aa  50.4  0.00005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.429993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5844  transporter, major facilitator family  26.11 
 
 		 392 aa  50.4  0.00006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.482212 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1291  hypothetical protein  32.57 
 
 		 408 aa  50.1  0.00008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.895388  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2020  major facilitator transporter  35.71 
 
 		 391 aa  49.7  0.00008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.286294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1611  hypothetical protein  28.89 
 
 		 409 aa  49.3  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4773  transporter, major facilitator family  25.53 
 
 		 392 aa  48.9  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2535  major facilitator superfamily MFS_1  35.12 
 
 		 391 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.216008  normal  0.0447169 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4555  hypothetical protein  35.29 
 
 		 417 aa  48.1  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4318  hypothetical protein  27.69 
 
 		 409 aa  47.8  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0616031  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1505  major facilitator transporter  35.98 
 
 		 395 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.484367  normal  0.264768 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1909  major facilitator family transporter  24.5 
 
 		 406 aa  47.4  0.0005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04690  arabinose efflux permease family protein  36.14 
 
 		 422 aa  47.4  0.0005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0553  major facilitator transporter  31.91 
 
 		 390 aa  47.4  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.125845  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33770  hypothetical protein  30.05 
 
 		 408 aa  47  0.0006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.756882  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0593  major facilitator family transporter  29.83 
 
 		 390 aa  46.6  0.0008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>