279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2332 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_2332  major facilitator transporter  100 
 
 		 410 aa  776    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000158827  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2482  major facilitator superfamily MFS_1  63.64 
 
 		 417 aa  474  1e-132  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0706  major facilitator family transporter  61.4 
 
 		 428 aa  449  1e-125  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.233996  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1737  major facilitator superfamily MFS_1  65.15 
 
 		 413 aa  448  1.0000000000000001e-124  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0557  major facilitator superfamily MFS_1  64.94 
 
 		 415 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0349703  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2580  major facilitator transporter  26.53 
 
 		 398 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0171602  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0489  major facilitator transporter  30.16 
 
 		 394 aa  100  4e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5090  major facilitator transporter  30.81 
 
 		 416 aa  93.6  6e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.778625 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1455  major facilitator transporter  29.1 
 
 		 411 aa  92  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0225  protein of unknown function DUF1228  28.81 
 
 		 395 aa  90.9  4e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0515  major facilitator superfamily MFS_1  28.65 
 
 		 399 aa  90.5  5e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3608  major facilitator transporter  31.02 
 
 		 416 aa  90.5  5e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3912  major facilitator transporter  30.45 
 
 		 416 aa  90.1  6e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.812744 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2507  hypothetical protein  30.19 
 
 		 443 aa  90.1  6e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.690501  normal  0.711571 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0434  major facilitator transporter  32.95 
 
 		 408 aa  89.4  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5344  major facilitator transporter  30.3 
 
 		 415 aa  89.4  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0908766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7222  major facilitator superfamily MFS_1  31.61 
 
 		 415 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3514  major facilitator transporter  30.3 
 
 		 415 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.747582  normal  0.0415191 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6744  major facilitator superfamily MFS_1  28.65 
 
 		 405 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.713185 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3596  major facilitator transporter  27.46 
 
 		 398 aa  81.6  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0334  major facilitator superfamily MFS_1  27.37 
 
 		 395 aa  79.7  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0280  major facilitator transporter  31.34 
 
 		 395 aa  76.3  0.0000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0905  major facilitator superfamily MFS_1  26.04 
 
 		 368 aa  73.9  0.000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6123  major facilitator superfamily permease  28.98 
 
 		 434 aa  72.8  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.121683  normal  0.649512 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6538  major facilitator transporter  27.53 
 
 		 404 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.499845 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3251  major facilitator superfamily MFS_1  27.42 
 
 		 430 aa  71.6  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104072  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2826  major facilitator superfamily MFS_1  31.94 
 
 		 380 aa  71.6  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.160845 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2883  major facilitator transporter  28.49 
 
 		 391 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000788215 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1883  major facilitator superfamily MFS_1  24.26 
 
 		 421 aa  70.1  0.00000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0279  major facilitator transporter  25 
 
 		 398 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1585  major facilitator transporter  25.98 
 
 		 403 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0339  major facilitator superfamily permease  27.2 
 
 		 399 aa  67  0.0000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.2038  normal  0.0205502 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8502  major facilitator transporter  26.61 
 
 		 388 aa  67  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.988555 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0386  hypothetical protein  28.08 
 
 		 359 aa  66.6  0.0000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0080  major facilitator transporter  26.02 
 
 		 434 aa  66.6  0.0000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.163505  hitchhiker  0.00273826 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0835  major facilitator transporter  26.02 
 
 		 434 aa  66.2  0.000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.65824  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1290  major facilitator superfamily MFS_1  23.99 
 
 		 441 aa  65.5  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3607  major facilitator transporter  25.67 
 
 		 439 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.943392 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3309  major facilitator transporter  27.61 
 
 		 395 aa  65.1  0.000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0424  major facilitator transporter  27.27 
 
 		 420 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0169  major facilitator superfamily MFS_1  23.85 
 
 		 397 aa  64.3  0.000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08080  arabinose efflux permease family protein  22.74 
 
 		 398 aa  64.3  0.000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0134  regulatory protein UhpC  25 
 
 		 443 aa  63.9  0.000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0426  major facilitator transporter  25.42 
 
 		 427 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0445  major facilitator transporter  26.01 
 
 		 408 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4009  major facilitator transporter  26.56 
 
 		 436 aa  63.9  0.000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.636189  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0484  hypothetical protein  25.81 
 
 		 400 aa  63.5  0.000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3532  major facilitator superfamily MFS_1  25.24 
 
 		 427 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.697797  normal  0.296652 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2718  oxalate:formate antiporter, putative  26.91 
 
 		 402 aa  63.2  0.000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00584048  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2495  oxalate:formate antiporter  26.76 
 
 		 402 aa  63.2  0.000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.116022  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0235  major facilitator transporter  27.49 
 
 		 378 aa  63.2  0.000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2680  oxalate:formate antiporter  26.76 
 
 		 402 aa  63.2  0.000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0040  major facilitator transporter  29.58 
 
 		 394 aa  63.2  0.000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0831  GlpT/PgpT/UhpT family protein  24.91 
 
 		 456 aa  62.4  0.00000001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.571145  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1953  hypothetical protein  27.48 
 
 		 406 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2823  major facilitator transporter  26.53 
 
 		 408 aa  62.8  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.087939  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1909  major facilitator family transporter  23.51 
 
 		 406 aa  61.6  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2731  major facilitator transporter  27.09 
 
 		 427 aa  62  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3099  major facilitator transporter  24.74 
 
 		 430 aa  61.2  0.00000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0643355  normal  0.382365 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2703  putative oxalate:formate antiporter  26.54 
 
 		 402 aa  60.8  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0624  regulatory protein UhpC  27.78 
 
 		 436 aa  60.8  0.00000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1367  major facilitator superfamily MFS_1  24.86 
 
 		 446 aa  60.8  0.00000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2607  putative oxalate:formate antiporter  26.46 
 
 		 402 aa  60.5  0.00000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000121238 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7234  major facilitator superfamily MFS_1  26.84 
 
 		 411 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2878  major facilitator transporter  25.56 
 
 		 459 aa  59.7  0.00000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.124672 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1773  major facilitator superfamily MFS_1  25.99 
 
 		 441 aa  59.3  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1376  major facilitator superfamily MFS_1  27.81 
 
 		 439 aa  58.5  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.757312  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000089  hexose phosphate uptake regulatory protein UhpC  26.16 
 
 		 446 aa  58.2  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2484  major facilitator superfamily MFS_1  28 
 
 		 437 aa  57.8  0.0000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.371428  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2623  hypothetical protein  23.13 
 
 		 455 aa  57.8  0.0000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1590  major facilitator transporter  24.74 
 
 		 431 aa  57.8  0.0000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0171149  normal  0.72938 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2288  major facilitator superfamily MFS_1  26.61 
 
 		 433 aa  57.8  0.0000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.16784  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2456  oxalate/formate antiporter (permease)  25.78 
 
 		 402 aa  57  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.001991  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2474  hypothetical protein  22.83 
 
 		 455 aa  57  0.0000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4318  hypothetical protein  27.34 
 
 		 409 aa  57  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0616031  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2695  putative oxalate:formate antiporter  25.78 
 
 		 402 aa  57  0.0000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000183174 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2746  putative oxalate:formate antiporter  25.78 
 
 		 402 aa  56.6  0.0000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000311684  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1213  major facilitator transporter  28.34 
 
 		 398 aa  56.2  0.0000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.451147 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0856  major facilitator transporter  24.87 
 
 		 397 aa  56.2  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10910  major facilitator transporter  29 
 
 		 419 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0129173  normal  0.971248 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0393  major facilitator transporter  30.11 
 
 		 421 aa  56.2  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.464327  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4130  regulatory protein UhpC  23.65 
 
 		 453 aa  55.1  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.543128  normal  0.246836 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2389  regulatory protein UhpC  23.08 
 
 		 440 aa  55.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.365654 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2251  major facilitator transporter  28.21 
 
 		 441 aa  55.1  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000681216  hitchhiker  4.26317e-17 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0083  regulatory protein UhpC  23.65 
 
 		 443 aa  55.1  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.644662  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4078  regulatory protein UhpC  23.65 
 
 		 443 aa  55.1  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2433  regulatory protein UhpC  23.08 
 
 		 440 aa  55.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.186527 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2437  regulatory protein UhpC  23.08 
 
 		 440 aa  55.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2344  regulatory protein UhpC  23.08 
 
 		 440 aa  55.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.209168  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2547  regulatory protein UhpC  23.08 
 
 		 440 aa  55.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0466951 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6043  major facilitator transporter  29.54 
 
 		 415 aa  54.7  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.100748 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0079  major facilitator transporter  25.7 
 
 		 428 aa  54.7  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.129235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5683  major facilitator transporter  28.18 
 
 		 415 aa  54.7  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.660955  normal  0.0309673 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1467  major facilitator superfamily MFS_1  26.44 
 
 		 443 aa  54.7  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5906  major facilitator transporter  28.18 
 
 		 415 aa  54.7  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.544672  hitchhiker  0.0068458 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5472  major facilitator transporter  31.11 
 
 		 437 aa  54.3  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0834  major facilitator transporter  26.87 
 
 		 433 aa  54.3  0.000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.789702 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2428  oxalate:formate antiporter (permease)  26.27 
 
 		 402 aa  53.9  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.739048  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2585  twin-arginine translocation pathway signal  25.19 
 
 		 423 aa  54.3  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0520  major facilitator transporter  25.19 
 
 		 423 aa  54.3  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>