290 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_0557 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_0557  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 415 aa  810    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0349703  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0706  major facilitator family transporter  64.48 
 
 		 428 aa  471  1e-132  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.233996  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2482  major facilitator superfamily MFS_1  60.67 
 
 		 417 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2332  major facilitator transporter  66.41 
 
 		 410 aa  409  1e-113  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000158827  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1737  major facilitator superfamily MFS_1  59.62 
 
 		 413 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2580  major facilitator transporter  27.65 
 
 		 398 aa  149  9e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0171602  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1883  major facilitator superfamily MFS_1  26.32 
 
 		 421 aa  98.2  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0489  major facilitator transporter  29.19 
 
 		 394 aa  96.3  9e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3251  major facilitator superfamily MFS_1  28.72 
 
 		 430 aa  92.4  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104072  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6744  major facilitator superfamily MFS_1  28.9 
 
 		 405 aa  88.2  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.713185 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0169  major facilitator superfamily MFS_1  25.69 
 
 		 397 aa  87.4  4e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1455  major facilitator transporter  29.12 
 
 		 411 aa  86.3  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0279  major facilitator transporter  23.5 
 
 		 398 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5090  major facilitator transporter  28.65 
 
 		 416 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.778625 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7222  major facilitator superfamily MFS_1  30 
 
 		 415 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2507  hypothetical protein  28.21 
 
 		 443 aa  80.1  0.00000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.690501  normal  0.711571 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6538  major facilitator transporter  30.09 
 
 		 404 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.499845 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0225  protein of unknown function DUF1228  27.69 
 
 		 395 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3608  major facilitator transporter  29.09 
 
 		 416 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2823  major facilitator transporter  28.02 
 
 		 408 aa  77.4  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.087939  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0424  major facilitator transporter  28.89 
 
 		 420 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3912  major facilitator transporter  28.53 
 
 		 416 aa  76.6  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.812744 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0434  major facilitator transporter  28.93 
 
 		 408 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5344  major facilitator transporter  27.32 
 
 		 415 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0908766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3514  major facilitator transporter  28.14 
 
 		 415 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.747582  normal  0.0415191 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2826  major facilitator superfamily MFS_1  29.23 
 
 		 380 aa  73.9  0.000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.160845 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0334  major facilitator superfamily MFS_1  27.41 
 
 		 395 aa  73.9  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6123  major facilitator superfamily permease  28.33 
 
 		 434 aa  73.9  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.121683  normal  0.649512 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1585  major facilitator transporter  21.83 
 
 		 403 aa  73.2  0.000000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0515  major facilitator superfamily MFS_1  26.91 
 
 		 399 aa  72.8  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0856  major facilitator transporter  24.34 
 
 		 397 aa  71.2  0.00000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2883  major facilitator transporter  27.95 
 
 		 391 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000788215 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2585  twin-arginine translocation pathway signal  27.09 
 
 		 423 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0520  major facilitator transporter  27.09 
 
 		 423 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3309  major facilitator transporter  26.95 
 
 		 395 aa  70.1  0.00000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08080  arabinose efflux permease family protein  25.32 
 
 		 398 aa  70.1  0.00000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3596  major facilitator transporter  25.95 
 
 		 398 aa  70.5  0.00000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0079  major facilitator transporter  25.81 
 
 		 428 aa  70.1  0.00000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.129235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0905  major facilitator superfamily MFS_1  24.19 
 
 		 368 aa  69.7  0.00000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4306  major facilitator superfamily transporter  28.15 
 
 		 413 aa  69.3  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0575629 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1160  major facilitator superfamily MFS_1  25.29 
 
 		 430 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.13883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1033  major facilitator transporter  25.29 
 
 		 430 aa  68.9  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.512076  normal  0.078006 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0484  hypothetical protein  23.08 
 
 		 400 aa  68.2  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0965  major facilitator superfamily MFS_1  25.29 
 
 		 429 aa  67.8  0.0000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.122687  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1573  transporter, putative  26.53 
 
 		 430 aa  67  0.0000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0040  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 394 aa  66.6  0.0000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0386  hypothetical protein  24.32 
 
 		 359 aa  66.6  0.0000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2759  phosphoglycerate transporter  21.86 
 
 		 463 aa  65.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2540  phosphoglycerate transport: transporter  21.86 
 
 		 463 aa  65.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2588  phosphoglycerate transport: transporter  21.86 
 
 		 463 aa  65.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0235  major facilitator transporter  31.43 
 
 		 378 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0835  major facilitator transporter  23.5 
 
 		 434 aa  64.7  0.000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.65824  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0080  major facilitator transporter  21.89 
 
 		 434 aa  64.3  0.000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.163505  hitchhiker  0.00273826 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2653  phosphoglycerate transport: transporter  21.91 
 
 		 463 aa  63.9  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00132768 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2629  phosphoglycerate transport: transporter  21.91 
 
 		 463 aa  63.9  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3607  major facilitator transporter  25.67 
 
 		 439 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.943392 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0456  major facilitator superfamily MFS_1  27.57 
 
 		 415 aa  63.2  0.000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.317164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1521  putative transporter  26.3 
 
 		 429 aa  63.2  0.000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.488674  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10910  major facilitator transporter  26.14 
 
 		 419 aa  62  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0129173  normal  0.971248 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3096  major facilitator superfamily MFS_1  22.4 
 
 		 431 aa  62  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00556654 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1047  major facilitator transporter  26.8 
 
 		 405 aa  61.6  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0492  major facilitator transporter  27.46 
 
 		 422 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8502  major facilitator transporter  27.25 
 
 		 388 aa  61.6  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.988555 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3364  major facilitator transporter  25.35 
 
 		 412 aa  61.2  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2246  major facilitator superfamily MFS_1  29.02 
 
 		 427 aa  61.2  0.00000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1909  major facilitator family transporter  23.44 
 
 		 406 aa  60.5  0.00000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1953  hypothetical protein  25.62 
 
 		 406 aa  60.5  0.00000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3043  major facilitator transporter  26.1 
 
 		 394 aa  60.5  0.00000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.890919 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4033  hypothetical protein  27.27 
 
 		 386 aa  60.5  0.00000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.253788 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1033  major facilitator transporter  28.9 
 
 		 389 aa  60.5  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.611435 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5732  major facilitator superfamily MFS_1  25.43 
 
 		 401 aa  60.1  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.495479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1594  major facilitator transporter  25.17 
 
 		 457 aa  60.1  0.00000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.224646  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3681  major facilitator superfamily MFS_1  26.41 
 
 		 402 aa  59.7  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0393  major facilitator transporter  25.99 
 
 		 421 aa  59.3  0.0000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.464327  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0038  major facilitator transporter  28.78 
 
 		 432 aa  58.9  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4896  hypothetical protein  24.3 
 
 		 395 aa  58.9  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3052  major facilitator family transporter  24.81 
 
 		 413 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0742962  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0358  hypothetical protein  23.88 
 
 		 400 aa  58.5  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.23836  unclonable  0.0000000671481 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2878  major facilitator transporter  26.59 
 
 		 459 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.124672 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2373  MFS family transporter  28.9 
 
 		 389 aa  58.9  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.098036  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1590  major facilitator transporter  23.65 
 
 		 431 aa  58.5  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0171149  normal  0.72938 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0445  major facilitator transporter  28.62 
 
 		 408 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1234  major facilitator transporter  27.08 
 
 		 433 aa  58.2  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4009  major facilitator transporter  27.76 
 
 		 436 aa  58.9  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.636189  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0513  MFS permease  24.13 
 
 		 430 aa  58.5  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.773198  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3310  MFS permease  29.82 
 
 		 401 aa  58.2  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.641652  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7234  major facilitator superfamily MFS_1  27.57 
 
 		 411 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0450  major facilitator transporter  26.37 
 
 		 424 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.240321  normal  0.0410928 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3154  major facilitator superfamily MFS_1  27.09 
 
 		 421 aa  57  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.328617  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2958  major facilitator transporter  27.46 
 
 		 421 aa  57  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.175452  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3001  major facilitator transporter  25.42 
 
 		 432 aa  57  0.0000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0339  major facilitator superfamily permease  25.67 
 
 		 399 aa  56.6  0.0000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.2038  normal  0.0205502 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0598  MFS transporter  24.69 
 
 		 412 aa  56.2  0.0000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.991617  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02171  transport transmembrane protein  24.33 
 
 		 448 aa  55.5  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.115532  normal  0.0335477 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10510  arabinose efflux permease family protein  23.88 
 
 		 500 aa  55.5  0.000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.67129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4990  major facilitator transporter  26.55 
 
 		 431 aa  55.1  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.214245  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4428  major facilitator transporter  23.1 
 
 		 428 aa  55.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00672186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3046  major facilitator superfamily MFS_1  27.11 
 
 		 421 aa  55.1  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.548752  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1902  major facilitator transporter  28.25 
 
 		 427 aa  54.7  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00743695 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4945  major facilitator transporter  24.14 
 
 		 440 aa  54.3  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>