113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_2373 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_2373  MFS family transporter  100 
 
 		 389 aa  717    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.098036  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1033  major facilitator transporter  99.49 
 
 		 389 aa  711    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.611435 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1455  major facilitator transporter  40.48 
 
 		 411 aa  202  7e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0489  major facilitator transporter  38.12 
 
 		 394 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0225  protein of unknown function DUF1228  41 
 
 		 395 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3596  major facilitator transporter  38.68 
 
 		 398 aa  192  8e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0334  major facilitator superfamily MFS_1  39.15 
 
 		 395 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2883  major facilitator transporter  39.28 
 
 		 391 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000788215 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3608  major facilitator transporter  39.85 
 
 		 416 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7222  major facilitator superfamily MFS_1  41.48 
 
 		 415 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5344  major facilitator transporter  40.27 
 
 		 415 aa  172  1e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0908766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3912  major facilitator transporter  40 
 
 		 416 aa  170  4e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.812744 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0434  major facilitator transporter  39.83 
 
 		 408 aa  169  6e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2507  hypothetical protein  38.3 
 
 		 443 aa  167  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.690501  normal  0.711571 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0339  major facilitator superfamily permease  40.56 
 
 		 399 aa  166  5e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.2038  normal  0.0205502 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5090  major facilitator transporter  39.19 
 
 		 416 aa  164  3e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.778625 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8502  major facilitator transporter  36.97 
 
 		 388 aa  162  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.988555 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0241  major facilitator transporter  40.11 
 
 		 393 aa  160  4e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.616236  normal  0.0363881 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3514  major facilitator transporter  37.57 
 
 		 415 aa  157  3e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.747582  normal  0.0415191 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2826  major facilitator superfamily MFS_1  40.17 
 
 		 380 aa  151  2e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.160845 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1585  major facilitator transporter  27.44 
 
 		 403 aa  106  8e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0169  major facilitator superfamily MFS_1  30.03 
 
 		 397 aa  105  2e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0856  major facilitator transporter  29.18 
 
 		 397 aa  100  5e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4509  hypothetical protein  32.01 
 
 		 392 aa  100  5e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.530694 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0706  major facilitator family transporter  29.67 
 
 		 428 aa  91.3  3e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.233996  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3043  major facilitator transporter  32.42 
 
 		 394 aa  90.1  6e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.890919 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0358  hypothetical protein  30.25 
 
 		 400 aa  89  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.23836  unclonable  0.0000000671481 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2482  major facilitator superfamily MFS_1  29.85 
 
 		 417 aa  83.2  0.000000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0484  hypothetical protein  31.62 
 
 		 400 aa  82.8  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1231  major facilitator superfamily tranporter  27.01 
 
 		 428 aa  79.3  0.0000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.475499 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0279  major facilitator transporter  23.8 
 
 		 398 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1047  major facilitator transporter  29.57 
 
 		 405 aa  76.3  0.0000000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4896  hypothetical protein  25.28 
 
 		 395 aa  75.1  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2851  protein of unknown function DUF1228  30.31 
 
 		 394 aa  74.3  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0859226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0386  hypothetical protein  31.71 
 
 		 359 aa  73.9  0.000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3120  protein of unknown function DUF1228  30.29 
 
 		 394 aa  73.6  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.508963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1160  major facilitator transporter  25.32 
 
 		 433 aa  73.2  0.000000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0149798 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0634  protein of unknown function DUF1228  30.33 
 
 		 374 aa  70.1  0.00000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0072  hypothetical protein  31.59 
 
 		 400 aa  68.2  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6839  protein of unknown function DUF1228  28.97 
 
 		 408 aa  68.2  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0480421  normal  0.134894 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6538  major facilitator transporter  32.66 
 
 		 404 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.499845 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1909  major facilitator family transporter  29 
 
 		 406 aa  66.6  0.0000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3310  MFS permease  29.89 
 
 		 401 aa  66.2  0.0000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.641652  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2649  major facilitator transporter  22.05 
 
 		 389 aa  65.5  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.189084 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1737  major facilitator superfamily MFS_1  29.1 
 
 		 413 aa  64.3  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0557  major facilitator superfamily MFS_1  28.61 
 
 		 415 aa  63.2  0.000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0349703  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2332  major facilitator transporter  38.51 
 
 		 410 aa  62.4  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000158827  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1488  hypothetical protein  31.47 
 
 		 417 aa  61.6  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.861875 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1213  major facilitator transporter  33.61 
 
 		 398 aa  62  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.451147 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3678  protein of unknown function DUF1228  31.79 
 
 		 405 aa  60.1  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.28396  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2580  major facilitator transporter  20.62 
 
 		 398 aa  59.3  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0171602  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1291  hypothetical protein  31.62 
 
 		 408 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.895388  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4528  major facilitator transporter  30.17 
 
 		 392 aa  58.2  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0733  hypothetical protein  27.65 
 
 		 388 aa  57  0.0000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.162418  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4526  hypothetical protein  32.3 
 
 		 390 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0806  hypothetical protein  28.49 
 
 		 423 aa  55.1  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.314007 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4033  hypothetical protein  32.14 
 
 		 386 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.253788 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3309  major facilitator transporter  29.22 
 
 		 395 aa  54.7  0.000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0280  major facilitator transporter  27.63 
 
 		 395 aa  54.7  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1611  hypothetical protein  30.02 
 
 		 409 aa  54.7  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0445  major facilitator transporter  29.69 
 
 		 408 aa  54.3  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04201  predicted inner membrane protein  27.95 
 
 		 392 aa  53.9  0.000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000208654  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3664  protein of unknown function DUF1228  27.95 
 
 		 392 aa  53.9  0.000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000330121  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2647  major facilitator transporter  30.18 
 
 		 385 aa  53.9  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.652327  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04164  hypothetical protein  27.95 
 
 		 392 aa  53.9  0.000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000012722  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5732  major facilitator superfamily MFS_1  27.04 
 
 		 401 aa  53.9  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.495479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1953  hypothetical protein  29.92 
 
 		 406 aa  53.5  0.000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4560  major facilitator transporter  27.83 
 
 		 392 aa  53.1  0.000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4870  major facilitator family protein  28.8 
 
 		 394 aa  53.1  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.444375 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08080  arabinose efflux permease family protein  26.32 
 
 		 398 aa  53.1  0.000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3732  hypothetical protein  27.99 
 
 		 392 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000100771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4318  hypothetical protein  31.33 
 
 		 409 aa  52  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0616031  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4555  hypothetical protein  35.23 
 
 		 417 aa  52  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0190  hypothetical protein  30.47 
 
 		 422 aa  51.6  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4846  transporter, major facilitator family  28.4 
 
 		 394 aa  51.6  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4918  major facilitator family transporter  28.4 
 
 		 394 aa  51.6  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.844872  normal  0.222303 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4773  transporter, major facilitator family  27.7 
 
 		 392 aa  51.2  0.00003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6744  major facilitator superfamily MFS_1  30.45 
 
 		 405 aa  51.2  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.713185 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7234  major facilitator superfamily MFS_1  30.12 
 
 		 411 aa  51.2  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0856  hypothetical protein  26.41 
 
 		 412 aa  50.8  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5539  hypothetical protein  28.08 
 
 		 402 aa  50.8  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.188295  normal  0.0555001 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4932  major facilitator transporter  27.41 
 
 		 392 aa  50.8  0.00004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4772  transporter major facilitator family  28.4 
 
 		 394 aa  50.8  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1330  hypothetical protein  35.33 
 
 		 413 aa  50.1  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.312035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0209  protein of unknown function DUF1228  30.71 
 
 		 422 aa  50.1  0.00007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.805115  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1559  hypothetical protein  27.01 
 
 		 385 aa  49.7  0.00008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0393  major facilitator transporter  29.22 
 
 		 421 aa  48.9  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.464327  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2822  protein of unknown function DUF1228  27.95 
 
 		 421 aa  48.9  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.503322  normal  0.147565 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0751  protein of unknown function DUF1228  27.3 
 
 		 404 aa  48.9  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.361372 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0821  protein of unknown function DUF1228  27.23 
 
 		 404 aa  47.8  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.303268  normal  0.29655 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4306  major facilitator superfamily transporter  32.53 
 
 		 413 aa  47.8  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0575629 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2754  hypothetical protein  29.41 
 
 		 382 aa  47.4  0.0004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4920  major facilitator family transporter  28.47 
 
 		 394 aa  47.4  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.177935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1904  hypothetical protein  36.43 
 
 		 437 aa  47.4  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.21993 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4877  major facilitator transporter  30.66 
 
 		 392 aa  47  0.0006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.429993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5844  transporter, major facilitator family  30.66 
 
 		 392 aa  46.6  0.0007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.482212 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46180  hypothetical protein  30.41 
 
 		 397 aa  45.8  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0113792 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33770  hypothetical protein  30.59 
 
 		 408 aa  45.8  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.756882  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0207  hypothetical protein  27.52 
 
 		 395 aa  45.1  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.49283  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0319  major facilitator superfamily MFS_1  42.11 
 
 		 402 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0621236  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>