27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_5732 on replicon NC_011366
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011366  Rleg2_5732  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 401 aa  790    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.495479  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4013  hypothetical protein  25.4 
 
 		 398 aa  91.3  3e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0244  major facilitator transporter  23.4 
 
 		 403 aa  88.2  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2482  major facilitator superfamily MFS_1  24.43 
 
 		 417 aa  66.6  0.0000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0706  major facilitator family transporter  22.77 
 
 		 428 aa  64.3  0.000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.233996  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1737  major facilitator superfamily MFS_1  22.88 
 
 		 413 aa  61.6  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0489  major facilitator transporter  27.08 
 
 		 394 aa  60.5  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3596  major facilitator transporter  23.13 
 
 		 398 aa  57.4  0.0000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0225  protein of unknown function DUF1228  27.17 
 
 		 395 aa  51.2  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1985  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  24.27 
 
 		 410 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.884683 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0040  major facilitator transporter  23.72 
 
 		 394 aa  49.7  0.00009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4020  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  22.97 
 
 		 415 aa  49.7  0.00009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000164842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1467  major facilitator superfamily MFS_1  23.96 
 
 		 443 aa  47  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0652  major facilitator superfamily anion(tartrate)/cation symporter  29.89 
 
 		 437 aa  46.6  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.55035  normal  0.662228 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2826  major facilitator superfamily MFS_1  27.69 
 
 		 380 aa  46.2  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.160845 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2560  putative MFS transporter  24.14 
 
 		 407 aa  45.8  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.399252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0334  major facilitator superfamily MFS_1  23.56 
 
 		 395 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2731  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  26.11 
 
 		 406 aa  45.8  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.541783 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0216  hypothetical protein  22.68 
 
 		 393 aa  45.4  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0557  major facilitator superfamily MFS_1  28.79 
 
 		 415 aa  45.1  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0349703  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0806  major facilitator transporter  23.78 
 
 		 396 aa  45.4  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.674294 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1282  major facilitator transporter  33.57 
 
 		 400 aa  44.7  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.800461 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0279  major facilitator transporter  21.93 
 
 		 398 aa  43.9  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0241  major facilitator transporter  24.24 
 
 		 393 aa  43.5  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.616236  normal  0.0363881 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0865  major facilitator transporter  19.4 
 
 		 430 aa  43.5  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2055  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  24.5 
 
 		 401 aa  43.1  0.009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.205311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4035  major facilitator transporter  32.86 
 
 		 400 aa  43.1  0.01  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>