41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_0244 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_0244  major facilitator transporter  100 
 
 		 403 aa  796    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4013  hypothetical protein  52.75 
 
 		 398 aa  390  1e-107  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5732  major facilitator superfamily MFS_1  23.53 
 
 		 401 aa  76.3  0.0000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.495479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0905  major facilitator superfamily MFS_1  23.93 
 
 		 368 aa  67  0.0000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0706  major facilitator family transporter  25.67 
 
 		 428 aa  56.6  0.0000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.233996  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1866  major facilitator transporter  23.76 
 
 		 425 aa  54.7  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.591814  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1920  major facilitator superfamily permease  23.94 
 
 		 423 aa  54.7  0.000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000507154  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3898  major facilitator superfamily MFS_1  25.12 
 
 		 404 aa  53.5  0.000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.82159  normal  0.735977 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0489  major facilitator transporter  22.64 
 
 		 394 aa  52.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0906  major facilitator transporter  25.21 
 
 		 391 aa  52.4  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2482  major facilitator superfamily MFS_1  23.74 
 
 		 417 aa  52.8  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3429  major facilitator superfamily MFS_1  23.54 
 
 		 407 aa  50.8  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2622  major facilitator superfamily MFS_1  22.31 
 
 		 421 aa  48.9  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0840  major facilitator superfamily MFS_1  26.76 
 
 		 413 aa  47.8  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2316  major facilitator superfamily MFS_1  23.46 
 
 		 446 aa  47.8  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0184  major facilitator transporter  27.23 
 
 		 396 aa  47  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1673  major facilitator transporter  27.23 
 
 		 396 aa  46.2  0.0009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00717957  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3109  major facilitator transporter  23.31 
 
 		 414 aa  46.2  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.953505  normal  0.200859 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1224  MFS permease  25.47 
 
 		 415 aa  45.4  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0960  major facilitator superfamily MFS_1  28.82 
 
 		 413 aa  45.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.272153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3167  major facilitator transporter  21.98 
 
 		 417 aa  45.1  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.312872 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0515  major facilitator superfamily MFS_1  20.94 
 
 		 399 aa  44.7  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1737  major facilitator superfamily MFS_1  23.38 
 
 		 413 aa  44.7  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1282  major facilitator transporter  22.59 
 
 		 400 aa  44.7  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.800461 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0295  inner membrane transport protein YdhP  26.22 
 
 		 391 aa  44.3  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0911  major facilitator superfamily permease  22.47 
 
 		 388 aa  44.3  0.004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000338401  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08080  arabinose efflux permease family protein  22.63 
 
 		 398 aa  44.3  0.004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5749  major facilitator superfamily MFS_1  24.07 
 
 		 436 aa  43.9  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0301  inner membrane transport protein YdhP  26.45 
 
 		 391 aa  43.9  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32250  Major facilitator family transporter protein  21.19 
 
 		 415 aa  43.5  0.006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1718  transporter, putative  21.35 
 
 		 402 aa  43.5  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.149984  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3671  major facilitator transporter  21.35 
 
 		 402 aa  43.5  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.112178  normal  0.0907085 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2297  hypothetical protein  22.35 
 
 		 528 aa  43.5  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3544  major facilitator transporter  26.21 
 
 		 415 aa  43.9  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.773676  normal  0.279857 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2580  major facilitator transporter  21.15 
 
 		 398 aa  43.5  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0171602  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2713  major facilitator transporter  22.99 
 
 		 412 aa  43.5  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.11572 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4144  major facilitator transporter  19.53 
 
 		 404 aa  43.5  0.007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0444016  hitchhiker  0.00345151 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3622  major facilitator transporter  23.94 
 
 		 411 aa  43.1  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.769068  normal  0.781308 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1013  major facilitator superfamily transporter  24.11 
 
 		 405 aa  43.1  0.008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1676  major facilitator transporter  19.35 
 
 		 411 aa  43.1  0.009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0280  inner membrane transport protein YdhP  26.45 
 
 		 391 aa  43.1  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>