226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_B0184 on replicon NC_007410
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007410  Ava_B0184  major facilitator transporter  100 
 
 		 396 aa  786    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1673  major facilitator transporter  95.71 
 
 		 396 aa  743    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00717957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4494  major facilitator transporter  36.95 
 
 		 416 aa  186  6e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3032  major facilitator superfamily MFS_1  35 
 
 		 411 aa  178  2e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.998579  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1339  major facilitator superfamily MFS_1  30.05 
 
 		 406 aa  176  5e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2336  major facilitator transporter  33.16 
 
 		 424 aa  169  7e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1571  major facilitator superfamily MFS_1  31.98 
 
 		 412 aa  168  2e-40  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.823301  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3259  RhtX/FptX family siderophore transporter  33.88 
 
 		 420 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.569308  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0590  major facilitator transporter  30.07 
 
 		 465 aa  166  5e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.97195 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1044  muropeptide transporter  30 
 
 		 495 aa  159  8e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0385615  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3268  muropeptide transporter  29.46 
 
 		 495 aa  155  1e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.482744  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3834  major facilitator transporter  27.64 
 
 		 417 aa  155  1e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2276  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 		 416 aa  154  2e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1218  major facilitator superfamily MFS_1  31.77 
 
 		 425 aa  152  8e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.8639  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5064  RhtX/FptX family siderophore transporter  31.57 
 
 		 418 aa  150  4e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.646034  hitchhiker  0.00624927 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2999  major facilitator transporter  29.08 
 
 		 388 aa  148  2.0000000000000003e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4017  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 412 aa  147  2.0000000000000003e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.165032 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2881  muropeptide transporter  31.23 
 
 		 489 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.457618  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3380  RhtX/FptX family siderophore transporter  35.83 
 
 		 271 aa  147  3e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1091  muropeptide transporter  28.34 
 
 		 492 aa  147  3e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000207294  hitchhiker  0.00000512549 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1498  major facilitator transporter  29.97 
 
 		 408 aa  147  3e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.85322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3983  major facilitator superfamily MFS_1  29.15 
 
 		 416 aa  146  5e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.819094 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3239  muropeptide transporter  28.18 
 
 		 492 aa  146  6e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.83474  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1496  major facilitator transporter  29.44 
 
 		 395 aa  146  8.000000000000001e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.372528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3096  muropeptide transporter  28.18 
 
 		 492 aa  145  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0966625  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3058  muropeptide transporter  28.18 
 
 		 492 aa  145  1e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000335083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0600  AmpG protein  31.74 
 
 		 428 aa  144  2e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.674312  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0344  major facilitator transporter  29.3 
 
 		 415 aa  145  2e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0470  major facilitator superfamily protein  30.08 
 
 		 428 aa  145  2e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.807635  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0320  ampG protein, putative  29.16 
 
 		 409 aa  144  3e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3088  major facilitator superfamily MFS_1  30.1 
 
 		 408 aa  143  6e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.120291  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0191  muropeptide transporter  28.61 
 
 		 419 aa  142  9e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10028  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4990  major facilitator superfamily MFS_1  27.72 
 
 		 424 aa  142  9e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1901  AmpG  27.67 
 
 		 433 aa  141  1.9999999999999998e-32  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.165833  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0289  AmpG protein  27.67 
 
 		 433 aa  141  1.9999999999999998e-32  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0900  muropeptide transporter  26.28 
 
 		 491 aa  140  3e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00841123  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0333  major facilitator superfamily MFS_1  29.1 
 
 		 464 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2483  major facilitator transporter  29.23 
 
 		 411 aa  140  4.999999999999999e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0059  major facilitator transporter  27.68 
 
 		 464 aa  139  1e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.955073  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00384  muropeptide transporter  26.79 
 
 		 491 aa  138  2e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000202049  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0856  hypothetical protein  29.6 
 
 		 419 aa  138  2e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0830  hypothetical protein  29.87 
 
 		 415 aa  137  2e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00388  hypothetical protein  26.79 
 
 		 491 aa  138  2e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000464324  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3176  AmpG-related permease  26.79 
 
 		 491 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000022392  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0508  muropeptide transporter  26.79 
 
 		 491 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000051766  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3200  muropeptide transporter  26.79 
 
 		 491 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00206592  hitchhiker  0.000120766 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0468  muropeptide transporter  26.79 
 
 		 491 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000134905  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0517  muropeptide transporter  26.79 
 
 		 491 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000689062  normal  0.616646 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0474  muropeptide transporter  27.2 
 
 		 491 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000168996  normal  0.779827 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0355  muropeptide transporter  26.79 
 
 		 491 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000149162  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0146  muropeptide transporter  28.05 
 
 		 426 aa  136  5e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.802826 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4390  major facilitator superfamily (MFS)muropeptide transporter  28.17 
 
 		 464 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3072  muropeptide transporter  28.85 
 
 		 489 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000553099  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0047  muropeptide transporter  27.67 
 
 		 429 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.252605 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0044  muropeptide transporter  27.95 
 
 		 429 aa  133  5e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3267  major facilitator superfamily MFS_1  30.26 
 
 		 641 aa  133  6.999999999999999e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0360641 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3244  AmpG-related permease  26.58 
 
 		 437 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0375  major facilitator superfamily muropeptide transporter  26.58 
 
 		 437 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2905  AmpG-related permease  26.58 
 
 		 437 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2184  AmpG-related permease  26.58 
 
 		 437 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.452697  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0180  major facilitator transporter  26.58 
 
 		 437 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.277448  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0190  major facilitator transporter  26.58 
 
 		 437 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3443  AmpG-related permease  26.58 
 
 		 437 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0155  AmpG-related permease  27.09 
 
 		 437 aa  130  3e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0074  major facilitator superfamily MFS_1  31.97 
 
 		 406 aa  130  4.0000000000000003e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.220484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0486  muropeptide transporter  26.79 
 
 		 491 aa  129  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00924697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1299  major facilitator transporter  25.18 
 
 		 447 aa  129  6e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.333624  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0547  muropeptide transporter  26.79 
 
 		 491 aa  130  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.283527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0484  muropeptide transporter  26.79 
 
 		 493 aa  129  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000603755  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0492  muropeptide transporter  26.79 
 
 		 493 aa  129  7.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00144184  decreased coverage  0.00023941 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0503  muropeptide transporter  26.79 
 
 		 491 aa  129  7.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000985164  normal  0.643991 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0706  putative ampG protein  26.88 
 
 		 426 aa  128  2.0000000000000002e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0866  major facilitator transporter  29.73 
 
 		 413 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00348625  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0154  muropeptide transporter  27 
 
 		 426 aa  126  6e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.679367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2561  major facilitator transporter  25.75 
 
 		 517 aa  124  3e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.249955  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0337  major facilitator transporter  31.69 
 
 		 418 aa  124  3e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.957507  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6452  major facilitator transporter  30.3 
 
 		 473 aa  123  4e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.554159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2487  major facilitator transporter  29.97 
 
 		 473 aa  123  6e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.60868  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3101  major facilitator transporter  29.97 
 
 		 473 aa  123  6e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3117  major facilitator transporter  29.97 
 
 		 473 aa  123  6e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1287  major facilitator superfamily MFS_1  25.6 
 
 		 517 aa  122  9e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3039  major facilitator transporter  29.63 
 
 		 473 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3156  major facilitator transporter  29.63 
 
 		 473 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6531  major facilitator transporter  27.49 
 
 		 443 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.118713  normal  0.219837 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1388  major facilitator superfamily MFS_1  25.6 
 
 		 517 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.344668  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3098  major facilitator transporter  29.29 
 
 		 473 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0128  major facilitator transporter  29.59 
 
 		 422 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7099  major facilitator superfamily MFS_1  25.46 
 
 		 447 aa  114  3e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.835982  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0840  major facilitator transporter  29.33 
 
 		 439 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02935  signal transducer  28.34 
 
 		 431 aa  110  4.0000000000000004e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.726126  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0756  major facilitator transporter  27.93 
 
 		 428 aa  108  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0688  major facilitator transporter  27.5 
 
 		 434 aa  106  8e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0814  putative permease  25.06 
 
 		 424 aa  104  3e-21  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0110  major facilitator superfamily MFS_1  24.75 
 
 		 452 aa  103  6e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0140571  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0083  major facilitator transporter  27.67 
 
 		 457 aa  103  6e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0365182 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2009  major facilitator transporter  23.66 
 
 		 415 aa  102  1e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.872827  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4038  major facilitator transporter  27.05 
 
 		 482 aa  102  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.549121  normal  0.182505 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4408  major facilitator superfamily MFS_1  27.05 
 
 		 482 aa  101  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0623  major facilitator superfamily MFS_1  26.44 
 
 		 459 aa  101  3e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.89214  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0664  major facilitator transporter  26.81 
 
 		 456 aa  101  3e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.757276  normal  0.314251 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>