219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_1218 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_1218  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
425 aa  828    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.8639  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3983  major facilitator superfamily MFS_1  70.37 
 
 
416 aa  574  1.0000000000000001e-163  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.819094 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0470  major facilitator superfamily protein  66.27 
 
 
428 aa  559  1e-158  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.807635  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4017  major facilitator transporter  54.36 
 
 
412 aa  434  1e-120  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.165032 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0044  muropeptide transporter  49.53 
 
 
429 aa  379  1e-104  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0047  muropeptide transporter  49.29 
 
 
429 aa  377  1e-103  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.252605 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0154  muropeptide transporter  50.62 
 
 
426 aa  371  1e-101  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.679367  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3096  muropeptide transporter  50.13 
 
 
492 aa  359  5e-98  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0966625  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3058  muropeptide transporter  50.13 
 
 
492 aa  359  5e-98  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000335083  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3239  muropeptide transporter  49.87 
 
 
492 aa  357  1.9999999999999998e-97  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.83474  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1091  muropeptide transporter  50.9 
 
 
492 aa  355  5.999999999999999e-97  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000207294  hitchhiker  0.00000512549 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1044  muropeptide transporter  49.13 
 
 
495 aa  354  2e-96  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0385615  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0900  muropeptide transporter  49.49 
 
 
491 aa  353  4e-96  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00841123  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3268  muropeptide transporter  49.13 
 
 
495 aa  352  5.9999999999999994e-96  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.482744  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3072  muropeptide transporter  47.41 
 
 
489 aa  348  1e-94  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000553099  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3176  AmpG-related permease  48.75 
 
 
491 aa  341  1e-92  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000022392  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0191  muropeptide transporter  47.13 
 
 
419 aa  341  1e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10028  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0508  muropeptide transporter  48.75 
 
 
491 aa  341  1e-92  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000051766  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0468  muropeptide transporter  48.75 
 
 
491 aa  341  1e-92  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000134905  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3200  muropeptide transporter  48.75 
 
 
491 aa  341  1e-92  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00206592  hitchhiker  0.000120766 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0355  muropeptide transporter  48.75 
 
 
491 aa  341  1e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000149162  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0517  muropeptide transporter  48.75 
 
 
491 aa  341  1e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000689062  normal  0.616646 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00384  muropeptide transporter  48.75 
 
 
491 aa  340  2e-92  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000202049  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0474  muropeptide transporter  48.75 
 
 
491 aa  341  2e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000168996  normal  0.779827 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0146  muropeptide transporter  48.38 
 
 
426 aa  340  2e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.802826 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00388  hypothetical protein  48.75 
 
 
491 aa  340  2e-92  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000464324  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3834  major facilitator transporter  42.43 
 
 
417 aa  334  2e-90  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0547  muropeptide transporter  50 
 
 
491 aa  332  8e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.283527  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0492  muropeptide transporter  50 
 
 
493 aa  332  8e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00144184  decreased coverage  0.00023941 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0484  muropeptide transporter  50 
 
 
493 aa  332  9e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000603755  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0503  muropeptide transporter  50 
 
 
491 aa  332  9e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000985164  normal  0.643991 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0486  muropeptide transporter  50 
 
 
491 aa  332  9e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00924697  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2483  major facilitator transporter  46.91 
 
 
411 aa  331  1e-89  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2881  muropeptide transporter  49.63 
 
 
489 aa  329  5.0000000000000004e-89  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.457618  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2276  major facilitator superfamily MFS_1  46.62 
 
 
416 aa  328  2.0000000000000001e-88  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0320  ampG protein, putative  47.03 
 
 
409 aa  326  6e-88  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2999  major facilitator transporter  45.88 
 
 
388 aa  318  1e-85  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3244  AmpG-related permease  39.61 
 
 
437 aa  306  6e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0375  major facilitator superfamily muropeptide transporter  39.61 
 
 
437 aa  306  6e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2905  AmpG-related permease  39.61 
 
 
437 aa  306  6e-82  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2184  AmpG-related permease  39.61 
 
 
437 aa  306  6e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.452697  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0180  major facilitator transporter  39.61 
 
 
437 aa  306  6e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.277448  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0190  major facilitator transporter  39.61 
 
 
437 aa  306  6e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3443  AmpG-related permease  39.61 
 
 
437 aa  306  6e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0600  AmpG protein  39.95 
 
 
428 aa  305  1.0000000000000001e-81  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.674312  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4390  major facilitator superfamily (MFS)muropeptide transporter  37.99 
 
 
464 aa  300  2e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0289  AmpG protein  41.84 
 
 
433 aa  299  5e-80  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1901  AmpG  41.58 
 
 
433 aa  298  2e-79  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.165833  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0155  AmpG-related permease  39.9 
 
 
437 aa  296  6e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0059  major facilitator transporter  37.01 
 
 
464 aa  294  3e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.955073  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0128  major facilitator transporter  42.14 
 
 
422 aa  293  4e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6452  major facilitator transporter  36.38 
 
 
473 aa  292  8e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.554159  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0333  major facilitator superfamily MFS_1  38.04 
 
 
464 aa  292  1e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2487  major facilitator transporter  36.84 
 
 
473 aa  291  1e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.60868  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3101  major facilitator transporter  36.84 
 
 
473 aa  291  1e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3098  major facilitator transporter  36.16 
 
 
473 aa  291  1e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3117  major facilitator transporter  36.61 
 
 
473 aa  291  2e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3039  major facilitator transporter  35.93 
 
 
473 aa  290  4e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3156  major facilitator transporter  35.7 
 
 
473 aa  289  6e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0706  putative ampG protein  38.67 
 
 
426 aa  289  8e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0083  major facilitator transporter  40.96 
 
 
457 aa  263  4.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0365182 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3691  major facilitator transporter  39.47 
 
 
454 aa  261  2e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.639879  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0664  major facilitator transporter  39.33 
 
 
456 aa  256  6e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.757276  normal  0.314251 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3063  major facilitator transporter  40.19 
 
 
452 aa  254  2.0000000000000002e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.797307  normal  0.542737 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2937  major facilitator transporter  41.44 
 
 
443 aa  254  3e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1299  major facilitator transporter  36.72 
 
 
447 aa  251  2e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.333624  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2561  major facilitator transporter  39.07 
 
 
517 aa  247  3e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.249955  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0623  major facilitator superfamily MFS_1  39.33 
 
 
459 aa  246  4e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.89214  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1388  major facilitator superfamily MFS_1  39.46 
 
 
517 aa  246  4.9999999999999997e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.344668  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1287  major facilitator superfamily MFS_1  39.46 
 
 
517 aa  246  4.9999999999999997e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6531  major facilitator transporter  38.77 
 
 
443 aa  246  6e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.118713  normal  0.219837 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7099  major facilitator superfamily MFS_1  37.66 
 
 
447 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.835982  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3644  major facilitator transporter  35.67 
 
 
472 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0893526 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3814  ampG protein, putative  33.63 
 
 
461 aa  241  2e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0812  major facilitator transporter  34.08 
 
 
463 aa  241  2e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0711  major facilitator transporter  33.94 
 
 
471 aa  241  2e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3531  major facilitator superfamily MFS_1  33.41 
 
 
471 aa  240  2.9999999999999997e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000125194 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0783  major facilitator transporter  34.55 
 
 
463 aa  240  4e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.191663  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3155  major facilitator transporter  34.55 
 
 
465 aa  239  5e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0770  major facilitator transporter  38.07 
 
 
455 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.742854 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2892  major facilitator transporter  34.48 
 
 
472 aa  236  5.0000000000000005e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0730175  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3442  major facilitator transporter  35.27 
 
 
478 aa  236  6e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.141995  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0819  major facilitator transporter  33.49 
 
 
471 aa  236  7e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3113  major facilitator transporter  32.97 
 
 
476 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7340  major facilitator superfamily permease  39.81 
 
 
460 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3600  major facilitator transporter  33.19 
 
 
471 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3723  major facilitator transporter  33.19 
 
 
471 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0814  putative permease  33.01 
 
 
424 aa  233  5e-60  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1400  signal transducer ampG1  56.89 
 
 
502 aa  233  6e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00988952  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4038  major facilitator transporter  35.71 
 
 
482 aa  232  8.000000000000001e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.549121  normal  0.182505 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4408  major facilitator superfamily MFS_1  35.71 
 
 
482 aa  231  1e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0771  major facilitator transporter  34.01 
 
 
465 aa  232  1e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00332718  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0069  major facilitator superfamily MFS_1  33.41 
 
 
475 aa  231  2e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.805125  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0830  hypothetical protein  36.34 
 
 
415 aa  228  1e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4520  major facilitator superfamily MFS_1  35.2 
 
 
504 aa  228  1e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.623775  normal  0.239632 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0856  hypothetical protein  35.75 
 
 
419 aa  228  2e-58  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2556  AmpG protein, putative  34.92 
 
 
466 aa  227  3e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.368438 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0152  major facilitator superfamily transporter  35.66 
 
 
466 aa  227  4e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.421087  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0624  major facilitator transporter  38.63 
 
 
461 aa  226  6e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.471905  normal  0.556428 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1449  major facilitator transporter  40.73 
 
 
453 aa  226  6e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>