214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_0110 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_0110  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 452 aa  888    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0140571  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2937  major facilitator transporter  44.9 
 
 		 443 aa  320  3e-86  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0253  putative transport transmembrane protein  43.96 
 
 		 462 aa  316  5e-85  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0069  major facilitator superfamily MFS_1  40.39 
 
 		 475 aa  308  9e-83  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.805125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2556  AmpG protein, putative  45.71 
 
 		 466 aa  305  9.000000000000001e-82  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.368438 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0783  major facilitator transporter  43.72 
 
 		 463 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.191663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2892  major facilitator transporter  41.83 
 
 		 472 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0730175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3113  major facilitator transporter  41.67 
 
 		 476 aa  302  9e-81  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0771  major facilitator transporter  42.06 
 
 		 465 aa  301  1e-80  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00332718  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3155  major facilitator transporter  42.58 
 
 		 465 aa  302  1e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0812  major facilitator transporter  42.73 
 
 		 463 aa  302  1e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002702  AmpG permease  40.55 
 
 		 450 aa  301  2e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3814  ampG protein, putative  43.05 
 
 		 461 aa  300  3e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3644  major facilitator transporter  41.69 
 
 		 472 aa  298  1e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0893526 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2679  major facilitator transporter  42.39 
 
 		 465 aa  298  2e-79  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000459278 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0944  MSF transporter  39.41 
 
 		 447 aa  296  6e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0819  major facilitator transporter  41.45 
 
 		 471 aa  293  6e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3600  major facilitator transporter  40.43 
 
 		 471 aa  292  9e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3723  major facilitator transporter  40.43 
 
 		 471 aa  292  9e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0711  major facilitator transporter  40.79 
 
 		 471 aa  291  1e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3531  major facilitator superfamily MFS_1  40.43 
 
 		 471 aa  291  2e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000125194 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1667  major facilitator transporter  39.41 
 
 		 451 aa  291  2e-77  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0579205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0329  major facilitator transporter  42.28 
 
 		 478 aa  288  2e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3596  major facilitator transporter  39.15 
 
 		 478 aa  287  2.9999999999999996e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.597959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1889  putative ampG protein  38.96 
 
 		 462 aa  287  2.9999999999999996e-76  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3114  major facilitator transporter  42.56 
 
 		 475 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3442  major facilitator transporter  41.35 
 
 		 478 aa  283  4.0000000000000003e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.141995  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0152  major facilitator superfamily transporter  39.1 
 
 		 466 aa  278  1e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.421087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2584  major facilitator superfamily transporter  41.13 
 
 		 439 aa  274  2.0000000000000002e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.11871  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0223  major facilitator transporter  40.14 
 
 		 461 aa  274  3e-72  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2143  major facilitator transporter  40.32 
 
 		 450 aa  273  5.000000000000001e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6531  major facilitator transporter  39.65 
 
 		 443 aa  268  1e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.118713  normal  0.219837 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2288  major facilitator transporter  40.27 
 
 		 468 aa  268  1e-70  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0199  major facilitator superfamily transporter  42.28 
 
 		 447 aa  268  2e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.723346  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3691  major facilitator transporter  39.33 
 
 		 454 aa  267  2.9999999999999995e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.639879  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03703  putative muropeptide transport protein  37.64 
 
 		 448 aa  267  2.9999999999999995e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3063  major facilitator transporter  40.67 
 
 		 452 aa  266  4e-70  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.797307  normal  0.542737 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03281  hypothetical protein  39.04 
 
 		 409 aa  266  7e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0209  major facilitator transporter  39.61 
 
 		 466 aa  265  8.999999999999999e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0263  major facilitator superfamily MFS_1  40.94 
 
 		 462 aa  263  6e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.464987  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0623  major facilitator superfamily MFS_1  39.01 
 
 		 459 aa  261  1e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.89214  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5113  major facilitator superfamily MFS_1  44.25 
 
 		 463 aa  261  2e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0470  major facilitator superfamily protein  37.19 
 
 		 428 aa  259  7e-68  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.807635  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1726  major facilitator superfamily MFS_1  39.49 
 
 		 417 aa  258  1e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.299438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2009  major facilitator transporter  39.3 
 
 		 415 aa  258  1e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.872827  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4017  major facilitator transporter  37.73 
 
 		 412 aa  257  3e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.165032 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0276  major facilitator superfamily transporter  39.91 
 
 		 449 aa  256  5e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.800927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0083  major facilitator transporter  39.01 
 
 		 457 aa  255  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0365182 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0770  major facilitator transporter  40.45 
 
 		 455 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.742854 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0214  major facilitator superfamily MFS_1  42.14 
 
 		 444 aa  254  3e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.131109  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0664  major facilitator transporter  38.29 
 
 		 456 aa  251  3e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.757276  normal  0.314251 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0516  major facilitator transporter  40.14 
 
 		 441 aa  250  4e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3983  major facilitator superfamily MFS_1  36.19 
 
 		 416 aa  248  1e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.819094 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7099  major facilitator superfamily MFS_1  37.67 
 
 		 447 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.835982  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2999  major facilitator transporter  40.39 
 
 		 388 aa  245  9e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0044  muropeptide transporter  37.98 
 
 		 429 aa  245  9.999999999999999e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0047  muropeptide transporter  38.2 
 
 		 429 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.252605 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2636  major facilitator transporter  39.09 
 
 		 429 aa  244  3e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.103448  normal  0.465614 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7340  major facilitator superfamily permease  40 
 
 		 460 aa  243  7e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0296  AmpG protein  36.88 
 
 		 457 aa  242  7.999999999999999e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0367426 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0154  muropeptide transporter  37.98 
 
 		 426 aa  241  2e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.679367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1235  muropeptide MFS uptake transporter AmpG  34.14 
 
 		 550 aa  241  2e-62  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.988982 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2483  major facilitator transporter  37.85 
 
 		 411 aa  240  4e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4520  major facilitator superfamily MFS_1  35.87 
 
 		 504 aa  238  1e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.623775  normal  0.239632 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13420  AmpG-related permease  35.76 
 
 		 515 aa  238  2e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3268  muropeptide transporter  36.51 
 
 		 495 aa  238  2e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.482744  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1044  muropeptide transporter  36.51 
 
 		 495 aa  238  2e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0385615  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0147  major facilitator transporter  35.99 
 
 		 550 aa  237  4e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4408  major facilitator superfamily MFS_1  35.11 
 
 		 482 aa  236  6e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4038  major facilitator transporter  35.11 
 
 		 482 aa  236  8e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.549121  normal  0.182505 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1218  major facilitator superfamily MFS_1  37.31 
 
 		 425 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.8639  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0624  major facilitator transporter  37.18 
 
 		 461 aa  233  7.000000000000001e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.471905  normal  0.556428 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0191  muropeptide transporter  37.3 
 
 		 419 aa  233  7.000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10028  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00384  muropeptide transporter  35.16 
 
 		 491 aa  229  5e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000202049  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00388  hypothetical protein  35.16 
 
 		 491 aa  229  5e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000464324  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1091  muropeptide transporter  36.23 
 
 		 492 aa  229  6e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000207294  hitchhiker  0.00000512549 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0474  muropeptide transporter  35.38 
 
 		 491 aa  229  9e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000168996  normal  0.779827 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3239  muropeptide transporter  35.75 
 
 		 492 aa  228  1e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.83474  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3058  muropeptide transporter  35.75 
 
 		 492 aa  228  1e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000335083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3096  muropeptide transporter  35.75 
 
 		 492 aa  228  1e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0966625  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0468  muropeptide transporter  35.16 
 
 		 491 aa  229  1e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000134905  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3200  muropeptide transporter  35.16 
 
 		 491 aa  229  1e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00206592  hitchhiker  0.000120766 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0508  muropeptide transporter  35.16 
 
 		 491 aa  229  1e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000051766  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0355  muropeptide transporter  35.16 
 
 		 491 aa  229  1e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000149162  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3176  AmpG-related permease  35.88 
 
 		 491 aa  228  2e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000022392  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0517  muropeptide transporter  35.88 
 
 		 491 aa  228  2e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000689062  normal  0.616646 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0289  AmpG protein  35.1 
 
 		 433 aa  227  4e-58  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1901  AmpG  34.87 
 
 		 433 aa  225  1e-57  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.165833  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0320  ampG protein, putative  36.84 
 
 		 409 aa  223  7e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0900  muropeptide transporter  34.97 
 
 		 491 aa  223  8e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00841123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1156  major facilitator transporter  34.42 
 
 		 553 aa  221  3e-56  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0968602  normal  0.231698 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0059  major facilitator transporter  34.67 
 
 		 464 aa  219  7e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.955073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0146  muropeptide transporter  37.22 
 
 		 426 aa  219  7.999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.802826 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4383  ampG protein, putative  33.72 
 
 		 516 aa  219  1e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.920569  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0484  muropeptide transporter  35.73 
 
 		 493 aa  218  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000603755  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6452  major facilitator transporter  34.48 
 
 		 473 aa  218  1e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.554159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2276  major facilitator superfamily MFS_1  38.53 
 
 		 416 aa  219  1e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0155  AmpG-related permease  35.27 
 
 		 437 aa  218  1e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0503  muropeptide transporter  35.73 
 
 		 491 aa  218  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000985164  normal  0.643991 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0375  major facilitator superfamily muropeptide transporter  34.8 
 
 		 437 aa  218  2e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>