216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpl0830 on replicon NC_006369
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp0856  hypothetical protein  97.54 
 
 
419 aa  767    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0830  hypothetical protein  100 
 
 
415 aa  822    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3239  muropeptide transporter  38.98 
 
 
492 aa  289  7e-77  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.83474  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3096  muropeptide transporter  38.98 
 
 
492 aa  288  9e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0966625  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3058  muropeptide transporter  38.98 
 
 
492 aa  288  9e-77  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000335083  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3268  muropeptide transporter  39.12 
 
 
495 aa  288  2e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.482744  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1044  muropeptide transporter  38.33 
 
 
495 aa  286  5e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0385615  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1091  muropeptide transporter  40.85 
 
 
492 aa  285  1.0000000000000001e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000207294  hitchhiker  0.00000512549 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2881  muropeptide transporter  40.49 
 
 
489 aa  282  1e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.457618  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0289  AmpG protein  37.65 
 
 
433 aa  281  2e-74  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1901  AmpG  37.65 
 
 
433 aa  279  5e-74  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.165833  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0900  muropeptide transporter  38.42 
 
 
491 aa  279  5e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00841123  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3176  AmpG-related permease  37.77 
 
 
491 aa  277  2e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000022392  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0517  muropeptide transporter  37.77 
 
 
491 aa  277  2e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000689062  normal  0.616646 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3200  muropeptide transporter  38.99 
 
 
491 aa  277  2e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00206592  hitchhiker  0.000120766 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0474  muropeptide transporter  38.96 
 
 
491 aa  278  2e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000168996  normal  0.779827 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0468  muropeptide transporter  38.99 
 
 
491 aa  277  2e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000134905  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0355  muropeptide transporter  38.99 
 
 
491 aa  277  2e-73  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000149162  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0508  muropeptide transporter  38.99 
 
 
491 aa  277  2e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000051766  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00384  muropeptide transporter  38.99 
 
 
491 aa  277  3e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000202049  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00388  hypothetical protein  38.99 
 
 
491 aa  277  3e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000464324  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3072  muropeptide transporter  39.81 
 
 
489 aa  272  9e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000553099  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0503  muropeptide transporter  38.18 
 
 
491 aa  270  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000985164  normal  0.643991 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0547  muropeptide transporter  38.18 
 
 
491 aa  270  2.9999999999999997e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.283527  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0044  muropeptide transporter  36.12 
 
 
429 aa  270  4e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0486  muropeptide transporter  37.93 
 
 
491 aa  269  7e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00924697  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0484  muropeptide transporter  37.93 
 
 
493 aa  269  8e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000603755  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0492  muropeptide transporter  37.93 
 
 
493 aa  269  8.999999999999999e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00144184  decreased coverage  0.00023941 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0191  muropeptide transporter  37.07 
 
 
419 aa  268  2e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10028  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4017  major facilitator transporter  37.92 
 
 
412 aa  266  5.999999999999999e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.165032 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0047  muropeptide transporter  37.4 
 
 
429 aa  265  1e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.252605 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0154  muropeptide transporter  35.99 
 
 
426 aa  263  4.999999999999999e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.679367  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0470  major facilitator superfamily protein  37.78 
 
 
428 aa  254  3e-66  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.807635  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2276  major facilitator superfamily MFS_1  40.05 
 
 
416 aa  251  1e-65  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0146  muropeptide transporter  35.44 
 
 
426 aa  249  7e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.802826 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2999  major facilitator transporter  37.85 
 
 
388 aa  246  6.999999999999999e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3983  major facilitator superfamily MFS_1  34.48 
 
 
416 aa  233  7.000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.819094 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0320  ampG protein, putative  35.52 
 
 
409 aa  227  3e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1218  major facilitator superfamily MFS_1  36.34 
 
 
425 aa  225  9e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.8639  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2483  major facilitator transporter  35.26 
 
 
411 aa  219  5e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0706  putative ampG protein  32.6 
 
 
426 aa  211  1e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0110  major facilitator superfamily MFS_1  34.7 
 
 
452 aa  204  3e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0140571  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2937  major facilitator transporter  33.5 
 
 
443 aa  203  4e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3834  major facilitator transporter  30.73 
 
 
417 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4070  HNH endonuclease  32.48 
 
 
509 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3691  major facilitator transporter  33.49 
 
 
454 aa  194  3e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.639879  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0600  AmpG protein  31.01 
 
 
428 aa  192  7e-48  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.674312  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0375  major facilitator superfamily muropeptide transporter  30.1 
 
 
437 aa  190  4e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0180  major facilitator transporter  30.1 
 
 
437 aa  190  4e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.277448  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0190  major facilitator transporter  30.1 
 
 
437 aa  190  4e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3063  major facilitator transporter  32.78 
 
 
452 aa  190  5e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.797307  normal  0.542737 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0083  major facilitator transporter  34.04 
 
 
457 aa  190  5e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0365182 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0664  major facilitator transporter  33.97 
 
 
456 aa  189  7e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.757276  normal  0.314251 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3244  AmpG-related permease  30.1 
 
 
437 aa  188  1e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2905  AmpG-related permease  30.1 
 
 
437 aa  188  1e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2184  AmpG-related permease  30.1 
 
 
437 aa  188  1e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.452697  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3443  AmpG-related permease  30.1 
 
 
437 aa  188  1e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0155  AmpG-related permease  30.1 
 
 
437 aa  187  2e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4390  major facilitator superfamily (MFS)muropeptide transporter  28.79 
 
 
464 aa  187  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0623  major facilitator superfamily MFS_1  33.73 
 
 
459 aa  187  4e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.89214  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0333  major facilitator superfamily MFS_1  29.26 
 
 
464 aa  186  7e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3644  major facilitator transporter  31.21 
 
 
472 aa  186  8e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0893526 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0128  major facilitator transporter  31.04 
 
 
422 aa  184  3e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0059  major facilitator transporter  29.02 
 
 
464 aa  184  3e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.955073  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0770  major facilitator transporter  35.17 
 
 
455 aa  184  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.742854 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0771  major facilitator transporter  32.17 
 
 
465 aa  182  9.000000000000001e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00332718  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0812  major facilitator transporter  30.89 
 
 
463 aa  180  4e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2584  major facilitator superfamily transporter  31.93 
 
 
439 aa  180  4e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.11871  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3155  major facilitator transporter  30.75 
 
 
465 aa  180  4.999999999999999e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0783  major facilitator transporter  31.21 
 
 
463 aa  180  4.999999999999999e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.191663  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6452  major facilitator transporter  28.08 
 
 
473 aa  179  7e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.554159  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0711  major facilitator transporter  30.11 
 
 
471 aa  178  1e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2487  major facilitator transporter  27.85 
 
 
473 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.60868  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3101  major facilitator transporter  27.85 
 
 
473 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0814  putative permease  30 
 
 
424 aa  177  4e-43  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3117  major facilitator transporter  27.63 
 
 
473 aa  177  4e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3039  major facilitator transporter  27.85 
 
 
473 aa  176  5e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0819  major facilitator transporter  31.17 
 
 
471 aa  176  5e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3156  major facilitator transporter  27.63 
 
 
473 aa  176  8e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3531  major facilitator superfamily MFS_1  31.17 
 
 
471 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000125194 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3098  major facilitator transporter  27.34 
 
 
473 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3442  major facilitator transporter  31.41 
 
 
478 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.141995  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3113  major facilitator transporter  31.71 
 
 
476 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0069  major facilitator superfamily MFS_1  29.45 
 
 
475 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.805125  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3814  ampG protein, putative  31.34 
 
 
461 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2892  major facilitator transporter  29.82 
 
 
472 aa  173  5e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0730175  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0296  AmpG protein  30.91 
 
 
457 aa  172  1e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0367426 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3600  major facilitator transporter  31.17 
 
 
471 aa  172  1e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3723  major facilitator transporter  31.17 
 
 
471 aa  172  1e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1667  major facilitator transporter  30.59 
 
 
451 aa  170  4e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0579205  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002702  AmpG permease  30.75 
 
 
450 aa  169  6e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2556  AmpG protein, putative  31.67 
 
 
466 aa  168  2e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.368438 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0944  MSF transporter  29.2 
 
 
447 aa  167  2e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7340  major facilitator superfamily permease  32.54 
 
 
460 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2143  major facilitator transporter  32.51 
 
 
450 aa  167  2.9999999999999998e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1449  major facilitator transporter  31.53 
 
 
453 aa  167  4e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3114  major facilitator transporter  32.17 
 
 
475 aa  167  5e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0253  putative transport transmembrane protein  29.2 
 
 
462 aa  166  6.9999999999999995e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2679  major facilitator transporter  28.81 
 
 
465 aa  163  4.0000000000000004e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000459278 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2561  major facilitator transporter  30 
 
 
517 aa  162  1e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.249955  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>