214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I0944 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A1889  putative ampG protein  76.58 
 
 		 462 aa  695    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1667  major facilitator transporter  75.96 
 
 		 451 aa  702    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0579205  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0944  MSF transporter  100 
 
 		 447 aa  905    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002702  AmpG permease  78.05 
 
 		 450 aa  730    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03281  hypothetical protein  78.08 
 
 		 409 aa  665    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03703  putative muropeptide transport protein  52.66 
 
 		 448 aa  444  1e-123  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0110  major facilitator superfamily MFS_1  39.91 
 
 		 452 aa  277  3e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0140571  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0771  major facilitator transporter  35.63 
 
 		 465 aa  258  2e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00332718  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2892  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 472 aa  249  5e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0730175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0069  major facilitator superfamily MFS_1  32.49 
 
 		 475 aa  248  1e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.805125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0783  major facilitator transporter  34.53 
 
 		 463 aa  247  2e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.191663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3155  major facilitator transporter  34.53 
 
 		 465 aa  246  6e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3644  major facilitator transporter  33.77 
 
 		 472 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0893526 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0812  major facilitator transporter  34.53 
 
 		 463 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3723  major facilitator transporter  33.55 
 
 		 471 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3600  major facilitator transporter  33.55 
 
 		 471 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3442  major facilitator transporter  35.23 
 
 		 478 aa  244  3e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.141995  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3814  ampG protein, putative  34 
 
 		 461 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3531  major facilitator superfamily MFS_1  32.9 
 
 		 471 aa  243  5e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000125194 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0711  major facilitator transporter  33.56 
 
 		 471 aa  243  5e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0819  major facilitator transporter  33.05 
 
 		 471 aa  242  7.999999999999999e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2556  AmpG protein, putative  34.51 
 
 		 466 aa  240  4e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.368438 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2143  major facilitator transporter  34.54 
 
 		 450 aa  237  2e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3113  major facilitator transporter  33.85 
 
 		 476 aa  238  2e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2679  major facilitator transporter  31.75 
 
 		 465 aa  230  3e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000459278 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0623  major facilitator superfamily MFS_1  33.85 
 
 		 459 aa  229  8e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.89214  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0879  hypothetical protein  58.25 
 
 		 528 aa  229  9e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.207268  hitchhiker  0.000254267 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0253  putative transport transmembrane protein  34.08 
 
 		 462 aa  228  2e-58  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0083  major facilitator transporter  34.74 
 
 		 457 aa  227  3e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0365182 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3114  major facilitator transporter  34.47 
 
 		 475 aa  227  3e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2288  major facilitator transporter  32.02 
 
 		 468 aa  226  5.0000000000000005e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3063  major facilitator transporter  33.11 
 
 		 452 aa  226  6e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.797307  normal  0.542737 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0664  major facilitator transporter  34.74 
 
 		 456 aa  226  7e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.757276  normal  0.314251 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3691  major facilitator transporter  32.96 
 
 		 454 aa  224  2e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.639879  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3983  major facilitator superfamily MFS_1  33.41 
 
 		 416 aa  222  9e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.819094 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1449  major facilitator transporter  37.12 
 
 		 453 aa  220  3.9999999999999997e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0152  major facilitator superfamily transporter  32.58 
 
 		 466 aa  220  3.9999999999999997e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.421087  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0470  major facilitator superfamily protein  33.57 
 
 		 428 aa  220  5e-56  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.807635  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0770  major facilitator transporter  33.78 
 
 		 455 aa  216  5.9999999999999996e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.742854 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7340  major facilitator superfamily permease  32.3 
 
 		 460 aa  212  1e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2584  major facilitator superfamily transporter  30.97 
 
 		 439 aa  211  2e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.11871  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2483  major facilitator transporter  32.78 
 
 		 411 aa  208  2e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2009  major facilitator transporter  33.26 
 
 		 415 aa  208  2e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.872827  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2636  major facilitator transporter  33.25 
 
 		 429 aa  207  4e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.103448  normal  0.465614 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6531  major facilitator transporter  33.65 
 
 		 443 aa  205  1e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.118713  normal  0.219837 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7099  major facilitator superfamily MFS_1  32.13 
 
 		 447 aa  202  8e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.835982  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0223  major facilitator transporter  30.9 
 
 		 461 aa  202  9.999999999999999e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0209  major facilitator transporter  30.75 
 
 		 466 aa  201  1.9999999999999998e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1218  major facilitator superfamily MFS_1  31.57 
 
 		 425 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.8639  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1726  major facilitator superfamily MFS_1  32.72 
 
 		 417 aa  201  1.9999999999999998e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.299438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2937  major facilitator transporter  32.02 
 
 		 443 aa  199  9e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0329  major facilitator transporter  31.14 
 
 		 478 aa  197  2.0000000000000003e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0516  major facilitator transporter  32.45 
 
 		 441 aa  196  7e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3596  major facilitator transporter  29.22 
 
 		 478 aa  195  1e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.597959  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0276  major facilitator superfamily transporter  32.94 
 
 		 449 aa  196  1e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.800927  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0044  muropeptide transporter  32.17 
 
 		 429 aa  195  1e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13420  AmpG-related permease  30.92 
 
 		 515 aa  194  2e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0199  major facilitator superfamily transporter  31.64 
 
 		 447 aa  195  2e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.723346  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0296  AmpG protein  28.41 
 
 		 457 aa  193  4e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0367426 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0047  muropeptide transporter  31.7 
 
 		 429 aa  193  5e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.252605 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4017  major facilitator transporter  31.44 
 
 		 412 aa  193  6e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.165032 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1298  major facilitator transporter  28.96 
 
 		 442 aa  192  1e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1235  muropeptide MFS uptake transporter AmpG  29.09 
 
 		 550 aa  191  2e-47  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.988982 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1156  major facilitator transporter  29.49 
 
 		 553 aa  191  2e-47  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0968602  normal  0.231698 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0263  major facilitator superfamily MFS_1  32.01 
 
 		 462 aa  191  2.9999999999999997e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.464987  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5113  major facilitator superfamily MFS_1  33.09 
 
 		 463 aa  189  9e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0154  muropeptide transporter  31.41 
 
 		 426 aa  188  1e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.679367  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00384  muropeptide transporter  28.6 
 
 		 491 aa  186  7e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000202049  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3176  AmpG-related permease  28.6 
 
 		 491 aa  186  7e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000022392  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0474  muropeptide transporter  28.6 
 
 		 491 aa  186  7e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000168996  normal  0.779827 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00388  hypothetical protein  28.6 
 
 		 491 aa  186  7e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000464324  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0517  muropeptide transporter  28.6 
 
 		 491 aa  186  7e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000689062  normal  0.616646 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0508  muropeptide transporter  28.6 
 
 		 491 aa  186  8e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000051766  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3200  muropeptide transporter  28.6 
 
 		 491 aa  186  8e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00206592  hitchhiker  0.000120766 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0468  muropeptide transporter  28.6 
 
 		 491 aa  186  8e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000134905  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0355  muropeptide transporter  28.6 
 
 		 491 aa  186  8e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000149162  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0214  major facilitator superfamily MFS_1  31.37 
 
 		 444 aa  186  1.0000000000000001e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.131109  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0547  muropeptide transporter  28.84 
 
 		 491 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.283527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0503  muropeptide transporter  28.84 
 
 		 491 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000985164  normal  0.643991 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0486  muropeptide transporter  28.84 
 
 		 491 aa  184  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00924697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0814  putative permease  29.52 
 
 		 424 aa  184  3e-45  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0492  muropeptide transporter  28.84 
 
 		 493 aa  184  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00144184  decreased coverage  0.00023941 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0484  muropeptide transporter  28.84 
 
 		 493 aa  184  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000603755  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3268  muropeptide transporter  27.56 
 
 		 495 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.482744  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1420  major facilitator superfamily MFS_1  31.42 
 
 		 438 aa  183  5.0000000000000004e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.508599 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0320  ampG protein, putative  32.7 
 
 		 409 aa  183  6e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3058  muropeptide transporter  28.87 
 
 		 492 aa  182  7e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000335083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3096  muropeptide transporter  28.87 
 
 		 492 aa  182  7e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0966625  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8458  major facilitator superfamily MFS_1  30.77 
 
 		 442 aa  182  9.000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1091  muropeptide transporter  29 
 
 		 492 aa  182  1e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000207294  hitchhiker  0.00000512549 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2276  major facilitator superfamily MFS_1  31.75 
 
 		 416 aa  182  1e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0900  muropeptide transporter  27.68 
 
 		 491 aa  182  1e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00841123  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4016  major facilitator transporter  31.01 
 
 		 444 aa  181  2e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1044  muropeptide transporter  27.21 
 
 		 495 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0385615  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1209  major facilitator transporter  29.73 
 
 		 448 aa  180  4.999999999999999e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.299464  normal  0.44689 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3239  muropeptide transporter  28.64 
 
 		 492 aa  179  7e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.83474  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0191  muropeptide transporter  30.25 
 
 		 419 aa  177  3e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10028  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1648  major facilitator transporter  30.37 
 
 		 450 aa  176  8e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.236568 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2999  major facilitator transporter  32.2 
 
 		 388 aa  174  3.9999999999999995e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02935  signal transducer  32.47 
 
 		 431 aa  171  2e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.726126  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>