200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_03281 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_002702  AmpG permease  91.93 
 
 		 450 aa  773    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03281  hypothetical protein  100 
 
 		 409 aa  825    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0944  MSF transporter  78.08 
 
 		 447 aa  665    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1667  major facilitator transporter  77.51 
 
 		 451 aa  663    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0579205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1889  putative ampG protein  80.68 
 
 		 462 aa  673    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03703  putative muropeptide transport protein  51.98 
 
 		 448 aa  405  1.0000000000000001e-112  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0110  major facilitator superfamily MFS_1  40.05 
 
 		 452 aa  253  6e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0140571  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0812  major facilitator transporter  35.13 
 
 		 463 aa  236  6e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3155  major facilitator transporter  35.58 
 
 		 465 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0783  major facilitator transporter  35.82 
 
 		 463 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.191663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2556  AmpG protein, putative  37.06 
 
 		 466 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.368438 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3814  ampG protein, putative  34.81 
 
 		 461 aa  233  3e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0771  major facilitator transporter  35.73 
 
 		 465 aa  229  7e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00332718  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0819  major facilitator transporter  34.33 
 
 		 471 aa  228  2e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0879  hypothetical protein  55.84 
 
 		 528 aa  225  1e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.207268  hitchhiker  0.000254267 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0069  major facilitator superfamily MFS_1  32.35 
 
 		 475 aa  225  1e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.805125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0711  major facilitator transporter  34.53 
 
 		 471 aa  225  1e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3531  major facilitator superfamily MFS_1  34.05 
 
 		 471 aa  224  2e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000125194 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3600  major facilitator transporter  34.53 
 
 		 471 aa  223  4e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3723  major facilitator transporter  34.53 
 
 		 471 aa  223  4e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2892  major facilitator transporter  33.81 
 
 		 472 aa  222  7e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0730175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3644  major facilitator transporter  33.74 
 
 		 472 aa  222  8e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0893526 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2143  major facilitator transporter  36.09 
 
 		 450 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3442  major facilitator transporter  35.44 
 
 		 478 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.141995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0253  putative transport transmembrane protein  35.38 
 
 		 462 aa  220  3.9999999999999997e-56  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2288  major facilitator transporter  32.85 
 
 		 468 aa  215  9.999999999999999e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3113  major facilitator transporter  33.73 
 
 		 476 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2009  major facilitator transporter  33.83 
 
 		 415 aa  214  1.9999999999999998e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.872827  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2679  major facilitator transporter  32.82 
 
 		 465 aa  212  1e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000459278 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0623  major facilitator superfamily MFS_1  35.59 
 
 		 459 aa  211  2e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.89214  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3114  major facilitator transporter  35.71 
 
 		 475 aa  211  2e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2636  major facilitator transporter  35.51 
 
 		 429 aa  210  3e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.103448  normal  0.465614 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0083  major facilitator transporter  35.84 
 
 		 457 aa  210  4e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0365182 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0470  major facilitator superfamily protein  36.32 
 
 		 428 aa  208  1e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.807635  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6531  major facilitator transporter  35.64 
 
 		 443 aa  208  2e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.118713  normal  0.219837 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0152  major facilitator superfamily transporter  32.59 
 
 		 466 aa  207  2e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.421087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0664  major facilitator transporter  35.99 
 
 		 456 aa  206  7e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.757276  normal  0.314251 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1726  major facilitator superfamily MFS_1  32.27 
 
 		 417 aa  205  1e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.299438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3063  major facilitator transporter  35.37 
 
 		 452 aa  203  4e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.797307  normal  0.542737 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7099  major facilitator superfamily MFS_1  34.87 
 
 		 447 aa  202  7e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.835982  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2584  major facilitator superfamily transporter  32.43 
 
 		 439 aa  202  9.999999999999999e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.11871  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3691  major facilitator transporter  34.94 
 
 		 454 aa  199  9e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.639879  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0223  major facilitator transporter  33 
 
 		 461 aa  196  5.000000000000001e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0199  major facilitator superfamily transporter  32.82 
 
 		 447 aa  196  6e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.723346  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2483  major facilitator transporter  35.01 
 
 		 411 aa  192  7e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3983  major facilitator superfamily MFS_1  33.25 
 
 		 416 aa  192  7e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.819094 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0770  major facilitator transporter  35.11 
 
 		 455 aa  192  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.742854 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1449  major facilitator transporter  37.22 
 
 		 453 aa  191  2e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0329  major facilitator transporter  31.41 
 
 		 478 aa  191  2e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4017  major facilitator transporter  33.5 
 
 		 412 aa  191  2.9999999999999997e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.165032 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0209  major facilitator transporter  33.25 
 
 		 466 aa  189  1e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0375  major facilitator superfamily muropeptide transporter  30.58 
 
 		 437 aa  187  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0180  major facilitator transporter  30.58 
 
 		 437 aa  187  2e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.277448  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0190  major facilitator transporter  30.58 
 
 		 437 aa  187  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3244  AmpG-related permease  30.58 
 
 		 437 aa  186  5e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0516  major facilitator transporter  31.96 
 
 		 441 aa  186  5e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2905  AmpG-related permease  30.58 
 
 		 437 aa  186  5e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2184  AmpG-related permease  30.58 
 
 		 437 aa  186  5e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.452697  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3443  AmpG-related permease  30.58 
 
 		 437 aa  186  5e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7340  major facilitator superfamily permease  32.93 
 
 		 460 aa  186  7e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5113  major facilitator superfamily MFS_1  36.51 
 
 		 463 aa  186  8e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3176  AmpG-related permease  32.5 
 
 		 491 aa  185  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000022392  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0517  muropeptide transporter  32.5 
 
 		 491 aa  185  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000689062  normal  0.616646 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0355  muropeptide transporter  32.5 
 
 		 491 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000149162  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0508  muropeptide transporter  32.5 
 
 		 491 aa  185  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000051766  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0214  major facilitator superfamily MFS_1  31.85 
 
 		 444 aa  185  1.0000000000000001e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.131109  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0276  major facilitator superfamily transporter  32.32 
 
 		 449 aa  185  1.0000000000000001e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.800927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3200  muropeptide transporter  32.5 
 
 		 491 aa  185  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00206592  hitchhiker  0.000120766 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0468  muropeptide transporter  32.5 
 
 		 491 aa  185  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000134905  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0044  muropeptide transporter  33.33 
 
 		 429 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0474  muropeptide transporter  32.5 
 
 		 491 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000168996  normal  0.779827 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00384  muropeptide transporter  32.5 
 
 		 491 aa  184  3e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000202049  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00388  hypothetical protein  32.5 
 
 		 491 aa  184  3e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000464324  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0155  AmpG-related permease  30.33 
 
 		 437 aa  184  3e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1198  AmpG permease  29.55 
 
 		 519 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.1584 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0047  muropeptide transporter  33.09 
 
 		 429 aa  183  5.0000000000000004e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.252605 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0154  muropeptide transporter  33.25 
 
 		 426 aa  181  2e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.679367  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1218  major facilitator superfamily MFS_1  32.99 
 
 		 425 aa  181  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.8639  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1298  major facilitator transporter  30.33 
 
 		 442 aa  179  8e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0191  muropeptide transporter  33.25 
 
 		 419 aa  177  4e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10028  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0900  muropeptide transporter  30.33 
 
 		 491 aa  176  4e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00841123  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0296  AmpG protein  29.98 
 
 		 457 aa  176  5e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0367426 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2937  major facilitator transporter  32.74 
 
 		 443 aa  176  5e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0547  muropeptide transporter  31.91 
 
 		 491 aa  176  8e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.283527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0492  muropeptide transporter  31.91 
 
 		 493 aa  176  8e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00144184  decreased coverage  0.00023941 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0486  muropeptide transporter  31.91 
 
 		 491 aa  176  8e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00924697  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0484  muropeptide transporter  31.91 
 
 		 493 aa  176  9e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000603755  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0503  muropeptide transporter  31.91 
 
 		 491 aa  176  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000985164  normal  0.643991 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13420  AmpG-related permease  31.18 
 
 		 515 aa  175  9.999999999999999e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0962  AmpG-related permease  28.79 
 
 		 515 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0263  major facilitator superfamily MFS_1  32.26 
 
 		 462 aa  174  2.9999999999999996e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.464987  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2276  major facilitator superfamily MFS_1  34.58 
 
 		 416 aa  174  2.9999999999999996e-42  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4016  major facilitator transporter  32.07 
 
 		 444 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0128  major facilitator transporter  32.15 
 
 		 422 aa  173  3.9999999999999995e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3268  muropeptide transporter  30.1 
 
 		 495 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.482744  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3596  major facilitator transporter  30 
 
 		 478 aa  173  5e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.597959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1420  major facilitator superfamily MFS_1  30.75 
 
 		 438 aa  172  6.999999999999999e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.508599 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3239  muropeptide transporter  29.15 
 
 		 492 aa  172  9e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.83474  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1044  muropeptide transporter  30.58 
 
 		 495 aa  172  1e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0385615  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4494  AmpG-related permease  29.44 
 
 		 515 aa  172  1e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.769685  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>