214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5113 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_5113  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 463 aa  885    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2937  major facilitator transporter  52.4 
 
 		 443 aa  355  1e-96  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0664  major facilitator transporter  44.55 
 
 		 456 aa  340  2e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.757276  normal  0.314251 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0083  major facilitator transporter  44.32 
 
 		 457 aa  336  5.999999999999999e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0365182 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0623  major facilitator superfamily MFS_1  44.52 
 
 		 459 aa  335  1e-90  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.89214  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3691  major facilitator transporter  44.32 
 
 		 454 aa  325  1e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.639879  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0770  major facilitator transporter  45.01 
 
 		 455 aa  320  3e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.742854 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4017  major facilitator transporter  43.95 
 
 		 412 aa  319  7.999999999999999e-86  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.165032 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0044  muropeptide transporter  44.77 
 
 		 429 aa  319  7.999999999999999e-86  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7340  major facilitator superfamily permease  45.48 
 
 		 460 aa  318  1e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0047  muropeptide transporter  46.1 
 
 		 429 aa  317  2e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.252605 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3063  major facilitator transporter  43.85 
 
 		 452 aa  315  9e-85  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.797307  normal  0.542737 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0069  major facilitator superfamily MFS_1  41.94 
 
 		 475 aa  314  1.9999999999999998e-84  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.805125  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0154  muropeptide transporter  46.34 
 
 		 426 aa  311  1e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.679367  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2556  AmpG protein, putative  42.23 
 
 		 466 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.368438 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0470  major facilitator superfamily protein  43.29 
 
 		 428 aa  310  2.9999999999999997e-83  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.807635  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0771  major facilitator transporter  39.91 
 
 		 465 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00332718  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0783  major facilitator transporter  38.19 
 
 		 463 aa  303  4.0000000000000003e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.191663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3155  major facilitator transporter  38.79 
 
 		 465 aa  303  6.000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3531  major facilitator superfamily MFS_1  38.05 
 
 		 471 aa  303  6.000000000000001e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000125194 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0711  major facilitator transporter  37.97 
 
 		 471 aa  303  6.000000000000001e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0812  major facilitator transporter  39.33 
 
 		 463 aa  301  1e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1449  major facilitator transporter  44.03 
 
 		 453 aa  301  1e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3814  ampG protein, putative  39.51 
 
 		 461 aa  301  2e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3442  major facilitator transporter  41.34 
 
 		 478 aa  301  2e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.141995  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3644  major facilitator transporter  39.02 
 
 		 472 aa  300  3e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0893526 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0819  major facilitator transporter  38.66 
 
 		 471 aa  300  3e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0191  muropeptide transporter  43.91 
 
 		 419 aa  299  8e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10028  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0110  major facilitator superfamily MFS_1  42.72 
 
 		 452 aa  298  2e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0140571  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3600  major facilitator transporter  37.21 
 
 		 471 aa  296  4e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3723  major facilitator transporter  37.21 
 
 		 471 aa  296  4e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0146  muropeptide transporter  44.32 
 
 		 426 aa  292  8e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.802826 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3113  major facilitator transporter  37.79 
 
 		 476 aa  291  2e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2679  major facilitator transporter  43.13 
 
 		 465 aa  290  3e-77  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000459278 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3983  major facilitator superfamily MFS_1  40.53 
 
 		 416 aa  287  2.9999999999999996e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.819094 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2892  major facilitator transporter  38.14 
 
 		 472 aa  287  2.9999999999999996e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0730175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3239  muropeptide transporter  41.02 
 
 		 492 aa  286  5e-76  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.83474  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3096  muropeptide transporter  41.02 
 
 		 492 aa  286  7e-76  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0966625  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3058  muropeptide transporter  41.02 
 
 		 492 aa  286  7e-76  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000335083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3114  major facilitator transporter  39.64 
 
 		 475 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0253  putative transport transmembrane protein  40.62 
 
 		 462 aa  282  7.000000000000001e-75  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1044  muropeptide transporter  40.52 
 
 		 495 aa  282  9e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0385615  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1091  muropeptide transporter  41.5 
 
 		 492 aa  280  3e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000207294  hitchhiker  0.00000512549 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00384  muropeptide transporter  40.73 
 
 		 491 aa  280  3e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000202049  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0375  major facilitator superfamily muropeptide transporter  40.37 
 
 		 437 aa  280  3e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0468  muropeptide transporter  40.73 
 
 		 491 aa  280  3e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000134905  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0355  muropeptide transporter  40.73 
 
 		 491 aa  280  3e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000149162  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0508  muropeptide transporter  40.73 
 
 		 491 aa  280  3e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000051766  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3200  muropeptide transporter  40.73 
 
 		 491 aa  280  3e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00206592  hitchhiker  0.000120766 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0180  major facilitator transporter  40.37 
 
 		 437 aa  280  3e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.277448  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0190  major facilitator transporter  40.37 
 
 		 437 aa  280  3e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3268  muropeptide transporter  40.05 
 
 		 495 aa  280  3e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.482744  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00388  hypothetical protein  40.73 
 
 		 491 aa  280  3e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000464324  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3176  AmpG-related permease  41.3 
 
 		 491 aa  280  4e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000022392  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0517  muropeptide transporter  41.3 
 
 		 491 aa  280  4e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000689062  normal  0.616646 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0474  muropeptide transporter  40.5 
 
 		 491 aa  280  4e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000168996  normal  0.779827 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2483  major facilitator transporter  42.96 
 
 		 411 aa  279  6e-74  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0152  major facilitator superfamily transporter  39.07 
 
 		 466 aa  278  1e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.421087  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3244  AmpG-related permease  40.14 
 
 		 437 aa  276  5e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2905  AmpG-related permease  40.14 
 
 		 437 aa  276  5e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2184  AmpG-related permease  40.14 
 
 		 437 aa  276  5e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.452697  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3443  AmpG-related permease  40.14 
 
 		 437 aa  276  5e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1218  major facilitator superfamily MFS_1  40.23 
 
 		 425 aa  274  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.8639  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4520  major facilitator superfamily MFS_1  39.26 
 
 		 504 aa  273  3e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.623775  normal  0.239632 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0155  AmpG-related permease  40.83 
 
 		 437 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2288  major facilitator transporter  41.99 
 
 		 468 aa  272  9e-72  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0223  major facilitator transporter  39.5 
 
 		 461 aa  271  1e-71  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2276  major facilitator superfamily MFS_1  44.36 
 
 		 416 aa  272  1e-71  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4038  major facilitator transporter  39.49 
 
 		 482 aa  269  5.9999999999999995e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.549121  normal  0.182505 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2999  major facilitator transporter  42.64 
 
 		 388 aa  268  1e-70  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0547  muropeptide transporter  42.51 
 
 		 491 aa  268  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.283527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4408  major facilitator superfamily MFS_1  38.44 
 
 		 482 aa  268  2e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0492  muropeptide transporter  42.06 
 
 		 493 aa  268  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00144184  decreased coverage  0.00023941 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0484  muropeptide transporter  42.06 
 
 		 493 aa  268  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000603755  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0503  muropeptide transporter  42.51 
 
 		 491 aa  268  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000985164  normal  0.643991 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0486  muropeptide transporter  42.51 
 
 		 491 aa  267  2.9999999999999995e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00924697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0900  muropeptide transporter  38.35 
 
 		 491 aa  267  2.9999999999999995e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00841123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3596  major facilitator transporter  40.94 
 
 		 478 aa  265  1e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.597959  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3039  major facilitator transporter  37.37 
 
 		 473 aa  264  3e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3156  major facilitator transporter  37.37 
 
 		 473 aa  263  4e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0624  major facilitator transporter  42.14 
 
 		 461 aa  263  4.999999999999999e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.471905  normal  0.556428 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0059  major facilitator transporter  37 
 
 		 464 aa  263  6e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.955073  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0320  ampG protein, putative  43 
 
 		 409 aa  262  8e-69  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7099  major facilitator superfamily MFS_1  40.69 
 
 		 447 aa  262  8e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.835982  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3072  muropeptide transporter  39.37 
 
 		 489 aa  262  8.999999999999999e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000553099  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2881  muropeptide transporter  40.28 
 
 		 489 aa  262  1e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.457618  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0706  putative ampG protein  39.51 
 
 		 426 aa  261  2e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3098  major facilitator transporter  35.94 
 
 		 473 aa  261  2e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6531  major facilitator transporter  41.19 
 
 		 443 aa  261  2e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.118713  normal  0.219837 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6452  major facilitator transporter  37.36 
 
 		 473 aa  261  2e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.554159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2487  major facilitator transporter  36.86 
 
 		 473 aa  261  2e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.60868  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3101  major facilitator transporter  36.86 
 
 		 473 aa  261  2e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3117  major facilitator transporter  36.86 
 
 		 473 aa  261  2e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4390  major facilitator superfamily (MFS)muropeptide transporter  36.28 
 
 		 464 aa  259  7e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0333  major facilitator superfamily MFS_1  36.82 
 
 		 464 aa  258  2e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0289  AmpG protein  39.56 
 
 		 433 aa  256  8e-67  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1901  AmpG  39.32 
 
 		 433 aa  254  2.0000000000000002e-66  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.165833  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3834  major facilitator transporter  35.31 
 
 		 417 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2143  major facilitator transporter  40.18 
 
 		 450 aa  251  2e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0209  major facilitator transporter  39.14 
 
 		 466 aa  250  3e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.810291 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>