215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_3596 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_3596  major facilitator transporter  100 
 
 		 478 aa  930    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.597959  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6531  major facilitator transporter  52.02 
 
 		 443 aa  395  1e-109  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.118713  normal  0.219837 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7099  major facilitator superfamily MFS_1  51.37 
 
 		 447 aa  397  1e-109  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.835982  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0253  putative transport transmembrane protein  49.26 
 
 		 462 aa  394  1e-108  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0069  major facilitator superfamily MFS_1  45.11 
 
 		 475 aa  388  1e-106  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.805125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0152  major facilitator superfamily transporter  47.12 
 
 		 466 aa  384  1e-105  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.421087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3531  major facilitator superfamily MFS_1  44.14 
 
 		 471 aa  375  1e-103  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000125194 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2584  major facilitator superfamily transporter  47.85 
 
 		 439 aa  377  1e-103  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.11871  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0711  major facilitator transporter  43.92 
 
 		 471 aa  375  1e-103  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0819  major facilitator transporter  44.61 
 
 		 471 aa  375  1e-103  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3600  major facilitator transporter  43.07 
 
 		 471 aa  375  1e-102  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0771  major facilitator transporter  45.99 
 
 		 465 aa  374  1e-102  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00332718  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3723  major facilitator transporter  43.07 
 
 		 471 aa  375  1e-102  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3814  ampG protein, putative  42.53 
 
 		 461 aa  372  1e-101  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0329  major facilitator transporter  46.22 
 
 		 478 aa  371  1e-101  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0209  major facilitator transporter  48.6 
 
 		 466 aa  371  1e-101  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0783  major facilitator transporter  42.74 
 
 		 463 aa  369  1e-101  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.191663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2556  AmpG protein, putative  45.54 
 
 		 466 aa  369  1e-101  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.368438 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3155  major facilitator transporter  43.38 
 
 		 465 aa  367  1e-100  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0812  major facilitator transporter  42.53 
 
 		 463 aa  368  1e-100  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3442  major facilitator transporter  46.1 
 
 		 478 aa  367  1e-100  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.141995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2892  major facilitator transporter  44.33 
 
 		 472 aa  366  1e-100  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0730175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3644  major facilitator transporter  44.57 
 
 		 472 aa  366  1e-100  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0893526 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3113  major facilitator transporter  44.54 
 
 		 476 aa  367  1e-100  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0223  major facilitator transporter  48.01 
 
 		 461 aa  363  5.0000000000000005e-99  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4038  major facilitator transporter  44.49 
 
 		 482 aa  347  2e-94  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.549121  normal  0.182505 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4520  major facilitator superfamily MFS_1  45.16 
 
 		 504 aa  347  2e-94  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.623775  normal  0.239632 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4408  major facilitator superfamily MFS_1  44.49 
 
 		 482 aa  347  3e-94  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3114  major facilitator transporter  44.84 
 
 		 475 aa  347  3e-94  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2143  major facilitator transporter  48.71 
 
 		 450 aa  345  1e-93  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1726  major facilitator superfamily MFS_1  43.98 
 
 		 417 aa  344  2e-93  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.299438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0199  major facilitator superfamily transporter  47.17 
 
 		 447 aa  342  1e-92  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.723346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2009  major facilitator transporter  43.97 
 
 		 415 aa  341  2e-92  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.872827  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0276  major facilitator superfamily transporter  43.97 
 
 		 449 aa  340  2.9999999999999998e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.800927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2636  major facilitator transporter  46.68 
 
 		 429 aa  338  9.999999999999999e-92  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.103448  normal  0.465614 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2288  major facilitator transporter  46.07 
 
 		 468 aa  338  9.999999999999999e-92  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0263  major facilitator superfamily MFS_1  46.05 
 
 		 462 aa  332  7.000000000000001e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.464987  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0214  major facilitator superfamily MFS_1  46.95 
 
 		 444 aa  332  8e-90  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.131109  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2679  major facilitator transporter  45.8 
 
 		 465 aa  330  2e-89  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000459278 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0516  major facilitator transporter  47.12 
 
 		 441 aa  330  4e-89  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0624  major facilitator transporter  45.74 
 
 		 461 aa  323  4e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.471905  normal  0.556428 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13420  AmpG-related permease  40.19 
 
 		 515 aa  318  9e-86  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0296  AmpG protein  41.14 
 
 		 457 aa  301  1e-80  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0367426 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1648  major facilitator transporter  40.17 
 
 		 450 aa  287  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.236568 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0110  major facilitator superfamily MFS_1  39.15 
 
 		 452 aa  273  6e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0140571  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8458  major facilitator superfamily MFS_1  39.14 
 
 		 442 aa  271  2e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1235  muropeptide MFS uptake transporter AmpG  36.05 
 
 		 550 aa  269  7e-71  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.988982 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1420  major facilitator superfamily MFS_1  40.35 
 
 		 438 aa  266  4e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.508599 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1156  major facilitator transporter  35.85 
 
 		 553 aa  264  3e-69  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0968602  normal  0.231698 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4016  major facilitator transporter  38.28 
 
 		 444 aa  261  2e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02935  signal transducer  41.78 
 
 		 431 aa  260  3e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.726126  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2937  major facilitator transporter  40.79 
 
 		 443 aa  256  6e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0664  major facilitator transporter  35.92 
 
 		 456 aa  242  1e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.757276  normal  0.314251 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0623  major facilitator superfamily MFS_1  37.47 
 
 		 459 aa  238  2e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.89214  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0083  major facilitator transporter  35.05 
 
 		 457 aa  237  3e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0365182 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5113  major facilitator superfamily MFS_1  43.48 
 
 		 463 aa  234  2.0000000000000002e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2483  major facilitator transporter  35.92 
 
 		 411 aa  230  5e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0470  major facilitator superfamily protein  34.42 
 
 		 428 aa  228  2e-58  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.807635  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3691  major facilitator transporter  35.31 
 
 		 454 aa  227  3e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.639879  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4017  major facilitator transporter  35.58 
 
 		 412 aa  227  3e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.165032 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0770  major facilitator transporter  35.92 
 
 		 455 aa  227  4e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.742854 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3063  major facilitator transporter  35.1 
 
 		 452 aa  226  9e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.797307  normal  0.542737 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3834  major facilitator transporter  32.13 
 
 		 417 aa  226  9e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2999  major facilitator transporter  35.35 
 
 		 388 aa  224  3e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002702  AmpG permease  30.93 
 
 		 450 aa  223  4.9999999999999996e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3983  major facilitator superfamily MFS_1  35.02 
 
 		 416 aa  223  8e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.819094 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0320  ampG protein, putative  36.07 
 
 		 409 aa  219  8.999999999999998e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0944  MSF transporter  30.11 
 
 		 447 aa  218  2e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2570  YD repeat-containing protein  46.58 
 
 		 1565 aa  216  5e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.332337  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2577  YD repeat-containing protein  46.58 
 
 		 1565 aa  216  5e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.328115  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7340  major facilitator superfamily permease  35.56 
 
 		 460 aa  216  9e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1889  putative ampG protein  30.75 
 
 		 462 aa  215  1.9999999999999998e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0044  muropeptide transporter  37.62 
 
 		 429 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0047  muropeptide transporter  37.62 
 
 		 429 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.252605 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1218  major facilitator superfamily MFS_1  37.69 
 
 		 425 aa  214  3.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.8639  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3019  major facilitator transporter  39.2 
 
 		 523 aa  211  2e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.649834  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0375  major facilitator superfamily muropeptide transporter  31.19 
 
 		 437 aa  210  4e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0180  major facilitator transporter  31.19 
 
 		 437 aa  210  4e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.277448  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0190  major facilitator transporter  31.19 
 
 		 437 aa  210  4e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0154  muropeptide transporter  37.97 
 
 		 426 aa  208  1e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.679367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1309  major facilitator transporter  36.38 
 
 		 475 aa  209  1e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.327307  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1091  muropeptide transporter  34.16 
 
 		 492 aa  207  4e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000207294  hitchhiker  0.00000512549 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03703  putative muropeptide transport protein  30.87 
 
 		 448 aa  207  4e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1667  major facilitator transporter  30.59 
 
 		 451 aa  207  4e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0579205  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3244  AmpG-related permease  30.97 
 
 		 437 aa  206  5e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2905  AmpG-related permease  30.97 
 
 		 437 aa  206  5e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2184  AmpG-related permease  30.97 
 
 		 437 aa  206  5e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.452697  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3443  AmpG-related permease  30.97 
 
 		 437 aa  206  5e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3268  muropeptide transporter  33.42 
 
 		 495 aa  206  6e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.482744  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0814  putative permease  28.85 
 
 		 424 aa  206  9e-52  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1044  muropeptide transporter  33.42 
 
 		 495 aa  206  9e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0385615  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00384  muropeptide transporter  34.91 
 
 		 491 aa  205  2e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000202049  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00388  hypothetical protein  34.91 
 
 		 491 aa  205  2e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000464324  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2276  major facilitator superfamily MFS_1  38.29 
 
 		 416 aa  205  2e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3176  AmpG-related permease  34.91 
 
 		 491 aa  204  3e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000022392  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0517  muropeptide transporter  34.91 
 
 		 491 aa  204  3e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000689062  normal  0.616646 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0355  muropeptide transporter  34.91 
 
 		 491 aa  204  3e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000149162  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3200  muropeptide transporter  34.91 
 
 		 491 aa  204  3e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00206592  hitchhiker  0.000120766 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0474  muropeptide transporter  34.91 
 
 		 491 aa  204  3e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000168996  normal  0.779827 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0468  muropeptide transporter  34.91 
 
 		 491 aa  204  3e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000134905  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>