192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_3019 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_3019  major facilitator transporter  100 
 
 		 523 aa  1035    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.649834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2556  AmpG protein, putative  33.2 
 
 		 466 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.368438 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3596  major facilitator transporter  39.2 
 
 		 478 aa  211  3e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.597959  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0069  major facilitator superfamily MFS_1  40.92 
 
 		 475 aa  207  3e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.805125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2288  major facilitator transporter  42.31 
 
 		 468 aa  202  1.9999999999999998e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0199  major facilitator superfamily transporter  41.72 
 
 		 447 aa  197  3e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.723346  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0329  major facilitator transporter  39.44 
 
 		 478 aa  196  7e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0253  putative transport transmembrane protein  36.94 
 
 		 462 aa  192  8e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0783  major facilitator transporter  37.36 
 
 		 463 aa  193  8e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.191663  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0263  major facilitator superfamily MFS_1  39.42 
 
 		 462 aa  191  2e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.464987  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3155  major facilitator transporter  37.36 
 
 		 465 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0812  major facilitator transporter  38.24 
 
 		 463 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4038  major facilitator transporter  40.18 
 
 		 482 aa  190  5.999999999999999e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.549121  normal  0.182505 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0152  major facilitator superfamily transporter  37.61 
 
 		 466 aa  190  5.999999999999999e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.421087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2679  major facilitator transporter  39.61 
 
 		 465 aa  189  8e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000459278 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0209  major facilitator transporter  37.3 
 
 		 466 aa  189  9e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4408  major facilitator superfamily MFS_1  39.88 
 
 		 482 aa  188  2e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0819  major facilitator transporter  36.72 
 
 		 471 aa  188  2e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2009  major facilitator transporter  37.58 
 
 		 415 aa  187  4e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.872827  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4520  major facilitator superfamily MFS_1  40.58 
 
 		 504 aa  187  5e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.623775  normal  0.239632 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3814  ampG protein, putative  38.62 
 
 		 461 aa  186  6e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2636  major facilitator transporter  40.33 
 
 		 429 aa  186  1.0000000000000001e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.103448  normal  0.465614 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1726  major facilitator superfamily MFS_1  36.5 
 
 		 417 aa  185  2.0000000000000003e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.299438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2584  major facilitator superfamily transporter  38.48 
 
 		 439 aa  185  2.0000000000000003e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.11871  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0276  major facilitator superfamily transporter  38.69 
 
 		 449 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.800927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0771  major facilitator transporter  37.43 
 
 		 465 aa  184  3e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00332718  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3723  major facilitator transporter  37.83 
 
 		 471 aa  184  3e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3600  major facilitator transporter  37.83 
 
 		 471 aa  184  3e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0214  major facilitator superfamily MFS_1  39.86 
 
 		 444 aa  183  8.000000000000001e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.131109  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0711  major facilitator transporter  37.83 
 
 		 471 aa  182  1e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2892  major facilitator transporter  36.72 
 
 		 472 aa  182  1e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0730175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3531  major facilitator superfamily MFS_1  37.54 
 
 		 471 aa  182  1e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000125194 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3113  major facilitator transporter  36.26 
 
 		 476 aa  178  3e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3442  major facilitator transporter  38.05 
 
 		 478 aa  177  3e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.141995  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3644  major facilitator transporter  36.59 
 
 		 472 aa  177  4e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0893526 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0623  major facilitator superfamily MFS_1  30.38 
 
 		 459 aa  177  5e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.89214  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0516  major facilitator transporter  39.02 
 
 		 441 aa  176  7e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1235  muropeptide MFS uptake transporter AmpG  29.09 
 
 		 550 aa  173  5.999999999999999e-42  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.988982 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0223  major facilitator transporter  34.54 
 
 		 461 aa  172  1e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6531  major facilitator transporter  38.26 
 
 		 443 aa  172  1e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.118713  normal  0.219837 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7099  major facilitator superfamily MFS_1  39.46 
 
 		 447 aa  170  6e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.835982  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0624  major facilitator transporter  38.49 
 
 		 461 aa  169  1e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.471905  normal  0.556428 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3114  major facilitator transporter  37.79 
 
 		 475 aa  169  1e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2143  major facilitator transporter  38.49 
 
 		 450 aa  166  6.9999999999999995e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0296  AmpG protein  38.34 
 
 		 457 aa  166  9e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0367426 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1156  major facilitator transporter  28.27 
 
 		 553 aa  164  5.0000000000000005e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0968602  normal  0.231698 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1309  major facilitator transporter  36.45 
 
 		 475 aa  153  8.999999999999999e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.327307  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0664  major facilitator transporter  35.35 
 
 		 456 aa  152  1e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.757276  normal  0.314251 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0770  major facilitator transporter  35.94 
 
 		 455 aa  150  6e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.742854 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0083  major facilitator transporter  35.05 
 
 		 457 aa  148  3e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0365182 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3691  major facilitator transporter  36.39 
 
 		 454 aa  143  8e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.639879  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0147  major facilitator transporter  42.64 
 
 		 550 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4017  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 412 aa  139  7.999999999999999e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.165032 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1648  major facilitator transporter  34.62 
 
 		 450 aa  139  1e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.236568 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3063  major facilitator transporter  34.57 
 
 		 452 aa  137  4e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.797307  normal  0.542737 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1400  signal transducer ampG1  30.15 
 
 		 502 aa  135  1.9999999999999998e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00988952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2937  major facilitator transporter  34.43 
 
 		 443 aa  135  1.9999999999999998e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1060  major facilitator transporter  26.57 
 
 		 467 aa  134  3.9999999999999996e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0118336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2570  YD repeat-containing protein  39.3 
 
 		 1565 aa  127  4.0000000000000003e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.332337  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2577  YD repeat-containing protein  39.3 
 
 		 1565 aa  127  4.0000000000000003e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.328115  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0470  major facilitator superfamily protein  32.67 
 
 		 428 aa  127  5e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.807635  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02935  signal transducer  34.11 
 
 		 431 aa  127  6e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.726126  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1355  AmpG-related permease  36.52 
 
 		 515 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.010612  normal  0.140605 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0154  muropeptide transporter  33.45 
 
 		 426 aa  125  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.679367  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1218  major facilitator superfamily MFS_1  30.84 
 
 		 425 aa  125  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.8639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4369  AmpG-related permease  36.52 
 
 		 515 aa  125  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0389334 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0044  muropeptide transporter  32.77 
 
 		 429 aa  124  3e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4494  AmpG-related permease  37.39 
 
 		 515 aa  124  4e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.769685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7340  major facilitator superfamily permease  32.39 
 
 		 460 aa  123  7e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0047  muropeptide transporter  32.2 
 
 		 429 aa  123  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.252605 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3983  major facilitator superfamily MFS_1  31 
 
 		 416 aa  120  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.819094 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1298  major facilitator transporter  30.67 
 
 		 442 aa  120  6e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0900  muropeptide transporter  29.87 
 
 		 491 aa  119  9.999999999999999e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00841123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0375  major facilitator superfamily muropeptide transporter  30.56 
 
 		 437 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0155  AmpG-related permease  30.56 
 
 		 437 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0180  major facilitator transporter  30.56 
 
 		 437 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.277448  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0190  major facilitator transporter  30.56 
 
 		 437 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0059  major facilitator transporter  28.66 
 
 		 464 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.955073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2999  major facilitator transporter  32.33 
 
 		 388 aa  117  5e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1209  major facilitator transporter  32.17 
 
 		 448 aa  117  5e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.299464  normal  0.44689 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00384  muropeptide transporter  29.41 
 
 		 491 aa  117  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000202049  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00388  hypothetical protein  29.41 
 
 		 491 aa  117  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000464324  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3176  AmpG-related permease  29.41 
 
 		 491 aa  116  8.999999999999998e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000022392  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0517  muropeptide transporter  29.41 
 
 		 491 aa  116  8.999999999999998e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000689062  normal  0.616646 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0355  muropeptide transporter  29.41 
 
 		 491 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000149162  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0468  muropeptide transporter  29.41 
 
 		 491 aa  116  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000134905  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3239  muropeptide transporter  30.39 
 
 		 492 aa  115  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.83474  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0474  muropeptide transporter  29.1 
 
 		 491 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000168996  normal  0.779827 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0962  AmpG-related permease  35.11 
 
 		 515 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3200  muropeptide transporter  29.41 
 
 		 491 aa  116  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00206592  hitchhiker  0.000120766 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4390  major facilitator superfamily (MFS)muropeptide transporter  28.61 
 
 		 464 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002702  AmpG permease  30.63 
 
 		 450 aa  115  1.0000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0508  muropeptide transporter  29.41 
 
 		 491 aa  116  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000051766  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0110  major facilitator superfamily MFS_1  30.62 
 
 		 452 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0140571  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3244  AmpG-related permease  30.23 
 
 		 437 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2905  AmpG-related permease  30.23 
 
 		 437 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3058  muropeptide transporter  30.39 
 
 		 492 aa  115  2.0000000000000002e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000335083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2184  AmpG-related permease  30.23 
 
 		 437 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.452697  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3443  AmpG-related permease  30.23 
 
 		 437 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3096  muropeptide transporter  30.39 
 
 		 492 aa  115  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0966625  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>