211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_2636 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_2636  major facilitator transporter  100 
 
 		 429 aa  828    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.103448  normal  0.465614 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0152  major facilitator superfamily transporter  73.88 
 
 		 466 aa  617  1e-176  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.421087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0209  major facilitator transporter  74.7 
 
 		 466 aa  607  9.999999999999999e-173  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0329  major facilitator transporter  74.7 
 
 		 478 aa  597  1e-169  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0199  major facilitator superfamily transporter  75.55 
 
 		 447 aa  586  1e-166  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.723346  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0263  major facilitator superfamily MFS_1  75.88 
 
 		 462 aa  567  1e-160  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.464987  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0276  major facilitator superfamily transporter  75.85 
 
 		 449 aa  566  1e-160  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.800927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0214  major facilitator superfamily MFS_1  75.12 
 
 		 444 aa  561  1.0000000000000001e-159  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.131109  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0516  major facilitator transporter  72.97 
 
 		 441 aa  554  1e-157  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2009  major facilitator transporter  65.85 
 
 		 415 aa  534  1e-150  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.872827  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1726  major facilitator superfamily MFS_1  66.01 
 
 		 417 aa  528  1e-149  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.299438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0253  putative transport transmembrane protein  62.12 
 
 		 462 aa  478  1e-133  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0223  major facilitator transporter  57.85 
 
 		 461 aa  448  1e-125  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2556  AmpG protein, putative  55.58 
 
 		 466 aa  438  9.999999999999999e-123  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.368438 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3814  ampG protein, putative  53.06 
 
 		 461 aa  437  1e-121  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0771  major facilitator transporter  53.05 
 
 		 465 aa  438  1e-121  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00332718  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3155  major facilitator transporter  52 
 
 		 465 aa  437  1e-121  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0812  major facilitator transporter  52.6 
 
 		 463 aa  435  1e-121  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0783  major facilitator transporter  52.27 
 
 		 463 aa  431  1e-120  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.191663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3113  major facilitator transporter  51.82 
 
 		 476 aa  431  1e-120  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0711  major facilitator transporter  52.13 
 
 		 471 aa  434  1e-120  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0819  major facilitator transporter  51.56 
 
 		 471 aa  433  1e-120  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3531  major facilitator superfamily MFS_1  51.9 
 
 		 471 aa  431  1e-119  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000125194 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3644  major facilitator transporter  51.35 
 
 		 472 aa  429  1e-119  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0893526 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2892  major facilitator transporter  51.47 
 
 		 472 aa  429  1e-119  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0730175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3723  major facilitator transporter  51.23 
 
 		 471 aa  424  1e-117  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3442  major facilitator transporter  52.45 
 
 		 478 aa  422  1e-117  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.141995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3600  major facilitator transporter  51.23 
 
 		 471 aa  424  1e-117  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3114  major facilitator transporter  53.02 
 
 		 475 aa  410  1e-113  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2584  major facilitator superfamily transporter  48.29 
 
 		 439 aa  372  1e-102  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.11871  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0069  major facilitator superfamily MFS_1  47.2 
 
 		 475 aa  367  1e-100  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.805125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3596  major facilitator transporter  45.45 
 
 		 478 aa  344  2e-93  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.597959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7099  major facilitator superfamily MFS_1  48.39 
 
 		 447 aa  342  5.999999999999999e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.835982  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2143  major facilitator transporter  47.4 
 
 		 450 aa  336  3.9999999999999995e-91  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6531  major facilitator transporter  48.04 
 
 		 443 aa  333  4e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.118713  normal  0.219837 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2288  major facilitator transporter  44.39 
 
 		 468 aa  319  7e-86  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2679  major facilitator transporter  42.46 
 
 		 465 aa  313  3.9999999999999997e-84  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000459278 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4520  major facilitator superfamily MFS_1  43.47 
 
 		 504 aa  301  2e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.623775  normal  0.239632 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4038  major facilitator transporter  42.99 
 
 		 482 aa  297  3e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.549121  normal  0.182505 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4408  major facilitator superfamily MFS_1  42.76 
 
 		 482 aa  296  7e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0296  AmpG protein  44.7 
 
 		 457 aa  285  9e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0367426 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0624  major facilitator transporter  43.23 
 
 		 461 aa  279  8e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.471905  normal  0.556428 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0083  major facilitator transporter  38.79 
 
 		 457 aa  245  8e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0365182 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0623  major facilitator superfamily MFS_1  38.79 
 
 		 459 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.89214  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1420  major facilitator superfamily MFS_1  37.68 
 
 		 438 aa  244  3e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.508599 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02935  signal transducer  41.49 
 
 		 431 aa  243  3e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.726126  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2937  major facilitator transporter  40.87 
 
 		 443 aa  241  2e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0664  major facilitator transporter  38.08 
 
 		 456 aa  239  5.999999999999999e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.757276  normal  0.314251 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0110  major facilitator superfamily MFS_1  38.37 
 
 		 452 aa  238  2e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0140571  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3691  major facilitator transporter  37.85 
 
 		 454 aa  232  1e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.639879  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0191  muropeptide transporter  41.15 
 
 		 419 aa  231  2e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10028  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2570  YD repeat-containing protein  55.09 
 
 		 1565 aa  231  2e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.332337  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2577  YD repeat-containing protein  55.09 
 
 		 1565 aa  231  2e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.328115  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4016  major facilitator transporter  38.92 
 
 		 444 aa  230  3e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002702  AmpG permease  34.56 
 
 		 450 aa  229  5e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1648  major facilitator transporter  39.81 
 
 		 450 aa  229  9e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.236568 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3063  major facilitator transporter  38.08 
 
 		 452 aa  228  1e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.797307  normal  0.542737 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2999  major facilitator transporter  38.08 
 
 		 388 aa  228  1e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1667  major facilitator transporter  34.62 
 
 		 451 aa  228  2e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0579205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0047  muropeptide transporter  39.02 
 
 		 429 aa  227  3e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.252605 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0154  muropeptide transporter  40 
 
 		 426 aa  226  6e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.679367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0770  major facilitator transporter  38.79 
 
 		 455 aa  226  8e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.742854 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0044  muropeptide transporter  38.78 
 
 		 429 aa  225  1e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8458  major facilitator superfamily MFS_1  38.93 
 
 		 442 aa  225  1e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4017  major facilitator transporter  35.61 
 
 		 412 aa  223  4e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.165032 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0944  MSF transporter  33.26 
 
 		 447 aa  223  6e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1044  muropeptide transporter  37.83 
 
 		 495 aa  222  8e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0385615  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4494  AmpG-related permease  53.43 
 
 		 515 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.769685  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3268  muropeptide transporter  37.35 
 
 		 495 aa  222  9.999999999999999e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.482744  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1355  AmpG-related permease  55.21 
 
 		 515 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.010612  normal  0.140605 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4369  AmpG-related permease  54.69 
 
 		 515 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0389334 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03281  hypothetical protein  34.9 
 
 		 409 aa  219  6e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0962  AmpG-related permease  53.81 
 
 		 515 aa  219  7e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1091  muropeptide transporter  37.87 
 
 		 492 aa  219  7.999999999999999e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000207294  hitchhiker  0.00000512549 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7340  major facilitator superfamily permease  37.38 
 
 		 460 aa  219  8.999999999999998e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0470  major facilitator superfamily protein  35.11 
 
 		 428 aa  217  2.9999999999999998e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.807635  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1889  putative ampG protein  34.17 
 
 		 462 aa  217  4e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1198  AmpG permease  53.65 
 
 		 519 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.1584 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3239  muropeptide transporter  35.14 
 
 		 492 aa  214  1.9999999999999998e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.83474  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3058  muropeptide transporter  35.14 
 
 		 492 aa  213  3.9999999999999995e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000335083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3096  muropeptide transporter  35.14 
 
 		 492 aa  213  3.9999999999999995e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0966625  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2483  major facilitator transporter  37.11 
 
 		 411 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0320  ampG protein, putative  39.01 
 
 		 409 aa  211  2e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1298  major facilitator transporter  34.6 
 
 		 442 aa  210  3e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0146  muropeptide transporter  39.47 
 
 		 426 aa  210  4e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.802826 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5113  major facilitator superfamily MFS_1  38.3 
 
 		 463 aa  209  6e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3983  major facilitator superfamily MFS_1  34.21 
 
 		 416 aa  208  2e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.819094 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0147  major facilitator transporter  57.21 
 
 		 550 aa  206  5e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1449  major facilitator transporter  37.88 
 
 		 453 aa  206  5e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0814  putative permease  31.63 
 
 		 424 aa  206  7e-52  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1209  major facilitator transporter  35.31 
 
 		 448 aa  205  1e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.299464  normal  0.44689 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0900  muropeptide transporter  34.35 
 
 		 491 aa  205  1e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00841123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0941  hypothetical protein  54.69 
 
 		 598 aa  205  1e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.274634 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4078  AmpG-related permease  53.61 
 
 		 516 aa  204  2e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00384  muropeptide transporter  34.77 
 
 		 491 aa  204  3e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000202049  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4383  ampG protein, putative  54.64 
 
 		 516 aa  204  3e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.920569  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00388  hypothetical protein  34.77 
 
 		 491 aa  204  3e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000464324  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0355  muropeptide transporter  34.77 
 
 		 491 aa  203  4e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000149162  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0468  muropeptide transporter  34.77 
 
 		 491 aa  203  4e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000134905  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57100  putative permease  48.43 
 
 		 594 aa  203  4e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>