206 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_8458 on replicon NC_011892
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011892  Mnod_8458  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 442 aa  861    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4016  major facilitator transporter  94.12 
 
 		 444 aa  791    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1648  major facilitator transporter  69.32 
 
 		 450 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.236568 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1420  major facilitator superfamily MFS_1  67.89 
 
 		 438 aa  530  1e-149  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.508599 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4520  major facilitator superfamily MFS_1  45.01 
 
 		 504 aa  315  9.999999999999999e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.623775  normal  0.239632 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4038  major facilitator transporter  45.01 
 
 		 482 aa  313  4.999999999999999e-84  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.549121  normal  0.182505 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4408  major facilitator superfamily MFS_1  44.77 
 
 		 482 aa  312  1e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7099  major facilitator superfamily MFS_1  44.25 
 
 		 447 aa  309  5.9999999999999995e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.835982  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6531  major facilitator transporter  43.56 
 
 		 443 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.118713  normal  0.219837 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0624  major facilitator transporter  43.32 
 
 		 461 aa  294  3e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.471905  normal  0.556428 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3596  major facilitator transporter  39.14 
 
 		 478 aa  263  4e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.597959  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0152  major facilitator superfamily transporter  35.31 
 
 		 466 aa  233  6e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.421087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0069  major facilitator superfamily MFS_1  33.71 
 
 		 475 aa  230  4e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.805125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2143  major facilitator transporter  38.81 
 
 		 450 aa  230  4e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0819  major facilitator transporter  33.87 
 
 		 471 aa  230  4e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0771  major facilitator transporter  34.18 
 
 		 465 aa  229  8e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00332718  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3442  major facilitator transporter  33.18 
 
 		 478 aa  228  2e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.141995  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0329  major facilitator transporter  38.29 
 
 		 478 aa  228  2e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0296  AmpG protein  37.06 
 
 		 457 aa  227  3e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0367426 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3113  major facilitator transporter  33.56 
 
 		 476 aa  226  4e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0711  major facilitator transporter  33.56 
 
 		 471 aa  227  4e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3644  major facilitator transporter  33.87 
 
 		 472 aa  227  4e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0893526 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3814  ampG protein, putative  33.41 
 
 		 461 aa  226  5.0000000000000005e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3155  major facilitator transporter  34.1 
 
 		 465 aa  226  5.0000000000000005e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0812  major facilitator transporter  34.1 
 
 		 463 aa  226  6e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0253  putative transport transmembrane protein  34.58 
 
 		 462 aa  226  7e-58  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0783  major facilitator transporter  34.1 
 
 		 463 aa  226  7e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.191663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3531  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 471 aa  226  8e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000125194 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3600  major facilitator transporter  33.11 
 
 		 471 aa  225  1e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3723  major facilitator transporter  33.11 
 
 		 471 aa  225  1e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2892  major facilitator transporter  33.02 
 
 		 472 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0730175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2584  major facilitator superfamily transporter  36.34 
 
 		 439 aa  219  7e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.11871  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2636  major facilitator transporter  38.44 
 
 		 429 aa  218  1e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.103448  normal  0.465614 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0209  major facilitator transporter  36.06 
 
 		 466 aa  218  2e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0276  major facilitator superfamily transporter  38.5 
 
 		 449 aa  216  8e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.800927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02935  signal transducer  36.7 
 
 		 431 aa  214  2.9999999999999995e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.726126  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0516  major facilitator transporter  36.3 
 
 		 441 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2556  AmpG protein, putative  32.24 
 
 		 466 aa  211  2e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.368438 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3114  major facilitator transporter  33.72 
 
 		 475 aa  209  7e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2009  major facilitator transporter  34.9 
 
 		 415 aa  209  1e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.872827  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0223  major facilitator transporter  34.89 
 
 		 461 aa  206  5e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1726  major facilitator superfamily MFS_1  35.19 
 
 		 417 aa  205  1e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.299438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0199  major facilitator superfamily transporter  36.84 
 
 		 447 aa  203  4e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.723346  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0263  major facilitator superfamily MFS_1  36.97 
 
 		 462 aa  202  8e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.464987  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2679  major facilitator transporter  33.64 
 
 		 465 aa  200  3e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000459278 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2288  major facilitator transporter  34.56 
 
 		 468 aa  197  4.0000000000000005e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4017  major facilitator transporter  32.35 
 
 		 412 aa  194  2e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.165032 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1044  muropeptide transporter  31.59 
 
 		 495 aa  194  4e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0385615  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3268  muropeptide transporter  31.42 
 
 		 495 aa  191  2e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.482744  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1218  major facilitator superfamily MFS_1  33 
 
 		 425 aa  190  5e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.8639  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002702  AmpG permease  30.81 
 
 		 450 aa  189  1e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0047  muropeptide transporter  31.38 
 
 		 429 aa  189  1e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.252605 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0664  major facilitator transporter  32.34 
 
 		 456 aa  189  1e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.757276  normal  0.314251 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0083  major facilitator transporter  32.61 
 
 		 457 aa  188  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0365182 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0044  muropeptide transporter  31.38 
 
 		 429 aa  189  1e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3063  major facilitator transporter  32.54 
 
 		 452 aa  187  3e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.797307  normal  0.542737 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0623  major facilitator superfamily MFS_1  31.42 
 
 		 459 aa  186  5e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.89214  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03703  putative muropeptide transport protein  31.41 
 
 		 448 aa  186  6e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0944  MSF transporter  30.77 
 
 		 447 aa  186  6e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1091  muropeptide transporter  31.65 
 
 		 492 aa  186  7e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000207294  hitchhiker  0.00000512549 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0214  major facilitator superfamily MFS_1  36.62 
 
 		 444 aa  185  1.0000000000000001e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.131109  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0191  muropeptide transporter  32.43 
 
 		 419 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10028  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1901  AmpG  31.74 
 
 		 433 aa  182  1e-44  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.165833  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0154  muropeptide transporter  31.37 
 
 		 426 aa  181  2e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.679367  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0289  AmpG protein  31.74 
 
 		 433 aa  181  2e-44  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3691  major facilitator transporter  32.07 
 
 		 454 aa  179  7e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.639879  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0146  muropeptide transporter  32.44 
 
 		 426 aa  179  8e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.802826 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3058  muropeptide transporter  29.47 
 
 		 492 aa  178  1e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000335083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0814  putative permease  29.79 
 
 		 424 aa  178  1e-43  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3096  muropeptide transporter  29.47 
 
 		 492 aa  178  1e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0966625  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0470  major facilitator superfamily protein  29.7 
 
 		 428 aa  178  2e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.807635  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0900  muropeptide transporter  31.13 
 
 		 491 aa  178  2e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00841123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7340  major facilitator superfamily permease  31.94 
 
 		 460 aa  178  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0375  major facilitator superfamily muropeptide transporter  31.93 
 
 		 437 aa  176  6e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0180  major facilitator transporter  31.93 
 
 		 437 aa  176  6e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.277448  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0190  major facilitator transporter  31.93 
 
 		 437 aa  176  6e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3244  AmpG-related permease  31.93 
 
 		 437 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2999  major facilitator transporter  33.25 
 
 		 388 aa  176  9.999999999999999e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3834  major facilitator transporter  27.62 
 
 		 417 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3239  muropeptide transporter  29.23 
 
 		 492 aa  175  9.999999999999999e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.83474  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2905  AmpG-related permease  31.93 
 
 		 437 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2184  AmpG-related permease  31.93 
 
 		 437 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.452697  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3443  AmpG-related permease  31.93 
 
 		 437 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0474  muropeptide transporter  30.17 
 
 		 491 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000168996  normal  0.779827 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0503  muropeptide transporter  31.85 
 
 		 491 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000985164  normal  0.643991 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3983  major facilitator superfamily MFS_1  29.54 
 
 		 416 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.819094 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0492  muropeptide transporter  31.85 
 
 		 493 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00144184  decreased coverage  0.00023941 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3176  AmpG-related permease  30.17 
 
 		 491 aa  174  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000022392  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0547  muropeptide transporter  31.85 
 
 		 491 aa  174  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.283527  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0355  muropeptide transporter  30.17 
 
 		 491 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000149162  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0486  muropeptide transporter  31.85 
 
 		 491 aa  174  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00924697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0508  muropeptide transporter  30.17 
 
 		 491 aa  174  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000051766  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0468  muropeptide transporter  30.17 
 
 		 491 aa  174  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000134905  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0517  muropeptide transporter  30.17 
 
 		 491 aa  174  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000689062  normal  0.616646 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3200  muropeptide transporter  30.17 
 
 		 491 aa  174  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00206592  hitchhiker  0.000120766 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0484  muropeptide transporter  31.85 
 
 		 493 aa  174  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000603755  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1889  putative ampG protein  29.64 
 
 		 462 aa  173  5.999999999999999e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1298  major facilitator transporter  31.32 
 
 		 442 aa  171  2e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1667  major facilitator transporter  29.77 
 
 		 451 aa  171  2e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0579205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03281  hypothetical protein  31.06 
 
 		 409 aa  170  5e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>