211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_1726 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010531  Pnec_1726  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 417 aa  828    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.299438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2009  major facilitator transporter  91.57 
 
 		 415 aa  745    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.872827  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0329  major facilitator transporter  69.45 
 
 		 478 aa  573  1.0000000000000001e-162  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0209  major facilitator transporter  72.95 
 
 		 466 aa  568  1e-161  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0152  major facilitator superfamily transporter  69.98 
 
 		 466 aa  562  1.0000000000000001e-159  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.421087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0214  major facilitator superfamily MFS_1  75 
 
 		 444 aa  554  1e-156  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.131109  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0199  major facilitator superfamily transporter  73.42 
 
 		 447 aa  554  1e-156  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.723346  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0276  major facilitator superfamily transporter  72.73 
 
 		 449 aa  548  1e-155  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.800927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0516  major facilitator transporter  72.52 
 
 		 441 aa  534  1e-150  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0263  major facilitator superfamily MFS_1  70.43 
 
 		 462 aa  522  1e-147  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.464987  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2636  major facilitator transporter  66.5 
 
 		 429 aa  511  1e-144  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.103448  normal  0.465614 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0253  putative transport transmembrane protein  60.05 
 
 		 462 aa  482  1e-135  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0223  major facilitator transporter  62.62 
 
 		 461 aa  466  9.999999999999999e-131  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3814  ampG protein, putative  57.62 
 
 		 461 aa  455  1e-127  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0819  major facilitator transporter  56.9 
 
 		 471 aa  456  1e-127  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0812  major facilitator transporter  56.19 
 
 		 463 aa  451  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3531  major facilitator superfamily MFS_1  55.95 
 
 		 471 aa  450  1e-125  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000125194 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0771  major facilitator transporter  56.19 
 
 		 465 aa  450  1e-125  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00332718  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3155  major facilitator transporter  55.95 
 
 		 465 aa  449  1e-125  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0783  major facilitator transporter  54.46 
 
 		 463 aa  448  1e-125  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.191663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0711  major facilitator transporter  55.95 
 
 		 471 aa  450  1e-125  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3644  major facilitator transporter  56.53 
 
 		 472 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0893526 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2556  AmpG protein, putative  55.93 
 
 		 466 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.368438 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3442  major facilitator transporter  57 
 
 		 478 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.141995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3723  major facilitator transporter  54.29 
 
 		 471 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3600  major facilitator transporter  54.29 
 
 		 471 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2892  major facilitator transporter  55.24 
 
 		 472 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0730175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3113  major facilitator transporter  53.81 
 
 		 476 aa  436  1e-121  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3114  major facilitator transporter  56.25 
 
 		 475 aa  424  1e-117  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0069  major facilitator superfamily MFS_1  48.46 
 
 		 475 aa  383  1e-105  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.805125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2584  major facilitator superfamily transporter  50.12 
 
 		 439 aa  379  1e-104  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.11871  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3596  major facilitator transporter  43.98 
 
 		 478 aa  336  5.999999999999999e-91  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.597959  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2143  major facilitator transporter  47.64 
 
 		 450 aa  333  4e-90  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2679  major facilitator transporter  46.27 
 
 		 465 aa  328  1.0000000000000001e-88  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000459278 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6531  major facilitator transporter  45.91 
 
 		 443 aa  327  3e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.118713  normal  0.219837 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2288  major facilitator transporter  47.27 
 
 		 468 aa  324  1e-87  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7099  major facilitator superfamily MFS_1  45.64 
 
 		 447 aa  322  9.999999999999999e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.835982  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0296  AmpG protein  43.9 
 
 		 457 aa  299  5e-80  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0367426 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4408  major facilitator superfamily MFS_1  42.36 
 
 		 482 aa  292  8e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4038  major facilitator transporter  42.36 
 
 		 482 aa  292  1e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.549121  normal  0.182505 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4520  major facilitator superfamily MFS_1  40.89 
 
 		 504 aa  280  2e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.623775  normal  0.239632 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0623  major facilitator superfamily MFS_1  39.66 
 
 		 459 aa  277  2e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.89214  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0083  major facilitator transporter  39.95 
 
 		 457 aa  273  3e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0365182 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0664  major facilitator transporter  39.22 
 
 		 456 aa  268  1e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.757276  normal  0.314251 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0624  major facilitator transporter  41.52 
 
 		 461 aa  261  2e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.471905  normal  0.556428 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0770  major facilitator transporter  39.46 
 
 		 455 aa  256  6e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.742854 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3691  major facilitator transporter  38.42 
 
 		 454 aa  255  8e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.639879  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3063  major facilitator transporter  39.41 
 
 		 452 aa  254  2.0000000000000002e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.797307  normal  0.542737 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2999  major facilitator transporter  40.1 
 
 		 388 aa  250  4e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2937  major facilitator transporter  40.67 
 
 		 443 aa  249  7e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02935  signal transducer  40.94 
 
 		 431 aa  243  5e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.726126  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0110  major facilitator superfamily MFS_1  39.13 
 
 		 452 aa  241  1e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0140571  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7340  major facilitator superfamily permease  37.93 
 
 		 460 aa  238  2e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1355  AmpG-related permease  59.47 
 
 		 515 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.010612  normal  0.140605 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4369  AmpG-related permease  58.95 
 
 		 515 aa  236  7e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0389334 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4494  AmpG-related permease  58.42 
 
 		 515 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.769685  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0962  AmpG-related permease  58.95 
 
 		 515 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1198  AmpG permease  58.42 
 
 		 519 aa  231  2e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.1584 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1420  major facilitator superfamily MFS_1  35.37 
 
 		 438 aa  229  5e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.508599 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2570  YD repeat-containing protein  46.01 
 
 		 1565 aa  228  1e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.332337  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2577  YD repeat-containing protein  46.01 
 
 		 1565 aa  228  1e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.328115  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1449  major facilitator transporter  38.57 
 
 		 453 aa  226  8e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002702  AmpG permease  33.49 
 
 		 450 aa  223  4e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0470  major facilitator superfamily protein  35.08 
 
 		 428 aa  223  4e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.807635  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2483  major facilitator transporter  36.75 
 
 		 411 aa  223  6e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0047  muropeptide transporter  36.97 
 
 		 429 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.252605 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0044  muropeptide transporter  36.72 
 
 		 429 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3268  muropeptide transporter  35.77 
 
 		 495 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.482744  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0191  muropeptide transporter  36.84 
 
 		 419 aa  218  1e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10028  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1044  muropeptide transporter  35.52 
 
 		 495 aa  218  1e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0385615  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0154  muropeptide transporter  36.97 
 
 		 426 aa  218  2e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.679367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1091  muropeptide transporter  37.11 
 
 		 492 aa  217  4e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000207294  hitchhiker  0.00000512549 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4383  ampG protein, putative  54.37 
 
 		 516 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.920569  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4078  AmpG-related permease  54.41 
 
 		 516 aa  216  8e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0814  putative permease  32.18 
 
 		 424 aa  216  8e-55  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3239  muropeptide transporter  35.24 
 
 		 492 aa  214  1.9999999999999998e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.83474  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3058  muropeptide transporter  35.24 
 
 		 492 aa  214  2.9999999999999995e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000335083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3096  muropeptide transporter  35.24 
 
 		 492 aa  214  2.9999999999999995e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0966625  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4017  major facilitator transporter  35.07 
 
 		 412 aa  212  1e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.165032 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0320  ampG protein, putative  38.85 
 
 		 409 aa  211  2e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1648  major facilitator transporter  33.91 
 
 		 450 aa  211  2e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.236568 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0944  MSF transporter  32.72 
 
 		 447 aa  210  3e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0941  hypothetical protein  57.37 
 
 		 598 aa  211  3e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.274634 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0147  major facilitator transporter  54.36 
 
 		 550 aa  210  4e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13420  AmpG-related permease  55.26 
 
 		 515 aa  209  9e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4964  putative permease  50.47 
 
 		 594 aa  208  1e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.559843  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3983  major facilitator superfamily MFS_1  34 
 
 		 416 aa  207  2e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.819094 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57100  putative permease  51.4 
 
 		 594 aa  207  2e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1667  major facilitator transporter  32.71 
 
 		 451 aa  208  2e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0579205  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00384  muropeptide transporter  34.33 
 
 		 491 aa  206  6e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000202049  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00388  hypothetical protein  34.33 
 
 		 491 aa  206  6e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000464324  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0900  muropeptide transporter  33.58 
 
 		 491 aa  206  7e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00841123  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3176  AmpG-related permease  34.33 
 
 		 491 aa  205  1e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000022392  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4016  major facilitator transporter  34.39 
 
 		 444 aa  205  1e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03281  hypothetical protein  32.59 
 
 		 409 aa  205  1e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0517  muropeptide transporter  34.33 
 
 		 491 aa  205  1e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000689062  normal  0.616646 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1889  putative ampG protein  31.84 
 
 		 462 aa  205  1e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3200  muropeptide transporter  34.33 
 
 		 491 aa  204  2e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00206592  hitchhiker  0.000120766 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0508  muropeptide transporter  34.33 
 
 		 491 aa  204  2e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000051766  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0468  muropeptide transporter  34.33 
 
 		 491 aa  204  2e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000134905  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>