208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_002702 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I0944  MSF transporter  78.05 
 
 		 447 aa  730    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03281  hypothetical protein  91.93 
 
 		 409 aa  773    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1667  major facilitator transporter  76.4 
 
 		 451 aa  717    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0579205  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002702  AmpG permease  100 
 
 		 450 aa  909    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1889  putative ampG protein  79.15 
 
 		 462 aa  726    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03703  putative muropeptide transport protein  51.39 
 
 		 448 aa  434  1e-120  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0110  major facilitator superfamily MFS_1  40.94 
 
 		 452 aa  287  2.9999999999999996e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0140571  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0771  major facilitator transporter  35.63 
 
 		 465 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00332718  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3155  major facilitator transporter  35.92 
 
 		 465 aa  254  3e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3814  ampG protein, putative  35.56 
 
 		 461 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0812  major facilitator transporter  35.92 
 
 		 463 aa  253  5.000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0783  major facilitator transporter  35.7 
 
 		 463 aa  251  1e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.191663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0069  major facilitator superfamily MFS_1  31.95 
 
 		 475 aa  248  2e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.805125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0711  major facilitator transporter  34.97 
 
 		 471 aa  247  3e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0819  major facilitator transporter  34.89 
 
 		 471 aa  247  3e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3723  major facilitator transporter  35.27 
 
 		 471 aa  246  4e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3600  major facilitator transporter  35.27 
 
 		 471 aa  246  4e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2556  AmpG protein, putative  35.76 
 
 		 466 aa  246  4.9999999999999997e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.368438 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3531  major facilitator superfamily MFS_1  34.82 
 
 		 471 aa  246  6e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000125194 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2143  major facilitator transporter  35.42 
 
 		 450 aa  245  9.999999999999999e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2892  major facilitator transporter  35.28 
 
 		 472 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0730175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3644  major facilitator transporter  33.69 
 
 		 472 aa  241  2e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0893526 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3442  major facilitator transporter  35.82 
 
 		 478 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.141995  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0623  major facilitator superfamily MFS_1  36.11 
 
 		 459 aa  240  4e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.89214  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2679  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 465 aa  239  5.999999999999999e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000459278 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3063  major facilitator transporter  36.89 
 
 		 452 aa  239  9e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.797307  normal  0.542737 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3113  major facilitator transporter  33.77 
 
 		 476 aa  238  1e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0083  major facilitator transporter  36.42 
 
 		 457 aa  238  1e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0365182 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2288  major facilitator transporter  33.11 
 
 		 468 aa  239  1e-61  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3691  major facilitator transporter  35.82 
 
 		 454 aa  233  4.0000000000000004e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.639879  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3114  major facilitator transporter  35.99 
 
 		 475 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0664  major facilitator transporter  36.5 
 
 		 456 aa  232  1e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.757276  normal  0.314251 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6531  major facilitator transporter  35.47 
 
 		 443 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.118713  normal  0.219837 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0253  putative transport transmembrane protein  32.58 
 
 		 462 aa  226  7e-58  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0152  major facilitator superfamily transporter  32.72 
 
 		 466 aa  224  2e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.421087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0770  major facilitator transporter  36.89 
 
 		 455 aa  224  3e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.742854 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0879  hypothetical protein  58.29 
 
 		 528 aa  223  4e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.207268  hitchhiker  0.000254267 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2009  major facilitator transporter  35.48 
 
 		 415 aa  223  4e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.872827  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7099  major facilitator superfamily MFS_1  34.35 
 
 		 447 aa  222  9.999999999999999e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.835982  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0470  major facilitator superfamily protein  34.97 
 
 		 428 aa  221  1.9999999999999999e-56  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.807635  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7340  major facilitator superfamily permease  34.21 
 
 		 460 aa  219  6e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1449  major facilitator transporter  38.14 
 
 		 453 aa  219  1e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2483  major facilitator transporter  34.65 
 
 		 411 aa  216  5e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2584  major facilitator superfamily transporter  32.49 
 
 		 439 aa  216  5.9999999999999996e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.11871  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0223  major facilitator transporter  31.81 
 
 		 461 aa  215  1.9999999999999998e-54  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1726  major facilitator superfamily MFS_1  33.49 
 
 		 417 aa  214  2.9999999999999995e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.299438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3983  major facilitator superfamily MFS_1  32.39 
 
 		 416 aa  211  2e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.819094 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2636  major facilitator transporter  35.12 
 
 		 429 aa  211  2e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.103448  normal  0.465614 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0329  major facilitator transporter  31.44 
 
 		 478 aa  206  1e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1298  major facilitator transporter  31.38 
 
 		 442 aa  205  1e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0516  major facilitator transporter  32.57 
 
 		 441 aa  205  1e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4017  major facilitator transporter  33.1 
 
 		 412 aa  204  2e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.165032 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2937  major facilitator transporter  33.89 
 
 		 443 aa  204  2e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0209  major facilitator transporter  32.73 
 
 		 466 aa  204  4e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1235  muropeptide MFS uptake transporter AmpG  30.51 
 
 		 550 aa  202  9e-51  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.988982 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0296  AmpG protein  30.87 
 
 		 457 aa  202  9e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0367426 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0044  muropeptide transporter  33.8 
 
 		 429 aa  202  9e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0047  muropeptide transporter  33.33 
 
 		 429 aa  201  3e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.252605 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3596  major facilitator transporter  30.28 
 
 		 478 aa  200  3.9999999999999996e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.597959  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13420  AmpG-related permease  30.85 
 
 		 515 aa  200  5e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0468  muropeptide transporter  32.03 
 
 		 491 aa  200  5e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000134905  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0355  muropeptide transporter  32.03 
 
 		 491 aa  200  5e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000149162  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3200  muropeptide transporter  32.03 
 
 		 491 aa  200  5e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00206592  hitchhiker  0.000120766 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0508  muropeptide transporter  32.03 
 
 		 491 aa  200  5e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000051766  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3176  AmpG-related permease  32.03 
 
 		 491 aa  200  6e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000022392  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0474  muropeptide transporter  32.03 
 
 		 491 aa  200  6e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000168996  normal  0.779827 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0517  muropeptide transporter  32.03 
 
 		 491 aa  200  6e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000689062  normal  0.616646 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0191  muropeptide transporter  33.86 
 
 		 419 aa  199  7e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10028  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00384  muropeptide transporter  32.03 
 
 		 491 aa  199  9e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000202049  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00388  hypothetical protein  32.03 
 
 		 491 aa  199  9e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000464324  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0154  muropeptide transporter  33.1 
 
 		 426 aa  198  2.0000000000000003e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.679367  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5113  major facilitator superfamily MFS_1  36.5 
 
 		 463 aa  198  2.0000000000000003e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0199  major facilitator superfamily transporter  31.92 
 
 		 447 aa  197  4.0000000000000005e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.723346  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4078  AmpG-related permease  29.64 
 
 		 516 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1156  major facilitator transporter  30.51 
 
 		 553 aa  195  1e-48  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0968602  normal  0.231698 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0263  major facilitator superfamily MFS_1  32.05 
 
 		 462 aa  195  2e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.464987  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4383  ampG protein, putative  29.84 
 
 		 516 aa  194  2e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.920569  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0146  muropeptide transporter  34.53 
 
 		 426 aa  194  3e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.802826 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0276  major facilitator superfamily transporter  32.32 
 
 		 449 aa  194  3e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.800927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1218  major facilitator superfamily MFS_1  32.77 
 
 		 425 aa  194  4e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.8639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0900  muropeptide transporter  30.84 
 
 		 491 aa  192  9e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00841123  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2276  major facilitator superfamily MFS_1  34.8 
 
 		 416 aa  192  1e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1198  AmpG permease  29.64 
 
 		 519 aa  191  2e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.1584 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4369  AmpG-related permease  30.44 
 
 		 515 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0389334 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4494  AmpG-related permease  30.44 
 
 		 515 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.769685  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1355  AmpG-related permease  30.65 
 
 		 515 aa  190  4e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.010612  normal  0.140605 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0375  major facilitator superfamily muropeptide transporter  30.05 
 
 		 437 aa  190  4e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0180  major facilitator transporter  30.05 
 
 		 437 aa  190  4e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.277448  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0190  major facilitator transporter  30.05 
 
 		 437 aa  190  4e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0962  AmpG-related permease  30.44 
 
 		 515 aa  189  8e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0214  major facilitator superfamily MFS_1  32.14 
 
 		 444 aa  189  9e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.131109  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3244  AmpG-related permease  30.05 
 
 		 437 aa  189  1e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2905  AmpG-related permease  30.05 
 
 		 437 aa  189  1e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2184  AmpG-related permease  30.05 
 
 		 437 aa  189  1e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.452697  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3443  AmpG-related permease  30.05 
 
 		 437 aa  189  1e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0155  AmpG-related permease  29.48 
 
 		 437 aa  187  3e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4016  major facilitator transporter  31.68 
 
 		 444 aa  187  3e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0486  muropeptide transporter  30.45 
 
 		 491 aa  187  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00924697  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0492  muropeptide transporter  30.45 
 
 		 493 aa  187  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00144184  decreased coverage  0.00023941 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0484  muropeptide transporter  30.45 
 
 		 493 aa  187  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000603755  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>