215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_4070 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_4070  HNH endonuclease  100 
 
 		 509 aa  984    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4105  major facilitator transporter  58.05 
 
 		 547 aa  502  1e-141  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000015602 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0122  major facilitator transporter  56.02 
 
 		 509 aa  499  1e-140  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.00126713  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0139  beta-lactamase induction signal transducer protein  56.02 
 
 		 509 aa  498  1e-140  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.143308  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0154  muropeptide transporter  46.36 
 
 		 426 aa  364  2e-99  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.679367  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1044  muropeptide transporter  44.24 
 
 		 495 aa  344  2.9999999999999997e-93  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0385615  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3268  muropeptide transporter  44.98 
 
 		 495 aa  341  1e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.482744  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0503  muropeptide transporter  43.78 
 
 		 491 aa  338  1.9999999999999998e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000985164  normal  0.643991 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0486  muropeptide transporter  43.78 
 
 		 491 aa  335  1e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00924697  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0484  muropeptide transporter  43.23 
 
 		 493 aa  335  1e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000603755  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0492  muropeptide transporter  43.23 
 
 		 493 aa  335  1e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00144184  decreased coverage  0.00023941 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0547  muropeptide transporter  43.78 
 
 		 491 aa  335  2e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.283527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1091  muropeptide transporter  43.78 
 
 		 492 aa  332  1e-89  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000207294  hitchhiker  0.00000512549 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0047  muropeptide transporter  43.43 
 
 		 429 aa  328  1.0000000000000001e-88  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.252605 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0044  muropeptide transporter  41.21 
 
 		 429 aa  303  4.0000000000000003e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0900  muropeptide transporter  36.71 
 
 		 491 aa  286  5.999999999999999e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00841123  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3983  major facilitator superfamily MFS_1  38.03 
 
 		 416 aa  282  1e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.819094 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00384  muropeptide transporter  38.1 
 
 		 491 aa  281  2e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000202049  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3176  AmpG-related permease  38.1 
 
 		 491 aa  281  2e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000022392  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0508  muropeptide transporter  38.1 
 
 		 491 aa  281  2e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000051766  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0474  muropeptide transporter  38.1 
 
 		 491 aa  281  2e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000168996  normal  0.779827 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3200  muropeptide transporter  38.1 
 
 		 491 aa  281  2e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00206592  hitchhiker  0.000120766 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00388  hypothetical protein  38.1 
 
 		 491 aa  281  2e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000464324  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0517  muropeptide transporter  38.1 
 
 		 491 aa  281  2e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000689062  normal  0.616646 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0355  muropeptide transporter  38.1 
 
 		 491 aa  281  2e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000149162  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0468  muropeptide transporter  38.1 
 
 		 491 aa  281  2e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000134905  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0470  major facilitator superfamily protein  37.82 
 
 		 428 aa  258  1e-67  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.807635  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0664  major facilitator transporter  36.71 
 
 		 456 aa  249  8e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.757276  normal  0.314251 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1400  signal transducer ampG1  36.06 
 
 		 502 aa  247  3e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00988952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0083  major facilitator transporter  36.51 
 
 		 457 aa  248  3e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0365182 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2999  major facilitator transporter  35.65 
 
 		 388 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0623  major facilitator superfamily MFS_1  36.31 
 
 		 459 aa  244  3e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.89214  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2276  major facilitator superfamily MFS_1  35.79 
 
 		 416 aa  239  1e-61  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0600  AmpG protein  33.26 
 
 		 428 aa  232  1e-59  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.674312  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1218  major facilitator superfamily MFS_1  35.77 
 
 		 425 aa  231  3e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.8639  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3063  major facilitator transporter  35.69 
 
 		 452 aa  229  8e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.797307  normal  0.542737 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0770  major facilitator transporter  35.38 
 
 		 455 aa  227  3e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.742854 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7340  major facilitator superfamily permease  36.31 
 
 		 460 aa  227  4e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1901  AmpG  33.4 
 
 		 433 aa  224  3e-57  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.165833  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0289  AmpG protein  33.54 
 
 		 433 aa  223  6e-57  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2937  major facilitator transporter  36.53 
 
 		 443 aa  223  9e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0706  putative ampG protein  33.89 
 
 		 426 aa  220  5e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3098  major facilitator transporter  31.55 
 
 		 473 aa  206  6e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4390  major facilitator superfamily (MFS)muropeptide transporter  31.15 
 
 		 464 aa  205  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3156  major facilitator transporter  31.65 
 
 		 473 aa  203  6e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3117  major facilitator transporter  32.27 
 
 		 473 aa  203  6e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0830  hypothetical protein  32.43 
 
 		 415 aa  202  9.999999999999999e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2881  muropeptide transporter  56.74 
 
 		 489 aa  199  1.0000000000000001e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.457618  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6531  major facilitator transporter  32.1 
 
 		 443 aa  196  1e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.118713  normal  0.219837 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0333  major facilitator superfamily MFS_1  31.3 
 
 		 464 aa  196  1e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2584  major facilitator superfamily transporter  29.88 
 
 		 439 aa  193  5e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.11871  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6452  major facilitator transporter  31.6 
 
 		 473 aa  192  1e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.554159  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3039  major facilitator transporter  31.46 
 
 		 473 aa  192  1e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2487  major facilitator transporter  32.27 
 
 		 473 aa  192  2e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.60868  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3101  major facilitator transporter  32.27 
 
 		 473 aa  192  2e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3072  muropeptide transporter  57.74 
 
 		 489 aa  190  4e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000553099  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0147  major facilitator transporter  31.56 
 
 		 550 aa  188  2e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3096  muropeptide transporter  45.98 
 
 		 492 aa  187  4e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0966625  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5113  major facilitator superfamily MFS_1  35.18 
 
 		 463 aa  187  4e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3058  muropeptide transporter  45.98 
 
 		 492 aa  187  4e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000335083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1449  major facilitator transporter  34.3 
 
 		 453 aa  187  4e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0146  muropeptide transporter  48.91 
 
 		 426 aa  187  5e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.802826 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0253  putative transport transmembrane protein  30.19 
 
 		 462 aa  186  8e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0191  muropeptide transporter  54.79 
 
 		 419 aa  186  1.0000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10028  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03703  putative muropeptide transport protein  28.48 
 
 		 448 aa  186  1.0000000000000001e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3239  muropeptide transporter  45.54 
 
 		 492 aa  184  4.0000000000000006e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.83474  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0059  major facilitator transporter  31.17 
 
 		 464 aa  183  7e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.955073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2679  major facilitator transporter  29.42 
 
 		 465 aa  179  2e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000459278 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1235  muropeptide MFS uptake transporter AmpG  27.81 
 
 		 550 aa  177  3e-43  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.988982 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4017  major facilitator transporter  49.48 
 
 		 412 aa  176  8e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.165032 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0944  MSF transporter  27.86 
 
 		 447 aa  170  6e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1156  major facilitator transporter  28.54 
 
 		 553 aa  170  7e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0968602  normal  0.231698 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4038  major facilitator transporter  28.84 
 
 		 482 aa  169  9e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.549121  normal  0.182505 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2556  AmpG protein, putative  30.3 
 
 		 466 aa  169  1e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.368438 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0771  major facilitator transporter  28.34 
 
 		 465 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00332718  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4408  major facilitator superfamily MFS_1  29.05 
 
 		 482 aa  168  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4520  major facilitator superfamily MFS_1  29.46 
 
 		 504 aa  167  5e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.623775  normal  0.239632 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0152  major facilitator superfamily transporter  30.15 
 
 		 466 aa  165  2.0000000000000002e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.421087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0223  major facilitator transporter  29.56 
 
 		 461 aa  161  2e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002702  AmpG permease  27.98 
 
 		 450 aa  162  2e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2288  major facilitator transporter  28.66 
 
 		 468 aa  161  3e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0814  putative permease  26.6 
 
 		 424 aa  160  4e-38  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2143  major facilitator transporter  29.28 
 
 		 450 aa  159  1e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13420  AmpG-related permease  30.04 
 
 		 515 aa  159  2e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0329  major facilitator transporter  30.04 
 
 		 478 aa  158  2e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0711  major facilitator transporter  27.9 
 
 		 471 aa  158  2e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0819  major facilitator transporter  28.24 
 
 		 471 aa  159  2e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2009  major facilitator transporter  28.66 
 
 		 415 aa  157  4e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.872827  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3814  ampG protein, putative  27.72 
 
 		 461 aa  157  5.0000000000000005e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0624  major facilitator transporter  29.79 
 
 		 461 aa  156  6e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.471905  normal  0.556428 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0190  major facilitator transporter  29.9 
 
 		 576 aa  157  6e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.397868 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0199  major facilitator superfamily transporter  32.47 
 
 		 447 aa  157  6e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.723346  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1726  major facilitator superfamily MFS_1  28.03 
 
 		 417 aa  156  8e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.299438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3114  major facilitator transporter  28.75 
 
 		 475 aa  156  9e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3531  major facilitator superfamily MFS_1  28.48 
 
 		 471 aa  156  1e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000125194 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3644  major facilitator transporter  26.9 
 
 		 472 aa  155  2e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0893526 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1889  putative ampG protein  27.99 
 
 		 462 aa  155  2e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0296  AmpG protein  29.38 
 
 		 457 aa  154  2.9999999999999998e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0367426 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0276  major facilitator superfamily transporter  30 
 
 		 449 aa  154  4e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.800927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2892  major facilitator transporter  29.07 
 
 		 472 aa  154  4e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0730175  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>