217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2336 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2336  major facilitator transporter  100 
 
 		 424 aa  827    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1498  major facilitator transporter  53.91 
 
 		 408 aa  339  5e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.85322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1339  major facilitator superfamily MFS_1  45.09 
 
 		 406 aa  331  2e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1571  major facilitator superfamily MFS_1  40.79 
 
 		 412 aa  270  4e-71  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.823301  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0344  major facilitator transporter  35.37 
 
 		 415 aa  249  7e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0184  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 396 aa  190  4e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1673  major facilitator transporter  32.31 
 
 		 396 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00717957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3267  major facilitator superfamily MFS_1  39.31 
 
 		 641 aa  171  2e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0360641 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3088  major facilitator superfamily MFS_1  32.61 
 
 		 408 aa  138  1e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.120291  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1496  major facilitator transporter  30.67 
 
 		 395 aa  123  5e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.372528  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3032  major facilitator superfamily MFS_1  31.35 
 
 		 411 aa  122  9.999999999999999e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.998579  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0590  major facilitator transporter  28.38 
 
 		 465 aa  115  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.97195 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0866  major facilitator transporter  29.72 
 
 		 413 aa  112  8.000000000000001e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00348625  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0074  major facilitator superfamily MFS_1  31.51 
 
 		 406 aa  113  8.000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.220484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4494  major facilitator transporter  30.31 
 
 		 416 aa  106  7e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00384  muropeptide transporter  33.84 
 
 		 491 aa  105  1e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000202049  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00388  hypothetical protein  33.84 
 
 		 491 aa  105  1e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000464324  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0468  muropeptide transporter  33.84 
 
 		 491 aa  105  2e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000134905  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3176  AmpG-related permease  33.84 
 
 		 491 aa  105  2e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000022392  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0517  muropeptide transporter  33.84 
 
 		 491 aa  105  2e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000689062  normal  0.616646 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0474  muropeptide transporter  33.84 
 
 		 491 aa  105  2e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000168996  normal  0.779827 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0355  muropeptide transporter  33.84 
 
 		 491 aa  105  2e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000149162  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0508  muropeptide transporter  33.84 
 
 		 491 aa  105  2e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000051766  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3200  muropeptide transporter  33.84 
 
 		 491 aa  105  2e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00206592  hitchhiker  0.000120766 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5064  RhtX/FptX family siderophore transporter  28.97 
 
 		 418 aa  103  6e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.646034  hitchhiker  0.00624927 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0900  muropeptide transporter  31.3 
 
 		 491 aa  101  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00841123  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4990  major facilitator superfamily MFS_1  28.75 
 
 		 424 aa  101  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3380  RhtX/FptX family siderophore transporter  32.56 
 
 		 271 aa  101  3e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3096  muropeptide transporter  31.25 
 
 		 492 aa  99.4  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0966625  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3268  muropeptide transporter  30.71 
 
 		 495 aa  99  1e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.482744  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3239  muropeptide transporter  31.25 
 
 		 492 aa  99.4  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.83474  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3058  muropeptide transporter  31.25 
 
 		 492 aa  99.4  1e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000335083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1091  muropeptide transporter  30.98 
 
 		 492 aa  98.6  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000207294  hitchhiker  0.00000512549 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1044  muropeptide transporter  30.31 
 
 		 495 aa  98.2  2e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0385615  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4017  major facilitator transporter  29.17 
 
 		 412 aa  99  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.165032 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0154  muropeptide transporter  31.35 
 
 		 426 aa  96.7  6e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.679367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3259  RhtX/FptX family siderophore transporter  28.53 
 
 		 420 aa  95.5  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.569308  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0486  muropeptide transporter  32.64 
 
 		 491 aa  95.1  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00924697  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0503  muropeptide transporter  32.64 
 
 		 491 aa  95.5  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000985164  normal  0.643991 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0492  muropeptide transporter  32.64 
 
 		 493 aa  95.1  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00144184  decreased coverage  0.00023941 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0484  muropeptide transporter  32.64 
 
 		 493 aa  95.1  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000603755  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0547  muropeptide transporter  32.82 
 
 		 491 aa  95.1  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.283527  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0044  muropeptide transporter  31.18 
 
 		 429 aa  95.1  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3072  muropeptide transporter  30.98 
 
 		 489 aa  94.4  3e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000553099  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0191  muropeptide transporter  30.33 
 
 		 419 aa  94.4  4e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10028  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0047  muropeptide transporter  31.1 
 
 		 429 aa  92.8  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.252605 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0337  major facilitator transporter  29.73 
 
 		 418 aa  91.7  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.957507  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1955  major facilitator superfamily MFS_1  32.07 
 
 		 420 aa  89.7  8e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.558727  normal  0.0965293 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0706  putative ampG protein  26.69 
 
 		 426 aa  87.8  3e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1726  major facilitator superfamily MFS_1  26.1 
 
 		 417 aa  88.2  3e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.299438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0146  muropeptide transporter  33.99 
 
 		 426 aa  88.2  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.802826 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2881  muropeptide transporter  31.3 
 
 		 489 aa  87.8  3e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.457618  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1299  major facilitator transporter  26.5 
 
 		 447 aa  84.3  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.333624  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0680  major facilitator transporter  34.26 
 
 		 414 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.440664  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0848  major facilitator transporter  29.55 
 
 		 413 aa  82.8  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0600  AmpG protein  26.56 
 
 		 428 aa  82  0.00000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.674312  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4390  major facilitator superfamily (MFS)muropeptide transporter  27.91 
 
 		 464 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3834  major facilitator transporter  25.4 
 
 		 417 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5297  RhtX/FptX family siderophore transporter  33.86 
 
 		 415 aa  80.5  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0680678 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1901  AmpG  27.35 
 
 		 433 aa  79.7  0.00000000000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.165833  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0320  ampG protein, putative  27.25 
 
 		 409 aa  79  0.0000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2999  major facilitator transporter  28.38 
 
 		 388 aa  79.3  0.0000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0470  major facilitator superfamily protein  25.16 
 
 		 428 aa  79.3  0.0000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.807635  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1218  major facilitator superfamily MFS_1  26.4 
 
 		 425 aa  79  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.8639  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3377  major facilitator transporter  33.07 
 
 		 415 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4990  major facilitator transporter  33.07 
 
 		 415 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2009  major facilitator transporter  28.26 
 
 		 415 aa  79  0.0000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.872827  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0289  AmpG protein  26.94 
 
 		 433 aa  78.2  0.0000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0333  major facilitator superfamily MFS_1  26.74 
 
 		 464 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0395  major facilitator transporter  23.44 
 
 		 411 aa  77.4  0.0000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0840  major facilitator transporter  28.06 
 
 		 439 aa  77  0.0000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0756  major facilitator transporter  25.55 
 
 		 428 aa  75.9  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3983  major facilitator superfamily MFS_1  23.98 
 
 		 416 aa  75.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.819094 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4408  major facilitator superfamily MFS_1  25.44 
 
 		 482 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0688  major facilitator transporter  24.76 
 
 		 434 aa  75.1  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4038  major facilitator transporter  26.33 
 
 		 482 aa  75.5  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.549121  normal  0.182505 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2102  yersinabactin region putative transporter YbtX  25.68 
 
 		 426 aa  75.1  0.000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0059  major facilitator transporter  24.43 
 
 		 464 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.955073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0296  AmpG protein  28.46 
 
 		 457 aa  74.3  0.000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0367426 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0094  hypothetical protein  32.5 
 
 		 511 aa  73.2  0.000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.4429  normal  0.916942 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0623  major facilitator superfamily MFS_1  25.97 
 
 		 459 aa  72.4  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.89214  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2487  major facilitator transporter  25.66 
 
 		 473 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.60868  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3101  major facilitator transporter  25.66 
 
 		 473 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3244  AmpG-related permease  24.62 
 
 		 437 aa  72  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6452  major facilitator transporter  26.04 
 
 		 473 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.554159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1821  transporter  31.43 
 
 		 457 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2584  major facilitator superfamily transporter  30.68 
 
 		 439 aa  71.6  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.11871  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2905  AmpG-related permease  24.62 
 
 		 437 aa  72  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3117  major facilitator transporter  25.28 
 
 		 473 aa  72  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2184  AmpG-related permease  24.62 
 
 		 437 aa  72  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.452697  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3443  AmpG-related permease  24.62 
 
 		 437 aa  72  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4105  major facilitator transporter  34.85 
 
 		 547 aa  71.2  0.00000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000015602 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4964  putative permease  29.94 
 
 		 594 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.559843  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1629  major facilitator superfamily MFS_1  24.21 
 
 		 412 aa  71.2  0.00000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00218526  hitchhiker  0.00000020409 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0375  major facilitator superfamily muropeptide transporter  27.2 
 
 		 437 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3039  major facilitator transporter  25.28 
 
 		 473 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0516  major facilitator transporter  28.88 
 
 		 441 aa  70.9  0.00000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2937  major facilitator transporter  27.71 
 
 		 443 aa  70.9  0.00000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0180  major facilitator transporter  27.2 
 
 		 437 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.277448  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1961  AmpG permease protein, putative  24.21 
 
 		 412 aa  71.2  0.00000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>