88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_0395 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_0395  major facilitator transporter  100 
 
 		 411 aa  820    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0655  major facilitator superfamily transporter  38.01 
 
 		 427 aa  202  7e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.597769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1673  major facilitator transporter  24.55 
 
 		 396 aa  83.6  0.000000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00717957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0184  major facilitator transporter  23.77 
 
 		 396 aa  82.4  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0706  putative ampG protein  24.05 
 
 		 426 aa  74.7  0.000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5064  RhtX/FptX family siderophore transporter  26.2 
 
 		 418 aa  72  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.646034  hitchhiker  0.00624927 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3259  RhtX/FptX family siderophore transporter  25.1 
 
 		 420 aa  68.6  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.569308  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3032  major facilitator superfamily MFS_1  27.97 
 
 		 411 aa  67.4  0.0000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.998579  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2336  major facilitator transporter  23.68 
 
 		 424 aa  67  0.0000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1955  major facilitator superfamily MFS_1  27.65 
 
 		 420 aa  64.3  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.558727  normal  0.0965293 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1044  muropeptide transporter  24.66 
 
 		 495 aa  63.5  0.000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0385615  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0180  major facilitator transporter  23.53 
 
 		 437 aa  63.2  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.277448  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0190  major facilitator transporter  23.53 
 
 		 437 aa  63.2  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0375  major facilitator superfamily muropeptide transporter  23.53 
 
 		 437 aa  63.2  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1571  major facilitator superfamily MFS_1  24.81 
 
 		 412 aa  63.2  0.000000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.823301  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3268  muropeptide transporter  24.65 
 
 		 495 aa  61.6  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.482744  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0600  AmpG protein  22.77 
 
 		 428 aa  61.6  0.00000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.674312  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4494  major facilitator transporter  25.54 
 
 		 416 aa  62  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1496  major facilitator transporter  22.46 
 
 		 395 aa  60.8  0.00000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.372528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3834  major facilitator transporter  20.94 
 
 		 417 aa  60.1  0.00000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3244  AmpG-related permease  23.29 
 
 		 437 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3443  AmpG-related permease  23.29 
 
 		 437 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2184  AmpG-related permease  23.29 
 
 		 437 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.452697  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2905  AmpG-related permease  23.29 
 
 		 437 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0128  major facilitator transporter  23.84 
 
 		 422 aa  58.5  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2881  muropeptide transporter  23.85 
 
 		 489 aa  58.5  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.457618  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0155  AmpG-related permease  22.16 
 
 		 437 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1339  major facilitator superfamily MFS_1  21.52 
 
 		 406 aa  56.6  0.0000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0289  AmpG protein  21.63 
 
 		 433 aa  56.2  0.0000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1901  AmpG  21.63 
 
 		 433 aa  56.2  0.000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.165833  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1388  major facilitator superfamily MFS_1  22.61 
 
 		 517 aa  54.3  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.344668  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1287  major facilitator superfamily MFS_1  22.61 
 
 		 517 aa  53.9  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2999  major facilitator transporter  23.4 
 
 		 388 aa  54.3  0.000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4017  major facilitator transporter  23.5 
 
 		 412 aa  52.8  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.165032 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2561  major facilitator transporter  22.67 
 
 		 517 aa  52.8  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.249955  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3096  muropeptide transporter  22.89 
 
 		 492 aa  52  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0966625  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3380  RhtX/FptX family siderophore transporter  25.48 
 
 		 271 aa  52.4  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3058  muropeptide transporter  22.89 
 
 		 492 aa  52  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000335083  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3239  muropeptide transporter  22.89 
 
 		 492 aa  51.6  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.83474  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0333  major facilitator superfamily MFS_1  21.8 
 
 		 464 aa  52  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0047  muropeptide transporter  23.16 
 
 		 429 aa  52  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.252605 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6452  major facilitator transporter  22.52 
 
 		 473 aa  52.4  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.554159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0337  major facilitator transporter  20.93 
 
 		 418 aa  52.4  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.957507  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0492  muropeptide transporter  21.5 
 
 		 493 aa  51.2  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00144184  decreased coverage  0.00023941 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0484  muropeptide transporter  21.5 
 
 		 493 aa  51.2  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000603755  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1091  muropeptide transporter  22.61 
 
 		 492 aa  51.2  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000207294  hitchhiker  0.00000512549 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0547  muropeptide transporter  21.5 
 
 		 491 aa  50.8  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.283527  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0044  muropeptide transporter  23.16 
 
 		 429 aa  51.2  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0486  muropeptide transporter  21.5 
 
 		 491 aa  51.2  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00924697  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0503  muropeptide transporter  21.5 
 
 		 491 aa  50.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000985164  normal  0.643991 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3039  major facilitator transporter  22.03 
 
 		 473 aa  50.4  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0590  major facilitator transporter  20.7 
 
 		 465 aa  50.1  0.00007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.97195 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0664  major facilitator transporter  23.2 
 
 		 456 aa  50.1  0.00007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.757276  normal  0.314251 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3156  major facilitator transporter  22.03 
 
 		 473 aa  50.1  0.00007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3117  major facilitator transporter  22.28 
 
 		 473 aa  50.1  0.00008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2487  major facilitator transporter  22.28 
 
 		 473 aa  49.7  0.00009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.60868  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3101  major facilitator transporter  22.28 
 
 		 473 aa  49.7  0.00009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3157  major facilitator superfamily MFS_1  21.81 
 
 		 437 aa  49.3  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.447147  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3098  major facilitator transporter  21.43 
 
 		 473 aa  48.9  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3970  major facilitator transporter  25 
 
 		 415 aa  49.3  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0770  major facilitator transporter  24.46 
 
 		 455 aa  48.5  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.742854 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0623  major facilitator superfamily MFS_1  22.25 
 
 		 459 aa  48.5  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.89214  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1498  major facilitator transporter  25.26 
 
 		 408 aa  48.5  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.85322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0083  major facilitator transporter  23.06 
 
 		 457 aa  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0365182 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0320  ampG protein, putative  21.35 
 
 		 409 aa  48.1  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0900  muropeptide transporter  21.81 
 
 		 491 aa  47.8  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00841123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4390  major facilitator superfamily (MFS)muropeptide transporter  20.9 
 
 		 464 aa  47.8  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0154  muropeptide transporter  22.43 
 
 		 426 aa  47  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.679367  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2276  major facilitator superfamily MFS_1  22.91 
 
 		 416 aa  47  0.0006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1299  major facilitator transporter  23.41 
 
 		 447 aa  46.6  0.0009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.333624  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0856  hypothetical protein  24.75 
 
 		 419 aa  45.8  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2483  major facilitator transporter  26.81 
 
 		 411 aa  45.8  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1218  major facilitator superfamily MFS_1  22.8 
 
 		 425 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.8639  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3072  muropeptide transporter  22.61 
 
 		 489 aa  46.2  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000553099  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0624  major facilitator transporter  21.85 
 
 		 461 aa  45.8  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.471905  normal  0.556428 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3691  major facilitator transporter  22.76 
 
 		 454 aa  45.1  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.639879  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0344  major facilitator transporter  23.23 
 
 		 415 aa  45.4  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00384  muropeptide transporter  21.33 
 
 		 491 aa  44.7  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000202049  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00388  hypothetical protein  21.33 
 
 		 491 aa  44.7  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000464324  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0830  hypothetical protein  24.75 
 
 		 415 aa  44.3  0.004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0355  muropeptide transporter  21.55 
 
 		 491 aa  43.9  0.005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000149162  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0508  muropeptide transporter  21.55 
 
 		 491 aa  43.9  0.005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000051766  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0468  muropeptide transporter  21.55 
 
 		 491 aa  43.9  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000134905  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3200  muropeptide transporter  21.55 
 
 		 491 aa  43.9  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00206592  hitchhiker  0.000120766 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0517  muropeptide transporter  21.71 
 
 		 491 aa  43.9  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000689062  normal  0.616646 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0474  muropeptide transporter  21.55 
 
 		 491 aa  43.9  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000168996  normal  0.779827 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3176  AmpG-related permease  21.71 
 
 		 491 aa  43.9  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000022392  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0688  major facilitator transporter  26.37 
 
 		 434 aa  43.5  0.008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>