199 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_1955 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_1955  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 420 aa  797    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.558727  normal  0.0965293 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1304  major facilitator transporter  65.74 
 
 		 424 aa  418  9.999999999999999e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4990  major facilitator superfamily MFS_1  30.6 
 
 		 424 aa  99.8  9e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0623  major facilitator superfamily MFS_1  25.35 
 
 		 459 aa  93.6  5e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.89214  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3983  major facilitator superfamily MFS_1  26.95 
 
 		 416 aa  91.3  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.819094 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0184  major facilitator transporter  27.06 
 
 		 396 aa  90.9  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0083  major facilitator transporter  26.03 
 
 		 457 aa  89  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0365182 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0664  major facilitator transporter  24.94 
 
 		 456 aa  87.4  4e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.757276  normal  0.314251 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3088  major facilitator superfamily MFS_1  30.37 
 
 		 408 aa  87  6e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.120291  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1339  major facilitator superfamily MFS_1  27.35 
 
 		 406 aa  86.7  7e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1496  major facilitator transporter  28.82 
 
 		 395 aa  86.3  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.372528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1673  major facilitator transporter  25.27 
 
 		 396 aa  85.5  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00717957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2336  major facilitator transporter  27.49 
 
 		 424 aa  85.5  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0074  major facilitator superfamily MFS_1  28.64 
 
 		 406 aa  84.7  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.220484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0337  major facilitator transporter  30.77 
 
 		 418 aa  84.3  0.000000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.957507  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3032  major facilitator superfamily MFS_1  29.9 
 
 		 411 aa  84.3  0.000000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.998579  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0866  major facilitator transporter  29.89 
 
 		 413 aa  83.2  0.000000000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00348625  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0329  major facilitator transporter  30.05 
 
 		 478 aa  82.4  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3268  muropeptide transporter  28.89 
 
 		 495 aa  82.8  0.00000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.482744  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5064  RhtX/FptX family siderophore transporter  30.98 
 
 		 418 aa  82.4  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.646034  hitchhiker  0.00624927 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0900  muropeptide transporter  26.39 
 
 		 491 aa  82.8  0.00000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00841123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0688  major facilitator transporter  27.74 
 
 		 434 aa  82  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1437  major facilitator superfamily MFS_1  27.08 
 
 		 415 aa  82  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0547  muropeptide transporter  27.27 
 
 		 491 aa  82  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.283527  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0069  major facilitator superfamily MFS_1  25.76 
 
 		 475 aa  82  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.805125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0503  muropeptide transporter  27.27 
 
 		 491 aa  82  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000985164  normal  0.643991 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0484  muropeptide transporter  27.27 
 
 		 493 aa  81.3  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000603755  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6531  major facilitator transporter  28.85 
 
 		 443 aa  81.3  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.118713  normal  0.219837 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1218  major facilitator superfamily MFS_1  30.49 
 
 		 425 aa  81.3  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.8639  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0492  muropeptide transporter  27.27 
 
 		 493 aa  81.3  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00144184  decreased coverage  0.00023941 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0756  major facilitator transporter  27.5 
 
 		 428 aa  81.6  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0486  muropeptide transporter  27.27 
 
 		 491 aa  80.9  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00924697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0474  muropeptide transporter  27.32 
 
 		 491 aa  80.9  0.00000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000168996  normal  0.779827 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0468  muropeptide transporter  27.32 
 
 		 491 aa  80.5  0.00000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000134905  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3200  muropeptide transporter  27.32 
 
 		 491 aa  80.5  0.00000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00206592  hitchhiker  0.000120766 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0355  muropeptide transporter  27.32 
 
 		 491 aa  80.5  0.00000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000149162  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0508  muropeptide transporter  27.32 
 
 		 491 aa  80.5  0.00000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000051766  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00384  muropeptide transporter  27.94 
 
 		 491 aa  80.1  0.00000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000202049  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3176  AmpG-related permease  27.39 
 
 		 491 aa  80.5  0.00000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000022392  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0517  muropeptide transporter  27.39 
 
 		 491 aa  80.5  0.00000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000689062  normal  0.616646 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00388  hypothetical protein  27.94 
 
 		 491 aa  80.1  0.00000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000464324  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0516  major facilitator transporter  32.3 
 
 		 441 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0770  major facilitator transporter  25.87 
 
 		 455 aa  79  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.742854 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0152  major facilitator superfamily transporter  30.27 
 
 		 466 aa  78.2  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.421087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1571  major facilitator superfamily MFS_1  31.64 
 
 		 412 aa  77  0.0000000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.823301  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1044  muropeptide transporter  27.3 
 
 		 495 aa  76.6  0.0000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0385615  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0044  muropeptide transporter  29.95 
 
 		 429 aa  75.9  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1091  muropeptide transporter  27.32 
 
 		 492 aa  76.3  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000207294  hitchhiker  0.00000512549 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0154  muropeptide transporter  30.3 
 
 		 426 aa  74.7  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.679367  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4520  major facilitator superfamily MFS_1  28.72 
 
 		 504 aa  75.5  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.623775  normal  0.239632 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7099  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 		 447 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.835982  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4038  major facilitator transporter  27.64 
 
 		 482 aa  75.5  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.549121  normal  0.182505 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0344  major facilitator transporter  26.2 
 
 		 415 aa  75.5  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0047  muropeptide transporter  29.95 
 
 		 429 aa  74.3  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.252605 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4408  major facilitator superfamily MFS_1  27.64 
 
 		 482 aa  74.3  0.000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7340  major facilitator superfamily permease  25.95 
 
 		 460 aa  74.7  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0276  major facilitator superfamily transporter  29.21 
 
 		 449 aa  74.3  0.000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.800927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0253  putative transport transmembrane protein  27.23 
 
 		 462 aa  73.6  0.000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0296  AmpG protein  26.56 
 
 		 457 aa  73.6  0.000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0367426 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0333  major facilitator superfamily MFS_1  24.04 
 
 		 464 aa  73.2  0.000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2276  major facilitator superfamily MFS_1  29.63 
 
 		 416 aa  73.2  0.000000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0059  major facilitator transporter  25.27 
 
 		 464 aa  73.2  0.000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.955073  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0263  major facilitator superfamily MFS_1  29.14 
 
 		 462 aa  72.8  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.464987  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3058  muropeptide transporter  26.48 
 
 		 492 aa  72.8  0.00000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000335083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3096  muropeptide transporter  26.48 
 
 		 492 aa  72.8  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0966625  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4390  major facilitator superfamily (MFS)muropeptide transporter  24.04 
 
 		 464 aa  72  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2487  major facilitator transporter  26.35 
 
 		 473 aa  72  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.60868  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3259  RhtX/FptX family siderophore transporter  27.11 
 
 		 420 aa  72  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.569308  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3101  major facilitator transporter  26.35 
 
 		 473 aa  72  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3117  major facilitator transporter  26.03 
 
 		 473 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4016  major facilitator transporter  27.61 
 
 		 444 aa  71.2  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0375  major facilitator superfamily muropeptide transporter  26.51 
 
 		 437 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0180  major facilitator transporter  26.51 
 
 		 437 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.277448  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0190  major facilitator transporter  26.51 
 
 		 437 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3039  major facilitator transporter  26.35 
 
 		 473 aa  71.2  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1498  major facilitator transporter  29.67 
 
 		 408 aa  70.9  0.00000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.85322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2009  major facilitator transporter  28.03 
 
 		 415 aa  70.9  0.00000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.872827  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3098  major facilitator transporter  26.35 
 
 		 473 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0600  AmpG protein  25.09 
 
 		 428 aa  70.5  0.00000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.674312  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6452  major facilitator transporter  26.35 
 
 		 473 aa  70.5  0.00000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.554159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3156  major facilitator transporter  26.03 
 
 		 473 aa  70.5  0.00000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2636  major facilitator transporter  27.47 
 
 		 429 aa  70.1  0.00000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.103448  normal  0.465614 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3072  muropeptide transporter  28.63 
 
 		 489 aa  69.7  0.00000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000553099  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0209  major facilitator transporter  28.28 
 
 		 466 aa  69.7  0.00000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3239  muropeptide transporter  26.22 
 
 		 492 aa  69.7  0.00000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.83474  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3244  AmpG-related permease  26.51 
 
 		 437 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0395  major facilitator transporter  25.93 
 
 		 411 aa  69.3  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2679  major facilitator transporter  26.78 
 
 		 465 aa  68.9  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000459278 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3442  major facilitator transporter  27.58 
 
 		 478 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.141995  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2905  AmpG-related permease  26.51 
 
 		 437 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2184  AmpG-related permease  26.51 
 
 		 437 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.452697  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3443  AmpG-related permease  26.51 
 
 		 437 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0470  major facilitator superfamily protein  26.67 
 
 		 428 aa  68.9  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.807635  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0094  hypothetical protein  34.04 
 
 		 511 aa  68.9  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.4429  normal  0.916942 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8458  major facilitator superfamily MFS_1  26.5 
 
 		 442 aa  67.4  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0199  major facilitator superfamily transporter  27.54 
 
 		 447 aa  67.4  0.0000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.723346  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2436  major facilitator transporter  27.75 
 
 		 408 aa  67  0.0000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.649035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1299  major facilitator transporter  27.3 
 
 		 447 aa  66.2  0.0000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.333624  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1726  major facilitator superfamily MFS_1  28.47 
 
 		 417 aa  65.9  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.299438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0155  AmpG-related permease  25.53 
 
 		 437 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>