167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_2436 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_2436  major facilitator transporter  100 
 
 		 408 aa  806    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.649035  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1437  major facilitator superfamily MFS_1  57.88 
 
 		 415 aa  429  1e-119  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2601  hypothetical protein  61.67 
 
 		 408 aa  408  1e-113  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0722822  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0840  major facilitator transporter  30.75 
 
 		 439 aa  120  6e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2102  yersinabactin region putative transporter YbtX  28.5 
 
 		 426 aa  105  2e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1496  major facilitator transporter  27.49 
 
 		 395 aa  100  5e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.372528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0337  major facilitator transporter  30.87 
 
 		 418 aa  100  6e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.957507  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0184  major facilitator transporter  25.33 
 
 		 396 aa  94.7  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1673  major facilitator transporter  24.41 
 
 		 396 aa  91.7  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00717957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3259  RhtX/FptX family siderophore transporter  27.67 
 
 		 420 aa  82.8  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.569308  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1901  AmpG  28.28 
 
 		 433 aa  82.4  0.00000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.165833  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0289  AmpG protein  28.28 
 
 		 433 aa  81.3  0.00000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0866  major facilitator transporter  29.69 
 
 		 413 aa  77.8  0.0000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00348625  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3088  major facilitator superfamily MFS_1  28.75 
 
 		 408 aa  76.6  0.0000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.120291  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0047  muropeptide transporter  28.78 
 
 		 429 aa  75.1  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.252605 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0044  muropeptide transporter  29.07 
 
 		 429 aa  74.3  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4494  major facilitator transporter  31.52 
 
 		 416 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0329  major facilitator transporter  29.36 
 
 		 478 aa  74.7  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0154  muropeptide transporter  28.49 
 
 		 426 aa  74.3  0.000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.679367  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0276  major facilitator superfamily transporter  29.48 
 
 		 449 aa  73.9  0.000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.800927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1955  major facilitator superfamily MFS_1  26.59 
 
 		 420 aa  74.3  0.000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.558727  normal  0.0965293 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0214  major facilitator superfamily MFS_1  30.81 
 
 		 444 aa  73.6  0.000000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.131109  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0199  major facilitator superfamily transporter  29.68 
 
 		 447 aa  72.8  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.723346  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2636  major facilitator transporter  29.51 
 
 		 429 aa  72.4  0.00000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.103448  normal  0.465614 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3032  major facilitator superfamily MFS_1  35.45 
 
 		 411 aa  72  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.998579  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4990  major facilitator superfamily MFS_1  30.89 
 
 		 424 aa  71.6  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3380  RhtX/FptX family siderophore transporter  28.5 
 
 		 271 aa  71.2  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4038  major facilitator transporter  27.27 
 
 		 482 aa  70.1  0.00000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.549121  normal  0.182505 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0516  major facilitator transporter  28.78 
 
 		 441 aa  70.1  0.00000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4408  major facilitator superfamily MFS_1  27.27 
 
 		 482 aa  70.1  0.00000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1218  major facilitator superfamily MFS_1  27.07 
 
 		 425 aa  69.3  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.8639  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1571  major facilitator superfamily MFS_1  24.94 
 
 		 412 aa  68.9  0.0000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.823301  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0209  major facilitator transporter  26.91 
 
 		 466 aa  69.7  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3834  major facilitator transporter  23.14 
 
 		 417 aa  69.3  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4520  major facilitator superfamily MFS_1  27.57 
 
 		 504 aa  69.3  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.623775  normal  0.239632 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0770  major facilitator transporter  25.8 
 
 		 455 aa  68.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.742854 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0263  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 		 462 aa  68.2  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.464987  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0152  major facilitator superfamily transporter  28.07 
 
 		 466 aa  67  0.0000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.421087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0074  major facilitator superfamily MFS_1  26.85 
 
 		 406 aa  67  0.0000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.220484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0623  major facilitator superfamily MFS_1  25.36 
 
 		 459 aa  66.6  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.89214  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3983  major facilitator superfamily MFS_1  25.87 
 
 		 416 aa  66.2  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.819094 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0590  major facilitator transporter  27.31 
 
 		 465 aa  65.1  0.000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.97195 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0706  putative ampG protein  26.24 
 
 		 426 aa  63.2  0.000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5064  RhtX/FptX family siderophore transporter  26.65 
 
 		 418 aa  63.2  0.000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.646034  hitchhiker  0.00624927 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02935  signal transducer  31.15 
 
 		 431 aa  63.2  0.000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.726126  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3268  muropeptide transporter  26.46 
 
 		 495 aa  62.8  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.482744  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5297  RhtX/FptX family siderophore transporter  29.14 
 
 		 415 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0680678 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3377  major facilitator transporter  29.14 
 
 		 415 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4990  major facilitator transporter  29.14 
 
 		 415 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407927  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1044  muropeptide transporter  25.93 
 
 		 495 aa  61.2  0.00000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0385615  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03281  hypothetical protein  23.7 
 
 		 409 aa  61.2  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3117  major facilitator transporter  26.36 
 
 		 473 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0680  major facilitator transporter  29.24 
 
 		 414 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.440664  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2999  major facilitator transporter  25.22 
 
 		 388 aa  60.5  0.00000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6452  major facilitator transporter  26.04 
 
 		 473 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.554159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002702  AmpG permease  23.72 
 
 		 450 aa  60.5  0.00000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0083  major facilitator transporter  22.99 
 
 		 457 aa  60.5  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0365182 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2487  major facilitator transporter  26.36 
 
 		 473 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.60868  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3101  major facilitator transporter  26.36 
 
 		 473 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3156  major facilitator transporter  25.8 
 
 		 473 aa  59.7  0.00000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7099  major facilitator superfamily MFS_1  28.61 
 
 		 447 aa  59.7  0.00000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.835982  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0664  major facilitator transporter  23.85 
 
 		 456 aa  58.9  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.757276  normal  0.314251 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3039  major facilitator transporter  25.8 
 
 		 473 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0333  major facilitator superfamily MFS_1  23.43 
 
 		 464 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1726  major facilitator superfamily MFS_1  25.21 
 
 		 417 aa  58.5  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.299438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4017  major facilitator transporter  25.21 
 
 		 412 aa  58.2  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.165032 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0069  major facilitator superfamily MFS_1  23.96 
 
 		 475 aa  58.5  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.805125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0880  putative transporter  30.4 
 
 		 414 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.179079  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2009  major facilitator transporter  25.14 
 
 		 415 aa  57.4  0.0000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.872827  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4390  major facilitator superfamily (MFS)muropeptide transporter  23.43 
 
 		 464 aa  57  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1339  major facilitator superfamily MFS_1  23.62 
 
 		 406 aa  57  0.0000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0094  hypothetical protein  28.92 
 
 		 511 aa  56.6  0.0000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.4429  normal  0.916942 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0191  muropeptide transporter  27.72 
 
 		 419 aa  55.8  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10028  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0848  major facilitator transporter  27.05 
 
 		 413 aa  56.2  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0771  major facilitator transporter  24.19 
 
 		 465 aa  56.2  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00332718  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3691  major facilitator transporter  22.9 
 
 		 454 aa  55.8  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.639879  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0624  major facilitator transporter  28.07 
 
 		 461 aa  56.2  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.471905  normal  0.556428 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09380  putative transporter  29.26 
 
 		 414 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000449575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2556  AmpG protein, putative  23.32 
 
 		 466 aa  55.8  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.368438 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7340  major facilitator superfamily permease  25.63 
 
 		 460 aa  56.2  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00384  muropeptide transporter  26.15 
 
 		 491 aa  55.1  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000202049  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3176  AmpG-related permease  26.15 
 
 		 491 aa  55.1  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000022392  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0223  major facilitator transporter  24.87 
 
 		 461 aa  55.5  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1420  major facilitator superfamily MFS_1  27.89 
 
 		 438 aa  55.1  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.508599 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3200  muropeptide transporter  26.15 
 
 		 491 aa  55.1  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00206592  hitchhiker  0.000120766 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0474  muropeptide transporter  26.15 
 
 		 491 aa  55.1  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000168996  normal  0.779827 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0517  muropeptide transporter  26.15 
 
 		 491 aa  55.1  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000689062  normal  0.616646 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0355  muropeptide transporter  26.15 
 
 		 491 aa  55.1  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000149162  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0508  muropeptide transporter  26.15 
 
 		 491 aa  55.1  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000051766  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0468  muropeptide transporter  26.15 
 
 		 491 aa  55.1  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000134905  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1091  muropeptide transporter  24.62 
 
 		 492 aa  55.5  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000207294  hitchhiker  0.00000512549 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00388  hypothetical protein  26.15 
 
 		 491 aa  55.1  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000464324  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0900  muropeptide transporter  25.4 
 
 		 491 aa  54.7  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00841123  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3098  major facilitator transporter  24.15 
 
 		 473 aa  54.7  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0253  putative transport transmembrane protein  25.86 
 
 		 462 aa  54.3  0.000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0783  major facilitator transporter  22.28 
 
 		 463 aa  54.3  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.191663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6531  major facilitator transporter  27.09 
 
 		 443 aa  53.5  0.000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.118713  normal  0.219837 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0059  major facilitator transporter  23.37 
 
 		 464 aa  53.5  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.955073  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3814  ampG protein, putative  22.31 
 
 		 461 aa  53.1  0.000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3155  major facilitator transporter  22.96 
 
 		 465 aa  53.1  0.000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>