207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0848 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0848  major facilitator transporter  100 
 
 		 413 aa  791    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09380  putative transporter  75.26 
 
 		 414 aa  507  9.999999999999999e-143  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000449575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0880  putative transporter  73.37 
 
 		 414 aa  495  1e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.179079  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5297  RhtX/FptX family siderophore transporter  66.75 
 
 		 415 aa  487  1e-136  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0680678 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0680  major facilitator transporter  67.49 
 
 		 414 aa  485  1e-136  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.440664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3377  major facilitator transporter  67 
 
 		 415 aa  488  1e-136  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4990  major facilitator transporter  67 
 
 		 415 aa  488  1e-136  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2158  hypothetical protein  68.59 
 
 		 423 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1821  transporter  68.59 
 
 		 457 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0796  RhtX/FptX family siderophore transporter  68.59 
 
 		 423 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.314363  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0886  RhtX/FptX family siderophore transporter  68.32 
 
 		 423 aa  455  1e-127  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.47536  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0866  major facilitator transporter  42.74 
 
 		 413 aa  250  4e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00348625  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3259  RhtX/FptX family siderophore transporter  31.77 
 
 		 420 aa  103  4e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.569308  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1571  major facilitator superfamily MFS_1  30.53 
 
 		 412 aa  98.6  2e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.823301  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3380  RhtX/FptX family siderophore transporter  33.81 
 
 		 271 aa  98.6  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0184  major facilitator transporter  27.3 
 
 		 396 aa  97.8  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1673  major facilitator transporter  27.81 
 
 		 396 aa  97.8  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00717957  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0756  major facilitator transporter  27.51 
 
 		 428 aa  97.4  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3088  major facilitator superfamily MFS_1  30.29 
 
 		 408 aa  97.1  5e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.120291  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3032  major facilitator superfamily MFS_1  34.17 
 
 		 411 aa  96.3  1e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.998579  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4494  major facilitator transporter  31.54 
 
 		 416 aa  96.3  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0624  major facilitator transporter  28.77 
 
 		 461 aa  95.1  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.471905  normal  0.556428 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0688  major facilitator transporter  27.79 
 
 		 434 aa  94.4  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1339  major facilitator superfamily MFS_1  28.82 
 
 		 406 aa  93.6  6e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4017  major facilitator transporter  26.38 
 
 		 412 aa  92.4  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.165032 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4990  major facilitator superfamily MFS_1  41.61 
 
 		 424 aa  90.5  5e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0074  major facilitator superfamily MFS_1  34.33 
 
 		 406 aa  89  1e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.220484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5064  RhtX/FptX family siderophore transporter  36.47 
 
 		 418 aa  88.6  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.646034  hitchhiker  0.00624927 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2999  major facilitator transporter  30.11 
 
 		 388 aa  87.4  4e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0094  hypothetical protein  36.54 
 
 		 511 aa  85.1  0.000000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.4429  normal  0.916942 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0337  major facilitator transporter  32.94 
 
 		 418 aa  81.6  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.957507  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1496  major facilitator transporter  30.15 
 
 		 395 aa  80.9  0.00000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.372528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1299  major facilitator transporter  26.68 
 
 		 447 aa  80.5  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.333624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0590  major facilitator transporter  30.65 
 
 		 465 aa  79.3  0.0000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.97195 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2336  major facilitator transporter  29.35 
 
 		 424 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0840  major facilitator transporter  37.36 
 
 		 439 aa  77.8  0.0000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4408  major facilitator superfamily MFS_1  26.56 
 
 		 482 aa  76.3  0.0000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0623  major facilitator superfamily MFS_1  29.25 
 
 		 459 aa  76.3  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.89214  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4038  major facilitator transporter  26.56 
 
 		 482 aa  75.9  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.549121  normal  0.182505 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2556  AmpG protein, putative  24.43 
 
 		 466 aa  74.7  0.000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.368438 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1235  muropeptide MFS uptake transporter AmpG  34.43 
 
 		 550 aa  74.3  0.000000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.988982 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0025  major facilitator superfamily MFS_1  33.54 
 
 		 445 aa  74.3  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00511907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4520  major facilitator superfamily MFS_1  25.47 
 
 		 504 aa  73.9  0.000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.623775  normal  0.239632 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0152  major facilitator superfamily transporter  27.85 
 
 		 466 aa  73.2  0.000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.421087  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3814  ampG protein, putative  26.22 
 
 		 461 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2276  major facilitator superfamily MFS_1  29.84 
 
 		 416 aa  72.8  0.00000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0819  major facilitator transporter  26.22 
 
 		 471 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1901  AmpG  27.86 
 
 		 433 aa  70.9  0.00000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.165833  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0856  hypothetical protein  23.02 
 
 		 419 aa  70.5  0.00000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02935  signal transducer  35.75 
 
 		 431 aa  70.5  0.00000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.726126  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0600  AmpG protein  32.74 
 
 		 428 aa  70.5  0.00000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.674312  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1044  muropeptide transporter  25.43 
 
 		 495 aa  70.5  0.00000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0385615  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0289  AmpG protein  27.57 
 
 		 433 aa  70.1  0.00000000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3442  major facilitator transporter  24.45 
 
 		 478 aa  70.1  0.00000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.141995  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13420  AmpG-related permease  35.15 
 
 		 515 aa  70.1  0.00000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0900  muropeptide transporter  25.81 
 
 		 491 aa  70.1  0.00000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00841123  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3155  major facilitator transporter  26.33 
 
 		 465 aa  69.7  0.00000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1091  muropeptide transporter  27.3 
 
 		 492 aa  69.7  0.00000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000207294  hitchhiker  0.00000512549 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0812  major facilitator transporter  26.08 
 
 		 463 aa  69.7  0.00000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04836  SD08430p (AFU_orthologue; AFUA_3G07290)  30.72 
 
 		 576 aa  68.9  0.0000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0706  putative ampG protein  26.48 
 
 		 426 aa  69.3  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3268  muropeptide transporter  25.26 
 
 		 495 aa  69.3  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.482744  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0830  hypothetical protein  23.23 
 
 		 415 aa  68.9  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0083  major facilitator transporter  25.69 
 
 		 457 aa  69.3  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0365182 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_33225  Acetyl-CoA transporter  29.14 
 
 		 560 aa  68.9  0.0000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.568918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2892  major facilitator transporter  24.16 
 
 		 472 aa  69.7  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0730175  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3176  AmpG-related permease  25.44 
 
 		 491 aa  68.9  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000022392  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0355  muropeptide transporter  25.44 
 
 		 491 aa  68.9  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000149162  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0468  muropeptide transporter  25.44 
 
 		 491 aa  68.9  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000134905  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH00180  SD08430p, putative  26.87 
 
 		 587 aa  68.9  0.0000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.026528  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0508  muropeptide transporter  25.44 
 
 		 491 aa  68.9  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000051766  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0771  major facilitator transporter  25.19 
 
 		 465 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00332718  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0517  muropeptide transporter  25.44 
 
 		 491 aa  68.9  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000689062  normal  0.616646 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3267  major facilitator superfamily MFS_1  31.74 
 
 		 641 aa  68.9  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0360641 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3113  major facilitator transporter  24.02 
 
 		 476 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3200  muropeptide transporter  25.44 
 
 		 491 aa  68.9  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00206592  hitchhiker  0.000120766 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0474  muropeptide transporter  25.44 
 
 		 491 aa  68.9  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000168996  normal  0.779827 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0664  major facilitator transporter  25.17 
 
 		 456 aa  67.8  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.757276  normal  0.314251 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2679  major facilitator transporter  38.41 
 
 		 465 aa  67.8  0.0000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000459278 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0470  major facilitator superfamily protein  27.91 
 
 		 428 aa  67.4  0.0000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.807635  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6531  major facilitator transporter  29.91 
 
 		 443 aa  67  0.0000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.118713  normal  0.219837 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3644  major facilitator transporter  24.48 
 
 		 472 aa  67.4  0.0000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0893526 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2483  major facilitator transporter  27.43 
 
 		 411 aa  67  0.0000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1156  major facilitator transporter  33.88 
 
 		 553 aa  66.6  0.0000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0968602  normal  0.231698 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3239  muropeptide transporter  27.48 
 
 		 492 aa  66.6  0.0000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.83474  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3096  muropeptide transporter  27.48 
 
 		 492 aa  66.6  0.0000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0966625  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3058  muropeptide transporter  27.48 
 
 		 492 aa  66.6  0.0000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000335083  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7099  major facilitator superfamily MFS_1  32.21 
 
 		 447 aa  65.9  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.835982  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3691  major facilitator transporter  26.27 
 
 		 454 aa  66.2  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.639879  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0069  major facilitator superfamily MFS_1  25.7 
 
 		 475 aa  65.9  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.805125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0783  major facilitator transporter  25.57 
 
 		 463 aa  65.9  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.191663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1726  major facilitator superfamily MFS_1  28.09 
 
 		 417 aa  65.1  0.000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.299438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3531  major facilitator superfamily MFS_1  25.19 
 
 		 471 aa  65.5  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000125194 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3834  major facilitator transporter  24.67 
 
 		 417 aa  65.5  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3098  major facilitator transporter  27.1 
 
 		 473 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0711  major facilitator transporter  25.19 
 
 		 471 aa  65.5  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2009  major facilitator transporter  26.25 
 
 		 415 aa  65.5  0.000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.872827  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1773  major facilitator transporter  31.68 
 
 		 630 aa  64.3  0.000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3723  major facilitator transporter  25.45 
 
 		 471 aa  64.7  0.000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57100  putative permease  31.79 
 
 		 594 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>