217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_09380 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_0880  putative transporter  97.34 
 
 		 414 aa  662    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.179079  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09380  putative transporter  100 
 
 		 414 aa  791    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000449575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0848  major facilitator transporter  74.68 
 
 		 413 aa  557  1e-157  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5297  RhtX/FptX family siderophore transporter  70.42 
 
 		 415 aa  518  1e-146  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0680678 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3377  major facilitator transporter  70.42 
 
 		 415 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4990  major facilitator transporter  70.42 
 
 		 415 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0680  major facilitator transporter  70.9 
 
 		 414 aa  508  1e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.440664  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2158  hypothetical protein  72.92 
 
 		 423 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1821  transporter  72.44 
 
 		 457 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0886  RhtX/FptX family siderophore transporter  72.92 
 
 		 423 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.47536  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0796  RhtX/FptX family siderophore transporter  72.92 
 
 		 423 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.314363  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0866  major facilitator transporter  43.06 
 
 		 413 aa  241  2e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00348625  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1673  major facilitator transporter  29.31 
 
 		 396 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00717957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0184  major facilitator transporter  29.34 
 
 		 396 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1571  major facilitator superfamily MFS_1  32.62 
 
 		 412 aa  111  3e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.823301  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3259  RhtX/FptX family siderophore transporter  36.25 
 
 		 420 aa  107  6e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.569308  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3380  RhtX/FptX family siderophore transporter  35.55 
 
 		 271 aa  105  2e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5064  RhtX/FptX family siderophore transporter  37.41 
 
 		 418 aa  105  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.646034  hitchhiker  0.00624927 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4017  major facilitator transporter  29.41 
 
 		 412 aa  102  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.165032 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3032  major facilitator superfamily MFS_1  34.94 
 
 		 411 aa  101  2e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.998579  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4990  major facilitator superfamily MFS_1  34.64 
 
 		 424 aa  100  7e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3088  major facilitator superfamily MFS_1  31.68 
 
 		 408 aa  93.6  5e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.120291  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2556  AmpG protein, putative  25.93 
 
 		 466 aa  93.2  7e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.368438 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4494  major facilitator transporter  32.73 
 
 		 416 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0094  hypothetical protein  37.99 
 
 		 511 aa  92.8  1e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.4429  normal  0.916942 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2999  major facilitator transporter  30.22 
 
 		 388 aa  90.9  4e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0590  major facilitator transporter  33.69 
 
 		 465 aa  90.9  4e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.97195 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1091  muropeptide transporter  27.83 
 
 		 492 aa  88.2  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000207294  hitchhiker  0.00000512549 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0623  major facilitator superfamily MFS_1  28.97 
 
 		 459 aa  88.2  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.89214  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0600  AmpG protein  28.17 
 
 		 428 aa  88.2  2e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.674312  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6531  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 443 aa  89  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.118713  normal  0.219837 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0152  major facilitator superfamily transporter  31.08 
 
 		 466 aa  88.2  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.421087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1299  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 447 aa  87.8  3e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.333624  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4390  major facilitator superfamily (MFS)muropeptide transporter  26.59 
 
 		 464 aa  87.8  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2276  major facilitator superfamily MFS_1  31.19 
 
 		 416 aa  87  6e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0756  major facilitator transporter  30.2 
 
 		 428 aa  85.5  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0771  major facilitator transporter  26 
 
 		 465 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00332718  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0333  major facilitator superfamily MFS_1  28.43 
 
 		 464 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0074  major facilitator superfamily MFS_1  31.97 
 
 		 406 aa  85.1  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.220484  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3268  muropeptide transporter  26.43 
 
 		 495 aa  84.7  0.000000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.482744  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0470  major facilitator superfamily protein  27.95 
 
 		 428 aa  84.7  0.000000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.807635  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3176  AmpG-related permease  26.52 
 
 		 491 aa  84.3  0.000000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000022392  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0474  muropeptide transporter  26.84 
 
 		 491 aa  84.3  0.000000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000168996  normal  0.779827 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0069  major facilitator superfamily MFS_1  24.18 
 
 		 475 aa  84  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.805125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0468  muropeptide transporter  26.84 
 
 		 491 aa  84.3  0.000000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000134905  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3200  muropeptide transporter  26.84 
 
 		 491 aa  84.3  0.000000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00206592  hitchhiker  0.000120766 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0355  muropeptide transporter  26.84 
 
 		 491 aa  84.3  0.000000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000149162  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0508  muropeptide transporter  26.84 
 
 		 491 aa  84.3  0.000000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000051766  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0517  muropeptide transporter  26.52 
 
 		 491 aa  84.3  0.000000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000689062  normal  0.616646 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1339  major facilitator superfamily MFS_1  26.84 
 
 		 406 aa  83.6  0.000000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0900  muropeptide transporter  26.67 
 
 		 491 aa  83.6  0.000000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00841123  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1044  muropeptide transporter  26.11 
 
 		 495 aa  83.2  0.000000000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0385615  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1235  muropeptide MFS uptake transporter AmpG  35.36 
 
 		 550 aa  81.6  0.00000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.988982 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2636  major facilitator transporter  31.61 
 
 		 429 aa  82  0.00000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.103448  normal  0.465614 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0083  major facilitator transporter  29.41 
 
 		 457 aa  81.3  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0365182 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0276  major facilitator superfamily transporter  31.71 
 
 		 449 aa  81.3  0.00000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.800927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2892  major facilitator transporter  24.57 
 
 		 472 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0730175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2009  major facilitator transporter  29 
 
 		 415 aa  81.6  0.00000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.872827  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0375  major facilitator superfamily muropeptide transporter  25.94 
 
 		 437 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0840  major facilitator transporter  31.12 
 
 		 439 aa  80.9  0.00000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3239  muropeptide transporter  25.49 
 
 		 492 aa  80.5  0.00000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.83474  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0180  major facilitator transporter  25.94 
 
 		 437 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.277448  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0190  major facilitator transporter  25.94 
 
 		 437 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3244  AmpG-related permease  25.94 
 
 		 437 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3096  muropeptide transporter  25.49 
 
 		 492 aa  80.5  0.00000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0966625  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2905  AmpG-related permease  25.94 
 
 		 437 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3058  muropeptide transporter  25.49 
 
 		 492 aa  80.5  0.00000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000335083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2184  AmpG-related permease  25.94 
 
 		 437 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.452697  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3443  AmpG-related permease  25.94 
 
 		 437 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00384  muropeptide transporter  26.84 
 
 		 491 aa  80.1  0.00000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000202049  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0706  putative ampG protein  23.51 
 
 		 426 aa  80.1  0.00000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3814  ampG protein, putative  24.31 
 
 		 461 aa  80.5  0.00000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00388  hypothetical protein  26.84 
 
 		 491 aa  80.1  0.00000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000464324  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04836  SD08430p (AFU_orthologue; AFUA_3G07290)  33.33 
 
 		 576 aa  80.1  0.00000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0688  major facilitator transporter  29.53 
 
 		 434 aa  80.1  0.00000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0664  major facilitator transporter  29.1 
 
 		 456 aa  80.1  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.757276  normal  0.314251 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0059  major facilitator transporter  27.4 
 
 		 464 aa  80.1  0.00000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.955073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1901  AmpG  28.37 
 
 		 433 aa  79.7  0.00000000000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.165833  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3113  major facilitator transporter  26.74 
 
 		 476 aa  79  0.0000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7099  major facilitator superfamily MFS_1  27.61 
 
 		 447 aa  79.3  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.835982  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3644  major facilitator transporter  26.67 
 
 		 472 aa  79  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0893526 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0819  major facilitator transporter  24.66 
 
 		 471 aa  79  0.0000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0624  major facilitator transporter  29.53 
 
 		 461 aa  79  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.471905  normal  0.556428 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1726  major facilitator superfamily MFS_1  28.66 
 
 		 417 aa  78.2  0.0000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.299438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1648  major facilitator transporter  28.41 
 
 		 450 aa  79  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.236568 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0155  AmpG-related permease  26.33 
 
 		 437 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0289  AmpG protein  27.66 
 
 		 433 aa  78.6  0.0000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2483  major facilitator transporter  30.14 
 
 		 411 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3155  major facilitator transporter  25.34 
 
 		 465 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_33225  Acetyl-CoA transporter  33.76 
 
 		 560 aa  78.2  0.0000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.568918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0337  major facilitator transporter  36.25 
 
 		 418 aa  77.8  0.0000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.957507  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0812  major facilitator transporter  25.11 
 
 		 463 aa  78.2  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4520  major facilitator superfamily MFS_1  27.97 
 
 		 504 aa  78.2  0.0000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.623775  normal  0.239632 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2881  muropeptide transporter  27.81 
 
 		 489 aa  77.8  0.0000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.457618  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0783  major facilitator transporter  24.95 
 
 		 463 aa  77.4  0.0000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.191663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3691  major facilitator transporter  28.78 
 
 		 454 aa  77  0.0000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.639879  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13420  AmpG-related permease  32.58 
 
 		 515 aa  77  0.0000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3098  major facilitator transporter  29.41 
 
 		 473 aa  76.6  0.0000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0484  muropeptide transporter  27.48 
 
 		 493 aa  75.9  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000603755  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0486  muropeptide transporter  27.48 
 
 		 491 aa  75.9  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00924697  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>