135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A2102 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A2102  yersinabactin region putative transporter YbtX  100 
 
 		 426 aa  833    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0840  major facilitator transporter  40.43 
 
 		 439 aa  258  2e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0337  major facilitator transporter  34.46 
 
 		 418 aa  194  3e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.957507  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1496  major facilitator transporter  32.82 
 
 		 395 aa  163  6e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.372528  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0074  major facilitator superfamily MFS_1  29.89 
 
 		 406 aa  120  3.9999999999999996e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.220484  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3088  major facilitator superfamily MFS_1  30.97 
 
 		 408 aa  119  9.999999999999999e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.120291  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1437  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 		 415 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3259  RhtX/FptX family siderophore transporter  27.34 
 
 		 420 aa  110  5e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.569308  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4494  major facilitator transporter  31.31 
 
 		 416 aa  108  2e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2436  major facilitator transporter  29.8 
 
 		 408 aa  107  4e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.649035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1673  major facilitator transporter  26.77 
 
 		 396 aa  106  7e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00717957  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5064  RhtX/FptX family siderophore transporter  29.15 
 
 		 418 aa  105  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.646034  hitchhiker  0.00624927 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0184  major facilitator transporter  26.52 
 
 		 396 aa  105  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3380  RhtX/FptX family siderophore transporter  30.17 
 
 		 271 aa  105  2e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4990  major facilitator superfamily MFS_1  29.85 
 
 		 424 aa  103  7e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0756  major facilitator transporter  27.34 
 
 		 428 aa  102  9e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0688  major facilitator transporter  27.88 
 
 		 434 aa  102  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0590  major facilitator transporter  34.88 
 
 		 465 aa  100  6e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.97195 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0866  major facilitator transporter  29.92 
 
 		 413 aa  96.7  8e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00348625  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1901  AmpG  26.34 
 
 		 433 aa  95.5  1e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.165833  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0289  AmpG protein  26.34 
 
 		 433 aa  94  4e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3032  major facilitator superfamily MFS_1  27.76 
 
 		 411 aa  93.2  8e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.998579  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2601  hypothetical protein  27.72 
 
 		 408 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0722822  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3834  major facilitator transporter  24.46 
 
 		 417 aa  84.7  0.000000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1339  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 406 aa  82.8  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1498  major facilitator transporter  28.27 
 
 		 408 aa  79.3  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.85322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3983  major facilitator superfamily MFS_1  25.99 
 
 		 416 aa  77  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.819094 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1218  major facilitator superfamily MFS_1  28.72 
 
 		 425 aa  76.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.8639  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00384  muropeptide transporter  26.67 
 
 		 491 aa  72  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000202049  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3176  AmpG-related permease  26.67 
 
 		 491 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000022392  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2336  major facilitator transporter  26.86 
 
 		 424 aa  71.6  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4017  major facilitator transporter  23.79 
 
 		 412 aa  72  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.165032 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0517  muropeptide transporter  26.67 
 
 		 491 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000689062  normal  0.616646 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0900  muropeptide transporter  26.12 
 
 		 491 aa  72  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00841123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0508  muropeptide transporter  26.67 
 
 		 491 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000051766  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0468  muropeptide transporter  26.67 
 
 		 491 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000134905  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3200  muropeptide transporter  26.67 
 
 		 491 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00206592  hitchhiker  0.000120766 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0474  muropeptide transporter  26.67 
 
 		 491 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000168996  normal  0.779827 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5297  RhtX/FptX family siderophore transporter  27.46 
 
 		 415 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0680678 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0355  muropeptide transporter  26.67 
 
 		 491 aa  71.6  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000149162  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00388  hypothetical protein  26.67 
 
 		 491 aa  72  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000464324  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2881  muropeptide transporter  26.55 
 
 		 489 aa  70.5  0.00000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.457618  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7099  major facilitator superfamily MFS_1  28.17 
 
 		 447 aa  69.7  0.00000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.835982  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3377  major facilitator transporter  28.21 
 
 		 415 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0600  AmpG protein  23.06 
 
 		 428 aa  69.7  0.0000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.674312  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4990  major facilitator transporter  28.21 
 
 		 415 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0848  major facilitator transporter  32.98 
 
 		 413 aa  68.6  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0155  major facilitator transporter  32.84 
 
 		 247 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.238338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6452  major facilitator transporter  24.32 
 
 		 473 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.554159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3156  major facilitator transporter  23.87 
 
 		 473 aa  67  0.0000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3268  muropeptide transporter  25.98 
 
 		 495 aa  66.2  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.482744  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3039  major facilitator transporter  23.87 
 
 		 473 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3117  major facilitator transporter  24.01 
 
 		 473 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1044  muropeptide transporter  25.98 
 
 		 495 aa  65.5  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0385615  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2487  major facilitator transporter  24.01 
 
 		 473 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.60868  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3101  major facilitator transporter  24.01 
 
 		 473 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1299  major facilitator transporter  29.14 
 
 		 447 aa  64.7  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.333624  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0470  major facilitator superfamily protein  23.9 
 
 		 428 aa  63.9  0.000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.807635  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3098  major facilitator transporter  23.71 
 
 		 473 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6531  major facilitator transporter  27.72 
 
 		 443 aa  63.9  0.000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.118713  normal  0.219837 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0680  major facilitator transporter  27.11 
 
 		 414 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.440664  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0492  muropeptide transporter  25.59 
 
 		 493 aa  62  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00144184  decreased coverage  0.00023941 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0486  muropeptide transporter  25.59 
 
 		 491 aa  62  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00924697  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0503  muropeptide transporter  25.59 
 
 		 491 aa  62  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000985164  normal  0.643991 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1091  muropeptide transporter  26.51 
 
 		 492 aa  62  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000207294  hitchhiker  0.00000512549 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0377  major facilitator transporter  29.05 
 
 		 506 aa  61.6  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0179804  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0547  muropeptide transporter  25.59 
 
 		 491 aa  62  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.283527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0484  muropeptide transporter  25.59 
 
 		 493 aa  62  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000603755  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0094  hypothetical protein  28.96 
 
 		 511 aa  61.6  0.00000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.4429  normal  0.916942 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1571  major facilitator superfamily MFS_1  25.53 
 
 		 412 aa  60.5  0.00000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.823301  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2276  major facilitator superfamily MFS_1  28.7 
 
 		 416 aa  60.1  0.00000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0706  putative ampG protein  25.37 
 
 		 426 aa  60.1  0.00000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4390  major facilitator superfamily (MFS)muropeptide transporter  25.74 
 
 		 464 aa  59.7  0.00000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0375  major facilitator superfamily muropeptide transporter  22.64 
 
 		 437 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0180  major facilitator transporter  22.64 
 
 		 437 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.277448  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0190  major facilitator transporter  22.64 
 
 		 437 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0344  major facilitator transporter  24.55 
 
 		 415 aa  59.7  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0333  major facilitator superfamily MFS_1  25.74 
 
 		 464 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3244  AmpG-related permease  22.64 
 
 		 437 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0128  major facilitator transporter  26.67 
 
 		 422 aa  58.5  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09380  putative transporter  29.84 
 
 		 414 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000449575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2905  AmpG-related permease  22.64 
 
 		 437 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2184  AmpG-related permease  22.64 
 
 		 437 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.452697  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3443  AmpG-related permease  22.64 
 
 		 437 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2999  major facilitator transporter  27.99 
 
 		 388 aa  58.2  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3239  muropeptide transporter  25.53 
 
 		 492 aa  57.8  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.83474  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0623  major facilitator superfamily MFS_1  23.66 
 
 		 459 aa  57.4  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.89214  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3096  muropeptide transporter  25.53 
 
 		 492 aa  56.6  0.0000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0966625  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3058  muropeptide transporter  25.53 
 
 		 492 aa  56.6  0.0000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000335083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0155  AmpG-related permease  22.1 
 
 		 437 aa  56.2  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3267  major facilitator superfamily MFS_1  31.36 
 
 		 641 aa  55.8  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0360641 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0880  putative transporter  30.11 
 
 		 414 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.179079  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0664  major facilitator transporter  23.28 
 
 		 456 aa  54.7  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.757276  normal  0.314251 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0624  major facilitator transporter  26.5 
 
 		 461 aa  54.7  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.471905  normal  0.556428 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1645  AmpG protein  21.27 
 
 		 433 aa  54.3  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0083  major facilitator transporter  23.86 
 
 		 457 aa  54.3  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0365182 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0044  muropeptide transporter  26.25 
 
 		 429 aa  54.3  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2158  hypothetical protein  29.19 
 
 		 423 aa  53.9  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3072  muropeptide transporter  24.27 
 
 		 489 aa  53.9  0.000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000553099  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0796  RhtX/FptX family siderophore transporter  29.19 
 
 		 423 aa  53.9  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.314363  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>