206 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0377 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_0377  major facilitator transporter  100 
 
 		 506 aa  1012    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0179804  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0094  hypothetical protein  30.4 
 
 		 511 aa  154  5e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.4429  normal  0.916942 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1629  major facilitator superfamily MFS_1  37.21 
 
 		 412 aa  124  5e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00218526  hitchhiker  0.00000020409 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1961  AmpG permease protein, putative  37.21 
 
 		 412 aa  124  5e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2008  putative transmembrane permease  32.99 
 
 		 423 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0141901  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0963  major facilitator transporter  36.15 
 
 		 428 aa  109  1e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.565393 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1645  AmpG protein  34.03 
 
 		 433 aa  107  5e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2584  major facilitator superfamily transporter  23.86 
 
 		 439 aa  107  5e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.11871  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0071  major facilitator transporter  32.26 
 
 		 421 aa  106  8e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.155501  hitchhiker  0.000000000000465333 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1618  major facilitator transporter  33.51 
 
 		 433 aa  106  9e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4070  HNH endonuclease  26.37 
 
 		 509 aa  106  1e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3983  major facilitator superfamily MFS_1  27 
 
 		 416 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.819094 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2121  major facilitator transporter  29.7 
 
 		 423 aa  103  9e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0664  major facilitator transporter  25.93 
 
 		 456 aa  102  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.757276  normal  0.314251 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0139  beta-lactamase induction signal transducer protein  23.98 
 
 		 509 aa  101  4e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.143308  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4494  AmpG-related permease  25.1 
 
 		 515 aa  100  5e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.769685  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0122  major facilitator transporter  23.64 
 
 		 509 aa  100  5e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.00126713  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1355  AmpG-related permease  25.1 
 
 		 515 aa  100  6e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.010612  normal  0.140605 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0190  major facilitator transporter  26.33 
 
 		 576 aa  99.8  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.397868 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4369  AmpG-related permease  24.9 
 
 		 515 aa  99  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0389334 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0962  AmpG-related permease  24.95 
 
 		 515 aa  97.4  5e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3691  major facilitator transporter  25.62 
 
 		 454 aa  97.4  6e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.639879  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0783  major facilitator transporter  25.69 
 
 		 463 aa  97.1  7e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.191663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0812  major facilitator transporter  25.69 
 
 		 463 aa  95.9  1e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3814  ampG protein, putative  25.16 
 
 		 461 aa  95.5  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3600  major facilitator transporter  25.4 
 
 		 471 aa  95.1  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3723  major facilitator transporter  25.4 
 
 		 471 aa  95.1  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3155  major facilitator transporter  25.48 
 
 		 465 aa  94.7  3e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4017  major facilitator transporter  30.58 
 
 		 412 aa  94.4  4e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.165032 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1496  major facilitator transporter  32.52 
 
 		 395 aa  93.6  7e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.372528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2556  AmpG protein, putative  25.21 
 
 		 466 aa  93.6  8e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.368438 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3039  major facilitator transporter  23.25 
 
 		 473 aa  92.8  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3063  major facilitator transporter  25.89 
 
 		 452 aa  92.8  1e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.797307  normal  0.542737 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3156  major facilitator transporter  23.25 
 
 		 473 aa  92.8  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0711  major facilitator transporter  25.2 
 
 		 471 aa  93.2  1e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0819  major facilitator transporter  25.35 
 
 		 471 aa  92.4  1e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0154  muropeptide transporter  25.11 
 
 		 426 aa  92  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.679367  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3531  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 471 aa  92  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000125194 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6452  major facilitator transporter  23.25 
 
 		 473 aa  92  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.554159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2487  major facilitator transporter  23.14 
 
 		 473 aa  92  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.60868  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3101  major facilitator transporter  23.14 
 
 		 473 aa  92  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2570  YD repeat-containing protein  27.59 
 
 		 1565 aa  92.4  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.332337  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2577  YD repeat-containing protein  27.59 
 
 		 1565 aa  92.4  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.328115  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3117  major facilitator transporter  22.94 
 
 		 473 aa  91.3  4e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4038  major facilitator transporter  23.4 
 
 		 482 aa  90.9  4e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.549121  normal  0.182505 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2892  major facilitator transporter  23.53 
 
 		 472 aa  88.6  2e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0730175  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13420  AmpG-related permease  24.66 
 
 		 515 aa  88.2  3e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0770  major facilitator transporter  24.49 
 
 		 455 aa  88.2  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.742854 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4408  major facilitator superfamily MFS_1  24.06 
 
 		 482 aa  88.2  3e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3032  major facilitator superfamily MFS_1  35.76 
 
 		 411 aa  88.2  3e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.998579  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1299  major facilitator transporter  30.17 
 
 		 447 aa  88.2  3e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.333624  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1400  signal transducer ampG1  25.37 
 
 		 502 aa  88.2  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00988952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3442  major facilitator transporter  24.48 
 
 		 478 aa  87.8  4e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.141995  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4520  major facilitator superfamily MFS_1  23.2 
 
 		 504 aa  87.8  4e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.623775  normal  0.239632 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3644  major facilitator transporter  23.72 
 
 		 472 aa  87  7e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0893526 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4990  major facilitator superfamily MFS_1  31.16 
 
 		 424 aa  84.7  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3114  major facilitator transporter  23.41 
 
 		 475 aa  84  0.000000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3596  major facilitator transporter  22.84 
 
 		 478 aa  84  0.000000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.597959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3113  major facilitator transporter  23.09 
 
 		 476 aa  82.4  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0856  hypothetical protein  22.71 
 
 		 419 aa  79.7  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3834  major facilitator transporter  25.31 
 
 		 417 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0470  major facilitator superfamily protein  27.36 
 
 		 428 aa  79.3  0.0000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.807635  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2483  major facilitator transporter  28.7 
 
 		 411 aa  78.2  0.0000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0830  hypothetical protein  22.27 
 
 		 415 aa  77.8  0.0000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0590  major facilitator transporter  35.57 
 
 		 465 aa  77.8  0.0000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.97195 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1449  major facilitator transporter  35.95 
 
 		 453 aa  77.8  0.0000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7099  major facilitator superfamily MFS_1  27.41 
 
 		 447 aa  77.8  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.835982  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2999  major facilitator transporter  27.18 
 
 		 388 aa  77.4  0.0000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3380  RhtX/FptX family siderophore transporter  32.53 
 
 		 271 aa  77.4  0.0000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6531  major facilitator transporter  28.28 
 
 		 443 aa  76.6  0.0000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.118713  normal  0.219837 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0069  major facilitator superfamily MFS_1  32.74 
 
 		 475 aa  76.3  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.805125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02935  signal transducer  31.55 
 
 		 431 aa  76.3  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.726126  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0320  ampG protein, putative  28 
 
 		 409 aa  75.9  0.000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0110  major facilitator superfamily MFS_1  23.41 
 
 		 452 aa  74.7  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0140571  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0044  muropeptide transporter  26.26 
 
 		 429 aa  74.3  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2561  major facilitator transporter  26.82 
 
 		 517 aa  73.9  0.000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.249955  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2679  major facilitator transporter  29.07 
 
 		 465 aa  73.9  0.000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000459278 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2276  major facilitator superfamily MFS_1  31.52 
 
 		 416 aa  73.9  0.000000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1218  major facilitator superfamily MFS_1  31.75 
 
 		 425 aa  73.6  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.8639  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1388  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 517 aa  73.6  0.000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.344668  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1287  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 517 aa  73.6  0.000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3058  muropeptide transporter  28.88 
 
 		 492 aa  72.8  0.00000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000335083  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3239  muropeptide transporter  28.88 
 
 		 492 aa  72.8  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.83474  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3096  muropeptide transporter  28.88 
 
 		 492 aa  72.8  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0966625  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1673  major facilitator transporter  25.75 
 
 		 396 aa  72.4  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00717957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1901  AmpG  27.9 
 
 		 433 aa  72.8  0.00000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.165833  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0289  AmpG protein  27.9 
 
 		 433 aa  72.4  0.00000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0047  muropeptide transporter  25.9 
 
 		 429 aa  72.4  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.252605 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0706  putative ampG protein  28.96 
 
 		 426 aa  71.6  0.00000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0253  putative transport transmembrane protein  22.97 
 
 		 462 aa  70.9  0.00000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0624  major facilitator transporter  29.51 
 
 		 461 aa  70.9  0.00000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.471905  normal  0.556428 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2143  major facilitator transporter  26.03 
 
 		 450 aa  70.9  0.00000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0296  AmpG protein  22.09 
 
 		 457 aa  70.9  0.00000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0367426 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2937  major facilitator transporter  21 
 
 		 443 aa  71.2  0.00000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0600  AmpG protein  31.33 
 
 		 428 aa  70.5  0.00000000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.674312  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0059  major facilitator transporter  26.37 
 
 		 464 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.955073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0333  major facilitator superfamily MFS_1  28.18 
 
 		 464 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0866  major facilitator transporter  32.89 
 
 		 413 aa  68.9  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00348625  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1648  major facilitator transporter  29.82 
 
 		 450 aa  68.9  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.236568 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0941  hypothetical protein  31.11 
 
 		 598 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.274634 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>