213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_1629 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_1961  AmpG permease protein, putative  100 
 
 		 412 aa  820    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1629  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 412 aa  820    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00218526  hitchhiker  0.00000020409 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2008  putative transmembrane permease  32.37 
 
 		 423 aa  208  1e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0141901  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1618  major facilitator transporter  30.66 
 
 		 433 aa  207  3e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1645  AmpG protein  30.5 
 
 		 433 aa  203  4e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0071  major facilitator transporter  31.86 
 
 		 421 aa  192  1e-47  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.155501  hitchhiker  0.000000000000465333 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1299  major facilitator transporter  31.12 
 
 		 447 aa  176  7e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.333624  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0963  major facilitator transporter  32.59 
 
 		 428 aa  174  1.9999999999999998e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.565393 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3983  major facilitator superfamily MFS_1  32.98 
 
 		 416 aa  171  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.819094 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2121  major facilitator transporter  29.9 
 
 		 423 aa  169  1e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0470  major facilitator superfamily protein  32.63 
 
 		 428 aa  167  2.9999999999999998e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.807635  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1287  major facilitator superfamily MFS_1  29.79 
 
 		 517 aa  158  1e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1388  major facilitator superfamily MFS_1  29.55 
 
 		 517 aa  157  3e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.344668  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0191  muropeptide transporter  32.11 
 
 		 419 aa  157  4e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10028  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2561  major facilitator transporter  29.76 
 
 		 517 aa  155  1e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.249955  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4017  major facilitator transporter  28.39 
 
 		 412 aa  154  4e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.165032 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1328  putative signal transducer  27.53 
 
 		 427 aa  152  1e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2276  major facilitator superfamily MFS_1  31.14 
 
 		 416 aa  148  1.0000000000000001e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1218  major facilitator superfamily MFS_1  31.69 
 
 		 425 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.8639  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0154  muropeptide transporter  31.68 
 
 		 426 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.679367  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3834  major facilitator transporter  26.05 
 
 		 417 aa  147  3e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0146  muropeptide transporter  32.11 
 
 		 426 aa  145  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.802826 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0044  muropeptide transporter  31.13 
 
 		 429 aa  145  1e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0320  ampG protein, putative  30.11 
 
 		 409 aa  144  2e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3058  muropeptide transporter  29.69 
 
 		 492 aa  144  2e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000335083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3096  muropeptide transporter  29.69 
 
 		 492 aa  144  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0966625  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3239  muropeptide transporter  29.69 
 
 		 492 aa  145  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.83474  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0047  muropeptide transporter  30.55 
 
 		 429 aa  143  5e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.252605 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1901  AmpG  29.37 
 
 		 433 aa  143  6e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.165833  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0623  major facilitator superfamily MFS_1  29.85 
 
 		 459 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.89214  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0289  AmpG protein  29.11 
 
 		 433 aa  141  1.9999999999999998e-32  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4390  major facilitator superfamily (MFS)muropeptide transporter  27.34 
 
 		 464 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2999  major facilitator transporter  31.07 
 
 		 388 aa  140  3e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0600  AmpG protein  27.69 
 
 		 428 aa  140  3e-32  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.674312  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1044  muropeptide transporter  28.64 
 
 		 495 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0385615  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2937  major facilitator transporter  31.16 
 
 		 443 aa  139  7e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00384  muropeptide transporter  29.13 
 
 		 491 aa  139  1e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000202049  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0508  muropeptide transporter  29.13 
 
 		 491 aa  138  1e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000051766  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0355  muropeptide transporter  29.13 
 
 		 491 aa  138  1e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000149162  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0468  muropeptide transporter  29.13 
 
 		 491 aa  138  1e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000134905  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00388  hypothetical protein  29.13 
 
 		 491 aa  139  1e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000464324  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3268  muropeptide transporter  29.21 
 
 		 495 aa  138  1e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.482744  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3200  muropeptide transporter  29.13 
 
 		 491 aa  138  1e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00206592  hitchhiker  0.000120766 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3176  AmpG-related permease  29.13 
 
 		 491 aa  138  2e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000022392  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3244  AmpG-related permease  26.79 
 
 		 437 aa  138  2e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0375  major facilitator superfamily muropeptide transporter  26.79 
 
 		 437 aa  138  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0083  major facilitator transporter  29.98 
 
 		 457 aa  138  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0365182 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0474  muropeptide transporter  29.13 
 
 		 491 aa  138  2e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000168996  normal  0.779827 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0517  muropeptide transporter  29.13 
 
 		 491 aa  138  2e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000689062  normal  0.616646 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2905  AmpG-related permease  26.79 
 
 		 437 aa  138  2e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2184  AmpG-related permease  26.79 
 
 		 437 aa  138  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.452697  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0180  major facilitator transporter  26.79 
 
 		 437 aa  138  2e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.277448  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0190  major facilitator transporter  26.79 
 
 		 437 aa  138  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3443  AmpG-related permease  26.79 
 
 		 437 aa  138  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1091  muropeptide transporter  29.84 
 
 		 492 aa  136  7.000000000000001e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000207294  hitchhiker  0.00000512549 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3072  muropeptide transporter  29.93 
 
 		 489 aa  135  9.999999999999999e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000553099  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0664  major facilitator transporter  29.56 
 
 		 456 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.757276  normal  0.314251 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2881  muropeptide transporter  28.72 
 
 		 489 aa  132  7.999999999999999e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.457618  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0155  AmpG-related permease  26.53 
 
 		 437 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0770  major facilitator transporter  28.61 
 
 		 455 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.742854 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3691  major facilitator transporter  29.38 
 
 		 454 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.639879  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2288  major facilitator transporter  26.28 
 
 		 468 aa  131  2.0000000000000002e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0900  muropeptide transporter  27.41 
 
 		 491 aa  131  2.0000000000000002e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00841123  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0484  muropeptide transporter  29.06 
 
 		 493 aa  131  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000603755  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0547  muropeptide transporter  29.06 
 
 		 491 aa  131  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.283527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0503  muropeptide transporter  29.06 
 
 		 491 aa  130  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000985164  normal  0.643991 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0492  muropeptide transporter  29.06 
 
 		 493 aa  130  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00144184  decreased coverage  0.00023941 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0486  muropeptide transporter  29.06 
 
 		 491 aa  130  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00924697  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0706  putative ampG protein  27.11 
 
 		 426 aa  130  4.0000000000000003e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2487  major facilitator transporter  25.23 
 
 		 473 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.60868  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3101  major facilitator transporter  25.23 
 
 		 473 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3117  major facilitator transporter  25.23 
 
 		 473 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7340  major facilitator superfamily permease  29.06 
 
 		 460 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3098  major facilitator transporter  25.24 
 
 		 473 aa  127  3e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0333  major facilitator superfamily MFS_1  25.96 
 
 		 464 aa  127  3e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2584  major facilitator superfamily transporter  26.49 
 
 		 439 aa  127  5e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.11871  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3156  major facilitator transporter  25.23 
 
 		 473 aa  126  6e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3039  major facilitator transporter  25 
 
 		 473 aa  126  7e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6452  major facilitator transporter  24.77 
 
 		 473 aa  126  8.000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.554159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0069  major facilitator superfamily MFS_1  25.76 
 
 		 475 aa  124  3e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.805125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0377  major facilitator transporter  37.21 
 
 		 506 aa  124  4e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0179804  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0059  major facilitator transporter  24.77 
 
 		 464 aa  123  8e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.955073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3063  major facilitator transporter  28.99 
 
 		 452 aa  120  6e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.797307  normal  0.542737 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2679  major facilitator transporter  25.75 
 
 		 465 aa  120  6e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000459278 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2483  major facilitator transporter  28.5 
 
 		 411 aa  119  7.999999999999999e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0624  major facilitator transporter  27.92 
 
 		 461 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.471905  normal  0.556428 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4990  major facilitator superfamily MFS_1  28.19 
 
 		 424 aa  115  1.0000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0856  hypothetical protein  25.85 
 
 		 419 aa  115  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4038  major facilitator transporter  28 
 
 		 482 aa  114  3e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.549121  normal  0.182505 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2143  major facilitator transporter  26.41 
 
 		 450 aa  114  3e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3596  major facilitator transporter  26.34 
 
 		 478 aa  114  3e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.597959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4408  major facilitator superfamily MFS_1  28 
 
 		 482 aa  113  6e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4520  major facilitator superfamily MFS_1  26.7 
 
 		 504 aa  113  7.000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.623775  normal  0.239632 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1309  major facilitator transporter  27.71 
 
 		 475 aa  113  7.000000000000001e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.327307  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3600  major facilitator transporter  23.86 
 
 		 471 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0830  hypothetical protein  25.72 
 
 		 415 aa  112  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3723  major facilitator transporter  23.86 
 
 		 471 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5113  major facilitator superfamily MFS_1  28.65 
 
 		 463 aa  111  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0128  major facilitator transporter  27.69 
 
 		 422 aa  110  6e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3531  major facilitator superfamily MFS_1  23.86 
 
 		 471 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000125194 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>