196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_2008 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_2008  putative transmembrane permease  100 
 
 		 423 aa  843    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0141901  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1618  major facilitator transporter  56.1 
 
 		 433 aa  470  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1645  AmpG protein  55.94 
 
 		 433 aa  465  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0071  major facilitator transporter  49.37 
 
 		 421 aa  379  1e-104  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.155501  hitchhiker  0.000000000000465333 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0963  major facilitator transporter  48.09 
 
 		 428 aa  366  1e-100  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.565393 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2121  major facilitator transporter  45.32 
 
 		 423 aa  353  4e-96  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1328  putative signal transducer  36.71 
 
 		 427 aa  258  1e-67  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0515  hypothetical protein  32.15 
 
 		 580 aa  201  3e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.10461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1629  major facilitator superfamily MFS_1  32.37 
 
 		 412 aa  186  8e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00218526  hitchhiker  0.00000020409 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1961  AmpG permease protein, putative  32.37 
 
 		 412 aa  186  8e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4017  major facilitator transporter  28.26 
 
 		 412 aa  132  2.0000000000000002e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.165032 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2276  major facilitator superfamily MFS_1  25.94 
 
 		 416 aa  127  3e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0154  muropeptide transporter  25.68 
 
 		 426 aa  127  5e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.679367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2561  major facilitator transporter  27.94 
 
 		 517 aa  126  7e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.249955  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0289  AmpG protein  26.85 
 
 		 433 aa  125  1e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1901  AmpG  26.85 
 
 		 433 aa  125  1e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.165833  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1388  major facilitator superfamily MFS_1  27.82 
 
 		 517 aa  125  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.344668  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1287  major facilitator superfamily MFS_1  27.58 
 
 		 517 aa  124  3e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3983  major facilitator superfamily MFS_1  25.85 
 
 		 416 aa  122  9e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.819094 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0470  major facilitator superfamily protein  26.65 
 
 		 428 aa  122  9.999999999999999e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.807635  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0047  muropeptide transporter  25.25 
 
 		 429 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.252605 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0044  muropeptide transporter  25.43 
 
 		 429 aa  120  3e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0191  muropeptide transporter  25.55 
 
 		 419 aa  120  4.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10028  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0900  muropeptide transporter  23.75 
 
 		 491 aa  117  3.9999999999999997e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00841123  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1044  muropeptide transporter  24.64 
 
 		 495 aa  117  5e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0385615  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3096  muropeptide transporter  24.49 
 
 		 492 aa  115  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0966625  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3058  muropeptide transporter  24.49 
 
 		 492 aa  115  1.0000000000000001e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000335083  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3268  muropeptide transporter  24.64 
 
 		 495 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.482744  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1299  major facilitator transporter  25.75 
 
 		 447 aa  114  3e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.333624  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3239  muropeptide transporter  24.26 
 
 		 492 aa  112  9e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.83474  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1218  major facilitator superfamily MFS_1  27.74 
 
 		 425 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.8639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0377  major facilitator transporter  32.99 
 
 		 506 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0179804  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2483  major facilitator transporter  25.87 
 
 		 411 aa  111  3e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2881  muropeptide transporter  25.56 
 
 		 489 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.457618  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1091  muropeptide transporter  24.31 
 
 		 492 aa  110  4.0000000000000004e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000207294  hitchhiker  0.00000512549 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3244  AmpG-related permease  24.32 
 
 		 437 aa  110  5e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0375  major facilitator superfamily muropeptide transporter  24.32 
 
 		 437 aa  110  5e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3072  muropeptide transporter  25.38 
 
 		 489 aa  110  5e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000553099  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2905  AmpG-related permease  24.32 
 
 		 437 aa  110  5e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2184  AmpG-related permease  24.32 
 
 		 437 aa  110  5e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.452697  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0180  major facilitator transporter  24.32 
 
 		 437 aa  110  5e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.277448  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0190  major facilitator transporter  24.32 
 
 		 437 aa  110  5e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3443  AmpG-related permease  24.32 
 
 		 437 aa  110  5e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0155  AmpG-related permease  24.82 
 
 		 437 aa  107  3e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0199  major facilitator superfamily transporter  27.11 
 
 		 447 aa  107  3e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.723346  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6531  major facilitator transporter  25.89 
 
 		 443 aa  107  5e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.118713  normal  0.219837 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0146  muropeptide transporter  24.82 
 
 		 426 aa  107  5e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.802826 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3063  major facilitator transporter  24.64 
 
 		 452 aa  107  6e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.797307  normal  0.542737 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3176  AmpG-related permease  24.82 
 
 		 491 aa  106  8e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000022392  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0517  muropeptide transporter  24.82 
 
 		 491 aa  106  8e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000689062  normal  0.616646 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0508  muropeptide transporter  24.82 
 
 		 491 aa  106  8e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000051766  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0468  muropeptide transporter  24.82 
 
 		 491 aa  106  8e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000134905  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3200  muropeptide transporter  24.82 
 
 		 491 aa  106  8e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00206592  hitchhiker  0.000120766 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0474  muropeptide transporter  24.82 
 
 		 491 aa  106  8e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000168996  normal  0.779827 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0355  muropeptide transporter  24.82 
 
 		 491 aa  106  8e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000149162  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00384  muropeptide transporter  25.24 
 
 		 491 aa  106  9e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000202049  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00388  hypothetical protein  25.24 
 
 		 491 aa  106  9e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000464324  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0276  major facilitator superfamily transporter  26.23 
 
 		 449 aa  106  1e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.800927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3442  major facilitator transporter  25 
 
 		 478 aa  105  1e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.141995  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0856  hypothetical protein  25.12 
 
 		 419 aa  105  2e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2487  major facilitator transporter  23.6 
 
 		 473 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.60868  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3039  major facilitator transporter  23.82 
 
 		 473 aa  105  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3156  major facilitator transporter  23.82 
 
 		 473 aa  105  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3101  major facilitator transporter  23.6 
 
 		 473 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0830  hypothetical protein  25.84 
 
 		 415 aa  104  3e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3600  major facilitator transporter  25 
 
 		 471 aa  104  3e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3117  major facilitator transporter  23.6 
 
 		 473 aa  104  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3723  major facilitator transporter  25 
 
 		 471 aa  104  3e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3644  major facilitator transporter  23.71 
 
 		 472 aa  103  5e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0893526 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0819  major facilitator transporter  25.12 
 
 		 471 aa  103  6e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3098  major facilitator transporter  23.54 
 
 		 473 aa  103  7e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4038  major facilitator transporter  25.06 
 
 		 482 aa  102  9e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.549121  normal  0.182505 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0320  ampG protein, putative  23.12 
 
 		 409 aa  102  1e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6452  major facilitator transporter  23.37 
 
 		 473 aa  102  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.554159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3834  major facilitator transporter  25.68 
 
 		 417 aa  102  1e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4408  major facilitator superfamily MFS_1  25.06 
 
 		 482 aa  102  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0664  major facilitator transporter  22.97 
 
 		 456 aa  101  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.757276  normal  0.314251 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0152  major facilitator superfamily transporter  25.24 
 
 		 466 aa  101  3e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.421087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0711  major facilitator transporter  24.37 
 
 		 471 aa  101  3e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3032  major facilitator superfamily MFS_1  25.51 
 
 		 411 aa  100  3e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.998579  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0503  muropeptide transporter  23.98 
 
 		 491 aa  100  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000985164  normal  0.643991 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0547  muropeptide transporter  23.98 
 
 		 491 aa  100  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.283527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3531  major facilitator superfamily MFS_1  24.37 
 
 		 471 aa  100  4e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000125194 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0059  major facilitator transporter  23.15 
 
 		 464 aa  100  4e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.955073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0486  muropeptide transporter  23.98 
 
 		 491 aa  100  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00924697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4390  major facilitator superfamily (MFS)muropeptide transporter  23.25 
 
 		 464 aa  100  6e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0492  muropeptide transporter  23.98 
 
 		 493 aa  100  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00144184  decreased coverage  0.00023941 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0329  major facilitator transporter  23.96 
 
 		 478 aa  100  7e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0484  muropeptide transporter  23.98 
 
 		 493 aa  100  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000603755  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0083  major facilitator transporter  22.4 
 
 		 457 aa  99  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0365182 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4990  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 424 aa  99  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3814  ampG protein, putative  23.31 
 
 		 461 aa  98.2  2e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4520  major facilitator superfamily MFS_1  23.99 
 
 		 504 aa  99  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.623775  normal  0.239632 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2556  AmpG protein, putative  23.42 
 
 		 466 aa  97.8  3e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.368438 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2636  major facilitator transporter  24.82 
 
 		 429 aa  97.8  3e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.103448  normal  0.465614 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0296  AmpG protein  24.83 
 
 		 457 aa  97.4  4e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0367426 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2584  major facilitator superfamily transporter  24.25 
 
 		 439 aa  97.4  4e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.11871  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2937  major facilitator transporter  26.23 
 
 		 443 aa  97.4  5e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0069  major facilitator superfamily MFS_1  23.89 
 
 		 475 aa  97.4  5e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.805125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0770  major facilitator transporter  22.59 
 
 		 455 aa  97.1  6e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.742854 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>