159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0515 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_0515  hypothetical protein  100 
 
 		 580 aa  1167    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.10461  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1328  putative signal transducer  36.73 
 
 		 427 aa  291  2e-77  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2008  putative transmembrane permease  32.15 
 
 		 423 aa  218  2.9999999999999998e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0141901  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0963  major facilitator transporter  34.2 
 
 		 428 aa  201  1.9999999999999998e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.565393 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1618  major facilitator transporter  30.12 
 
 		 433 aa  194  4e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0071  major facilitator transporter  30.47 
 
 		 421 aa  193  6e-48  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.155501  hitchhiker  0.000000000000465333 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1645  AmpG protein  29.59 
 
 		 433 aa  192  1e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2121  major facilitator transporter  30.31 
 
 		 423 aa  185  2.0000000000000003e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1629  major facilitator superfamily MFS_1  26.62 
 
 		 412 aa  96.3  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00218526  hitchhiker  0.00000020409 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1961  AmpG permease protein, putative  26.62 
 
 		 412 aa  96.3  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3983  major facilitator superfamily MFS_1  25.75 
 
 		 416 aa  92.8  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.819094 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1218  major facilitator superfamily MFS_1  26.38 
 
 		 425 aa  86.7  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.8639  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4017  major facilitator transporter  24.34 
 
 		 412 aa  85.9  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.165032 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0470  major facilitator superfamily protein  26 
 
 		 428 aa  84.3  0.000000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.807635  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0154  muropeptide transporter  25.55 
 
 		 426 aa  83.2  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.679367  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0044  muropeptide transporter  25.55 
 
 		 429 aa  83.6  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1299  major facilitator transporter  26.05 
 
 		 447 aa  81.6  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.333624  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0047  muropeptide transporter  25.06 
 
 		 429 aa  80.5  0.00000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.252605 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2276  major facilitator superfamily MFS_1  25.5 
 
 		 416 aa  79.3  0.0000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2483  major facilitator transporter  26.8 
 
 		 411 aa  75.5  0.000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1901  AmpG  23.91 
 
 		 433 aa  74.7  0.000000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.165833  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0289  AmpG protein  23.68 
 
 		 433 aa  73.2  0.00000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0069  major facilitator superfamily MFS_1  24.82 
 
 		 475 aa  72.4  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.805125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4016  major facilitator transporter  26.08 
 
 		 444 aa  71.2  0.00000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00384  muropeptide transporter  25.41 
 
 		 491 aa  69.7  0.0000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000202049  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00388  hypothetical protein  25.41 
 
 		 491 aa  69.7  0.0000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000464324  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3176  AmpG-related permease  24.88 
 
 		 491 aa  68.9  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000022392  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0517  muropeptide transporter  24.88 
 
 		 491 aa  68.9  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000689062  normal  0.616646 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0355  muropeptide transporter  24.88 
 
 		 491 aa  68.9  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000149162  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7099  major facilitator superfamily MFS_1  25.31 
 
 		 447 aa  68.9  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.835982  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0508  muropeptide transporter  24.88 
 
 		 491 aa  68.9  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000051766  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0468  muropeptide transporter  24.88 
 
 		 491 aa  68.9  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000134905  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3200  muropeptide transporter  24.88 
 
 		 491 aa  68.9  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00206592  hitchhiker  0.000120766 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0474  muropeptide transporter  24.88 
 
 		 491 aa  68.9  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000168996  normal  0.779827 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0191  muropeptide transporter  24.94 
 
 		 419 aa  67.8  0.0000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10028  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2679  major facilitator transporter  25.11 
 
 		 465 aa  67.4  0.0000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000459278 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8458  major facilitator superfamily MFS_1  25.36 
 
 		 442 aa  66.6  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0199  major facilitator superfamily transporter  23.91 
 
 		 447 aa  66.6  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.723346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0900  muropeptide transporter  22.6 
 
 		 491 aa  65.9  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00841123  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1648  major facilitator transporter  25.47 
 
 		 450 aa  66.2  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.236568 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6531  major facilitator transporter  24.57 
 
 		 443 aa  65.1  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.118713  normal  0.219837 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3268  muropeptide transporter  24.65 
 
 		 495 aa  65.1  0.000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.482744  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2999  major facilitator transporter  25.81 
 
 		 388 aa  64.7  0.000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0377  major facilitator transporter  25.82 
 
 		 506 aa  63.9  0.000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0179804  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2561  major facilitator transporter  22.09 
 
 		 517 aa  63.2  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.249955  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0146  muropeptide transporter  26.19 
 
 		 426 aa  62.8  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.802826 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2636  major facilitator transporter  25.13 
 
 		 429 aa  63.5  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.103448  normal  0.465614 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1044  muropeptide transporter  25.3 
 
 		 495 aa  63.2  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0385615  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1298  major facilitator transporter  20.96 
 
 		 442 aa  62.8  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0503  muropeptide transporter  23.58 
 
 		 491 aa  62.4  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000985164  normal  0.643991 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0547  muropeptide transporter  23.58 
 
 		 491 aa  62.4  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.283527  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0320  ampG protein, putative  25.58 
 
 		 409 aa  62  0.00000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1420  major facilitator superfamily MFS_1  25.24 
 
 		 438 aa  62  0.00000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.508599 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0486  muropeptide transporter  23.58 
 
 		 491 aa  62  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00924697  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0484  muropeptide transporter  23.58 
 
 		 493 aa  62  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000603755  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0492  muropeptide transporter  23.58 
 
 		 493 aa  62  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00144184  decreased coverage  0.00023941 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1209  major facilitator transporter  22.78 
 
 		 448 aa  61.6  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.299464  normal  0.44689 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0771  major facilitator transporter  21.89 
 
 		 465 aa  61.6  0.00000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00332718  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3834  major facilitator transporter  23.64 
 
 		 417 aa  61.6  0.00000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2892  major facilitator transporter  22.47 
 
 		 472 aa  61.2  0.00000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0730175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1091  muropeptide transporter  22.98 
 
 		 492 aa  61.6  0.00000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000207294  hitchhiker  0.00000512549 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3596  major facilitator transporter  23.91 
 
 		 478 aa  61.2  0.00000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.597959  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0263  major facilitator superfamily MFS_1  23.68 
 
 		 462 aa  60.8  0.00000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.464987  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0223  major facilitator transporter  23.39 
 
 		 461 aa  60.8  0.00000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1287  major facilitator superfamily MFS_1  21.85 
 
 		 517 aa  60.8  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3644  major facilitator transporter  22.04 
 
 		 472 aa  60.5  0.00000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0893526 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1388  major facilitator superfamily MFS_1  21.85 
 
 		 517 aa  60.5  0.00000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.344668  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0152  major facilitator superfamily transporter  23.19 
 
 		 466 aa  60.1  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.421087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3600  major facilitator transporter  22.44 
 
 		 471 aa  60.1  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3723  major facilitator transporter  22.44 
 
 		 471 aa  60.1  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3239  muropeptide transporter  23 
 
 		 492 aa  59.7  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.83474  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1400  signal transducer ampG1  28.89 
 
 		 502 aa  59.3  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00988952  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4520  major facilitator superfamily MFS_1  25.82 
 
 		 504 aa  59.3  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.623775  normal  0.239632 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3380  RhtX/FptX family siderophore transporter  24.74 
 
 		 271 aa  58.5  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0139  beta-lactamase induction signal transducer protein  28.64 
 
 		 509 aa  58.5  0.0000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.143308  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2937  major facilitator transporter  24.83 
 
 		 443 aa  57.8  0.0000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3096  muropeptide transporter  22.76 
 
 		 492 aa  57.8  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0966625  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3058  muropeptide transporter  22.76 
 
 		 492 aa  57.8  0.0000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000335083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0253  putative transport transmembrane protein  24.01 
 
 		 462 aa  57.4  0.0000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0624  major facilitator transporter  22.93 
 
 		 461 aa  57  0.0000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.471905  normal  0.556428 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1667  major facilitator transporter  23.44 
 
 		 451 aa  56.6  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0579205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4038  major facilitator transporter  24.77 
 
 		 482 aa  57  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.549121  normal  0.182505 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0770  major facilitator transporter  24.04 
 
 		 455 aa  55.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.742854 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3691  major facilitator transporter  23.97 
 
 		 454 aa  55.8  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.639879  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4408  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 482 aa  55.8  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0819  major facilitator transporter  23.26 
 
 		 471 aa  55.8  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3442  major facilitator transporter  21.85 
 
 		 478 aa  55.5  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.141995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0155  AmpG-related permease  26.26 
 
 		 437 aa  55.1  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0122  major facilitator transporter  27.23 
 
 		 509 aa  55.1  0.000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.00126713  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0600  AmpG protein  21.69 
 
 		 428 aa  55.1  0.000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.674312  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2556  AmpG protein, putative  23.44 
 
 		 466 aa  55.1  0.000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.368438 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0375  major facilitator superfamily muropeptide transporter  27.72 
 
 		 437 aa  54.7  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4390  major facilitator superfamily (MFS)muropeptide transporter  20.48 
 
 		 464 aa  54.7  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0180  major facilitator transporter  27.72 
 
 		 437 aa  54.7  0.000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.277448  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0190  major facilitator transporter  27.72 
 
 		 437 aa  54.7  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4105  major facilitator transporter  27.06 
 
 		 547 aa  54.7  0.000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000015602 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0128  major facilitator transporter  25 
 
 		 422 aa  54.3  0.000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2584  major facilitator superfamily transporter  23.89 
 
 		 439 aa  54.3  0.000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.11871  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0094  hypothetical protein  30.17 
 
 		 511 aa  54.3  0.000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.4429  normal  0.916942 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0110  major facilitator superfamily MFS_1  27.37 
 
 		 452 aa  53.9  0.000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0140571  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>