204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_1645 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_1618  major facilitator transporter  99.07 
 
 
433 aa  852    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1645  AmpG protein  100 
 
 
433 aa  858    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2008  putative transmembrane permease  55.94 
 
 
423 aa  465  9.999999999999999e-131  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0141901  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0963  major facilitator transporter  44.96 
 
 
428 aa  348  1e-94  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.565393 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0071  major facilitator transporter  43.75 
 
 
421 aa  347  2e-94  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.155501  hitchhiker  0.000000000000465333 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2121  major facilitator transporter  43.06 
 
 
423 aa  321  9.999999999999999e-87  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1328  putative signal transducer  36.13 
 
 
427 aa  263  6e-69  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1961  AmpG permease protein, putative  30.5 
 
 
412 aa  183  4.0000000000000006e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1629  major facilitator superfamily MFS_1  30.5 
 
 
412 aa  183  4.0000000000000006e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00218526  hitchhiker  0.00000020409 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0515  hypothetical protein  29.59 
 
 
580 aa  175  1.9999999999999998e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.10461  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4017  major facilitator transporter  27.93 
 
 
412 aa  157  4e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.165032 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3983  major facilitator superfamily MFS_1  28.2 
 
 
416 aa  154  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.819094 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1218  major facilitator superfamily MFS_1  30.07 
 
 
425 aa  137  5e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.8639  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2561  major facilitator transporter  26.08 
 
 
517 aa  133  6.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.249955  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2584  major facilitator superfamily transporter  26.45 
 
 
439 aa  132  1.0000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.11871  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0771  major facilitator transporter  26.04 
 
 
465 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00332718  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1287  major facilitator superfamily MFS_1  26.08 
 
 
517 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1388  major facilitator superfamily MFS_1  26.08 
 
 
517 aa  131  3e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.344668  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3239  muropeptide transporter  25.06 
 
 
492 aa  129  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.83474  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3723  major facilitator transporter  26.39 
 
 
471 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3600  major facilitator transporter  26.39 
 
 
471 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3644  major facilitator transporter  25.84 
 
 
472 aa  127  3e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0893526 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1044  muropeptide transporter  25.76 
 
 
495 aa  127  3e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0385615  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3058  muropeptide transporter  24.82 
 
 
492 aa  127  5e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000335083  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3096  muropeptide transporter  24.82 
 
 
492 aa  127  5e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0966625  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0470  major facilitator superfamily protein  26.73 
 
 
428 aa  126  7e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.807635  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0044  muropeptide transporter  25.12 
 
 
429 aa  126  8.000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3814  ampG protein, putative  25.06 
 
 
461 aa  124  3e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0047  muropeptide transporter  24.4 
 
 
429 aa  124  3e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.252605 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0289  AmpG protein  24.64 
 
 
433 aa  124  4e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2556  AmpG protein, putative  26.18 
 
 
466 aa  124  4e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.368438 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1901  AmpG  24.64 
 
 
433 aa  124  5e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.165833  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3155  major facilitator transporter  23.99 
 
 
465 aa  123  7e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0812  major facilitator transporter  24.44 
 
 
463 aa  122  9e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3268  muropeptide transporter  24.64 
 
 
495 aa  122  9.999999999999999e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.482744  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0154  muropeptide transporter  24.76 
 
 
426 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.679367  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3531  major facilitator superfamily MFS_1  24.65 
 
 
471 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000125194 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3442  major facilitator transporter  26.6 
 
 
478 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.141995  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2881  muropeptide transporter  25.61 
 
 
489 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.457618  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0783  major facilitator transporter  24.27 
 
 
463 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.191663  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0711  major facilitator transporter  24.42 
 
 
471 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0191  muropeptide transporter  24.94 
 
 
419 aa  120  3e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10028  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3072  muropeptide transporter  24.88 
 
 
489 aa  120  3e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000553099  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0152  major facilitator superfamily transporter  26.74 
 
 
466 aa  120  3.9999999999999996e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.421087  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0900  muropeptide transporter  22.98 
 
 
491 aa  120  3.9999999999999996e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00841123  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0355  muropeptide transporter  24.21 
 
 
491 aa  119  9e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000149162  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0508  muropeptide transporter  24.21 
 
 
491 aa  119  9e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000051766  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3200  muropeptide transporter  24.21 
 
 
491 aa  119  9e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00206592  hitchhiker  0.000120766 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2892  major facilitator transporter  25.29 
 
 
472 aa  119  9e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0730175  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0468  muropeptide transporter  24.21 
 
 
491 aa  119  9e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000134905  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3176  AmpG-related permease  24.21 
 
 
491 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000022392  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0517  muropeptide transporter  24.21 
 
 
491 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000689062  normal  0.616646 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0474  muropeptide transporter  24.21 
 
 
491 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000168996  normal  0.779827 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0819  major facilitator transporter  23.83 
 
 
471 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00384  muropeptide transporter  24.21 
 
 
491 aa  118  3e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000202049  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00388  hypothetical protein  24.21 
 
 
491 aa  118  3e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000464324  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0069  major facilitator superfamily MFS_1  23.49 
 
 
475 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.805125  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2276  major facilitator superfamily MFS_1  25.42 
 
 
416 aa  116  8.999999999999998e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1299  major facilitator transporter  25.11 
 
 
447 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.333624  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2679  major facilitator transporter  23.78 
 
 
465 aa  115  2.0000000000000002e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000459278 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0083  major facilitator transporter  25.17 
 
 
457 aa  114  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0365182 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1091  muropeptide transporter  24.06 
 
 
492 aa  113  6e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000207294  hitchhiker  0.00000512549 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0623  major facilitator superfamily MFS_1  25.06 
 
 
459 aa  113  6e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.89214  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7340  major facilitator superfamily permease  25.3 
 
 
460 aa  113  7.000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0320  ampG protein, putative  24.88 
 
 
409 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0209  major facilitator transporter  26.1 
 
 
466 aa  112  1.0000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2999  major facilitator transporter  24.09 
 
 
388 aa  112  2.0000000000000002e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0664  major facilitator transporter  24.59 
 
 
456 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.757276  normal  0.314251 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0329  major facilitator transporter  24.82 
 
 
478 aa  111  3e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3113  major facilitator transporter  24.2 
 
 
476 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2009  major facilitator transporter  23.83 
 
 
415 aa  110  5e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.872827  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0770  major facilitator transporter  24 
 
 
455 aa  110  6e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.742854 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2288  major facilitator transporter  24.55 
 
 
468 aa  110  7.000000000000001e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0486  muropeptide transporter  24.39 
 
 
491 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00924697  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3063  major facilitator transporter  25.18 
 
 
452 aa  109  1e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.797307  normal  0.542737 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0484  muropeptide transporter  24.39 
 
 
493 aa  109  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000603755  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0503  muropeptide transporter  24.39 
 
 
491 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000985164  normal  0.643991 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0492  muropeptide transporter  24.39 
 
 
493 aa  109  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00144184  decreased coverage  0.00023941 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0547  muropeptide transporter  24.39 
 
 
491 aa  109  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.283527  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2483  major facilitator transporter  24.51 
 
 
411 aa  108  2e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3691  major facilitator transporter  23.88 
 
 
454 aa  108  2e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.639879  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0146  muropeptide transporter  23.94 
 
 
426 aa  108  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.802826 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0199  major facilitator superfamily transporter  25.77 
 
 
447 aa  107  3e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.723346  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13420  AmpG-related permease  27.73 
 
 
515 aa  107  4e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0377  major facilitator transporter  34.03 
 
 
506 aa  107  4e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0179804  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1726  major facilitator superfamily MFS_1  24.08 
 
 
417 aa  106  7e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.299438  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3834  major facilitator transporter  23.53 
 
 
417 aa  105  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0253  putative transport transmembrane protein  23.5 
 
 
462 aa  105  2e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0600  AmpG protein  23.79 
 
 
428 aa  104  2e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.674312  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0276  major facilitator superfamily transporter  23.69 
 
 
449 aa  104  3e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.800927  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3244  AmpG-related permease  22.35 
 
 
437 aa  103  4e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2905  AmpG-related permease  22.35 
 
 
437 aa  103  4e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2184  AmpG-related permease  22.35 
 
 
437 aa  103  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.452697  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3443  AmpG-related permease  22.35 
 
 
437 aa  103  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0375  major facilitator superfamily muropeptide transporter  22.22 
 
 
437 aa  103  5e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3114  major facilitator transporter  24.13 
 
 
475 aa  103  5e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0180  major facilitator transporter  22.22 
 
 
437 aa  103  5e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.277448  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0190  major facilitator transporter  22.22 
 
 
437 aa  103  5e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0155  AmpG-related permease  22.46 
 
 
437 aa  103  6e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4990  major facilitator superfamily MFS_1  23.22 
 
 
424 aa  103  8e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>