217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3380 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3380  RhtX/FptX family siderophore transporter  100 
 
 		 271 aa  518  1e-146  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3032  major facilitator superfamily MFS_1  55.95 
 
 		 411 aa  260  1e-68  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.998579  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1673  major facilitator transporter  36.22 
 
 		 396 aa  143  3e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00717957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0184  major facilitator transporter  35.83 
 
 		 396 aa  143  4e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4990  major facilitator superfamily MFS_1  35.5 
 
 		 424 aa  132  5e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4494  major facilitator transporter  37.54 
 
 		 416 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0590  major facilitator transporter  33.44 
 
 		 465 aa  129  3e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.97195 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1496  major facilitator transporter  33.2 
 
 		 395 aa  112  5e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.372528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0688  major facilitator transporter  29 
 
 		 434 aa  111  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0756  major facilitator transporter  29.2 
 
 		 428 aa  110  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3088  major facilitator superfamily MFS_1  31.58 
 
 		 408 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.120291  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3259  RhtX/FptX family siderophore transporter  32.31 
 
 		 420 aa  108  7.000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.569308  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0866  major facilitator transporter  32.96 
 
 		 413 aa  107  2e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00348625  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5297  RhtX/FptX family siderophore transporter  33.97 
 
 		 415 aa  105  6e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0680678 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3834  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 417 aa  105  7e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1339  major facilitator superfamily MFS_1  31.37 
 
 		 406 aa  104  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3377  major facilitator transporter  33.97 
 
 		 415 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4990  major facilitator transporter  33.97 
 
 		 415 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0094  hypothetical protein  38.97 
 
 		 511 aa  102  8e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.4429  normal  0.916942 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1299  major facilitator transporter  29.92 
 
 		 447 aa  100  3e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.333624  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5064  RhtX/FptX family siderophore transporter  31.54 
 
 		 418 aa  100  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.646034  hitchhiker  0.00624927 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1901  AmpG  32.34 
 
 		 433 aa  100  3e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.165833  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0680  major facilitator transporter  35.91 
 
 		 414 aa  100  4e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.440664  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0848  major facilitator transporter  33.81 
 
 		 413 aa  99.4  6e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0600  AmpG protein  30.52 
 
 		 428 aa  99.4  6e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.674312  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0074  major facilitator superfamily MFS_1  34.29 
 
 		 406 aa  99  8e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.220484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0289  AmpG protein  31.91 
 
 		 433 aa  98.6  1e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0623  major facilitator superfamily MFS_1  29.85 
 
 		 459 aa  97.8  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.89214  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1629  major facilitator superfamily MFS_1  28.93 
 
 		 412 aa  95.9  6e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00218526  hitchhiker  0.00000020409 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1961  AmpG permease protein, putative  28.93 
 
 		 412 aa  95.9  6e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1821  transporter  35.55 
 
 		 457 aa  95.5  9e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0664  major facilitator transporter  30.51 
 
 		 456 aa  95.1  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.757276  normal  0.314251 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0083  major facilitator transporter  30.15 
 
 		 457 aa  95.1  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0365182 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0900  muropeptide transporter  28.29 
 
 		 491 aa  94.4  2e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00841123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2158  hypothetical protein  34.33 
 
 		 423 aa  93.6  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0886  RhtX/FptX family siderophore transporter  34.33 
 
 		 423 aa  93.6  3e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.47536  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0796  RhtX/FptX family siderophore transporter  34.33 
 
 		 423 aa  93.6  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.314363  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2881  muropeptide transporter  34.5 
 
 		 489 aa  93.2  4e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.457618  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0337  major facilitator transporter  32.57 
 
 		 418 aa  92.8  6e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.957507  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3691  major facilitator transporter  30.22 
 
 		 454 aa  92.4  8e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.639879  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0059  major facilitator transporter  28.84 
 
 		 464 aa  92  9e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.955073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3239  muropeptide transporter  26.92 
 
 		 492 aa  91.3  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.83474  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3058  muropeptide transporter  26.92 
 
 		 492 aa  91.3  1e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000335083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3096  muropeptide transporter  26.92 
 
 		 492 aa  91.3  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0966625  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1091  muropeptide transporter  29.28 
 
 		 492 aa  90.5  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000207294  hitchhiker  0.00000512549 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2336  major facilitator transporter  32.56 
 
 		 424 aa  90.9  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2102  yersinabactin region putative transporter YbtX  31.19 
 
 		 426 aa  91.3  2e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3267  major facilitator superfamily MFS_1  42.21 
 
 		 641 aa  90.1  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0360641 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3983  major facilitator superfamily MFS_1  26.15 
 
 		 416 aa  89.4  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.819094 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2276  major facilitator superfamily MFS_1  30.8 
 
 		 416 aa  89  7e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0840  major facilitator transporter  27.31 
 
 		 439 aa  89  8e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0333  major facilitator superfamily MFS_1  28.95 
 
 		 464 aa  88.2  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4038  major facilitator transporter  27.13 
 
 		 482 aa  88.2  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.549121  normal  0.182505 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3176  AmpG-related permease  27.82 
 
 		 491 aa  87.8  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000022392  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0706  putative ampG protein  28.34 
 
 		 426 aa  87.4  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0517  muropeptide transporter  27.82 
 
 		 491 aa  87.8  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000689062  normal  0.616646 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0474  muropeptide transporter  27.82 
 
 		 491 aa  87.8  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000168996  normal  0.779827 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4390  major facilitator superfamily (MFS)muropeptide transporter  29.63 
 
 		 464 aa  87.4  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0468  muropeptide transporter  27.82 
 
 		 491 aa  87.8  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000134905  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0355  muropeptide transporter  27.82 
 
 		 491 aa  87.8  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000149162  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2937  major facilitator transporter  30 
 
 		 443 aa  87.8  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3200  muropeptide transporter  27.82 
 
 		 491 aa  87.8  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00206592  hitchhiker  0.000120766 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1645  AmpG protein  25.37 
 
 		 433 aa  87.8  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0508  muropeptide transporter  27.82 
 
 		 491 aa  87.8  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000051766  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1571  major facilitator superfamily MFS_1  27.27 
 
 		 412 aa  87  3e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.823301  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1618  major facilitator transporter  25 
 
 		 433 aa  87  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4408  major facilitator superfamily MFS_1  27.13 
 
 		 482 aa  87  3e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4520  major facilitator superfamily MFS_1  27.13 
 
 		 504 aa  87  3e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.623775  normal  0.239632 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0154  muropeptide transporter  26.02 
 
 		 426 aa  86.3  5e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.679367  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1498  major facilitator transporter  30.8 
 
 		 408 aa  86.3  5e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.85322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09380  putative transporter  35 
 
 		 414 aa  85.9  6e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000449575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1218  major facilitator superfamily MFS_1  27.01 
 
 		 425 aa  85.1  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.8639  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2483  major facilitator transporter  31.12 
 
 		 411 aa  84.7  0.000000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4017  major facilitator transporter  28.85 
 
 		 412 aa  84.3  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.165032 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0044  muropeptide transporter  27.24 
 
 		 429 aa  84.7  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1044  muropeptide transporter  27.31 
 
 		 495 aa  84  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0385615  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0770  major facilitator transporter  29.85 
 
 		 455 aa  83.6  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.742854 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0880  putative transporter  34.83 
 
 		 414 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.179079  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3268  muropeptide transporter  26.92 
 
 		 495 aa  83.6  0.000000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.482744  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3063  major facilitator transporter  29.48 
 
 		 452 aa  83.2  0.000000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.797307  normal  0.542737 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2008  putative transmembrane permease  25.52 
 
 		 423 aa  83.2  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0141901  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02935  signal transducer  29.45 
 
 		 431 aa  83.2  0.000000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.726126  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00384  muropeptide transporter  27.44 
 
 		 491 aa  82.8  0.000000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000202049  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00388  hypothetical protein  27.44 
 
 		 491 aa  82.8  0.000000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000464324  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0047  muropeptide transporter  27.24 
 
 		 429 aa  82.8  0.000000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.252605 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3098  major facilitator transporter  27.72 
 
 		 473 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0486  muropeptide transporter  28.85 
 
 		 491 aa  82.4  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00924697  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0547  muropeptide transporter  28.85 
 
 		 491 aa  82.4  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.283527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0503  muropeptide transporter  28.85 
 
 		 491 aa  82.4  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000985164  normal  0.643991 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0492  muropeptide transporter  28.85 
 
 		 493 aa  82.4  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00144184  decreased coverage  0.00023941 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0484  muropeptide transporter  28.85 
 
 		 493 aa  82.4  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000603755  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0191  muropeptide transporter  31.28 
 
 		 419 aa  82  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10028  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6452  major facilitator transporter  27.31 
 
 		 473 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.554159  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0470  major facilitator superfamily protein  26.89 
 
 		 428 aa  80.5  0.00000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.807635  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3072  muropeptide transporter  28.68 
 
 		 489 aa  80.9  0.00000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000553099  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3039  major facilitator transporter  26.94 
 
 		 473 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3156  major facilitator transporter  26.57 
 
 		 473 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2999  major facilitator transporter  26.12 
 
 		 388 aa  79.7  0.00000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0071  major facilitator transporter  23.51 
 
 		 421 aa  79.3  0.00000000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.155501  hitchhiker  0.000000000000465333 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3117  major facilitator transporter  26.57 
 
 		 473 aa  79  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>