211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A0094 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A0094  hypothetical protein  100 
 
 		 511 aa  977    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.4429  normal  0.916942 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0377  major facilitator transporter  30.68 
 
 		 506 aa  160  5e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0179804  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0083  major facilitator transporter  30.1 
 
 		 457 aa  157  4e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0365182 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0664  major facilitator transporter  29.98 
 
 		 456 aa  154  5e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.757276  normal  0.314251 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4105  major facilitator transporter  32.36 
 
 		 547 aa  140  7e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000015602 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0623  major facilitator superfamily MFS_1  27.91 
 
 		 459 aa  139  2e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.89214  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0770  major facilitator transporter  27.33 
 
 		 455 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.742854 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3691  major facilitator transporter  27.38 
 
 		 454 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.639879  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7340  major facilitator superfamily permease  27.88 
 
 		 460 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0110  major facilitator superfamily MFS_1  29.61 
 
 		 452 aa  127  7e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0140571  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1400  signal transducer ampG1  27.77 
 
 		 502 aa  126  9e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00988952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0819  major facilitator transporter  26.84 
 
 		 471 aa  124  3e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4017  major facilitator transporter  34.98 
 
 		 412 aa  122  9.999999999999999e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.165032 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3155  major facilitator transporter  26.51 
 
 		 465 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0812  major facilitator transporter  26.9 
 
 		 463 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0783  major facilitator transporter  26.56 
 
 		 463 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.191663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0139  beta-lactamase induction signal transducer protein  27.44 
 
 		 509 aa  122  1.9999999999999998e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.143308  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0771  major facilitator transporter  25.49 
 
 		 465 aa  121  3e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00332718  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3814  ampG protein, putative  26.51 
 
 		 461 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2556  AmpG protein, putative  28.16 
 
 		 466 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.368438 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2679  major facilitator transporter  27.25 
 
 		 465 aa  118  3e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000459278 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3531  major facilitator superfamily MFS_1  26.14 
 
 		 471 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000125194 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0711  major facilitator transporter  26.14 
 
 		 471 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4070  HNH endonuclease  29.86 
 
 		 509 aa  117  6e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4369  AmpG-related permease  28.92 
 
 		 515 aa  117  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0389334 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4494  AmpG-related permease  28.92 
 
 		 515 aa  116  8.999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.769685  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3644  major facilitator transporter  26.23 
 
 		 472 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0893526 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3596  major facilitator transporter  26.42 
 
 		 478 aa  115  2.0000000000000002e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.597959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0296  AmpG protein  26.44 
 
 		 457 aa  115  3e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0367426 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1355  AmpG-related permease  28.6 
 
 		 515 aa  114  5e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.010612  normal  0.140605 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0962  AmpG-related permease  28.02 
 
 		 515 aa  114  5e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3723  major facilitator transporter  25.65 
 
 		 471 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2483  major facilitator transporter  32.89 
 
 		 411 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3600  major facilitator transporter  25.65 
 
 		 471 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2288  major facilitator transporter  27.59 
 
 		 468 aa  112  2.0000000000000002e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0122  major facilitator transporter  26.93 
 
 		 509 aa  111  3e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.00126713  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1299  major facilitator transporter  34.63 
 
 		 447 aa  110  5e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.333624  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3032  major facilitator superfamily MFS_1  45.27 
 
 		 411 aa  110  7.000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.998579  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1618  major facilitator transporter  24.32 
 
 		 433 aa  109  9.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0154  muropeptide transporter  33.91 
 
 		 426 aa  109  1e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.679367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3442  major facilitator transporter  26.26 
 
 		 478 aa  108  2e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.141995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1235  muropeptide MFS uptake transporter AmpG  25.23 
 
 		 550 aa  108  2e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.988982 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0044  muropeptide transporter  34.4 
 
 		 429 aa  108  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1198  AmpG permease  26.98 
 
 		 519 aa  108  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.1584 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1645  AmpG protein  23.79 
 
 		 433 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4383  ampG protein, putative  27.27 
 
 		 516 aa  108  3e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.920569  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3113  major facilitator transporter  25.97 
 
 		 476 aa  108  3e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2276  major facilitator superfamily MFS_1  37.5 
 
 		 416 aa  108  3e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3114  major facilitator transporter  25.97 
 
 		 475 aa  107  4e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0470  major facilitator superfamily protein  34.95 
 
 		 428 aa  107  6e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.807635  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2892  major facilitator transporter  25.79 
 
 		 472 aa  106  8e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0730175  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0320  ampG protein, putative  34.74 
 
 		 409 aa  105  1e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0253  putative transport transmembrane protein  27.4 
 
 		 462 aa  105  1e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0047  muropeptide transporter  33.94 
 
 		 429 aa  106  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.252605 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4078  AmpG-related permease  26.89 
 
 		 516 aa  105  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3983  major facilitator superfamily MFS_1  33.82 
 
 		 416 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.819094 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13420  AmpG-related permease  29.26 
 
 		 515 aa  104  5e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0199  major facilitator superfamily transporter  29.84 
 
 		 447 aa  103  8e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.723346  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0147  major facilitator transporter  28.82 
 
 		 550 aa  103  9e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0963  major facilitator transporter  25.49 
 
 		 428 aa  102  2e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.565393 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2561  major facilitator transporter  34.01 
 
 		 517 aa  102  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.249955  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3380  RhtX/FptX family siderophore transporter  38.97 
 
 		 271 aa  102  2e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2937  major facilitator transporter  38.39 
 
 		 443 aa  102  2e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0191  muropeptide transporter  34.5 
 
 		 419 aa  100  4e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10028  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0516  major facilitator transporter  28.66 
 
 		 441 aa  101  4e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1156  major facilitator transporter  25.92 
 
 		 553 aa  100  5e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0968602  normal  0.231698 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1287  major facilitator superfamily MFS_1  32.69 
 
 		 517 aa  100  7e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1388  major facilitator superfamily MFS_1  32.69 
 
 		 517 aa  100  7e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.344668  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1218  major facilitator superfamily MFS_1  35.08 
 
 		 425 aa  99.8  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.8639  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3039  major facilitator transporter  30.77 
 
 		 473 aa  99  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6452  major facilitator transporter  32.02 
 
 		 473 aa  98.2  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.554159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3156  major facilitator transporter  30.07 
 
 		 473 aa  97.8  4e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2999  major facilitator transporter  32.89 
 
 		 388 aa  97.1  7e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3098  major facilitator transporter  32.41 
 
 		 473 aa  97.1  7e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1901  AmpG  30.95 
 
 		 433 aa  97.1  8e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.165833  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0289  AmpG protein  30.95 
 
 		 433 aa  96.7  9e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0375  major facilitator superfamily muropeptide transporter  33.51 
 
 		 437 aa  95.5  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0180  major facilitator transporter  33.51 
 
 		 437 aa  95.5  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.277448  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0190  major facilitator transporter  33.51 
 
 		 437 aa  95.5  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0190  major facilitator transporter  27.27 
 
 		 576 aa  95.5  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.397868 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3239  muropeptide transporter  31.07 
 
 		 492 aa  94.4  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.83474  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2487  major facilitator transporter  29.66 
 
 		 473 aa  94.4  4e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.60868  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3101  major facilitator transporter  29.66 
 
 		 473 aa  94.4  4e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0059  major facilitator transporter  32.63 
 
 		 464 aa  94.4  4e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.955073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3117  major facilitator transporter  29.31 
 
 		 473 aa  94  5e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3244  AmpG-related permease  33.51 
 
 		 437 aa  94  6e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2905  AmpG-related permease  33.51 
 
 		 437 aa  94  6e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2184  AmpG-related permease  33.51 
 
 		 437 aa  94  6e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.452697  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3443  AmpG-related permease  33.51 
 
 		 437 aa  94  6e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3072  muropeptide transporter  30.87 
 
 		 489 aa  93.6  7e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000553099  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0600  AmpG protein  31.2 
 
 		 428 aa  93.6  8e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.674312  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0900  muropeptide transporter  32.65 
 
 		 491 aa  93.6  8e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00841123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3096  muropeptide transporter  31.07 
 
 		 492 aa  93.2  9e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0966625  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3058  muropeptide transporter  31.07 
 
 		 492 aa  93.2  9e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000335083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3063  major facilitator transporter  30.49 
 
 		 452 aa  92.8  1e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.797307  normal  0.542737 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3834  major facilitator transporter  31.7 
 
 		 417 aa  92.8  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1961  AmpG permease protein, putative  33.48 
 
 		 412 aa  92.8  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1629  major facilitator superfamily MFS_1  33.48 
 
 		 412 aa  92.8  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00218526  hitchhiker  0.00000020409 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0155  AmpG-related permease  32.98 
 
 		 437 aa  92.4  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3259  RhtX/FptX family siderophore transporter  38.22 
 
 		 420 aa  90.5  6e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.569308  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>